CcUC04G060170 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGAAGGGACCGATTCTAATTTTCATTTGCCCTCCAGAAAGGCCATCCGTTAAAAGAGGGAAAAACTTCCATTTTCGCAAGTGTGTTCTGTTTCTGCCTGGCACTCGAATGGAAGAAGACGAAGGTGAACTGCTCCTATGGAAGTCGAACTCAGCATCTCAATCTATGGTCTCCGTCACCATTGGCAGAGTTATGGTCACCTTACTCGCTGCTCGGCCAAAGAAGCTCCACGACGCCGTTTCTGCTCTCTCACCCGACCACCGGCACAAAGCTTCTTCACTAGGTCCGTCATTCATTTCACTCGCGGACTGTATTCCTCTTTAATCGTTTCGCTTTCAGTATACACTAACGAATTTTACCGGTTCCACAGATTCTCTTGACCAATCTCTCTGGTTTCTGCACCAGTATGTCAAGGACGCTGTTCAAAACCATGCGTCTTTAGATGAAATCCTCATCCCCATGCTTGAACATGTAATCTCATTCATCTTTTCTACGTTTGCAAATAAAATATGCGAGTCCGTCTGTAAAAATTTCAAGTGTAATCGTGCAGACGTTGAGATTCAAGGATAAGAACTGGCAGCGAGGGGGCCAAGTTATGGTGCTTCTTAACTGGCTGTTCCTTGACGAACTTATTTTCCGAACACTGATAAAAAATCTTGCGGATATTATTGTGAGAAAGGATGATCGCTATGTCGCCCTTGGCTGGTGTATCCTTGTCCGCAGTCTTGTGGAGTTCGAGTCTGTCCCCTGTGAACTTTCATTGAACGGTAGTGGTACCATCCTATGCCAAAATTAGGATATCCCCCATGTGGGTGTACGTTAGAATTTCTATTTGTATTCATACACTAAAATGCTGATCATAACGTCCTCTGTTTCTGGTATTGTTTTCATTTTTGTTGTTATTTATTTTGCTTTTTGGATAGGGTTGAGGGAGAGATACAATGATATGTTGAAGGTACTCTGTCCGTGCATTCCACGTCTGACATGTATTTTAAGTAAAAGAAGGTAAATTCCTTCTCATACTCTTAGCAAGGCTGTCAGCCCCTGCTTTTCATGTTTATTGGTATATTTTGCTTTTACATTTTTTGAATGTCGTAAAAACTGGCTCATGCTGTTATGCGTACCATCTTTGGTCATCAATATGCTGTGATACTAATTTTCAAGATAAATTGCCGCTTTACTTCTCATTGTGGAAGTGTGTCATCTACTTTTGTTTGCATCCACCTTATTGGTTTTTACATCTCACAGATGATTTGATTTTGCAGTATTCTACAGGAAGGGTTTGAGTTACCTTCTCGCCTTTCAGTTTGTGCTGCTGATTGTGTTGTATCTCTTACTAATGCACTGACCGCAAAGTCTGAGGTTCAAACGAGGCAGAAAAGATTAAATGTGAGTTCATCATATCAGCAAGTTACTTTCTTTTCAAATGCTGTTGATGACCAGCGAGAGAAACCAATTAGTAGTTCTTCAAAGGACTCAGACTCGGACATGGAATATTTACTCTGGCATCAATTGAAGGATCTCGTGATTTTAGTACAGAGGCTTCTTGCAGTATGTTTCTGTTTGCATGTTATTCTCTTCTTCTGTTTTGCATGGTACAGTTTTAATTTGTTAAATGTTACTTGGAACCTGGGTTGGCATGCTGTTTTATCCCGGTTAGTGATAGCACTTGTGCAGCAAAAAACAAAACATTTGGGAAATGATGTATTATTTCCTAATTGTAGATCATTATTACTGAAACAAATTCCTATCTATAAGACCACGTTAATTGCTTTTAAAGGTCTTGGTACTTTGAGACTTATTCTATTTTAATTCCTGTACTTTTTAAGGTCCAAATTTTGTTTTTGTACTTTCGATAGATCTTAGAATTAAGCCCTATTGTTAATCTATTATTAACTTCTCCAAAAGAATGTAATCTTGATTAACCTTCCCTATGTAAGATTTGGAAACATATTCACGTTATATCTTTCATTTATTAGGATTATGATTACTTTACTTGATTGATTAGGATTAGGATTAGTTTCCTTGGTTTATTAGGATGAGGATTAGTTTTTTTTGACTAACTAAAATTAGGATTTGTTTGCTATCCAATTCTTTATTAATAGAGGAATCGTTTCTTGTATTGATAACTTTTGATTCATAATAAAGACTTTGTTTTTAGTATTGGAGATTTCTTTTCTTTTATCCTTTAGGCTACATTAATTTGGTACCAGTGAGAACGTTTGAGCCAATAATGGTTGCCATTAGTAGAAGACCAAGAAGCGACAGATCGCAAGAGGGAGCTTTGTGAGTTGTGCATACTTAATTAGGGGAACCCTTTAAATTCAAAAAGATCAAGAAGAAATATGAAGAATCGTTGAAGAATGGAGTTCTAAGATGCTAAAAGAATTTTCAAGTCTAGAAAATACTCTCTTGGTTATGAAAAGCGACCAAGAAAGATGGAAGCCTATTCTAGAACACCTTTCACCTCCTACTATAGTTATCTTGAACCTAGCAAAGTAGCCGACGTGTCCTATATCACTCCTGCAGTATTGGAAGAAAGTAAAAAAGGAGTAATCAATGTTCTTGGTATCTTGAATAAAATGCTATAGAATTTGTTACAATATTCAAAAAGACGACAAGAATTTGAAAAGGCTAGAATTGCAAATATTGGGAATAACACTCATGAAATTCTAGAACTTAGCTGATACTGTGAAATGGTGCAAGCAATGAAACAAAAGTTCTAGAAGATTCGAGACTTGAGTGTGAAGGAGTGTAAGCAAACAGGTTGATATTCAGGACTCGAGTGTGAAAGACGTTGTGGGTGGTGAAGAAGAAAAATCAATTGAAAAAGAAATCCGAACTCAAAGTTGTACAACCTATGTATTGACAAAATCTGTGAGCAAGAAACAAGAAGATGGGATGATGGAACCTAAAATCCTATTTCCAGTCCTTGGTAAAGCAGAAGAAGAAGTTGCGATCCCAGGTAGTATTGTTGCTTGCGAAGAGGAAGAAGACGAGAAGGAAGAATATGCAATCATTTTCGACCTAATGCCCATCCAATCCGACTGGTATTTTTTTCTTTGACCTGCAATCTAAACATTCCAACCCAACTCCCTTCATTTTGGCCCCATGACCCACGCTATGCAACCTAAATTTGGCTTTCTTCATTTTTTTTCCCTTAATCCAACCAATTATCTTATCTCCCTAGTTGAGATGTCCGAGTGCACCTTCTGATCCCAATTTTGTTCTCATACGATGTGCCTAATTATCTTAATATGTATTGAAAATTGAACTATTGTAACATGAGCTTTGTCTCATTTCATTTCATCAATGAAAGAGGTTGTTTCCTTTTAAAAAAAATCCAACCAATTATCTCGGTAATGGAAGGCAAATATTTTTCTGGTCAGGTCCATGGTGTACTGAAATTCCCCTAAAAGATTGCTTTCCCAAGCTGTTCCGAATTGCTTCAGCTCCAAAAGGCAGCTTAAAGTTGAGGAAATTTTTGAGGTTCAACAGCTGCTAAGTAGGGTTGAAAGTAGCAGAATTTCTTCATTAAGTGATTCAAGAGTGTGGTCCTTGAATGCTTCAGGAAGTTACTCAGTAAAGTCCTTGTCAAAATACCTAAATGCCTCTTCTCCAGTTGACAAGGTATGTCATATTGCTCTTTGGAAAACAAAAAGTCCCAAAAGCGTAAACATTTTGGCATGGATCATGCTGTATGGGTTCCTAAATTGCTCATCTACCTTACAACACAAGCTTCAGAGCAAGTGTTTGTCACCCTCAATTTGCCCTCTATGTTTAGATAACAGTGAAGATATTCGGCACTTGTTTTTTGAATGTTTCTTTTCAAAAACTGCTGGTGAAAATTATTTAATTGCTTCAATATGAGTTGGGCCTTTGGGAATTCAGCAAAAGAAAATTTTATGCATTTGTTAGTTGGTCCTTCTCTTGCCTCTAAAGCTCAACTTTTACGGGCAAATGCTATTAAAGCTTTGACTTCTGAGAGTTGGGTTGAACAGAATCAGCGTGTTTTTCATGAAAAATAGAAAGATTGGTTAGATAGATGGAGTTTAGCCCACCTGCTTGCTTCTTCTTGGAGTTCACAATCCAAGTTTTTTTGAAGATTATTCTATTCAAGATATTTGTCTTAATTGGAATGCTTTCATTTTTTCTATGTAATCAAACATTGTAATTAGGTTTGTACTTTTGGTTTTCTTGTATCTCGAGTAGTATTTGATCTTGGTGTTAAAGGGGTGTCAACCTAGTTGAGATGCTTGGGCGCACCTCCTGATCCACACTTCTTTATTGTCTTTTTGGATTTTTTGTCTCTTTGTATTTGAGCAATTGCACTTTTCATTATATCAATGAAAAGTTCCGTTTCCGTTAAAAAAAGAAGTTCCAACCAAGCTTGATCACTAACCAACAAAGCCCATTATTTTTACAAACAAACTTCAGATATACGAGAGCTTCTTTTGTTAAAGTCAGCAATTTTTTTCCTTAAGGGACACTATTATTTGTGTTCAATTGGCTTGGAAGATGAATTTCTTTTATGTTTTACGACATATTTTGATGTCGAGGATGTAGATTTGTTTTTTTTAATAATATTCATTTTCTTTTTAAAACTTGAGGACATGTTTTTTTTTTCTTTTGGAAGGATAGAATGATGTAGTAGGATTAGAGTAAATTAGGGTTTCTTGGTCAAGTTCTTATATTATTTGAATTATGATTAGTGTCCTTGATCGATTAAGATTACGATTAGTTTGTTTGGTTTATTAGCACTAGAATTAATTTCTTTGATTAATTCGGATTATAATTAGCTTGCTTTCCAATTCTCTATAGCTAGAGGAATTGTCTTCTTGTATTGATAACTTCTGATTCATAATAAAGACTTTGATTTTATTATTGGAGATTTCTCTGCTTTTATCCTTTAGGCTAATTCACGTGCCATCATATTGATGCATCCCTTAAGGGGGAGTTTTCAACAGTAGCAATATAATCTGAGATGCTTAACCA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MEEDEGELLLWKSNSASQSMVSVTIGRVMVTLLAARPKKLHDAVSALSPDHRHKASSLDSLDQSLWFLHQYVKDAVQNHASLDEILIPMLEHTLRFKDKNWQRGGQVMVLLNWLFLDELIFRTLIKNLADIIVRKDDRYVALGWCILVRSLVEFESVPCELSLNGLRERYNDMLKVLCPCIPRLTCILSKRSILQEGFELPSRLSVCAADCVVSLTNALTAKSEVQTRQKRLNVSSSYQQVTFFSNAVDDQREKPISSSSKDSDSDMEYLLWHQLKDLVILVQRLLAWSRKSRPLHAKGLEQVLKWLHEINLHYGNFQNEAGKAKSKIPRTGALVLSSCWRHYSILLFLEDCRFSQHYEEWLNQYLSGIQYYSGHRTGESIGNKDGRETTIFFLNCICLLLGRLDSKRFESTISEYGTQICQVLLLQFHSTDEDVIDEVVSIFKAVFLNSKFSSGGNITDTWQLDVVMPLLLNLLDERDVTTRAVIILIAESCLMSRDGQFLLEVFKRFDSDSIMQRRNAIDVISEIVQMSSNTRNLLTQSAWQDTANQLIKCLEDEEILIRKQAADLLPCVDPTLFLPSLVRLVYSSNDKVLASAREALIGVLKCHNQNIGAIFMLLDCVSDFALNTTLPNTGGNSQGSKLQSDRVLSLIPQWSQSVQDWKFLIGQLIDKLFEEPSNAVLVRFLSIINDHLVKAIDVILKRILSYVKRQKEIDECFYTKQESQEEDISLSVQQFLFERLCPLLVIRMLPLEVFNDLSMSIMYGQLPNRSIMHDMDIVDHTCVAALLLNRAFSKFEFDDVRKLAAELCGRIHPQVLYPFVSSILEDAASSHNIPRIKACLFSMCTSLVVRGQHNFSHFDMFEIAKTLEVILSWPSQNGDEVSKLQHGCIDCMALMICAELQAPDSCSTSNLETIDIDKKGHASLKGSILGYVINQLINGTNELVSTNLDKSDNTSDNSTPLSLRLCMANVFISACQKLSDSRKRRFTRKVLPHLISFVEVTSTQVDIRAACIGVIFSAVYHLKSAILPYANDIFRVSLNALKNGPEKERIAGAKLMVSLMSSEDPILECISGGLLEARDVLSSVSSLDPSIEVQQICQKMLQCLLSP Homology
BLAST of CcUC04G060170 vs. NCBI nr
Match: XP_038882127.1 (uncharacterized protein LOC120073376 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1952.2 bits (5056), Expect = 0.0e+00 Identity = 990/1108 (89.35%), Postives = 1045/1108 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. NCBI nr
Match: XP_038882125.1 (uncharacterized protein LOC120073376 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1945.2 bits (5038), Expect = 0.0e+00 Identity = 990/1115 (88.79%), Postives = 1045/1115 (93.72%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. NCBI nr
Match: XP_038882126.1 (uncharacterized protein LOC120073376 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1933.7 bits (5008), Expect = 0.0e+00 Identity = 987/1115 (88.52%), Postives = 1042/1115 (93.45%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. NCBI nr
Match: XP_038882128.1 (uncharacterized protein LOC120073376 isoform X4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1923.3 bits (4981), Expect = 0.0e+00 Identity = 983/1115 (88.16%), Postives = 1038/1115 (93.09%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. NCBI nr
Match: XP_023543535.1 (uncharacterized protein LOC111803391 isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1872.8 bits (4850), Expect = 0.0e+00 Identity = 962/1111 (86.59%), Postives = 1023/1111 (92.08%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUA9 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X8 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1870.9 bits (4845), Expect = 0.0e+00 Identity = 949/1121 (84.66%), Postives = 1020/1121 (90.99%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B593 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X6 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1869.7 bits (4842), Expect = 0.0e+00 Identity = 950/1128 (84.22%), Postives = 1021/1128 (90.51%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUC1 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X7 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1865.1 bits (4830), Expect = 0.0e+00 Identity = 949/1125 (84.36%), Postives = 1020/1125 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUA1 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1860.5 bits (4818), Expect = 0.0e+00 Identity = 949/1137 (83.47%), Postives = 1020/1137 (89.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUB5 (uncharacterized protein LOC103486160 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1859.0 bits (4814), Expect = 0.0e+00 Identity = 949/1141 (83.17%), Postives = 1020/1141 (89.40%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. TAIR 10
Match: AT3G57570.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 957.2 bits (2473), Expect = 1.1e-278 Identity = 515/1096 (46.99%), Postives = 743/1096 (67.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G060170 vs. TAIR 10
Match: AT3G57570.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 948.7 bits (2451), Expect = 4.1e-276 Identity = 513/1100 (46.64%), Postives = 742/1100 (67.45%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
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