CcUC04G070420 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC04G070420
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr04: 27218914 .. 27227571 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC04G070420
SyntenyCcUC04G070420
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

GTAGATTACTGTGATTACTTCCACCCTCTTTGCTCCATGATCGAAGGTCAAAATTACCTAATTATGGCTCAAATAATGAAAGTTTATAGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGCGCCCGAGGATCGAGGGAGAGGGTGGCCCACTCAGACTGCCCAAACTGACCCGCAAGACTGCCCGACACCATTTCAGAGGAGGATCGAAAGCTCTCGTCGTTTTCCGCTGCCCTTGAGCCTAATTTTGGTTCAAATCAGTGAGTTGGGAGATATACGAGTTAATTATAATTTGATAGATTTCGCCCACATTAAAATGAATGATAAAAATTGCAATATTATTTTAGTCAATGTAAAACAGGGTCTGAAATGCACAAGAAAAAGTCATGTGTTTGAATTGTTGTTTTCATGTAATTTCTTTAATGTTTCTCAGTCACTATGTGAACTAAAAATCAGCCACTTAAACAGCAGTTTTCTCTTTTTTAAATCCGTGCATTTTCTTTCAGGGATTTTAGCTCAGACGATGAGTGCCCATAGCATGCAGCCTCTGTTTTGCTTTGAGGTGTGTGAATGGCCAAACTTGAAGCCCCCCCGAAGGGTATCATGCCCTTTAATTTGTGGGGTCGTCGTAGCTGGCTGGGACACTCAACCTTTATCCAGTATACCTCACAGTTTTATATACCATAACTTTCACATTATTCAATTTTGTATCGGTAGAGGAGTGGGTATTAAAGTCACTCCATTTCATCTATTCAATGACTATTTATATCTATGTTTGGCTTTCAATCATATCATCTTTTGTTAA

Coding sequence (CDS)

GTAGATTACTGTGATTACTTCCACCCTCTTTGCTCCATGATCGAAGGTCAAAATTACCTAATTATGGCTCAAATAATGAAAGTTTATAGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGCGCCCGAGGATCGAGGGAGAGGGTGGCCCACTCAGACTGCCCAAACTGACCCGCAAGACTGCCCGACACCATTTCAGAGGAGGATCGAAAGCTCTCGTCGTTTTCCGCTGCCCTTGAGCCTAATTTTGGTTCAAATCAGTGAGTTGGGAGATATACGAGTTAATTATAATTTGATAGATTTCGCCCACATTAAAATGAATGATAAAAATTGCAATATTATTTTAGTCAATGTAAAACAGGGTCTGAAATGCACAAGAAAAAGTCATGTGTTTGAATTGTTGTTTTCATGTAATTTCTTTAATGTTTCTCAGTCACTATGTGAACTAAAAATCAGCCACTTAAACAGCAGTTTTCTCTTTTTTAAATCCGTGCATTTTCTTTCAGGGATTTTAGCTCAGACGATGAGTGCCCATAGCATGCAGCCTCTGTTTTGCTTTGAGGTGTGTGAATGGCCAAACTTGAAGCCCCCCCGAAGGGTATCATGCCCTTTAATTTGTGGGGTCGTCGTAGCTGGCTGGGACACTCAACCTTTATCCAGTATACCTCACAGTTTTATATACCATAACTTTCACATTATTCAATTTTGTATCGGTAGAGGAGTGGGTATTAAAGTCACTCCATTTCATCTATTCAATGACTATTTATATCTATGTTTGGCTTTCAATCATATCATCTTTTGTTAA

Protein sequence

VDYCDYFHPLCSMIEGQNYLIMAQIMKVYRGRKEGRAPEDRGRGWPTQTAQTDPQDCPTPFQRRIESSRRFPLPLSLILVQISELGDIRVNYNLIDFAHIKMNDKNCNIILVNVKQGLKCTRKSHVFELLFSCNFFNVSQSLCELKISHLNSSFLFFKSVHFLSGILAQTMSAHSMQPLFCFEVCEWPNLKPPRRVSCPLICGVVVAGWDTQPLSSIPHSFIYHNFHIIQFCIGRGVGIKVTPFHLFNDYLYLCLAFNHIIFC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 35..57

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC04G070420.1CcUC04G070420.1mRNA