CcUC05G089790 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACTCTTTGAAAACTGGGTTTTTCTTAGTCGGAGGCGATTTCGACGAATTTAAGATTTTACAGTCCAGAGGGCATTCCGCCCAATTCTCTGTTTCTCTCCGGCAAGTCGCGGCGGTCACCGGAAAACGATGCTCCTTACTCTACATTCAAACTCTCCGCCTGCTGACAACTAACCATGGACGCCGTCGTCTCCTCCGCCGTTGAAGAAATTTGTTCACAGGGTCAAAACGGACTCGCTCTCCGCAATCTATGGTCCAGGCTTGAGCCGTCTCTCTCTGCTTCCGGCCTCGACCTCTCCAATGGCGTCAAGGCTGCCGTCTGGAACCAACTCCTTCGCGTCCCATCTTTGCAATTCGAAGCTGGCAAGGGGTCTTATGATGCTATGGACCCATCTATCCAGTCCTTCGAAGATGCTGAAAGGCTGAATTTGAAGGTTGTGGCTAAACAACATCTGAGGGATAGCTTTGTAGGGCTCTACAATGTGCGATCAGCCAGTTCCAACATGTCTGCCCATCAGAGACGCGTCCTTGAGCGACTCGCAATTGCTAGGTACGCTACTAACAACTCTTGTTTGCCTCATTCTGTCTTCTGCATTTGATGTGCATGTATATATATGCTCTTCTGTTTACGTTTTTGGGGCTCTGTTATGGATACCTATGATTAAACGTTCATCATCATCCACATATGGTGCAATGCACACTTCTTGTTACCCATTTGAAATTTTAGCATTATAGGCCGAGTTATGTATTGCCGAGATATGTATTGGAATGATCTCCATATCAGTTATTTTGCCTAATGGGAGATGAGAACTTCATTGTTGGCTATAAATATGATGGGTTCCCAAAAGGAGAATTTGCCATTAAGGAGCAGTCCAAGACATGAACTAGGCCAAGAGACCTTTTTACAACCGGCAATAAAGGCAAAAACAGTCCATCAAAGAGTTGCAATTTAGCTTTGATTGCCATGATTGATGTTAAGACCCGAAGCTTGTTTAAAGGTCTTTTGTTTGGATAAGAACAATAGCTTTCATTAAGAAAAAAATGAAAGATACATGGGCATATAAAAAACCAAGCCCACAAGAAAGAAGGGGAATCCCTCTAGAAGAAAAGACTCCAACTATACAAAATCATATCATTAATTCAATGAAGAAGGAACAACAACTTTGGTTTTTATGTATTTGCTTTTGTTGAAAGAGATGGACCACAGAGGAGGTGGCAAATGTTCTAGCAGGATTGGTAGATTCTTACTCTCAGTAGATTGGGTTGAAACTTTTGGTAGTCCTAGACAGACATTGAGTCTGAGTGTCACATCAGATCATTGACCCATTGTCTTGACCTTGGGTACTCAAAAGTGGGGCCTGAGCCCTTTTCAGTTTAAGAACATATTTCTTGAGCATCCTTCCTTAAGGGGAAATTTTTCTTCTTGGGGGGATGTGACTGTTCAAGGCAATTGGAAAGGTATCACTTCATGGAGAAATTGAGATTATTAAGAGGGGTTCTAAAGTCGTGGAATAGAGAGGTTTTTGGAGATGTTAAAGTCAAGGAACAAGAGATCTTAAACAAGATCAATGTGATAGACTTGAAGGAGTTGGAGGGTCCTTTGGATGTTCCTCTACAAGGGGAGTTCGCAAAGTTGATCAGAAAAGAAACCATGAGTTGGCGACAAAAGGCCAAAATGATGTGGGCTATGGAGGGGGATTGTAGTGCCGCCTTTTTTCAGGGTGGCTAGTGGCAGGGGGAATAAGAATAGTTTTGGCCCTTGATTTTGGATAGTGGGGAACTTTCCCATGATGAGAAATAAGTTAAGGAGGAGGTTTGTATCTTCTTGTATTCTTTCATTTTTTTCTCATTGAAAGCGGTTATTATAAAAAAAAAAAAAAAGAGTAAAGAGGAGTTTGTTTTTTTCTTTTCCATGACCCACTAGTGTATCCTAAACGTTTGTTTTGAGTATAGATTAATGTCCTACTTATGAGAGGAAAGGTGATGAGTTGGTGGCTTTGTTTACTTTGGAGGAAATCAAAAGAGCAGTTTTTGGGAGTGACAAGAGTAAGTTGTCGGGCACAAAAGGTTTTTCATTGGTTTGTTACCAAGACAATTGGGATCGCTTGTAGGGGAGTTGGAAGGTGTGTTTAAAGAATTCTTTGACAGGGATATATTGAATAACTCTATCTGAGAGACATTTGTTTGCCTCATTGTAAAGAAGGAGAAAGCTAATAAAGTTAAGGAGTTTAGCCCCGTCTTAGAATTATCGTGTACAAAATCTTGGCTAAGGTCCTAGCTAACTGTCTCAGAAAAGTGTTCTCTTCGACGATCTCTAAGACGCGAGGAGATTTTATTGCAGGAAGAAAAATTTTAGATCAAGTCTTCATAGCCAACAAGGCCATTGAGAATTATAGAGCCAATAAGAAGTAACGAGTGATTTTCAAAATTTTAAGAAGACTTATGATCATGTAGATTGGGACTAGGGTTCAGGTATAAATGGAGGTTGTGGATGTGGGGCTATGTTAGAAACTTGAGTTACTCTATTCTCATTAATAGGAGTTTAAGGGGTAAGATTAAGGCTTCAAGGGGTCTTAGACAAGGGAATGCTCTTTCTCCCTTCCCCTTTTTGCTTGTTGTAGATGTGTTGAGAAGGCTCGTCTTTAAGGGTCTTGAAGGTAATATTATTGGACCCTTTGTGGTTGGGAGGGGAGGAGTGGCTTTGTCTCACCTACAATTGGCGCTATATATATATATATATTTATATTTATATTTTGTTTAGTAGAGGAAGATCTTGTCCTGATTCTTAACCCTTTGGTGGGGTTCTTTGAGCTTGTGTTTGAGCTAAAAATTAACATTTCTAATGTTAGATTTTGGGGATCAAATGTGATTAGGAGAAGCTTAGGCATTGGGTGGACTTGATTGTTTGTGATATTGGTTCCTTTTCCTCTTCCTACCTTGGTCTTCCTCTTGGACGTAGCCTGAAATCTATCTCTTTTTGGTATCCAACAGTTGAAAAGATCAAGAAGAGATTGACCTCTTGGAAGAAGAACTTTTTCTTCAAAGTTGGTAGGCTTACTCGAATGTGGTTAGAAGTATTCCTATTTATTATTGTCCTTTATTTTTGGGGGCCCGTGCTCGATTTGCAAAAGCATTCAGAAGCTTACGTGGGATTTTCTTGTAGGGGTGGATGAAGGAAAAGGTTCGCATTTGGTTAGATGAGAGGTCACTCGAGAAGCCTATGAGTCGGGGGGGGGGGGTGGTGTTGGTGGGTGGGGTTAGAGATGTGAAACTTAATGACTCATAACAAATCCTTGTAGGCTAAATGGCTGTGGTGTTTCCTTTTTGAGCCTGAATCTTTATGGCATAGGGTTATTGTTAGCAGTCATGACCATCATCCCTTTGAATGGTCATTGGGTGGGGTTAAAGGCACTTTTTGGAACTTGTTGAAGGTTATTTCTCATGTGCTCCCATCCTTTTTCCATTTTTTTTATTGTGTGGTTGGGGAAGGTAAGGAACCATATTTTGGAAAGATTAATGGGTGGGGGATAGACCTTTTTGCTTCGCGTATCCTTGTTTATATCATTAGCCTTCCATTAAAATCGTTTAATTTATGATTTTTTGGTTTTTTGTTAGGGTTTTGTCGTTCATTGACCGATAGGGATACGATGGAGGCTGTCTCTCTTCTATCTCTGATGGGAGAGTTTGATTTAAACTTGGGAGAAGGGATATTCGTGTTCGGAGTCTTGCTCCCTTTCCCATTAGGGAGTTTTTCAACATTTGTTGGGTCCCTTTCCCATTAGGAAGTTTGTATTTGATATTTTGTGGAGGATTAAGATTTTGAAGAAAGTGAAGTTTTACACCTGACGAGTTTTACTTTGTTGTGTGAGCACTATGGATTGACTTTTGAGAAAGATGGTCTCCATTGAGGAATACCTGGATCACTTGCTTTGAAGTTGTGAGTTCACGAGGTTTGTGTGGAACCACTTCTTCCAAAAGTTTGGATTTATGTTGGTCCCCCAAAGGGATGGTTAGTAGTTTGAATGGGGTGTTCCTCTTCCATTTGCCTTTAAGAGAGAAAGATCGTTTTCTGTGGTTTGCTGAGGGGAGGAACTTTGATTTCAACGATTTTTTGAATTATTCTTTAAGTTACATTTTTACAACCTTACTTGAACAAGATTTGTTTTATAGGTTGTACAACTGTGTCCTTGAGTTTTTTAGGTTGCATTTTCTTAGTTGGTCCCCTTTTCTTTAGTGGCGTTTTTGTAGGCTTGATTTTTTGTATGCCCTTGTATTCTTTCATTTTATCTCAATAAAAGTCTAGATGTTGAATGTTTGAGTGTGATTCTATATCAACGTAGGGATCGGTTCCACCAGTTAGAGACAAAAAGCTAAAGTTAAAGTGAAATGTGCCAAATAGGGGGATTACAACATTGTGTTTGTCCATAGGCAGACAGGTGCAAAAGTAAAAGTTTCATTAGGTCTTTGCATTCTGATATCTTAAAGGAGAAAGGCACCTTGGACTTCCCCTCTTGCTTGGAGGAGATTAGAAAAGTGGTTTTGAGTCGATAGGAACAAGGCCTCTAGTTTAATGGGTTCTCTATGGCCTTCTTTCAAGATAATTGGGAAGGAATGAAAGATGACCTTGAGCGGGTTGTTAAGGATTTCTGTGAAAGAGGGATCTTGGATGGCACCCTAAATGGGACCTATGTTTGCCCCATCCCCAAAAAGGAAAGAGCAAATAAGGTTAAAAGACTTCATGCCCACTATTCTCATTACGAGTGCGTGCAAAGTATTTCTAAGGTCTTAAGTAATAGACTGAAAAGTGTTTGCTCTTCCACTTACGAGTGTGTGCAAAGCATTTTTAAGGTCTTTAAGTAATAGATTGAAAAAAGCTCGCCCTTCAACAATATTAAAGGCCCAGGGGCATTTATGACGAGGAGTTAGTTCTCATTGTTACTGAGGCTATTCAGGATTAACGAGAAGGTTTTATCTTCAAGGTTGATTTTTAGAAGGC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CTTGACTTCGATAGCTGGTTCCAAAAATCGTGTTACTCCATCAGTGGACATGCATGGGAGAAGTGATAGCCAGATGGTTTCGCATCCAGAAAATTACAATGTTGGTAGAAAAAATCCAGAAAATCACATTTCTGATGGTGCAAATTCTCAGAAGGAAAATAACATGATTGTTGATGAGGTTCACAAAGTAACGGTTCTCAATCTTCCTCCAGAAGTTAATGACAACACAAAAGAAAGTAAAACTAGCAGCATTCACCAACGCAGTCCCATAGATAAAACCATATTAACTACAGTAGGGAATGAGGATGGACTGTTTTGGCCCTCTTCTGGTGGTTCGAATATGCCAATACTCCCATGGATAAATGGAGATGGGACAACTAACAAAATTGTCTACAAGGGGCTTAGAAGGCGGATGTTTGGAATTGTAATGCAAAACCCAGGAATAATGGAGGTTGACATTATACAACGGATGAACGTCTTGAACCCCCAGAGTTGTAAGAAGCTGCTAGAGTTGATGATGTTAGATGCTCACATCATAGTGCGGAAGATGTATCAAAGTACGTTCAGTGGGCCCCCCGGTATTCTAGGGACTCTACTCAGCAGGAGCTACAGAGAATCGAAGTTTGTTTGCCGTGATCACTACTTTGCAAATCCCATGAGCACATCATTGCTATGGTTCATGGAATCTCATGAAGGTAGCAAAGTGACACGGTATTATGACGACAACGAGACAAAGGATGATGAGGTGATGAATATTTGCTGGTGCCCCACACACTAG MDAVVSSAVEEICSQGQNGLALRNLWSRLEPSLSASGLDLSNGVKAAVWNQLLRVPSLQFEAGKGSYDAMDPSIQSFEDAERLNLKVVAKQHLRDSFVGLYNVRSASSNMSAHQRRVLERLAIARKNGVTQNQLAKEFGVEGRNFFYVVKSLESQGLIARQSAVVRTKEALSTGELRNSPIVSTNLMYLHRYAKHLGCQQKLEITVEENNIEQLGDPVESAAAVEDGLPGKCIKEDVLVKDYLPKMKDICDKLEAANGKVLVVSDIKKDLGYTGSSSGHRAWREVCNRLERAGIIKVFEAKVNNKFDCCLRLLKKFSPKCFETSTTLGKDISGYKYHMKFGRKCQVTDQLTELAIENQIYDMIDAAGFEGITVMEVCKRLGIDHKRNYGRLVNMFTRFGMHLQAETQNKCTVYRVWTRGNFKPEYNNQYFHKPTAVNNEIENCNNHVVNVDDSKCSPQMAIQDHNAYDLKRLVQTSPYGCTKSENTILNVDGACRRKTEDGEMNTEVSHKLHGNGESDLRGNHLARESVFQPTCSIPAVGLSSANTVVETVSGSTTSPSALLRTSISAPYQKYPCLPLTVGSAWREQRILERLQDEKFILKGELHRWIIDQETDKSTTTDRRTIFRSINKLQSEGHCKCIDINVPVVTNCGRTRITQVILHPSIETLSPQLLGEIHDKMRLFEAQSRGHNSKKVKKRGLVPVLEGIQRIEHYMDPDVASIRSEAMRANGFVLAKMIRAKLLHCFLWDYLNCSDGSDGTSSSDMFVHDLKNLHTSYKPFLLEDAVRSIPIELFLQVVGSTKKFDDMLEKCKRGLSLADLPPEEYKHLMDTNATGRLSLIIDILRRLKLVRFVAASPGNVNDHGHATLKHALELKPYIEEPVSNDATRSLITRGLDLRPRIRHDFILSSKQAVNEYWQTLEYCYATADPRSALLAFPGSAVRETFLFRSWASTRVMTAEQRAALLELVARRDLREKLSYRECEKIAKDLNLTLEQVLRMYYDRCQQRLKSFDEGTGNESGQKIKRHSPEGKKIPKERSGKRARHDVVSKLLDGTRVTTFPENSISSIDEDKQLAANSGDQNIPLQEIFEDDDHLETVEEFGSNEEGEGNCSVASSMMKPTRQRRFIWTDETDRQLIIQYVRYRAARGTKFSRTNWCSISNLPAPPGTCRKRIAWLNGSIRFRKLVMRLCNILGKRYVKYLEKSKYASVHQDDPKLILTSSEGKGLNIGGSKHYSEDPQEQWDDFDDKDVKMALDEVLHFKKMTMLGDSKRVGSVYGDFVDANSADLEGKQHKFSRGRSKARCFHRRLMKILNGRHVTKEVFESLAVSNAVELFKLVFLSTSTTREVPNLLAENLRRYSEHDLFSAFSHLREKKIMIGGTNGDPFVLSQSFLHRISKSPFPANTGERASRFSKFLHERDKELVENGIDLPADLQCGDIFHLFALVSSGELSISSCLPDDGVGEPEDVRSLKRKVDSEHWGDTSAKKLKFGPADGEIISRREKGFPGIMVSVCHATILRTDAVELSNSWNCVDDQYIGGNDRFCVPPTDISISFDHMESGYDTDGVVSLLGNHCESTWQAMTAFADHLMSVGCDQQGSIISPEVFRSVYSAIQSAGDQGLSMEEVSQVANVQGEKLAQLIVDVLQTYQRVLKVNSFDSIRVVDALYRPKYFLTSIAGSKNRVTPSVDMHGRSDSQMVSHPENYNVGRKNPENHISDGANSQKENNMIVDEVHKVTVLNLPPEVNDNTKESKTSSIHQRSPIDKTILTTVGNEDGLFWPSSGGSNMPILPWINGDGTTNKIVYKGLRRRMFGIVMQNPGIMEVDIIQRMNVLNPQSCKKLLELMMLDAHIIVRKMYQSTFSGPPGILGTLLSRSYRESKFVCRDHYFANPMSTSLLWFMESHEGSKVTRYYDDNETKDDEVMNICWCPTH Homology
BLAST of CcUC05G089790 vs. NCBI nr
Match: XP_038903712.1 (uncharacterized protein LOC120090216 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038903717.1 uncharacterized protein LOC120090216 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038903723.1 uncharacterized protein LOC120090216 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038903732.1 uncharacterized protein LOC120090216 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3463.3 bits (8979), Expect = 0.0e+00 Identity = 1744/1894 (92.08%), Postives = 1800/1894 (95.04%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. NCBI nr
Match: XP_038903737.1 (uncharacterized protein LOC120090216 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3411.7 bits (8845), Expect = 0.0e+00 Identity = 1724/1893 (91.07%), Postives = 1778/1893 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. NCBI nr
Match: XP_008439073.2 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103483968 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 3252.6 bits (8432), Expect = 0.0e+00 Identity = 1663/1894 (87.80%), Postives = 1738/1894 (91.76%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. NCBI nr
Match: XP_011651113.1 (uncharacterized protein LOC101216506 [Cucumis sativus] >XP_031737978.1 uncharacterized protein LOC101216506 [Cucumis sativus] >XP_031737979.1 uncharacterized protein LOC101216506 [Cucumis sativus] >KGN57251.1 hypothetical protein Csa_010118 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 3250.3 bits (8426), Expect = 0.0e+00 Identity = 1660/1893 (87.69%), Postives = 1729/1893 (91.34%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. NCBI nr
Match: KAA0067657.1 (B-block_TFIIIC domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 3197.1 bits (8288), Expect = 0.0e+00 Identity = 1629/1821 (89.46%), Postives = 1696/1821 (93.14%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AXU5 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103483968 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483968 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3252.6 bits (8432), Expect = 0.0e+00 Identity = 1663/1894 (87.80%), Postives = 1738/1894 (91.76%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LAZ9 (B-block_TFIIIC domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G174540 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3250.3 bits (8426), Expect = 0.0e+00 Identity = 1660/1893 (87.69%), Postives = 1729/1893 (91.34%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VKG0 (B-block_TFIIIC domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold70G00260 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3197.1 bits (8288), Expect = 0.0e+00 Identity = 1629/1821 (89.46%), Postives = 1696/1821 (93.14%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I478 (uncharacterized protein LOC111470808 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470808 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3046.1 bits (7896), Expect = 0.0e+00 Identity = 1555/1908 (81.50%), Postives = 1682/1908 (88.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F242 (uncharacterized protein LOC111439088 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439088 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3033.4 bits (7863), Expect = 0.0e+00 Identity = 1550/1908 (81.24%), Postives = 1681/1908 (88.10%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. TAIR 10
Match: AT1G17450.2 (B-block binding subunit of TFIIIC ) HSP 1 Score: 1444.5 bits (3738), Expect = 0.0e+00 Identity = 871/1932 (45.08%), Postives = 1174/1932 (60.77%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. TAIR 10
Match: AT1G59453.1 (B-block binding subunit of TFIIIC ) HSP 1 Score: 1335.9 bits (3456), Expect = 0.0e+00 Identity = 810/1904 (42.54%), Postives = 1132/1904 (59.45%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. TAIR 10
Match: AT1G17450.1 (B-block binding subunit of TFIIIC ) HSP 1 Score: 1246.9 bits (3225), Expect = 0.0e+00 Identity = 804/1915 (41.98%), Postives = 1091/1915 (56.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. TAIR 10
Match: AT1G58766.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: B-block binding subunit of TFIIIC (TAIR:AT1G59453.1); Has 63 Blast hits to 58 proteins in 18 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 6; Fungi - 0; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 495.0 bits (1273), Expect = 2.8e-139 Identity = 301/715 (42.10%), Postives = 422/715 (59.02%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G089790 vs. TAIR 10
Match: AT1G59077.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: B-block binding subunit of TFIIIC (TAIR:AT1G59453.1); Has 63 Blast hits to 58 proteins in 18 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 6; Fungi - 0; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 495.0 bits (1273), Expect = 2.8e-139 Identity = 301/715 (42.10%), Postives = 422/715 (59.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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