CcUC04G070990 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC04G070990
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr04: 27763194 .. 27768374 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC04G070990
SyntenyCcUC04G070990
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTATCATCACCGGCGGGTGTCGGTGGGATAAAAAGTTGGGAAAGTTAGTTAAGTACGTGGACGCTGGAGAGTGGTGGAGATGATGATATTGGCAGGGGTTACAGCCTGTACTGACACAAATGTAGCAATAATTATTCGTTCCCCGATTCGGCGTCCCAAATTGTCGTTTTCTGCCACATCATCATATCTTTTTTCTTTTAAACTTCCACAATTTTTCTTAATTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAATAATAAATTGGGTAGAAGAAAATGGTAGACAGGCTGGCAAATTCAGTCAAAGTGGGGAAGGAGACTCAGAGACCTTCTTTCACCCACCCCTTCTTCTTTTATCTCTCTCTCTCCCATTTTTCTTCGCTCTCAAGTTTCTCCCCATCTTAATTCTTACCCTCCTTCTAAGTTCTATACATAAAATAACATTTTATAACCTATTTTAAGAAGTAGAGAAAAACATATCTCCACCTAAATTTGTTATATTGTATCAATTTAATTTTAAATGGTATTTCAGACACTTAATTAGTTATTATTTTCGGTGATTATAATAATCTATGTTTTTAGTGTAAACGATTTTAGTATAGACAAAAAATACATTATAAGAGAGAATGAAAGATAAAATGCATAGGAAATCGTAAACATTGTAATAAATAGTAAACAAAGTAGCAAAAAGGATTCCAAATAGTAATATTTTAGTTTTTTAGTTAACTATAGATTGTAATAATTAAAACACCGCAAGTGAAATTTTTTCTACAAAAGTAGCTTTTTAAGAATTATGTGGGGTTCACAAATTAAATAAATAATTAATTAATCATTTGATAACATGTCAAATAATGAGTAGAGTATTATGTACTACGGTAGCATATTTGTTTGGATTATAATATCTCACTCTATCCCAAACACCCCTAGCTAGCATTTTATACTTTTCCATAAATGTTGCAGTTTTTACACCCCTTTCTCTAGCGTGTAAACTAATTTTAACAAAATAATAATAATAATATTGAAATATTCATAAAACTCATTAAAGTTTCACATAAATATTTGCTTGACCAGTACAAATTTATTATTAATTAACTTTGCTAAATTTTTAAATTTTAACCAAAACATTAGTTCTAATGTCGTTTTTGTTCCATACTTAAATCAATTTCGTATTGCCCTTCTGTTTTATAATTCACTGAAAATAAAAATAAAAGATTCTGGGAAAATTTGGAAAAAGAAATTGTTAGAAAGTTAAAATTGCAACTCTTTTTTTAAAACTTAAAATTATTATTGTGCCATTTAAATTAAAAATTAAAAATCCAAATTGATACAATATACGTCAAGTTTAAGTTTAGGATTAATATTATTACTATTTCCCTATAAAGTAACAAGCATTTGAAAATAAAATATATGATTTAACTTTGTACTTCAGTCACCTAATAAATTTTATTATTCGTTTCTTTTCCAAAAACATCGACTACAAAATTATATAAAATAACACTATCTAGAACAATAAAAGTAATATAACATATAAAAGTTCACGATGAATCTCGCACATTCTTGGAAAAATAGACATTCAACTAATTAAAAAAAATACTAATTTTACATTTTACTGTTTATTCATTTAAAAGTCGAACTAACTTTGATTTTTTTTTCTTTTTATTTTAAAAAAACTTATTCTTTAATGAATAATAATTGAATATAAAAATGCAATGATATGGGGTTTCACTGTTTGCTTGTGTAAGTCATAGCTTGAATACTACTACTTTGGATCATACTCTTTATTTTAGGATGTTTTATTGATTATTTTTAGAGTTTTTTCTTTTAAATATAATAAAAATAACTAAAATATTTACGAATATAGCAAAATTTCACTTTTGGGATAAATGATATATTTTGCTATTAATTTTAAATATTTTTAACAGTTTTACTATTATTTTTACAAGACCATGAAAATAATATGCAGCTTTCACCTTTCACTATTTTTGCTTTCGTTTAGTATATTCTTTTGAAATAACTTTATGAAATGGGTAGATATTTATATATTTGTGAATAGTATTATAAGATATCATGATTTTCTTCTGGAATGCCTTCACGGTGATCCTCCTCCAGTCTTCACATTTTTGTTCCTATCCACAAGAAATATTTGCACTGAGAATGAGACATTAACTTTAGCATAACACAATTAGCAAAGATATTGTATTTATCTCGTAAATATTATATTACGTTTAAATTTCTATATTGAATTTTAAAAATTACATAGACCATTACAACACTCATCACCTTAGAAGAGTAAAAAGAAAAGGGAATTCGATAAACATGAAAACATTGTTAGGTGTTTTTTGATAAATATTTGTTTTTTAGTTTTTGATATTTGAAAAATAAGCTTACAACTACCAGTACTGATTTATATTAGATTTATTTGTTTTATGTCTAATTTATTAGATTTATTTGTTTTATGTCTAATTTTTAGGAGTGTTTTTAAAATTCAACCCGAATTCGAAAATGAAAGATAAGTTTTGAAGAACTATGACATACCCTTTTGGTAACCGTTTTCGTTTTTTGTTTTTGAAAATTAAACTTATTTACTCCCCATTTTCTTATAATGGTTTGCATATTTCTTAAATACCGTGGTTGAATTATTAGCCAAATTCCAAAAACAAAACGCAAGTTTTTAAAAGCTACTTTTTCATTTTTTAAAATTTGGTTTTTTTTTTTTTAAACAATTGGTAAAAAATAGATAACAAAAGAAAAAATTTAAAGGTGGAAATAGTCTTTATAAGGTGAATTTTCAAAAATAAAAACCAAAAACCAAAGGGTTACTAGATGAGATCTTAGTTTTTGGTTATTATTATTTTTTAAATAAGTCTATAACACCACTTCCATTTATCGTTGTTTTGTTGTCTACATTTTAGGAATATTTTTCAAAACCAAACCCAATTTTTTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAAGTTTTCAAAAACTTGTCTTTGTATTATAAAATTGGCTAATAATTCAAATATTTACTTCTAACTACTAAGTACGGAAATCATGAATAAAAAATTAGCAGAAAATAAGTACAAATTTAAAAAATCAAATGGTTACCAACCCCGTGTATATATATATATAAATAGTTTTCAAAGTTTGACTTTTATTGAAAGCATGAATAAAAAATGAATAACAAAACATGAAAACTTTTGGGTGTAAGTAGTCATAGCTTAAATTTTAAAATAACAAACTAAAAACCTAATGATTATCAAATGAGATCATAATATTTTTATTTTATCAAATGGAATCATAGTATTGTAGTACTCATTCTTTCCTATAATACATTCTTCAGGTAAGGACGAGGACACAGGCGAATAACAAGAAGAATTTGTAATCGTGCCATGGGACCAGTCATCACTTCTGGTATATCATGTTTTATGTCCTCTCTTTCTAGGCTATAGATAATCTAACTTATTTATTTATTTATTTTTATTCTTTTAATTTAATATTAATTTTCAACCTATATTTTAAGGGGACTAGAAAAGACTTATTTTATGTAATTTGATTGAATTAGTCTATTCAATTTTTATTTTATTTATTTATGCATTAATTTTAAAAAATAAAGTAATAATAGAATATATTTTATTACTTGATTTTAAAACCATTTTACACGATCTTTTATGCATAAAGTAGCGTCCAAACAATTAGAAAAGTTAGGTCGTTACAAAACTTTAGTGAAATGTATAAATAACATAACTTGTAGTGTTTTTATGTAACGTTGAAAACAGAAAAGAAATGTTTTAATATTTTGTATATTACATTTAGGAAATTACATTTTTGATGAGAAAACCCCTTTTTTTTTTAAACACATTTGAAGAAAAAATTTAGACCCTATTTGGTAATTATTTAGTTTTTTTGTTTTTATTTTTGTAAATTAAGCATATTTTCACCTATTTTTTACATTGATTTGTATCTCTCTTTGGAATAGAATAGTTGAATTCTTTGCCAAATTCAAAAAACCAAAGCAAATTTTTAAAAGCTACTGTTTTTAGTTTTCAAATTTTAATTTGATTTTTTAAAGTAGATAACAAATTAATAAATTTCGAGGAGGAAATAGTGTTTATAGGCTTTAGTTTTTATTTAAAAAAAAAAGGCAAAATAGTTACAAAATAAAGCATTAACTTTTATCTTTTAAAATCAGGACGTTGCATCCATTTTCACTTTTAATTTTAGCAAGTTAGATTCACAGTTAAATATTACCATTCTTTTTTGCTAATTTTTCTATTAATTTTTGCAAAAAAAGTAGAACATTATCTAAAATCAATACTATCAATATTATCTAGTTCTGCATAGATTTAGCTTAACTAATGTTTACCAATTGATCACCAAATAAATTTGTGAAGATTCATAATTTAAAAAAAGAAAGAAAACCATACACATGCTTGTTAATTCATTGAAAGCATATAATTTTACTTTTTATAAAAAATTTATTAGATTGAAAACGATTGTATTGTACAATTATCTGTGTGGCGTCAATTTGATTAAAAAAATGGAAATTTAAAGTAGAAAATGATAAAAGTAAATTTTCTTTTATTTTCATTTTACTCACACTTTCAAATTCTGTCCACTTTATTTCTAGAAAATATTTATACATTATAAAAATATTGCGATACAAATTTATCATATCATGTAATTTATTATTATTATTATTTTAAAAAAGAGACTGCGTTGGCCGGTGATCAAAATAGAGGGAGGTGAAACGACTGTTGACGTGGCGAGCTGGATTACACACACGTGGAATTAAGAGGAGGGAAAAAATGAAAAGTGGACGGTGAGGATAGAAGGTAGAAAGGTTTTAATTATTGGAGGCGGAGGCACAAAAAGACTTGCAACACAAGGTGTGTGCTGCCGAGCGTGTCCTTCACGCTCCTTCAATGAGCGTCATCTTTTCAAATTTCGAATTTTCATTTCCCTTTTGCCAGAAAGAAACTGAAAAAACAAGAGAGAGAGAAAAAAAAATTAAAAGAAGTGATTTTGTTATAAAATTGAATGCAGGTAAAAATGCGACGCGTGTTCATCGCCAGCTGTATCGCAACCGCAAAGTCCAACCGCTTACTGGGAAGAAGCGGTGCCACTTACCGGAGCGTTTCTCATTGCCTTTAAAACAAGGCCACCGGCTCAGTGGGTTGCCCGTGTCATCTCTTTTATAA

mRNA sequence

ATGTTATCATCACCGGCGGGTGTCGGTGGGATAAAAAGTTGGGAAAGTAAAAATGCGACGCGTGTTCATCGCCAGCTGTATCGCAACCGCAAAGTCCAACCGCTTACTGGGAAGAAGCGGTGCCACTTACCGGAGCGTTTCTCATTGCCTTTAAAACAAGGCCACCGGCTCAGTGGGTTGCCCGTGTCATCTCTTTTATAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTATCATCACCGGCGGGTGTCGGTGGGATAAAAAGTTGGGAAAGTAAAAATGCGACGCGTGTTCATCGCCAGCTGTATCGCAACCGCAAAGTCCAACCGCTTACTGGGAAGAAGCGGTGCCACTTACCGGAGCGTTTCTCATTGCCTTTAAAACAAGGCCACCGGCTCAGTGGGTTGCCCGTGTCATCTCTTTTATAA

Protein sequence

MLSSPAGVGGIKSWESKNATRVHRQLYRNRKVQPLTGKKRCHLPERFSLPLKQGHRLSGLPVSSLL
Homology
[Close]
BLAST of CcUC04G070990 vs. NCBI nr
Match: KAE8647504.1 (hypothetical protein Csa_023542, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 3.0e-11
Identity = 38/50 (76.00%), Postives = 39/50 (78.00%), Query Frame = 0 

Query: 17 KNATRVHRQLYRNRKVQPLTGKKRCHLPERFSLPLKQGHRLSGLPVSSLL 67
          KN TRV  QLYRNR VQPLT +KRCHLPER S P K  HRLS LPVSSLL
Sbjct: 1  KNTTRVESQLYRNRNVQPLTWEKRCHLPERLSFPFKPAHRLSKLPVSSLL 50

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC04G070990 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8647504.13.0e-1176.00hypothetical protein Csa_023542, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of CcUC04G070990 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC04G070990 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC04G070990 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC04G070990.1CcUC04G070990.1mRNA