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CcUC04G060690 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTATCATGTTTCAAACAAATTTGCAACCTCTTAGAGGACTTACAAATACTTGATTTATGTGTAGACGTGAGCGAAACTTATATCAACTTCATAATATGTATGACATACCTATTGCACATGCACCAGCTCCTAGGTGTAGAGGACGAGCTCCAGCAAAAGTAAGAGAGGAACAATTTGTACATGATGAAGTTCACCATGATGAAGAAGAAATGCCTCTTGTTACACAAACTTGATCTCAAGATCATGCTAGTCCTTTCACCCGAACGATGATGCCAACCTTTGGATCCCAGTATCATAGTGAAGCTAGGCCTTCATCGTCATCATATGTTGCTCATAATGAGTCTGGTTCATCATATAGGCATGGGTGTGGCGTGGTGAGAATGAACATTATTTGTTTCCTATAGTACCCATAGAAGAACAAGAGGAACAAGACGTGGCACAAATGGGTCATCCCCGACAACCAACTAGCAATTGACGATGTCCACCTTGTGGCTCTCATTGAGTTTACAGTGTGATTGTGTATGAACTTTATTTGTCTTTGAAATATGAACAATGCTATCGTCAATCATGTTATATTTTCCTTATCAATTTCATATTTTATTTTTTTAATTCTATATTTTGCTTATCAATTTTATAAAGTGTATGCAATACAATAATTCAAAATTATAATATAAAATGAAATTGGTTGAAAAAATTATAAATCCCCACTTTTCATTGAAAATTGGTTGAAACAATTACAACGGAACAGGAAAAACTAATTTGATCACCACTTTTTCTCCTAAATGTTTCAACTCATTTATTTTTCACTTCAAAAGATGAGGAGCTGCTTGATTTTTTTTTAATATTTTAATACCTTGTCCTAAAAAAAAGAGAATATATGTAGAAATTACATACTTGTCTTTTGAAAAGAAGAGGTGCGGCAAAACAACAATATTTTTCAGATAAGTTCGGAAACAATAGTATTCTTATAATTAGTTTAAAAATAAAAAATATTAATAAAAAAAACTCGGTTTTTAGATTTCCTATTAAGAGGCTTAGATTTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTATAATATTTTTCAATATTTCCTTGTTTATAGTGAAAATTATTATGAATATCATAATAAATTAGATGTCCATTATATAATTGAACTTAGTGGCTAAAGGTCATGTGTTTGCTAATGACACATCCTTAGTGATCATGAAATGCCACTACCTACTTGCCAAATTGCCTATACATAGAGCCTTTTGGTGGATATTGTAAGACACACATTGGAGAGAAAAGAAGAGAAAAGATTGGTGAAATTTGAGAAGTTTCATTTTCCATAAAATCTCACTTTCTTTATTTTAGTTTATTTTAAGTTACTTTATTTAATTTGGTTATTTTAATTATTTTGATATTATTTTATAATTTATTATTTTAATATGATATTTCTTGATTTTTGTGCTCCTGTTTTTCCGTCATTTTGCTCCTCAATTTTACAACACATTATTAGCATGAGTTTTTGTCGTTTTCCCATTGAAGGTAGGTTTTGAAGTTATGTCATTTTCTCCTTGTTATAATTAGTAAATTAAACACTATTTTGCATGTTTTAGTAGATATTAAATTACTAATATAAACATAATTCTTTGTGATAGTATTATCATGGCAAATCTTACAAAAATAGAATTTGCAACCTTTGACATGAATGGAAATAATTATTTGTCATGGATGTTTGATGCTAAAATACATCTAGATGCCATGAACATGGGAGAAACAATTAAAGAGGGAAATGCAACATTCATTCAGGAAAAAGCAAAAGCTATGATCTTCCTTCGCCATCATATCCACGAGGGATTGAAGATGGAATATTTAACAATAAAAATCCCTACATCTTGTGGAAGAATTTAAAATAGAGATACGATCATCAGAAAACAGTTATTCTTCCTAAAGCTCGTTATGAATGGATGCATTTGAGGCTCCAAGATTTCAAATCAGTAAGTGATTACAACTCCGCATTATTTAAAATCAGTTCAAAATTGTTGTTATGCAGAGAGAAAGTTACTAATGCGGATATGTTGGAGAAGACATTTTCTACATTTCATGCCTCGAATATGCTCCTACATCAGCAATATCGAGAGAAAGGTTTTAAACAATATTTTGAATTAATTTCATGTCTTCTCGTGGCTGAACAAAATAATGAGCTATTGATGAAGAACCATGAATCTCGACCAATTGGAACAACACCATTCCCTGAAGTGAATGATGTAAATTTTAATAATTCGGTCAAGGTCGTGACCGTAGCAGAGGAAGAAATAATTATTATTTTCGTGATTGTCATTCTAATCATCCAAATTTCAAAAAAAAAACCACTTGAAATGATGATCATAAAGAAATAATTATCATTCAAAAGATGATGAGCATAAATGCTTCTGATGCGGGATGACTGGGCACTGGTCTCGTGTTTGTTGTACATCAAAACACCTAGTTGATCTCTATCAAGCTTCCCTGAAGGAAAAAAGGAAAAATGTGGAAGCAAATTTTACATACCAGGATAATGATATAATTGACCCATCGAATATGACAAATTTGGATGTGGACTTCTTTGAATCTCTTGAAGAGAAAATCAGCACAAATGATGGCATAGCAAGTGTTTCTTTTGATTTTGAGAATGTGTATAATTTTTTTATCCATCTATCTTTCATGTTTTTTTTAAGTTAAACCTTGTATTTCAAATTTTGTTTTTCTTATTGTAATTATCTTGTTTAAATGAAGAATCATGGACAATTTTCATATATTGAGTGACTAAAAAATGAGGAATGAAGATCTATGTTTGGCAAACTGTGCAACTACACATACAGTACTTACAAATAGAAAATATTTTTCCAAATTGACAATGCTGGAAGCAAAAGTCAATACAATATTAGGTTCTGCAAACCTGATTGAAGGATTTGGAAAAAGCAAATATTATTTTGCGTAGAGGAACAAAATTTACAATTAACAATGCATTGTTCTCTAGTCAATCAAAGAGAAATTATTAAGTTTTAAAGATATACGTTGCAATTGTTATTATATTGAAACTGATAGGAAAAATGAGATAGAATATCTTTATATCAGATCTCCTGTCTCACATGAAAAACATATATTGGAAAAGTTGTCTGCTTTATCTTTTAGATTATATGATACTCATATACGAGTCTTTGAAACATATGCAACAATGAACACATGAATCCAGATATATTTACAATTTGGCATGACCGGTTGGGTCATCTAGGATCTATAATGATGAGAAAAATCATTAAAAGTTCAAATGGACACCCATTGAAGAACCAAAAGATTCTTCAATCTAATGAATTATTATGTGATGCTTGCTCTCAAGGCAAATTAATATTTAGACCATCACCAGCTAAAGTGGGAACTGAATCACCTGCATTTTTTGAACAAATTCATGATGATATATGTGGACGTATTAACCCACCAAGTTGACCATTTAAATACTTTATGGTATTAATAGACGCATCCAGTAGATGGTCGCATGTGTGCTTATTATCAAGTCGAAATGTTGCATTTGCAAGATTACTTGCTCAAATAATTAAGTTAAGAGCACAATTAGGACCATTCTTCTTAATAATGCTGGTGAATTACATCCCAAACTTTTGATAATTATTGTATGTCAATTGGGATAAATGTTGAACATCCTGTTGCTTATGTTTATACACAAAATGGTTTAGCATAATCATTTATAAAACGTTTGCAATTAATTACTAGACCATTACTTATGAAAGTGAAGCTTCCTACATCTGTATAGGGACATGCTATTTTGCATGCTACGTCATTTGCATGTATTAAGCCAGTAGCTTATCATAAATACTCACCATTACAATTAGCTTATGGCTAGGAGCCAAATATTTTCCATCTAAGAATTTTTGGATGTGCAATATATGTTTCAATTGCTTCACTACAATGTACTAAAATGGGTCCTCAAAGGAGGTTAGGAATATACGTCAGATATGATTCTCCATCAATTATTAAATATCTTGAACCCCTGACGGGTGATGTATTTACTGCACGATTTGCTGATTGTCATTTTAATGAGAAAAATTTTCCAACATTAGAGGGAGGAATTAAGAAGTTGGAAAAGGAAATTGCATGGAATGCATCTTTATTGTCTCATTTAGATCCCCGTACAAATCAATGTGAACTTGAAGTTTAGAAAATAACTCATGTGCAAAATATAGCAAATCAATTACCAAATGCATTTATAGATGCAAAGAAAGTAATTAAATCACATATACCCGTTGCAAATGTTTTTTTGAAAATTGATATCTCAACACAACAATTTGTCACTAATGAATTTGGAACACACAAGAAGCGTGGTAGATCAGTGGGTTCCAAAGATAAAAATCCTCAGAAAAAAAAAATAAATGATTGGAAAAAAGACTTGGTTGAGGATGTAAATATCCACGAAGAAACTCTGGACATGACTGATAATCCAATTAGTGAAGAAGGTAAAATACCTAAAGATAAGAATGAGATTTCAATAAATTATGTCATGACAGAAAAAGGATGGAATCGAACTAATATAGTTTTTTATAACATTTTTGCACATAATGTTGCACTTGATATTATATTTGAAAATGAGGATCTTGAATCAAAATCTGTTGAAGAATGTTGACATAAAAGAGATTGGCTTTAGTGGAAATAAGCAATCGAGATAGAATTAAACTCACTTTTAAAACATAAAGTTTTTGGACCAATAGTCCAGACACTAGAAGATGTCAAACATGTGAGATACAAATGGGTATTTGTGAGAAAAAGAAATGAAAATAATGAGATCACAAGATATAAAGCAAGACTAGGTGCATAAGGTTTATCTAGTGGTGGATGCAATTATATTAAGATATTTAATTGGTCTAACTGTGTATAAAAATTTGGACATGCATCTTATAGATGTTGTCACAGCATATTTATATGGATCTCTTGATAATGACATTTATATGAGAATCCCAG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ATGTATCATAAGAACAAGAGGAACAAGACGTGGCACAAATGGGTCATCCCCGACAACCAACTAGCAATTGACGATGTCCACCTTGTGGCTCTCATTGAGTTTACAATGGGGAATTTATTCGTCAAGAAGCCCAAAGTCACCGATGTTGATAAAGCGATTCTGTCTCTCAAGACCCAGAGACGCAAACTCGGTCAATATCAACAACAGCTTGATGCTGTCATTGAAGCAGAAAAGAATGCTGCAAGAGAGTTAGTTCGACAAAAGAAAAAGGATCGTGCCTTGTTAGCCTTGAAGAAGAAAAAGGCACAAGAAGAATTATTAAAGCAAGTTGATGCCTGGCTGATTAACGTTGAACAACAATTGTCAGATATTGAATTGGCCAGCAAACAGAAAGCTGTTTTTGAAAGTTTGAAGGCTGGTAATAATGCGATCAAAGCTATACAAAGTGAAATTAATATTGATGATGAAATTAATGCCATCTTAGGAGAGAAATTATCAGAAGAAGATGAGGAACAAATCTTAGCAGAGTTTGAGAGCTTGGAAGCTCAGCTCACTGTTCAAGATCTCCCTGAGGTTCCAACGTCCAAAGAAAATGCTGAAAAGTTAGATCTTCCCGACGTGCCCTCCAAAAAACCTGTTGCAGCTGATGCCATTGAAGAAGATGCTGAACTTGCTTCATCTAATGCACCCACAAAGAGAAGAGTTATGGAAGAACCGTTGGCAGCATAA MYHKNKRNKTWHKWVIPDNQLAIDDVHLVALIEFTMGNLFVKKPKVTDVDKAILSLKTQRRKLGQYQQQLDAVIEAEKNAARELVRQKKKDRALLALKKKKAQEELLKQVDAWLINVEQQLSDIELASKQKAVFESLKAGNNAIKAIQSEINIDDEINAILGEKLSEEDEEQILAEFESLEAQLTVQDLPEVPTSKENAEKLDLPDVPSKKPVAADAIEEDAELASSNAPTKRRVMEEPLAA Homology
BLAST of CcUC04G060690 vs. NCBI nr
Match: XP_038883019.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 346.7 bits (888), Expect = 1.7e-91 Identity = 201/223 (90.13%), Postives = 204/223 (91.48%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. NCBI nr
Match: XP_022149415.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 1.8e-90 Identity = 197/223 (88.34%), Postives = 202/223 (90.58%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. NCBI nr
Match: XP_011653914.2 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2 isoform X2 [Cucumis sativus] >XP_031740173.1 vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN55176.2 hypothetical protein Csa_012821 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 342.4 bits (877), Expect = 3.1e-90 Identity = 198/223 (88.79%), Postives = 202/223 (90.58%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. NCBI nr
Match: XP_022928588.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 337.8 bits (865), Expect = 7.7e-89 Identity = 195/223 (87.44%), Postives = 202/223 (90.58%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. NCBI nr
Match: KAG6603293.1 (Vacuolar protein sorting-associated protein 20-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 1.0e-88 Identity = 195/223 (87.44%), Postives = 201/223 (90.13%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FY89 (Vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS20.2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 262.3 bits (669), Expect = 5.4e-69 Identity = 152/226 (67.26%), Postives = 180/226 (79.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GXN6 (Vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS20.1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 259.6 bits (662), Expect = 3.5e-68 Identity = 149/224 (66.52%), Postives = 183/224 (81.70%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q503V0 (Charged multivesicular body protein 6 OS=Danio rerio OX=7955 GN=chmp6 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 110.5 bits (275), Expect = 2.6e-23 Identity = 73/196 (37.24%), Postives = 119/196 (60.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZL55 (Charged multivesicular body protein 6 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=CHMP6 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 104.8 bits (260), Expect = 1.4e-21 Identity = 73/199 (36.68%), Postives = 116/199 (58.29%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NU11 (Charged multivesicular body protein 6-B OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=chmp6-b PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 6.0e-20 Identity = 72/199 (36.18%), Postives = 114/199 (57.29%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D5M8 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017847 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 8.9e-91 Identity = 197/223 (88.34%), Postives = 202/223 (90.58%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EPH4 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435445 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 337.8 bits (865), Expect = 3.7e-89 Identity = 195/223 (87.44%), Postives = 202/223 (90.58%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B5R7 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486109 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 336.7 bits (862), Expect = 8.3e-89 Identity = 196/223 (87.89%), Postives = 200/223 (89.69%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EBQ2 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432566 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 334.0 bits (855), Expect = 5.4e-88 Identity = 194/224 (86.61%), Postives = 201/224 (89.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HS74 (vacuolar protein sorting-associated protein 20 homolog 2-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466101 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 5.9e-87 Identity = 191/224 (85.27%), Postives = 200/224 (89.29%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. TAIR 10
Match: AT5G09260.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 20.2 ) HSP 1 Score: 262.3 bits (669), Expect = 3.8e-70 Identity = 152/226 (67.26%), Postives = 180/226 (79.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. TAIR 10
Match: AT5G63880.1 (SNF7 family protein ) HSP 1 Score: 259.6 bits (662), Expect = 2.5e-69 Identity = 149/224 (66.52%), Postives = 183/224 (81.70%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. TAIR 10
Match: AT5G63880.2 (SNF7 family protein ) HSP 1 Score: 250.4 bits (638), Expect = 1.5e-66 Identity = 149/248 (60.08%), Postives = 183/248 (73.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060690 vs. TAIR 10
Match: AT2G19830.1 (SNF7 family protein ) HSP 1 Score: 43.1 bits (100), Expect = 3.6e-04 Identity = 59/213 (27.70%), Postives = 94/213 (44.13%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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