CcUC05G090230 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTGGTTATTATTTTAGAAAAAGCTACCTACCCTGTACTCGTTGTTATAAACCAAGTCTTGTGGGTCAAGCCAAGGAAGTTGTTATTACGTGGCTAACAATTTCGTCCTATTTGTTGATAACGACCTCTCAAAAATCTATAATACAATCAACTTTTAATCTAAATTTATGTTATTAAAATGAGCATAGTTTACATAACATAGTATTTGTATTATCAACTTTAAAATTAGAGGTTTGATTTCTATTGTCAAAAAAAAAAAAAAATCATATTAATTTGTTTTTAGTTTAATCCAAAATGCTTCAATGCATTAGAGATGACTGCACAGAAATAATTATAACTGAAACTCCTACTCTGCATATTGAATGAAGTCAATTTCGAACTTTCTCAATGCAAAGCTTTTCTAATTAAATCTACATCCTCGAAGGAAAATTTTGGTTCTCAATTTTTGCAGCAAATCGATGTAAAACTCATATATATATATATATTTTTTTTTTCCATTTCAAAGGAAAATTGTGATTTGAATGGTCTGATAGTAGCCAGAAGGGATGTAATTATCCATACACACAATATTTACACATAATATTAAAACATAATTTTGTTGCAACTTACAATTCTCAATTAATTTTGCTTTTTGCTCAATAATAATCAACATGACCTTCCTCTTTAAAAGTGGAAGATTCGATTTCCATCGCTAAATTAAAAAAAAAAAAAACTTAATTTTGTTGGCTACAAAATATAGGAAAATTAGAAGTAAATGGTACTTTTAAAAAATCAATAGAAAAATGTAGTAGTGTTGAAAATATTTATAAAAATATTGTGGTTTTAATTACTTGATTGAAAATTGTGTTTGGTCAGCCAATCTTTCTTTTCTATACATAACCTTTTTTACAATTATATTTTTCAATAATAAAAATATATATTTTATTAAAGAATATTTTAACTAACCTTTTTTAGTTTTTAATAATAAAAAATATATATTTGATTAATAACTAATAGTTTTGCAAAGAAATTATTTAAACCAATGTAAAAAAAGAAAAAAAAAAACATTAAACTACATTAAAACTATTGTTTATAATGAGAAAATAATAAAATATAAATTAAAATGTCAGTATTGATACAATAATTTAATATTTTCCTTTCACTAAAGATAATAAAAAAAACTCAATGTATCCCACGACGCGGACGTTGTTGATTTCGAGTTGGCTGTTGTCATCGATTTTGAACTTTAGGTTGCTTTGATTCCTTTAGTGGTTCTAGTACCTCTGCAAGCGCTTCATATTATAAATATTCATTATGCTCTCCACGATCGCACCCATGTGTATGCATGTATGAATACAATAGAACGACTTCTGAATTATAATATCCTGAAACAAAGGTTGGCCGCATCATTATTGGACTAGCATAACCAGTCTGACTCTGAGTCTGCATCATAGGAGGCAATTCTTCCACATTATGGTCAACCGCATCAAACTCATCTTCTTCTCCTCGAGCACATCTCCTATGCTTAGGAACTGGTGGAGGTGTAATAGGTATATCGTACATGTAGTATGAATCCTCTATGTAACTCTTGTTATTACTATATACAATAAGTACGTGATTTGGATATCTGCAACATCATGAAGGCTACTTTTGCTCGATTTTTGTGAATTACAAAACAATTAGACAATATTTAAAATAAGTTTAAATTAAAAATAATTAGACAATATTTGATTATATATCAAATGACCCAAAGCTGATCCTAGACGAGTAATGTAGCATCTCGTAATATTATTATACCAAAAGATGTAATCTTGAGTTGCATCCGTGTCGAATTGCCTAATTGAATTGGGTTTGGTATTCACTTACCTGGTCAGGTTAAAGCAGATTAAACATGTATTGTGTAGCTGACCTAGTCACACAAAATTGGTCTCTCTACCTATTATTAAATTAATATTTTAGATTTTAAACTAATTATATTAGTCATTATAAAAAATTTTAGTACCGAGAACCGTAGGCTTGTTCAGCTAATTGATGATCATTTGAGTTGTGGAACCATCATTGGAAATCGTTCCCAAGTCCATATTTGTAGAAGTATTAGAGGCTCAATGATTTCACAAACATCATGTTTTGTTGCTTTACATAGTTGTCTGTATTGCTAAGCCAAACACGCTCCACTCCAAGAATACTGTCTTGTTTCATGGAGATCGGCTAACAATGAAAGGAGCATCAGGTGTACGAAGTGACTTGATTTATCAGAAAACAAACTTCCACCCATCATCTGTAGTGTGAATGCTCGTGCATATCTCGTGAAACTTCCTCGTCTGCATCATCATTAGGCCCAGGAAATTGTGTCCCTAACCATATTAAACTTAAATTTGATCCCTTAATTTTATTAGCAAGTAGGGTCACACCGCGTAGCATTTGACAAATATGTAGTCAATCATCATGCAGTGCTCCAGTAATAGGCTTGCCATCAACAGGTAACGCAAAAAATACTTCTATACCGAAGGGAATTGAATCCCAGTGAAAGCGTGTGATCGTGTTCTTTGATTTCTTGAAAGAATTAAAAATACAAACAATTAAGGAAAGGTTAAGCAACTTACCTTTGCCGATCTATAATTTTAGCAAAATGTTCTACTCGAACCGATAATCTTCCCTATGACTCTGGCAAGGATTCGATTTGAGGGAACTGCTTCTTGAAAGAATGGGAAGAAGAATTTTCTTGGAATTTTTCTACGAAAATTGGGAGAATTTCTCAAGTAAGAGTCTTATAGAGTAATCGTAAAGATTATTTAGGGTGGGCTCCCAAGGACCATATTTATAGAATGGTTACTCCTAACCTTATTAGGATATCCCTGCGAAGATTTTAAATTAAATATTTAATAACATCCAATATTAATAAATATCTATCCAAATAATATCTCATATTAAATGTTTTAAAATATTTAAATCTTATTTAAATCTTTATCTTTTACAGAATTTTTAATTTTGATTCCATCCAAATTAAATAATTAATTATTTGAATCCAATTTAAATTAATTTATTAATTCTCCCTCTATTTATTTATATGGATTTCATCCAAATAAATAATTAACTATTTGAATTATATTTGAATAAACTAATTTTCCATATTATAAAGTGATAGTTTGAATCTTATTTAAATAAACTTTATAATAAATAATGTAATTAATTGTATCCATTACAATTAATTTTTCTTCATAAATTTGAACATTTCATTTTTTTCTTTCAACATAGTTGATCATTGTTGGTCCGTGGTGAGCTAGCAAAGGGACCTTATGAACCTAGAGATTATAAGCTCCAATGATCCAAGATTAATCAATTAAACTCTTTAATTAAATTAATCTTCATTCATTAATTACAGGGTAAACCACTAGAGACCCACAATTGAACTCTTATGCACGATAGGACAAGTTGTGTCCATGGATATAATCAATTTAAGCAAATCGATCCTTCACGAGTTGTTCATAATTACAGCTGTGTCACATGTTTGTAATGACCACTTTTCCTTAAGTACCATTGATTTCTCTAATGAACAATTTGTTTATGGTCTAACAATAAACTAAGTCCTTCTCGGGCTAATGAAAGGGTGAGGCCCCTTATTCAAGACTTGAAATCAGCCTTCAAGGGAACTACTCATTTACTTACCTATATGGGAAGGAGTAAATTCCATCTTGTAAAGTTATGTTTCCAGCTCCCCATTTAGTTAAATCCCTAAAATGGTAAGCTTATTGAGCCGGCAACTTAGGCCACTCTCGCCCATGCAAATCAAAGGACCGACCTCACAGACAGGAGTTCATAAGTCACTCAGGATTAAGATCGAGTCGCACATGATCATCCTATGAAATATTAATCTCATCAATTAACAGATTTACAAAGAGAGATTAAATATTTCGCGGTCCGGTCTTAAACAAACTTTTTGTATAGGATACCCCACTCACATGTCTCTACATGAACGGTTTAGATCAAACCATTTGTAACTATTACAAAGTGGGTCGTATCCATAGTGTCACTAGATAAGACACCCAACCTTATCCATATACTATAAAGCTTTAGGTTATTTCTTGAACATGATTCCTCCGTATGTCAATTAGATACATGTTCAAGACTTCATGTAATAATCTTAGATTTTTTCCATTAATGGATAAATTATTATTTCATAATTAATAACTAAATTAATTAACTAATCAATTACGAGCCTTTAGGGCACACATCCCAACATATGTTCTGTAACGTGATAGTGACTTCTCCACATGAAATGTATGGGTTTCTAGCATCTGTCTCTCAACCAGTGCAGTGATGAGGTGTCAATCTAATTGAATGAATCCCAATCTAGCAACCCCAAAAAATTCTGATGCTCGAAGTGGTGGTAGTATGCGACGGTGAAGTGGATAGTACGATAAACAACCGCCTCGCGACGTCTACAGTACATCTCGCCTGCAGTCCGATCTTGCCAAACAGTTGATGATCAATGAATAGATTGATCATATAAAATATCGGGATCAATTGGTTCTTGGTTTAAAGTTATGATCTAAAAGAATACAAATTATATATTTATCGAGTAAAACATACAAATAAATTAGAACTTAAATAATAAATTATATTAAAACCATAAAAATATTAAACACAGTAAAAAAATTAATCATAATAAAAGTATTAATTTTATTATAAAAACATTAATTACATTACACAAATATTAACAAAAAAGAAAAAAAAAAATCCTAACTGTATGGTGCCTGTCTTTGTAACAAAGGACACTTCCTTCGATTGTGACCTAGTTGATTACAAAATCCGCATCGTACTTGGTTCTGTCCAATCCATCTCATTATGATATTGTAAACTCTTTAGTCTACCAGGTTTCCTTAATAACGTTGGGTCGACATGTAGGACAGACATATTAGAAGGCGTGATCAAGTAATCTTTATGTGTTACATGTTGAAATTGAGGAGAGTAGCATGCAACGCATATCGACAATTTATAGTAGTTCTCAATAAA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MVENCDLNGLIVARRDAHGSAAVQRSFLYSLSLEQKSSSGKMATLLLPFFIFFFFSISPAQSTSSQPQAAPKSLSIGSIQKAGDCNYKVNITTSCSSPFHISAEIGVLFGDAHGNQIYEPKLEVESSNAFSKCSKDTFDLIGPCTDQICFFYLYKNGSDNWIPETVEISSPDIDTVKYKYNSSIPNDTWYGFDDCQYFPSPSPPPPPPVPSAAGFLPRWKWLASLIPVLLSSAFSKFFFSKHSSTLKPKKKEMKGVLCFLLTSAILFPLLEATELLPQPAESFNLTYIQQLGSCSYSVVISTSCSSPSYTRDQISLSFGDAYGNQIYVPRLDDPSRRIFERCSSDKFGLNGPCAYQICYVYLYRSGPDAWIPTTVTISGDHSRPVTFNYNTAIPNDVWFGFNLCGHASSSNRSSSCIGFLYVILVSTLLLLL Homology
BLAST of CcUC05G090230 vs. NCBI nr
Match: KAE8650438.1 (hypothetical protein Csa_009650 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 453.8 bits (1166), Expect = 1.7e-123 Identity = 257/407 (63.14%), Postives = 280/407 (68.80%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. NCBI nr
Match: XP_038877430.1 (embryo-specific protein ATS3B-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 359.8 bits (922), Expect = 3.4e-95 Identity = 174/194 (89.69%), Postives = 181/194 (93.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. NCBI nr
Match: XP_008439124.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484014 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 349.7 bits (896), Expect = 3.5e-92 Identity = 170/202 (84.16%), Postives = 180/202 (89.11%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. NCBI nr
Match: XP_038877434.1 (embryo-specific protein ATS3B-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 4.0e-88 Identity = 165/180 (91.67%), Postives = 170/180 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. NCBI nr
Match: XP_004148122.1 (embryo-specific protein ATS3B [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 332.8 bits (852), Expect = 4.4e-87 Identity = 160/181 (88.40%), Postives = 170/181 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NPM5 (Embryo-specific protein ATS3B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATS3B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 203.8 bits (517), Expect = 4.1e-51 Identity = 100/161 (62.11%), Postives = 118/161 (73.29%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q681K2 (Embryo-specific protein ATS3A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATS3A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 2.7e-39 Identity = 73/138 (52.90%), Postives = 94/138 (68.12%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LYP6 (Embryo-specific protein ATS3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATS3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 110.9 bits (276), Expect = 3.6e-23 Identity = 57/139 (41.01%), Postives = 89/139 (64.03%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AXL4 (uncharacterized protein LOC103484014 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484014 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 349.7 bits (896), Expect = 1.7e-92 Identity = 170/202 (84.16%), Postives = 180/202 (89.11%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L5P4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G177980 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 332.8 bits (852), Expect = 2.1e-87 Identity = 160/181 (88.40%), Postives = 170/181 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AXZ5 (uncharacterized protein LOC103484016 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484016 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 332.0 bits (850), Expect = 3.6e-87 Identity = 161/181 (88.95%), Postives = 169/181 (93.37%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E5E8 (embryo-specific protein ATS3B-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 330.1 bits (845), Expect = 1.4e-86 Identity = 162/193 (83.94%), Postives = 170/193 (88.08%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L8G7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G177970 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 329.3 bits (843), Expect = 2.4e-86 Identity = 162/201 (80.60%), Postives = 174/201 (86.57%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. TAIR 10
Match: AT5G62200.1 (Embryo-specific protein 3, (ATS3) ) HSP 1 Score: 203.8 bits (517), Expect = 2.9e-52 Identity = 100/161 (62.11%), Postives = 118/161 (73.29%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. TAIR 10
Match: AT2G41475.1 (Embryo-specific protein 3, (ATS3) ) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 1.9e-40 Identity = 73/138 (52.90%), Postives = 94/138 (68.12%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. TAIR 10
Match: AT5G62210.1 (Embryo-specific protein 3, (ATS3) ) HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 1.0e-28 Identity = 63/155 (40.65%), Postives = 91/155 (58.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. TAIR 10
Match: AT5G07190.1 (seed gene 3 ) HSP 1 Score: 110.9 bits (276), Expect = 2.5e-24 Identity = 57/139 (41.01%), Postives = 89/139 (64.03%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G090230 vs. TAIR 10
Match: AT5G07190.2 (seed gene 3 ) HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 2.8e-23 Identity = 53/130 (40.77%), Postives = 82/130 (63.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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