CcUC04G062730 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC04G062730
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr04: 17522798 .. 17525816 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC04G062730
SyntenyCcUC04G062730
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTTGGTATTGATCCTCTTGCAACTGCTCTTGTATCTGAATTGGATGATTTTGATAAAAAAATTTGATAGCGAAAGTTATGATAAAGAGGGTTATGATGGTGAGGATGATATGCCCCTTAATCAGTTGTTGTCGAGTATAAAAGACGCCTCTGCTGATGTTGTTACTAGCTCTGAGACTTCTAAAGAAACTACTCCTGCTGATGATTCTAATGTTAATTCTGTTTTGTCCAAAGACTGGGCTTCGAAAACAACTCACATGATGAAGTTGATGAAGGAATAGAATTCTCTAGGCGGAAGTGTTTAATCACTTTGCTCCTATGTGATTCTATGGATTTTCACAAAACAAGAAAGTATACATATGCACTGAAACACATTAAGTGATTCAACGGGAAAAATAAATACCTTTGAAGATCTAATTCTCAAGATATCAACCTTTGATTCTCTAAGAACACCACGAAGAAATCTTCTCTGGTTAACTCTTGGGACAAAGAGGTTTGTGAGAACCTTTGTGAAAAAGAAAAGAGAAGAACAGAGAGTTTGAGAGTTGAGAGTGAGGGAGAGTTTTGCAGAGATTTCCCATTCTCCTCACAATTGAGATCTCATCTCAATTTATGTGATTTAATTAATTAAATAATAATAATATAATTAATATAAATAAATCAAATTAAATTAATTTATATATAATAATTAAATATTAATTATGAAATTTCATTTAATTAATTAAAAGAAATCAAATCTCATATATTTGATTCAATGTGTCACGATACACATTTACTCTCATAACCTATAGTTTTAATATGAATCCAATTCGTACTAACTTAATATTTAAATCTCAGTCAAATATTGATTTTCTCATATAATAAAGTTTATTTTCTCACATTATAAACTTTATGAAGTATCTCACATATACAATTAATTCCCTTTAGCAATTTGAACATTCAAATTCTTTTATCACTTTGTTTCCTTGTTTTAACCTGTTGTGAGCTACCAGAGGGACCTAATGGACCAACAGTCATAGCTCTATTGATTCGAGATTAATAAATTAAACTCATTAATTATATAAATCAACATTCATTAACCATGGGGCATACCACTAAAGACCCATAGCTGCACTCTTATGAACTACAGTATATTTGTGTGTCCATTGAATAACCATATAATATAAGTCAATCCTTCACAGGGTGTTCATAATTATAGCTAAGTCAAATTACCGTTTTACCCATGCAATTACCTCTTGCACCTTAAGTACCATTGATCCTCTAATGAACAATATTGTTTATGGTCCAACTATAAACAAAGTCCATTTCAAATCAGTGAGAGAGTGAGGCCTCATTGTTCAAGTCCTAAAATTAGCACTTAAGGGAACAACCTATCTATTTTCCCTAGAGTAAGGAAGGAGTGTTCCATCTTGTGAATTTATGTTCCCAACTCCTCACTCAAAATCATTCCCAAAATGGCAGGCATATTAAGTCTGCAACTAAGGCACTCTCATCCATACAAATTGAAGAACGATGCTTATGAACAGGAGTTCATAATTCACTTAGGATTGAGATCAAGTTACATGGTTCTCATTTGAAATATAAAGCTCTTCAATTAACGGAGTTATAAAGAGAGATTTAATTTTGTGGTCCAGTCTTATACAAATTCACTATATAGGATCAAACCGTTTGTAACACTTACAACATTTGTAATACAAAGTGGGTCATATCCATAGTGTTATCAGGATGAGGCACCCAACCTCACCCATATACTATAAACCTTTTAGGTTATTTTTTGAACATGATCAACTGATTGTCAACAACATGTCGTTCAAGATCTTAGTTTATTGGATTTTGAGTTATGCAAACAAATAACAGTTAAAAGATACTTTATTTATTTATTTAAAAATTTACCCAGACTACAAGATTTAGGATATAAATCCCAACAATTGAAACTATCCATGCTCCTGTAACTCACTCATTCTCTCAAGCCCAAGGGAAGAAACCTGTCGTCTCTATTATACCCTCTGTTCCACTTGATGGAGTCTCTTTTCACTCTGAGGAGAGCACCATTTACTAGAAATTTGTCGTGAAAAGAAGAATTTTTTGCTGAAAAGGAGTTGTCAGTTGAAGCTCAAGAATATTCTAACATCATGAACTTGATTACAAAAGTTGAGGTTTCTAAGATTGTTCTGGATCTTGGTTTCTTTTATACTAAGTTCGTTATGGAGTATTGTCAACCTTTCTTAGTCTTTTGATAGTCCTAGTTCTCCTTACTATAGAAGAGTTCATGTGCGTGGTCACTATTTTGTTTTCTCTGCCTCTAAGATTTAACAATTTTCTTGGGAGATTTGTTCTAATCTATAATAGAAAATTGCGTCCTTCTATGAAGGAATTGGTAATAGAATTAACCGGTGGAATAAAAAAGGCTTGGCCAAAGTCTGGATAACTCCCCTTTGTTGAACTAAGTGCTAAATATGTTGTGTTGTTTCGAATTGGAATTGCTAATTGGTGTCTCTCTTCATATCACTTGGGCCTTTCTATCTCCTTGCCAACTTTGATTTATCAAATTTGGAAGCTTGCTAAGTTTGATTATGGAGCCTTTGTTATTGGCCAACTATGACATCACATTGTGTCCCAAGCCCTTCGTCTTCCCATTGCATATCCTCGTCTCATCTCAGGATCTTGTTGTCTAACAAACCAAACCTCCTTCTTGGGTAGGAAGCTGTTGATGATGCTCCTAGCATTCTTAACTTCAATTACAAGTTATTTTAGGGACATCATGTACCAGACATTGTTCCACCTACTTCTCTTGACACCGATGATACTCCTAGTGCTGAGCTGGTTAATTCTTCTTTTGGTCAGCAGCTTATGCACACTCTCTCTGTGGAACTTCGTAATCTTACTGATATAATTGATCGGGCAATTGATCACAAACGAGAGGTTTCCCTCTTGTTAACCATGATGAAACGGGCGGTTGAAGACAATGGTGAGGCTAGGCCATCTCAAGTGATTTTTTTTAAGCCAGAGGGGGACTAG

mRNA sequence

ATGTTGGTATTGATCCTCTTGCAACTGCTCTTGTATCTGAATTGGATGATTTTGATAAAAAAATTTGATAGCGAAAGTTATGATAAAGAGGGTTATGATGGTGAGGATGATATGCCCCTTAATCAGTTGTTGTCGAGTATAAAAGACGCCTCTGCTGATGTTGTTACTAGCTCTGAGACTTCTAAAGAAACTACTCCTGCTGATGATTCTAATCAGCTTATGCACACTCTCTCTGTGGAACTTCGTAATCTTACTGATATAATTGATCGGGCAATTGATCACAAACGAGAGGTTTCCCTCTTGTTAACCATGATGAAACGGGCGGTTGAAGACAATGGTGAGGCTAGGCCATCTCAAGTGATTTTTTTTAAGCCAGAGGGGGACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTGGTATTGATCCTCTTGCAACTGCTCTTGTATCTGAATTGGATGATTTTGATAAAAAAATTTGATAGCGAAAGTTATGATAAAGAGGGTTATGATGGTGAGGATGATATGCCCCTTAATCAGTTGTTGTCGAGTATAAAAGACGCCTCTGCTGATGTTGTTACTAGCTCTGAGACTTCTAAAGAAACTACTCCTGCTGATGATTCTAATCAGCTTATGCACACTCTCTCTGTGGAACTTCGTAATCTTACTGATATAATTGATCGGGCAATTGATCACAAACGAGAGGTTTCCCTCTTGTTAACCATGATGAAACGGGCGGTTGAAGACAATGGTGAGGCTAGGCCATCTCAAGTGATTTTTTTTAAGCCAGAGGGGGACTAG

Protein sequence

MLVLILLQLLLYLNWMILIKKFDSESYDKEGYDGEDDMPLNQLLSSIKDASADVVTSSETSKETTPADDSNQLMHTLSVELRNLTDIIDRAIDHKREVSLLLTMMKRAVEDNGEARPSQVIFFKPEGD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 52..71

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC04G062730.1CcUC04G062730.1mRNA