CcUC04G065340 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC04G065340
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr04: 22342677 .. 22345704 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC04G065340
SyntenyCcUC04G065340
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAATTTATGGTTTCTTTAGATGTCAAAATTGGGTTATGTTTATTTAATTCCTTGGTCATCAATGAACCCTTGAACCCACACAATGCATATCAGTTAAAAGAGAACACAAGTAATATAATAATATAATTAATTTTGAAAAAAAAATCAATTTACAAATTAGTAATTAGTAATGGTAATAATTTAAACACTCAAGTTGGATTAGTGAATTAATTGAGCTCTTTTCAAATATAGTAAAATTTTACTATCTATTTGTAATAGATCGCGATAGACCATGTATTTTGTTATTAGTTGTAAATATTTTTAACAAGTTTGCCATTTAAGATAATTTTTCGAATTAATTTAGACTTTTTCTATACTATTTTCAATTATATTAATATAAAATTAATTCGAAATTGCATAAATAAATAAATAAAAAATTCTAAAGTTTTACTAAATAGGCTAAAAGATTATCATATAATTCTTTTTAAATAAGTCGAGAAAAATAAAATAGGGAGATGAAAAGATGAAACATCACTCATATTATTGGAAAGCACTAATATTCATTATATTCCAACATTTTTCTTTAATATTTCACATTAATCCTTGTAGTCAAGGAAGTTATACACGTATATAAATTATACATTATAGGTTCTAAAAATGGAATCCTAATGGCGAGTCTATTTTTAATTTTTTATTTAAAAAAATGACAAATTCAAACAATCAAAATCTTGAGAGATAATCTTAGTAAAAGTTTAATTTGATTAACTTATAAAAGTTTAAGGACATTAATTGATAGAATTATTAGTTTAAAATTTTTGATAATACAACTCTTAAAGTTTTGACATATGAATTGACTTTTACACTTTGAACTTTTTTTTAGCAATTTTTGGAGGCCAAGGTAATAAAATACACACTTTATTGGAGAAGTTGCACATGAATCAGTCACATACTTTTTGTTACAAAACTCCTATAAATTATGGAAGAGTTCTCTTCATTCATGAAAAGTTATAATAAATATTATTTTAAATGATTAAAAAAATTATTTTTTTTTAATCAACCTAATTGAGGGAAAAAAAAAAGTTTAAACTTTAAACTTGGTATGTAAAAAGTTGAGCATCCAATGCTCAACTCTCTTTCTAAATATAAATATATATATGTTGAAGTTGTATTAATCCACAAAGGGAAAAGGAGAATGCAATTTAAATAGTAATCTAATCTAAATGGAATATTCCTAATAGTGGTTTTAAAAGAGAAGATTTTAAAAAGTTTTTTGGAGTCTTTGTTTATTTGTTTGACAAGACAATAAACAGTTGTCTCTCCAATGGCCTATGGCCTCTCTACTTAATATATATATATATATATATGAATGAGCTTCTTCTTCAAAAGGAATCAAACATACAACTTTGACTCATTTTTAAAGTGTATAAATTTTCAACAACACCATTGAAGAGTTCTCAAAATGGAAGAATAGTCTATATTTATGTTTATTTGCTTGTTTGACTAATGAGAAAATTAATTAAATCTCTAACTGACAAAAAGAAATTTAAATTCCCACTAAAAATTGAATATGAAAATTGTGATGTGTTTAAAGATTATAGTATAGATGTTTCGAGACTTAATTATTGAATTTAAAATTCGTCATACAATAATTGGATTGAGCTTCATTTAATTATATAATAAGTTTGTTTGAAAAATAAAATTTTCTTGACTAGAAAATAGACATATGAACTAGTAAGAACACTAAAATTTTGATATATAGAAATTTCATAAGTGAAAATGGGTAAGCCTTTCATTCCTTCTTTCACACCTTTATTTATGCAAACTTTAAATATTTACTTCCATTAACTAAATCTTCTTACTTTTCATTTTTTCTATCCGTTAAAGTATTGATATAATTAAATTTAGGATAAACTATAAAAACCATCCTTGAAGTATGATGTGGTAGTTGCAATTATACTCTTAAACTTTTAATTTTAAAAATTGAACCTTTAAACTTCTACCAATGTTAAAATTGGACCTTCAAACTTACAATAATCATAGAAATGATAAAAATTGAACTTTTAAACTTATACAAATAATACAATTTTATACAATTATGTAAGTTTGAAGGTCCAGTTTGACCTAATTTTTGACATTTATATAATTTTGAAGGTCTAATTTTTAAAATAAAAAATTTAAAGGTATAATTGCAACTATATGCACCATACTTTCAAGGTGGCTTTTGCAATTTGTCCTTAAATTTACTACAATCTATGAACTTAACCTTGTGAGACTTCTATGGTGATTTAACGTGGTATAAAAGCAGATAATCACGTGTTCGAACCTCTATAATAATATTTTCACTTTCCAATCATATTGATTTTCACTTGTTAAATTTTCTACAACTCAAGATAAAAATTATAAAGCTTATAAGTGAGAGAACATGTAAAAGTATCAACATAACCAAATTTACTAGTTTAAAATTTTTGGATAACATGTGATTTAATGCATGCTTTCCTACCATCAACTTCCGACATGACACTCTATTTGCTATCATTGAAGCCTTGGTTTGCCCCTATTCTATTTTTTTTATTTTTTTAAAGTTTCTTTTTCCTATGCTCCAAAGAAAAAAGAAAAAATAGTAGAGCAATATAAAATGTTAGGGTTCATATTTAGTCACATCACTATTTGAATTTAAAATGAAGTTTGTTGAAATGATAGTGGGAAGAAGGCCCTTCTTCCACATTTATTGGTTCCCCATACTATCTGTCGCATCCAACACCACACAATAATCCCTAAACAACCAAAGAGAGATAAATGTTCCTTGAACTTTTGTTAAAGCAAGGTGGGATTGTTTTGTCAATGACTACAAATACCCCCCGCCCCCAGGAATTCTTTATAATGTAGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTCAATAACATGTAGGATCGAGAATATATGTCGACTTAAATAAATTATGTGCCGATATCATTAGCATAGTTTAGTGGTAGTTAATACGTTCTCTTCTTTAGAAGATTAAAAAGTTTAATTTTCATATTCCACATTAA

mRNA sequence

ATGGAATTTATGGTTTCTTTAGATGTCAAAATTGGGTTATGTTTATTTAATTCCTTGGTCATCAATGAACCCTTGAACCCACACAATGCATATCAGTTAAAAGAGAACACAACAAGGTGGGATTGTTTTGTCAATGACTACAAATACCCCCCGCCCCCAGGAATTCTTTATAATAAGATTAAAAAGTTTAATTTTCATATTCCACATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAATTTATGGTTTCTTTAGATGTCAAAATTGGGTTATGTTTATTTAATTCCTTGGTCATCAATGAACCCTTGAACCCACACAATGCATATCAGTTAAAAGAGAACACAACAAGGTGGGATTGTTTTGTCAATGACTACAAATACCCCCCGCCCCCAGGAATTCTTTATAATAAGATTAAAAAGTTTAATTTTCATATTCCACATTAA

Protein sequence

MEFMVSLDVKIGLCLFNSLVINEPLNPHNAYQLKENTTRWDCFVNDYKYPPPPGILYNKIKKFNFHIPH
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC04G065340.1CcUC04G065340.1mRNA