CcUC03G054130 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC03G054130
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr03: 24659773 .. 24672237 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC03G054130
SyntenyCcUC03G054130
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCCAGTGGGCAGTCAAGATTTGTCAATGCAAACAACTTCAATGTTATTTACAAGATGGAAATCATTTTGTGCTGTGATCTTACAAACCATACTTTGAAATGCGTCTGATATGTTCCAATCTCTTCTTGAGGAAAAATTGTTTCTATCTCATTGAAAGATTGAATTTTTTTTCCTCAATAAGATGTATTTTCGTGACTATTTTCTTACTCATTTGAGTTCATATGCAAATGTATGTACTAATACTTATAATTATGATATTGTTGTGATTTGTTTTAACCGAATATCATTTGGGACATTGAGATAATAGTTAGTATCACATATAGAGGCAAGAGTTTGAACTAAAGATTTTTTCCCACATTTTCTGTTGAGATTAACTACATGCAGAGATGAGATTTGTCTCATATAATATATGAAACATTAGAAAACATTTACTAAAAAATTTATCATTTTTCTTTATTGTAACTAGTTGAGCTAAAGTTAGGTAGAAAAAGTTGCATTATCTATAGATTCTTTACGGTTGACAAACTAATTAACTTTTATGAGTTGAATTATTTGTGGAACCTTCTTTGTGGCTAAGTATTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTCCTCTCTCTCTCTTTGATTTAGCGAACATTTTTATGATTGAACAATGACTATTTTGATGAGTATTAATCTCTTCAATTGTTTTTCAAGTATTCTTTTAGCTCGATATTTTGGTACTTCAATGATGGTTTGAGCATTCTTTAGTTTTTGGTTTCATGGCTAAATCTACATGTTCTTTTCTAAAAACAATGTTCTTATGATTGGCCACTGTTGATATATTTGTTTGGGATTCAAACCACAGATTTCTTGGTCGCTAACACATCAGTTGAACTATGCTCAGTCTACACGCTAGCTAACTTTTATGAATTGAATTGCAACGACTATTTTGATGAGTGTTAATCTTTGTAATTGTTTTACACGTAATCTTTTAGCTTGGTATTTTGGTACTTCGGTGGTAATTTGGGCATTCTTTAGTTTTTGGTTTTGTGGCTAAATCTAAATGTTATTTTAAAATAATAATAATAATAATAATAAATAAAAATTAAAAAAAAATAATAATAATGTACTTATATGATTGAATCATTGTTGATATATTTATGGAGAACTTGAACCACAGACTTTTTGGTTTTAACACATATCGCATGCCAACTAAACTATGCTCTTTACCATTGACAAACAAACTAACTTTTATGAGTTGAATTGTTTGTAGGACTTCCCTTATGGCTATGTTTTCGCTCTTTCTTTCTTTTCTCTTCTTTTCTTTTTTCTATTTTCTTTTTTTATTTTTTTAGATTTTGAATCAGTGAACATTTTTCTGATTGAACAACAACTATTTTGATCAACGATAATTTTTTCAATTGTTTTGCAAGTATTCTTTAGCTTGGTATTTTGGTACTTCAATGATGGTTTGAGCACTCTTTAATTTTAGGTCTGGTGGCTAAATCTAAATGTTGTTTTTTAAAACAATGTTCTTATGATTGGATCACTGTTGATATATGAAAAATTTGAACTACATACATTTTGGTTGCTAACATGTATTGCATGTCAGTTGAACTATCCTCACTTTGGCAGCAAGATTGGTTAATAGAAGAGTATTGATTTCATATAATTTCATTTAATTGAGAGTTTGATAGGGATGAAAATAAAGCTTAAGATGATTTAAAGCTTTTAATTCTTGTTCCAATTGTACTAAAGTTTTTTTTTCTTTTAATTACATGGTTATTTATCTGTTTGACGTCAAATTTTATAAATCATTTTTTCAGGTAACATTTACATATTATTAATTTTTCATTTTATTTTTAAAAATGGCAAAATAGGTCAAACTATTTAAAAAAATTTCACTGTCCATCAACGATAAGCAGCAATAAACTTCTATCGCTCAGTGATAGAAATCTATTATAGTCTATCGTTAATAGATAACGAAAATTTTTTATATTTATAAATAGTTTGATATTCTGTTCATTTATTACATTTCAATCTGCTCCTAATGCTTTACCATTCTTAATTCTAGCATTATGTAATTGTTCTATTATATCACTATAAACTTCGTTAATCCAAACATAGTTTGTGGATAGGAAGTACGAATTACTATCCCAAAAGTTATCTCTCATGTCCAACAATTGTGAAGCTCCAAAAAAAGAAAATTTCAGTTCCTACCTTAGATTTGTGGATTTTAATAAAACATAATTGTCTTTGTTTTTAAATAGTTATATGTCTACTATTAAGACCCCATTTGGTAATCACTTTGTTATTTGTTTTTGCTTTTGAAAATTAAACATATAGCCACTACTTTCACCTTCAAATTTCTTCCTTTATTGCCTAGTTTTTACCAATAATTTAAAAAAACCAAGCCAAAATTTGAAAACTAAAAAAATAGGCCTCGTCTTATAACCAATTCGTTTTTCGTTTTGGTTTTTTAAACTTAAGCCTATAGACATTACTTCCATCTCAAAAATTCTTCCTTTGTTATCTGGTTTTTACCAATGGTTTAAAAACCAAGCCAAATTTTGAAAATTAAAAAAAAAAAATTATTATTTTATTATTTTTTTTTTTGGAATTTGACTAAGAATCCAACCATTGTACCTAAAAAAGATGCAAATTATTGTAAGAAGTATGGAGGAAATAGGCTTAATTTTCAAAAACCAAAAATAAAAAACGAAATGGTTACCAAATGAGACCTAAATTAATCATTCAAAATCAATTGTGTTTTTTCACATGAATAACAAAGAATTGTTTTAGTACAACAACTGAAATAAGGAGATTTGAACCTCCAACTCCGAAAAATGAATATATGTCAATTATCATTTAACTGTATTTAGTTTGACATTATTTTGAAGAATTAAAAACATATATTTTCAACACAAATATTTCTCTCTTCATTTCTTTCTTGAAATATGTCCAAAGAAAATAGTTTCTTTTCATGACATTTTGGAAGCTACTATATTACCATGTTCCAATGATTAAATTATAGCGAGAAAAAGCTTTGTGAATGTCTACAAGATTTTTATTCACAAAAGGATCAATTTGTTTTCTTATAAAACAAACCAAGATTGGTTGTCCATTTCACTCAATCTTCATGGTAACTCCATAAAAGAATTATCTTTACTCATTTTGAATTTTGTTTGGCAAGGGAAAAAATGTAGAGTCCTTTTGTGTTGTTCCACCGTTGTTTTACTCAGTTCTTTAACATTAGGTGTAATCTTGACATTCGTCACTAATTGTCTCTACATTCCAACCTTTTTGGCACATTTTAGGTATGCAAAATGTAATGTGCTCTTTTAGCACGATGATTTTGTCTTTAATTTGAATCATCTACCATTTTAAATAGGTTAAAGAACATTTTTTATTTCTACTTTTATGAGCATAGCAATTTGACTCTCAAACATTAGTCCGTAATAATTGATTTATGTCCTAAATATCTAGATATTATTTAGGACATTAAAAGAATAGTTAGACATTTGTATAACATTACATCACATATAACGATAAGCCAGCAGTGGAAGTGAGATTCGAACATGACCTTTTAGATAATGTAAAGATGTTTGAACTTTTAACCACTAAATTGTGGACCATAAATTAGGCTTTATAAATGCATCTCATATAGATGCATAAATCATCGGTTACACTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAATATCTATCATTTTCTTTGTCGTAACTAGTTTAACTAAAATAGAAAAGGCTGCATCATCTATTCTTTTCTTAATAAAGAAAAATGAGAGTAGAGTTCTAAGTCCACAATACAGTCTTCCAGCGTAAAACAAGTAGTCATTTGATAGGAAATAAATGGTTGTAAAACAAGAGCGATTAAGATATAGATATTATGATACAGGAATCCATGAACATAACTCGACGACAAGTACAATTAAACCGGTATCTACAACGATTGGCTAGCCTATTATGTATTTTTCATTTGCCCAAATGTTACACAGCATTACCGAGTGATCTATCACCTAATCTACAAAAAGAAAAAGGAAGAAGGTTTGAGGGGGAAAAATAGAAAATGTTGACGCCAGTTATATTGAGTCGAAAGATCGATGAAGGCCACTGTAGACTGCTTTCCTGAAAAGTGGGTGTGAATCTTCTGATAATAAGACTTCTACATCCAATTTCTCAATGTGTGGCCATATCTGAGCACATCACACAATGAAAATGGTTGGAGTAAGAAACAGAGTTCAGGTTGCTGCATGTTATTCTGATAGTTTCAGATATTAATCATAAATTTCTTTTGCATCATTTTTAGTTTTCATGGTTGGCAGTCTTGAAGTATGGCACTGTATCAAACGAAAAATACCTCGGAAGCGTATTGCCTCGAGAAGGCCTTGACATATCCCAAGGTGGTTAAACACCATTGTTCATTTTCACCTATAGTGTAGGCATGCTCTGTTCTACCATTCAAATGACTGCCAAAAAAGAAAAACATAGTGAATTCATAATTGAGATTAAAGGAAATGAAAAAGGTCATGGATTGAAAATTTGGCAAAAAGATATTGGATCAATGTCCTCTTGACGAAGAAAACCTTTTTTCAGGTCTTGAATCTACATTGTCCATCTCCATGGCTGATGGTTCTTCAAGGTCCATAGCATTCGCATCAGCAGGATTAATAGACTTCAAATCCTGCAGAGTTTGTGCGCTCGATGCAGCTGGAAGGCGTTCTGTCAATATACTGGAAAAGCTTTTGTACAAAGATAGAAATAATGTCTGCATAGGGAAAAGATTAGTTAAAATGAGAATGACATAGCTGTCAAGTTCCTTAACTCTACAGCAAAAGCAATAGAAAATCGAGAATACTGACATCAATATTGGCTCAGGTTAATGAAAGAGGTGCAAATTATTTCTAGTCTTGGAATTAAAATACCTCATTCTCCTCAAGAGCTCGAGCAAGAAGAGCTTCTTTGGCTTCTAAGGAGTCCCGCATCGATATCTCCTGCTCTTTTGCTCT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mRNA sequence

ATGGCCAGAATCCATGAACATAACTCGACGACAAGTACAATTAAACCGTTTTCATGGTTGGCAGTCTTGAAGTATGGCACTGTATCAAACGAAAAATACCTCGGAAGCGTATTGCCTCGAGAAGGCCTTGACATATCCCAAGGTCTTGAATCTACATTGTCCATCTCCATGGCTGATGGTTCTTCAAGGTCCATAGCATTCGCATCAGCAGGATTAATAGACTTCAAATCCTGCAGAGTTTGTGCGCTCGATGCAGCTGGAAGGCGTTCTGTCAATATACTGGAAAAGCTTTTCAAAAGCAATAGAAAATCGAGAATACTGACATCAATATTGGCTCAGGGAAACAGCACAGACACGCATGTTGACTCTATTCCAAGAAACCATAAGAAGTGTAGATTCCTTCTAACCATGCTGCTCAGAAAGGGGAAAAGAAAACAAGACGATAATATGAGCATTCCAAAATCCATAAGACCCCAACACATGTATGGCAAGAAAGATAATGCAAACACACACAACAATGAGTTCTTTGGTGTTTGCAAAGTTCAAACTTACAAATGGTGTGAAAACCAAAGTATCAACCGTATGCGACACTCCATGTCTAAATTGGCTATTTTCTCAAAAAGGGCACGAACTGCACCAGCTACAACTGCAGGAAAGGCCCCAGGGAGAGCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCAGAATCCATGAACATAACTCGACGACAAGTACAATTAAACCGTTTTCATGGTTGGCAGTCTTGAAGTATGGCACTGTATCAAACGAAAAATACCTCGGAAGCGTATTGCCTCGAGAAGGCCTTGACATATCCCAAGGTCTTGAATCTACATTGTCCATCTCCATGGCTGATGGTTCTTCAAGGTCCATAGCATTCGCATCAGCAGGATTAATAGACTTCAAATCCTGCAGAGTTTGTGCGCTCGATGCAGCTGGAAGGCGTTCTGTCAATATACTGGAAAAGCTTTTCAAAAGCAATAGAAAATCGAGAATACTGACATCAATATTGGCTCAGGGAAACAGCACAGACACGCATGTTGACTCTATTCCAAGAAACCATAAGAAGTGTAGATTCCTTCTAACCATGCTGCTCAGAAAGGGGAAAAGAAAACAAGACGATAATATGAGCATTCCAAAATCCATAAGACCCCAACACATGTATGGCAAGAAAGATAATGCAAACACACACAACAATGAGTTCTTTGGTGTTTGCAAAGTTCAAACTTACAAATGGTGTGAAAACCAAAGTATCAACCGTATGCGACACTCCATGTCTAAATTGGCTATTTTCTCAAAAAGGGCACGAACTGCACCAGCTACAACTGCAGGAAAGGCCCCAGGGAGAGCCTAA

Protein sequence

MARIHEHNSTTSTIKPFSWLAVLKYGTVSNEKYLGSVLPREGLDISQGLESTLSISMADGSSRSIAFASAGLIDFKSCRVCALDAAGRRSVNILEKLFKSNRKSRILTSILAQGNSTDTHVDSIPRNHKKCRFLLTMLLRKGKRKQDDNMSIPKSIRPQHMYGKKDNANTHNNEFFGVCKVQTYKWCENQSINRMRHSMSKLAIFSKRARTAPATTAGKAPGRA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC03G054130.1CcUC03G054130.1mRNA