CcUC05G081410 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAATCTGGAAACCCATGTGGTAGAAATACCACAGAATTTGACAGCATCAAACACATGATGATATTTACATATATATAGAAGAGAACGGTAAGTGCTCTTCCTTCTTGTGGAGTTGATATTCTTCTTCTTCATTCACACCATTTCTCTCTGACCTTCTTTCTCATCTCAATGCTGTAATTCTTCTCCAACCCTTTTCCCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCAAAACCACATTATTTCTCTCTCTTTCATTCTGTCTCTCTATGTATATGCCTGTGGTTAATTGGTGCACAACAGTGGAAAGTAAAATAGGGGAGAGAGGTGGACACATGCTTTGAGGGTTTGAGCTTCCTCTTTGTCAAAACATTGCCTGAATTCTCTCCAACCCTTTCTTAGCTCTGTCCTTCCTCTCTCTCCCTTCCTCTCTTTGCCATCTACGCTCCCTTTTCATCTATTCCGTGCTCAATTGGGACGTTTTTCAATCAATCATATTCAATGTGTCGTGATTTGTTCTAAAAGGTTGAAGATTTCAGGGTTTACCGGCGGACCCAGATAGCAAAAACTATCAGGTTTAAGGAGGCGTCGTTTTTCTTTCCTATAATCAATCCATAAGGCAGATTAATTTTGTTCTTTGTTCTTTTTTCCTCATCCCATTGTCCACAAACTTGGGTTTTTTTGGTTCACATTAAGAGTTTTCAATCAATTGTTACGCAATCATAACTTCTTTCTTTGGAGGACTAGGGTTTTGAAGTAATAGCATAGCTTCGCGTGGGTTTGTATACCCCCATCCAGCGTCTTAAGGAATTCGGAATTTGGGTTGGAAAAGAATGGTTTTGTGTATAACTGTGTTTCTTTTTTGTTGTTCGAAATTTCCCTGAGGTTTGGGGTGGCAGTATCTGGGTTTCTGGGATTGGCTGGAACATGAATCGGAGGGTGAGGAGGAAGGTGACAAGAAAAGGGAAGGAGAAGCTGATTTTGCCAAGCTACCCTGAAATTGAAATTGAGATTGCTGATTTGGACAATAAACAGACTGTAGATTGGACTAGTTTGCCTGATGATACAGTCATTCAGCTTTTCTCTTGTTTGAATTATCGTGACCGGGCAAACTTGTCATCGACTTGTAGAACATGGAGACTTCTTGGTTCATCTTCATGCTTGTGGACTTCATTTGATCTTCGAGCACACAGAATTGATGCTGCAATGGCTGCTTCTCTTGCTTCTAGGTGCAAGAATCTTCAGAAGCTCAGGTTTCGTGGGGCAGAGTCTGCTGATGCAATAATTCTACTTCTTGCAAAGAATTTGCGTGAAATAAGTGGTGATTACTGTAGAAAAATTACTGATGCTACACTCTCTGCCATTGCAGCTCGACACCAGGCACTTGAAAGCCTCCAGCTTGGGCCAGATTTCTGTGAAAGGATCAGTAGCGATGCTATAAAAGCAATAGCTATTTGTTGTCATAAGTTGAAAAAACTTAGGCTTTCTGGAATTAGGGATGTCAATGCAGAGGCTCTCAATGCTCTATCAAAGCATTGCCCTAATTTGCTGGAAATAGGGTTCATTGATTGTCAGAATATAGATGAGATGGCCCTTGGAAATGTATCATCGGTTCGTTTTCTCTCAGTTGCAGGGACCTCAAATATGAAGTGGGGTGCTGTTTCACATCAGTGGCACAAGCTGCCTAACTTGGTTGGTTTAGATGTGTCACGAACTGATATTGGTCCTGTTGCTGTATCAAGATTAATTTCATCTTCTCAGAGCTTAAAAGTCTTGTGTGCCTTCAATTGTGCAGTTCTAGAAGAAGATGCTGGCTTCACTGTCAGCAAATATAAAGGCAAGCTGTTGCTTGCCCTTTTCACTGATGTTGTGAAGGAAATAGCTTCTTTATTTGTCGATATCATAACGAAAGGGGAAAACATGTTGTTAGATTGGAGGAATTTGAAGAATAAAAACAAGATTTTGGACGAGATAATGATGTGGCTTGAGTGGATATTATCTCATAATCTTCTGCGCATTGCTGAGAGCAATCAACATGGTCTGGACAATTTTTGGCTCAATCAAGGTGCAGCTTTGTTACTTAGTTTGATGCAGAGCTCACAAGAGGATGTTCAAGAAAGGGCAGCGACAGGTCTTGCAACTTTTGTTGTCATTGATGATGAAAATGCTAGTATTGACTCTGGAAGGGCAGAAGAAGTTATGCGGCGTGGTGGTATTCGTCTCCTTCTAAACTTGGCAAAGTCTTGGAGAGAAGGGCTTCAGTCTGAGGCAGCAAAGGTAAATTTCATGTGGATATACTAACTGGTAAATAAGCATATTACAAAACTTTTGTTGGTTTATTCGATTTTGATGATAATTGAGACATCTATTCTATTTGTACCCGTTGCTCATAAATATTACAATGCTAATATGAATTGTAGTTGATGGGTTTGAGCCAAAACAACTTTAACATGCTTTTCTTTTGATTGTGTAGGCCATAGCAAACTTGTCTGTGAATGCTAATGTTGCAAAGGCAGTAGCCGAAGAAGGTGGAATTGATATTCTTGCAGGCCTTGCAAGATCCATGAACAGGCTAGTTGCAGAAGAGGCTGCTGGAGGATTGTGGAATCTTTCTGTTGGCGAGGAACACAAAGTCTGATGTTTACATATTGTATTTTTCTCATTAGTAGCATGACTGGAGACTCTTAACCTCTAGTTCTGATAATGGATTTTTAAAATTAAAAATAGGGTGCGATTGCTGAGGCTGGTGGAGTAAGAGCTTTAGTTGATTTGATATTTAAATGGTCTTCTGGTGGTGATGGAGTTCTTGTAAGTTTCACCCTTTCATTATTTGTTTTTGATATCCATGAGTGGCTAGTTATTTTTGTTTTATCTTCATTCCCTTATTCTCCTTTTGTATTCCCCATTTTGGAAATGATGAATTAAGTTCCTCAGAAATCACAGATTTTAATTTCATTTTACATGTATTTTCAGGAACGTGCAGCTGGTGCACTAGCAAATTTGGCAGCTGATGATAGGTGTAGTACTGAAGTTGCTTTAGCAGGTGGCGTGCATGCACTGGTGATGCTTGCTCGCAACTGCAAGTTTGAAGGAGTGCAAGAACAGGTGACCACCCTGTTGAATAACAAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTAAAAAAAGTTGCATACTAGAAGTTGCATATTTTGATCATTCTGTAAGATTGAAGACCACATTTCCTCTTGATTGAAGTAACTTTAATTTTGGTTATTTTCCTTCTGAAATATGCATTTTCCTAAATTATTCTTGACATGGTATTATACTCCCAACAATGAATGCTATGTAAACCTTTAATTACCATTGCGTTATTGTCTATGGCTATGTATTTAAATTTCAAATTCTAGCTCTTTTGCCCCTCTAGAATGCAACCAAGGATGCGTGAATAAAGTGATGGAAGATGTTCTCGCTTTCTATCTTGCACATTGTGTGAACTCCAGTGATTAATTTGCTTTAAGGGCATTTCGTCAATGTCTTCTCTCTTGAAGGTTAGTAGGTTCGATTCAAAGATTTATTCGATGGATTTTGGTTAGATGATTTCTAGTGCCTTTGCCTTTTCCATCTCACTTCAATTTTCTTTGGTAGATGGAGAAAGGTTTTTGGCTATCATGTTTATGTTTCGACGTCGTACCTTAGTAACATTTTTTTGGGAAGAGTTGAAGTATGTGGGGAGATGATTTGGTGTTTAAGAGGCAACTAGTGTTTCGATTATGAGGTGTTTAACAATTTGATCATTGGTAAGGAATTGAATGAAAGACCTCCGGAAAATTATATGTTAACCTGGTCCTTGTGTAACTTACAGGTCAATCTATTCCTTACTCTATAGATTTATAGTTCCTAGCAATTAGAAGAGGAAGAACTATTATTTAGCACATCTTTTCATAAGGTCCTTACCTCCTTCATGGGAGATGTTGCCTTTGTAGTCCTTGTTTGTCTAAAGGCTGTTCCTACAGTTCTTTCTTCTCGTGTTTGGTCTGTCTCTCCCTGTCGAGGGTTCTATTTTCTCCTCTTTGTGGCAGGTGAATAACCTTTCCCAAGAAGGTTAAGTTTCTGTGTGGCAGGTTATGACAAAGGAGTTACACCTTGGATTCGATATCGACTGGGAGGCCTATTTTGGTCAGGCCACTTTGTTGTATTCTTTGTAAAAGGGTGGTGGCGCACCTCGATCATATTATCTATTGATGTGATTTTGCTGGTGCTGTCTGGAGTTTATTCTTGGAGGCGTTTGACTTTTATTGAAAGGGCCCTTGACTCTTGAACAAAGCAAAGGGATTGTTGGAGTTGTTGGCTTGAAATGCTCTTTGAGGAGGTGATCGTGGGAGCTATTTTCAGTTTAGGGGATCTTAAAGCAATTCAGAATCCCATGCTCATCTATTTATTCATTGTTCTTTTGCCTCTCGGTTCTGGCATATTATTTTGGATGCTTATGGTTGGTCAATGACTTATTCATGGTTCAAAGAAGACGGTTTGGTTGACCATTATTCGAGCTTTCTTTTGGACTTTAAGGGATGAGTGCAACAAACTAGAGACTTATTTTCAGTTTCTGATAGTTTTATGGATTTGGTTCTATCTACAGCTTTGTATTTGTGCAAAAATAGGCAACCTTTTTAACACTTCAGTCTTTCTTACTTACTTTCCAATTGAAAATTTCTTTTGTAATCACCTTTAGGTGCTTATTTCATTTTATCGACGAAATGTTGTTATCTAAAAAAAGTCGTAGGGGCTTGATGGTTTCAATGTTGAATTCTTAGGAAAAAAAGTTGGAACATCTATGAAACTGACTTTTTTAAGGTGTTCCAAGAGTATTTTGAGAACAGTATTTAAGGTATTCTGAATAAGAAAGAGTGAAAGACGGATGAAACATATATTTGTTTGAGCCAGAAAAGTCATATGATAGCAATGAGTAGGAGAATTTTGGCCCCTTAGCCTAGTCACATGTCTTGATGAGGTCGTTGACTCATTGGTCATTG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Match: XP_008437823.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103483139 [Cucumis melo] >XP_016898997.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103483139 [Cucumis melo] >KAA0048848.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold171G00620 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK20800.1 uncharacterized protein E5676_scaffold291G00610 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 789.3 bits (2037), Expect = 1.9e-224 Identity = 419/481 (87.11%), Postives = 445/481 (92.52%), Query Frame = 0
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Match: XP_031737513.1 (uncharacterized protein LOC101222847 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 745.7 bits (1924), Expect = 2.4e-211 Identity = 398/481 (82.74%), Postives = 426/481 (88.57%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. NCBI nr
Match: XP_023527403.1 (uncharacterized protein LOC111790643 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 714.5 bits (1843), Expect = 6.0e-202 Identity = 394/482 (81.74%), Postives = 424/482 (87.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L704 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G118120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 792.0 bits (2044), Expect = 1.4e-225 Identity = 417/481 (86.69%), Postives = 445/481 (92.52%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AUK2 (uncharacterized protein LOC103483139 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483139 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 789.3 bits (2037), Expect = 9.2e-225 Identity = 419/481 (87.11%), Postives = 445/481 (92.52%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U0V8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold291G00610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 789.3 bits (2037), Expect = 9.2e-225 Identity = 419/481 (87.11%), Postives = 445/481 (92.52%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IQ89 (uncharacterized protein LOC111479028 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479028 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 708.4 bits (1827), Expect = 2.1e-200 Identity = 391/483 (80.95%), Postives = 423/483 (87.58%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CVZ4 (uncharacterized protein LOC111014899 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014899 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 679.1 bits (1751), Expect = 1.3e-191 Identity = 371/488 (76.02%), Postives = 415/488 (85.04%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. TAIR 10
Match: AT3G59670.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G37440.2); Has 77 Blast hits to 77 proteins in 14 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 73; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 189.1 bits (479), Expect = 8.1e-48 Identity = 136/356 (38.20%), Postives = 202/356 (56.74%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. TAIR 10
Match: AT4G37440.2 (unknown protein; LOCATED IN: cellular_component unknown; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G50040.1); Has 121 Blast hits to 117 proteins in 32 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 13; Fungi - 5; Plants - 66; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 31 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 172.2 bits (435), Expect = 1.0e-42 Identity = 130/361 (36.01%), Postives = 198/361 (54.85%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. TAIR 10
Match: AT4G37440.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G50040.1); Has 220 Blast hits to 205 proteins in 55 species: Archae - 0; Bacteria - 15; Metazoa - 50; Fungi - 11; Plants - 76; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 65 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 2.1e-40 Identity = 143/445 (32.13%), Postives = 232/445 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G081410 vs. TAIR 10
Match: AT3G50040.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G37440.2); Has 70 Blast hits to 70 proteins in 12 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 70; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 2.2e-29 Identity = 89/252 (35.32%), Postives = 135/252 (53.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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