CcUC05G088200 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC05G088200
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr05: 5905166 .. 5909294 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC05G088200
SyntenyCcUC05G088200
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGAGTTATTTTAGTTACTTCATAAGACATTTCTTTGTATCGATTGAAATTAGTTCAAACAAAGGAGGGAGATGATCGAAGAGTTTTTGTTTTCGTTGTTTGAGGTGTGAAGAAGACAGGTTGAACTTTAAGCAATATATATTATATATTTTTGAATCAAGTCAAATCTTTCTTTTATCTTCTCTTATCTTTTCACCGCTCTTTTAATTTTAGTTTTCGTTTTTATTTATATATATAACACCCTTGTATTTTTCCCTCCGGTTTCTAATAATAAAGTAAAATATTATTTTAGTTCTTTTACTTTATTCAATTTTAATTTTTAAACTTTTTAATATTTAATTTTAATTCATAAAATTTCAATAAATTTAAATTTAGTCTCTTCAAAAAAAATTGAAATTGGCTAAATAATTATAATAATTTTTATATAAAAAATATAATATTTTATTATGGTTTTAAAATTTATTGCGATAATGTTAATAAATTTTTTAAAAAATGTCTTGAAAAAAATGAAAAATAAACAAAGAAGACGGACTAAATAACAATTTAGGTTAAAAATCACTTTTAATTCCTAAACTCTTGTGAAAGTAACAATTTAGTTCCCAAGCTTTCAATTTTGTAACAATTTAGTTATTGGACTTTATTGTGTAACAATTTAGTCATTGTACTTTAAAATTTGCATCAAATTATTACCCATTGTGGAAATTAAATATTTCGATAAACTAATTAGATGCTCAATATTTTTATAAATACAAAGTATACATCAAATAATAATAATAATTGATATCTAATTTTGATTAAAAAAAATTACGTCAAGGACTAAATTGTTACAAATTTGAAAGTACTATGATTAAATTGTTACATAGTAAAATTTAGGGACCAAATTGTTACAATATTAAAAATACATAGACTAAATCGTTACAAACCAAAATTCAATGACTAAATTGTTACTTCCATTAAAATTTATGGACTAAATGTGTTTTTTAACCATTTTTTTTTAAATACAAAGACTAAAGCTGGACATTTGAAAGTATAGAAGTTGAAATTAAACAAACATTCGATTATAGAGATGAAAATTGTATTTTTACTTATTAATAATAATATGTTTAAATGTCATTTTGATCCCCAAATATTATGAACTTGGTTCAATTTTAATCTTGTATTTTCAAATTTGCAACTTTAGCATTTATACTGCTTATGCATCTTAAATAAAATCTCTCAAAGTTAGCTTTTATCATGATTGACTAAAAAATAAAATTAATATTTATGGAAGAAAATATAATATATATGTGAATATGTTTTCAAATTTTATAGTGAAAATGCTAATGGATAACAAAAATTTTTTTAAATAACTTAACAATAAACAAGCAAGAGAGACTAAATTTAAAATTTATTGAAAGTACAAAAACTGAAATTTGATAATTAAAAATATAGAAACGAAAATTTAACAAACTTCAAAGCATATGGATTAAAAGTGTATTTGAAGCTAGTGATAATTTAAACCGTCAAATTAAAAAGAAAAAAAAAGGTTTAGTGTTTTTTAAGGAAAATTATTTTAAATTACAAAACTTTTGAAAATAATTACAAATAATAACAAAACATCACATTATACATGAGATAAATCATGATAAACTACTATTTTTGTCTAACATGACACAATGGACACCATATATCTCGTACGACCACCATATAAACCCAATTGGTGGATACATCTCATTGGCCAATGATCTTCCTCATGGATGACTGTTTAGTGGAATATCATAGTCAATACTTGAAAGATTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAGTCAAAACTAAGTATACTTTATTTTTCTCAGATTTGGTTTATTGAAAATAAAGTTTTTGATGGTAAAAGAAACAAAATTCACATTGATTCAATTTTGAGGTAAAATAATGTAAAAATTTAATAAAAAAAATGACATTGACACGTGAAACTATATAATTGCATTCAGTGAGAATCATAAAACTGGAGAAGAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAACATGAACCAACGTAGCTAATTCCTCTAAGAAAAACCAAAATTGCATCGAAATGGTGCAAAAATAGAATACCCTTGCTACCAAAATTTCGAAATTTCAATGGAAATTTTTCACCATAACTCACAAGGAAGTATGACATAAGTAGGGGGAGAGGTGAGAGAAAAAACATAGAAGAGCAGAGAGATGGGGGATGGAAAAAGTAATTACAAATTGCATTCACACTCATTTTATAATTAAAGACAATTTCATGTGTATCAATATTTTTAACTTTTATTTTTCAAGTTTATAATTGTCCGATTGAGCATAATAACGGAAACAAAATTTTGTATTTCTTCTAAGAATAAGTAATTTAATTTTAACTTTTGGTTTTCTTTTTTTCATATTTAAACAATTATAGTAAACATAATAACCAAAACAAATTTTGTATTTTTCAGTATTAGTAATTCAATTTTAAACTAATGCATATCATCTCATAAAAATTTGGACTCTTTTTAAATATAGTAAAAATAACTAAAATATTTATAAATATAACAAAGTTTTACTTTCTATCTGCAATTGATCACAATAGACTGTGATATTTTGCTATTAGTTGTAAATATTTTTCACAATTTTGTCATTTAAAATAATTTTCATATAAATTATACCTACCATTCCATAGAATAAATAAAATATAAATAATTTTGTTTTTCTTTGGTGGCCCACATTTCATTTTAAAATGGTTTCTCCTACAAAAGATATTAAAGCTTTTTTTTTTTTTAATATATAAAAAAATTAAATTAAAAGTTTTTGTTATTTATAACCAAAAAAAATTGAATCATGACAAAATAGAGTTACGAGATTCCATAACTTTATTGTCACCAATAAAAATGTAGCATTGTTATCTTTAAATTTCAAATTTTATTCCAATTACATTATATGTACATTAATTTTATTCATATATATATATATACTTTTAAATTTCACGTCAAATATTTAAAATTTAAACTTAATTATAAATATTTTTATTCAAAATTTTTATTTCTTAGTTAAAATTTAAAGTTTTCTACCACAACCCACCCATTTCATTTATATTGAAAAACAACTTAACACAATAAACACATAGGTTTAAATACTATTTTCTTTAATTACTTAACTTAATTAAAAAACATAATAACTAAACTTAATCAAAAGTTAAAATTTATCATAAAAATTAAGTCATTAACATTTTAAGTTACATACATGTCTTCCAACGTGTATAACAATAGAAAAAGAGTTAGATTGATTTAAGGTCAATTTACCAATTCATAATAAAAATTGGTGTAATTATATTGAGATTTATATGAAGGATGGATGGTAATAGGTCTAAATCGCAAACATAATTTGACTGTCTTTGATCGCGTTTAATTAAAATTATGAATCTGTCAAATTTTACTATTATTGTTACTATTGTCTCTACTACTTGACTCTAATGATAATGGCGAAGATAATAAATGTGATAAACTCATAATTTTCATATTTTTACCGTAATAATAATTGTAACGATAGTAGGTCCCACAATTAATTACGATTGCACAATAGTTAAATAGCAACAAAAATAATTAACTAGAGCCACCTTTTTACTTTACCATTGACGGATTATGTTGACGTAGAGATGGAAAAGAAATTACAAGCAAATACATCATTTAACAAGTATAATTACAATATTGCCCCCGAGTATAATAACACTGTAAATAAATACTTAAAACAATTTGATATTTGTATAATAGACAAAGAGAAATAAGTAAGAATTCAAAACTTTTCAAAGAAAAAAGAAAACCACCAAAATCATCACCTACATCGAGTAATGGCGCTGCACCCACGAGAGTACGGATTCGCCGGAGCTCCAGCCTGGCAATTGTAATACGACGCGCCGCGTCGGGAGCACGGCACCGAGTTCCTCCGCATCGCACTGTAGCTAATATAACGCCTCGTAGTCGCCAGAATCCGGCGGCTGATCTCCGACGGTATCTTGAACTCCGCCGCCAACTGGCACTCGGCGATCGATCCCGATCCTGAACGACAAACAGATTCCTGCGGAAGGTGGAGGAACTGGCGGTCTCCGGTGAAATCGACGGCGGTGGATGAAGAGAGGGCCAGATAG

mRNA sequence

ATGGAACAAAGAGAAATAAGTAAGAATTCAAAACTTTTCAAAGAAAAAAGAAAACCACCAAAATCATCACCTACATCGAGTAATGGCGCTGCACCCACGAGAGTACGGATTCGCCGGAGCTCCAGCCTGGCAATTGTAATACGACGCGCCGCGTCGGGAGCACGGCACCGAGTTCCTCCGCATCGCACTGTAGCTAATATAACGCCTCTCGCCAGAATCCGGCGGCTGATCTCCGACGGTATCTTGAACTCCGCCGCCAACTGGCACTCGGCGATCGATCCCGATCCTGAACGACAAACAGATTCCTGCGGAAGGTGGAGGAACTGGCGGTCTCCGGTGAAATCGACGGCGGTGGATGAAGAGAGGGCCAGATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGAACAAAGAGAAATAAGTAAGAATTCAAAACTTTTCAAAGAAAAAAGAAAACCACCAAAATCATCACCTACATCGAGTAATGGCGCTGCACCCACGAGAGTACGGATTCGCCGGAGCTCCAGCCTGGCAATTGTAATACGACGCGCCGCGTCGGGAGCACGGCACCGAGTTCCTCCGCATCGCACTGTAGCTAATATAACGCCTCTCGCCAGAATCCGGCGGCTGATCTCCGACGGTATCTTGAACTCCGCCGCCAACTGGCACTCGGCGATCGATCCCGATCCTGAACGACAAACAGATTCCTGCGGAAGGTGGAGGAACTGGCGGTCTCCGGTGAAATCGACGGCGGTGGATGAAGAGAGGGCCAGATAG

Protein sequence

MEQREISKNSKLFKEKRKPPKSSPTSSNGAAPTRVRIRRSSSLAIVIRRAASGARHRVPPHRTVANITPLARIRRLISDGILNSAANWHSAIDPDPERQTDSCGRWRNWRSPVKSTAVDEERAR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 92..124
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..21
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..37

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC05G088200.1CcUC05G088200.1mRNA