CcUC04G079610 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC04G079610
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr04: 33885784 .. 33892416 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC04G079610
SyntenyCcUC04G079610
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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TGTAATTTGATTTGATATCCCAAATTAATATTAACTTGCGATGCCCTGTTTCGCGGCGAAGTTGAAGAACGTCGACGGAGCGGCCAAATACTGGTTATTATTTCATCTTCGTAGCGGCGGAAAAGAGCGCCTGTTGGACGAATTCGGTAGTCTCTAGTTCGTCAATTTTTTTTCACTGTTTTTCCTGCACTATAATGATATGTTATTCACTTTCAATTACTACTATAGAATTGGAAGAAATCAAATCAGATTCTACGAACTGAATTATCTACATAAGTTTCAGAAAGGTAGTGCTAATTCTGCTTTTGTTCTGAATGGAGTTATCTATAAATGTCTCGACCACTTTCGTTTACACCCTTTAGCATGTAGTGAACTTGGTGCATTTTTCTCGTCTTCTTCTTGGAGAGATTCGAGTTTCGGTCGCAGTTTAAGAACTTACTGTACTGGTATTTATGGGAGAAATAATGGGCTTGATGCTGCAAACGACGAATTTCAGAAAATTGATTTGGAGGATTCCGGAGATTCGAATTTCTTTGGAAATCCTAATGAGGAACATGAAAAGGATCGTCACTTTAAGTTCGGTGATGATATAGAAGATGAAGAGTCTAATGAAGAAGAAGAGGAAGATGGGGATCTAGGCGATGCCGCGGATCTTTTGGGGTCTAATTTGTCTAATAAAAATCATGGACAAGGAAATGATTTCAAAAGAGTCGAAATTGGTGAAGATGTATTTAGATATCCCTTGGTGAGAGATACTTGTAAACTGATCAAGCTAAGTTCCTCTTGGAACCGGAAGTTTGAAGGGGAATTGAGGTATTTAGTAAGAAGCCTAAATCCACTGCAGATTTGTGCTGTTCTGCGCTCTCAGGAAGACGAAAGAATTGCTTTGCGATTCTTCTACTGGGCGGATAGATTGTGGCGCTACAGACATGATTCATCTGTGTACTTAGTTATGCTGGAGATACTCAGCAAGACCAAATTATGTCAAGGTGCTAAGCGGGTTCTCCGACTTATGACTCGTAGAGGACTTCTGCTTTGGCCCGAAGCTTTTGGTTTTGTAATGGTGTCATACAGCCGGGCAGGAAGATTAAGGGATGCAATGAAGGTCTTGACCTTGATGCAGATGGCAGGTGTGGAACCTAATTTGTCTATTTGTAACACTGCAATCCATATTTTGGTTGTGGGAAATGAGTTAAAGAAGGCATTGAGGTTTGCAGAACGTATGGCTCTTATTGGAATTGCTCCAAATGTTGTGACTTATAACTGCTTGATCAAGGGCTATTGTATCGTGCATCAGGTTGACCAAGCCATGGAACTGATTGATCAAATGCCATCTAAGGGATGTTCCCCAGATAAAGTTAGTTACTATACTGTCATGGGATTCCTCTGTAGAGACAAGAGGGTGAAGGAAATTAGGGAATTGATGAAGAAAATGCGTACGAACAGTAACTTATTACCAGATAACGTTACTTACAATTCCCTAATCCAGATGCTTTCAAAGCATGGCCATGGAGATGAGGCTCTAGAGATTCTTAGAGAAGCGGAAGAATTGCGATTTAAGGTTGACAAGGTTGAGTATAGTGCAATAGTTCATGCATACTGCAAGGAAGGAAAGATTAAGAAGGCAAAAGAGCTTGTTGGTGAAATGTTCTCCAAGGGCTGTGATCCAGATGTTGTAACATACACCTCTGTCCTTGATGGGTTTTGTCGCATAGGGAAACTTGATCAAGCAAAAAAGATGATGCAACAGATGTACAAGCATCACTGCAAACCTAATGCTGTAACACATACAACATTGTTAAATGGTCTTTGCCGCAATGGGAAATCATTGGAAGCTAGAAAGATGATGAATATGAGTGAGGAAGAGTGGTGGACACCTAACGCCATTACTTATAGTGTTGTAGTTCATGGGTTACGCCGGGAAGGAAAATTGAATGAAGCTTGTGATGTAGTCAGGGAGATGATTGGAAAAGGTTTATTTCCAAATCCAGTTGAAATTAACTTATTGATACAATCTCTTTGCCGGGATGGTAAACCACATGAAGCTAATCAGTTACTGAAGGAGTGCATGAACAAGGGTTGTGCTGTTAATGTAGTCAATTTCACCACTGTCATTCATGGATTTTGTCAGAAAGATGATTTGGAGGCGGCACGGTCATTGTTGGATGATATGTATCTTTGTAACAAGCACCCTGATTCCGTGACATACACAACATTAATTGATGCACTGGGCAAGAATGGCCGTATAGAAGAAGCCACTGAACTTACAATGAAGATGTTGAGGCAAGGGTTGGTTCCTTCTCCTGTTACATACAGGTCTGTCATCCACCAGTATTGTCGAAAGGGAAGGGTAGAAGATTTGTTGAAATTATTGAAGAAGATGCTTTTGAAAAGCAGATTTCAAACGGCATATAATTTAGTTATTGAGAAACTGTGTAAATTTGGATACCTCGAGGAGGCCAACAGCCTTTTAGGTGAGGTTTTGAGGACGGCTTCAAGAATGGATGCTAAAACTTGTCATGTACTTATGGAGAGTTATTTAAATGTTGGAATGCCAATGTCAGCATATAAAGTTGCTTGTCGAATGTTCAATAGAAATTTACTTCCTGATTTGAAGTTATGTGAGAAGGTCAGCAAGAGGCTTATGATAGAAGGAAAACTGGAGGAGGCTGATAGGCTTGTATTACGGTTTGTTGAGCATGGTTGTGTTTCGGCTCAAGAACGAAAACACTTGCAGGACTAAGATTTCTAATAATTGATCGTGGTTGACTTCATATGAACACAATCTTTCTATGCTGTGAGTTGCATAAATCTGCTTCCAGGTTTCAGATTCTTATCATTTCCTTCATTGTGGGTTCTTTCTGATATTCTGTTTTGCATTGTGTTGTCACAGAAGAATATTCAGAATTGTTGGACGTGACATGTATTTCTCTTGTAATCTTGATTGAGGATGCTAGCTGTTATAATCACCATGGTTGGCCCCAGAGTTGCACACGCATATTCTTTAGTTATGCAAATCTTTGTAGTTACTCCCTAGATTATTAACATCCTATGGGATTTTACCGAGCTCTAATTACTGCAGAGCTAGGTAGTAGTCCTGGGGAATTTATATTGAGTTGATCCCATCCAGTTTATCCTAATACACGTATGATTGAACAACAAATGAAGAAACAAAGAATGAAAAGCAGATACCAGCTGCTTTAAGGATTTCAATATCAAGTCAGCATAATTGCTGGCATCCCTTACCTTTCTTTTTCCTTATGTCGCCGGTCGAGTGTTAGGAACTCAAGGGTGGTATTCTTTTCCAAAATTTAAGATACACAAACTAATGACATAAGTTTCCATCCCTCCTAAAGGTCTCAATGTGCTAAAATAGAATAGGTGTCTATGTAGATGAGAATTCTATGTATAACATCCACTTGCATAAAGTTGGCAGGTAATAGAAAATACGGGCTGCTCAGTCCTCCTGATATTTCCTTGTTAGCTGCTCATGGTAGTGTTTGGGTCGGAATGTACTTGGGTAAAATTATTTTTTTTCTTTTGTTTTATGATAAACTTTGCCACAAATATTGCTGTTCGAATCTTGTGCTGTTTCTCCCTTGTTGCTTCTGCTACAGGCTGGAAAGATCTTTTGGTGTTCCATTTTTGTTGGCCCTTCTCTGGGTCCTTGTGACCCACTGCCCACATCTCGCCCACCTCTCCCCTGAATAAAGTGGTTGGTCCAATAGGATCAACTTTGTCTTTTGATACAATTGTTTTTGGTAATTTAAATCTAAAAAGGGAAAAAAATCATTAATGCTATAACTACCTGCTGTTAGGACATCGACTGCTATAAGTACAGGTTTATGCATAGCTTAAACATTAACTGCTGTGGGACTTATTCTTCAGTGACTTGTTTCTAACTCTAAATGCTAGATTGGGTACTAGAATACTCTTGAAAGATCCCTAATGTTGGTTGGGGGCCATGGGATCATTGGTGATGGGTGAGGAGCTTTCCTTTCTAATAATGTAATCAAACAGTATGACCAGTGGGGCCGCAATTTTGGTTCATAGCAGGGCAGCCGGGTGCCTCACAAATATTTAAAGGTGTGGAGCTGGAGGACAAAGTTCGTAAAAAAGGTGTGGAGCTGGAGGACAAAGTTCGTAAAAAAGTGATTGAATGTAACTTTGGAGATACTTTCTGTCTCTTCCTCTAATTTCAAATTTAATGGTTTAAGCCCTTTAGTTAAGGCGCGCTAAATTGGATTATAACAAAAAATGCTTCAGTTCATGCATCATTGGCACATCTTGCTTGAAACAGGAAGACCCACTGATAGTTTCTTTCGTAGATGAGAATTTGAAAATGATTTCAGTTCATAAGAGCATATAGAAATATTGGTTATTAGTTGTTACCCTTTCTGTTCTTGTCTCCCATGTCAGTGTTATACCTCCGTGCAAACAAAATTACATTATCATAGTCAGTCACAATATTCTCTCTATCAGGTTCATGTGTACATGGTAATTGAACATGAATTGTTAGTACGTCCGGTCTGGTCAGTTTCTTCCTCAGCAATTGATTTTTAGTTTCTTATAAAAAGTCAGTTTCTTCCTCAGCAATTGATTTTTAGTTTCTAATTTTATAAGGTGAATTTTTATTTTGCTGGTTGGTATGCCATGGAGGGCTTAACACGGTTGAGACTACAAAAGAAATATCAGGATATGACTCTTTCCTGACGTTTCAATTTTTTCGCCCAAAGATCATATGATGCAACTATTGAGTGGACATAACTTTTAAGGAAAGGTTAAGATCATTTGAGTTAATGCGACTAAAGTAATATCTTGGATTCTTTGCTTGGAGAGAAACTATTAAATTTCACGTTGACAGGGAAGAGCATGGGAGGCTATATCCTAAAGCAAATGCATACGATTTGATGATTTATTCTTCTCAATATTACGCTATTATTCTTAGTAACTAATTTCTATGGGAGCTACTTTATGAAAACTCCTAATGGGGGAGCGAG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mRNA sequence

TGTAATTTGATTTGATATCCCAAATTAATATTAACTTGCGATGCCCTGTTTCGCGGCGAAGTTGAAGAACGTCGACGGAGCGGCCAAATACTGGTTATTATTTCATCTTCGTAGCGGCGGAAAAGAGCGCCTGTTGGACGAATTCGGTAGTCTCTAGTTCGTCAATTTTTTTTCACTGTTTTTCCTGCACTATAATGATATGTTATTCACTTTCAATTACTACTATAGAATTGGAAGAAATCAAATCAGATTCTACGAACTGAATTATCTACATAAGTTTCAGAAAGGTAGTGCTAATTCTGCTTTTGTTCTGAATGGAGTTATCTATAAATGTCTCGACCACTTTCGTTTACACCCTTTAGCATGTAGTGAACTTGGTGCATTTTTCTCGTCTTCTTCTTGGAGAGATTCGAGTTTCGGTCGCAGTTTAAGAACTTACTGTACTGGTATTTATGGGAGAAATAATGGGCTTGATGCTGCAAACGACGAATTTCAGAAAATTGATTTGGAGGATTCCGGAGATTCGAATTTCTTTGGAAATCCTAATGAGGAACATGAAAAGGATCGTCACTTTAAGTTCGGTGATGATATAGAAGATGAAGAGTCTAATGAAGAAGAAGAGGAAGATGGGGATCTAGGCGATGCCGCGGATCTTTTGGGGTCTAATTTGTCTAATAAAAATCATGGACAAGGAAATGATTTCAAAAGAGTCGAAATTGGTGAAGATGTATTTAGATATCCCTTGGTGAGAGATACTTGTAAACTGATCAAGCTAAGTTCCTCTTGGAACCGGAAGTTTGAAGGGGAATTGAGGTATTTAGTAAGAAGCCTAAATCCACTGCAGATTTGTGCTGTTCTGCGCTCTCAGGAAGACGAAAGAATTGCTTTGCGATTCTTCTACTGGGCGGATAGATTGTGGCGCTACAGACATGATTCATCTGTGTACTTAGTTATGCTGGAGATACTCAGCAAGACCAAATTATGTCAAGGTGCTAAGCGGGTTCTCCGACTTATGACTCGTAGAGGACTTCTGCTTTGGCCCGAAGCTTTTGGTTTTGTAATGGTGTCATACAGCCGGGCAGGAAGATTAAGGGATGCAATGAAGGTCTTGACCTTGATGCAGATGGCAGGTGTGGAACCTAATTTGTCTATTTGTAACACTGCAATCCATATTTTGGTTGTGGGAAATGAGTTAAAGAAGGCATTGAGGTTTGCAGAACGTATGGCTCTTATTGGAATTGCTCCAAATGTTGTGACTTATAACTGCTTGATCAAGGGCTATTGTATCGTGCATCAGGTTGACCAAGCCATGGAACTGATTGATCAAATGCCATCTAAGGGATGTTCCCCAGATAAAGTTAGTTACTATACTGTCATGGGATTCCTCTGTAGAGACAAGAGGGTGAAGGAAATTAGGGAATTGATGAAGAAAATGCGTACGAACAGTAACTTATTACCAGATAACGTTACTTACAATTCCCTAATCCAGATGCTTTCAAAGCATGGCCATGGAGATGAGGCTCTAGAGATTCTTAGAGAAGCGGAAGAATTGCGATTTAAGGTTGACAAGGTTGAGTATAGTGCAATAGTTCATGCATACTGCAAGGAAGGAAAGATTAAGAAGGCAAAAGAGCTTGTTGGTGAAATGTTCTCCAAGGGCTGTGATCCAGATGTTGTAACATACACCTCTGTCCTTGATGGGTTTTGTCGCATAGGGAAACTTGATCAAGCAAAAAAGATGATGCAACAGATGTACAAGCATCACTGCAAACCTAATGCTGTAACACATACAACATTGTTAAATGGTCTTTGCCGCAATGGGAAATCATTGGAAGCTAGAAAGATGATGAATATGAGTGAGGAAGAGTGGTGGACACCTAACGCCATTACTTATAGTGTTGTAGTTCATGGGTTACGCCGGGAAGGAAAATTGAATGAAGCTTGTGATGTAGTCAGGGAGATGATTGGAAAAGGTTTATTTCCAAATCCAGTTGAAATTAACTTATTGATACAATCTCTTTGCCGGGATGGTAAACCACATGAAGCTAATCAGTTACTGAAGGAGTGCATGAACAAGGGTTGTGCTGTTAATGTAGTCAATTTCACCACTGTCATTCATGGATTTTGTCAGAAAGATGATTTGGAGGCGGCACGGTCATTGTTGGATGATATGTATCTTTGTAACAAGCACCCTGATTCCGTGACATACACAACATTAATTGATGCACTGGGCAAGAATGGCCGTATAGAAGAAGCCACTGAACTTACAATGAAGATGTTGAGGCAAGGGTTGGTTCCTTCTCCTGTTACATACAGGTCTGTCATCCACCAGTATTGTCGAAAGGGAAGGGTAGAAGATTTGTTGAAATTATTGAAGAAGATGCTTTTGAAAAGCAGATTTCAAACGGCATATAATTTAGTTATTGAGAAACTGTGTAAATTTGGATACCTCGAGGAGGCCAACAGCCTTTTAGGTGAGGTTTTGAGGACGGCTTCAAGAATGGATGCTAAAACTTGTCATGTACTTATGGAGAGTTATTTAAATGTTGGAATGCCAATGTCAGCATATAAAGTTGCTTGTCGAATGTTCAATAGAAATTTACTTCCTGATTTGAAGTTATGTGAGAAGGTCAGCAAGAGGCTTATGATAGAAGGAAAACTGGAGGAGGCTGATAGGCTTGTATTACGGTTTGTTGAGCATGGTTGTGTTTCGGCTCAAGAACGAAAACACTTGCAGGACTAAGATTTCTAATAATTGATCGTGGTTGACTTCATATGAACACAATCTTTCTATGCTAAGAATATTCAGAATTGTTGGACGTGACATGTATTTCTCTTGTAATAGAAAATACGGGCTGCTCAGTCCTCCTGATATTTCCTTGTTAGCTGCTCATGGTAGTGTTTGGGTCGGAATGTACTTGGTGGGGCCGCAATTTTGGTTCATAGCAGGGCAGCCGGGTGCCTCACAAATATTTAAAGGTGTGGAGCTGGAGGACAAAGTTCGTAAAAAAGGTGTGGAGCTGGAGGACAAATATCATAATGCAGAGGATGAGATGAAGTCTGGAGTGGTTTCTTTGCCAGAGGTTCCAAAGTCCATGTTCCTCTTGTGGAGGAGAAATTGAATTCAAGTGCTGCAACAACTGGACCGGAAGGACAAGATCTTGGCATTCAAGGTATCAAAATCAAAGTCAAATCCAACGTCAAAAAGAAAGATACATATAAATCAAGTCAAGTCCAACTGTCAAAAATAAAAGTCAAATCCAAATTCAATTAAGGGTTGTTTTTTTCCTCCTTTTTTCTCCAACCAAAGTCAAATCAAATCATTCTTCTCAGTCCTAGTAATTCCTAACCAATCAGGAGCTTGAATGTAGCATATTTTAACCTCTCTTTATTTATATATGTATAAAATATTCCCCTCCT

Coding sequence (CDS)

ATGCTAAGAATATTCAGAATTGTTGGACGTGACATGTATTTCTCTTGTAATAGAAAATACGGGCTGCTCAGTCCTCCTGATATTTCCTTGTTAGCTGCTCATGGTAGTGTTTGGGTCGGAATGTACTTGGTGGGGCCGCAATTTTGGTTCATAGCAGGGCAGCCGGGTGCCTCACAAATATTTAAAGGTGTGGAGCTGGAGGACAAAGTTCGTAAAAAAGGTGTGGAGCTGGAGGACAAATATCATAATGCAGAGGATGAGATGAAGTCTGGAGTGGTTTCTTTGCCAGAGGTTCCAAAGTCCATGTTCCTCTTGTGGAGGAGAAATTGA

Protein sequence

MLRIFRIVGRDMYFSCNRKYGLLSPPDISLLAAHGSVWVGMYLVGPQFWFIAGQPGASQIFKGVELEDKVRKKGVELEDKYHNAEDEMKSGVVSLPEVPKSMFLLWRRN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 67..87

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC04G079610.1CcUC04G079610.1mRNA