CcUC03G053540 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC03G053540
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr03: 23043140 .. 23048646 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC03G053540
SyntenyCcUC03G053540
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAACTTCAACCAATTTGCTTATGTACCAAATAAGCACATGAATCCCAGTAAATTATAACTTGAATGATTTTGCCCAAAACACTTCAAATTTCTTAGTATGATATAAGGCAAGATCTATTATAATAGTCTTTGCTCTCAAGTCCTTTTTCTAACCAAGATTACTCTAGTGTTCAACAAATTTCAAATCCCTTGGCAAGAAGGAGAATATGTGCAAGCCTTCATCTTCTTATGAACCAATCCCAATCTTTAGCACACGTCAACAATATATCAATTGTTATTGGGTATAGTGTGTGCCCTAGTTTATTGTGTATTTATGTACATTACTATATTGTGACTTTTATCTTTACTATATTGTACACTCCACTAGCTTTAGAACAAATAGGAGATTGGTAGGATTTATGTCATAAATCTCGTAGTTTGTATTGTAAACAAATTTTATTTATTTAATAAAATAAAAGAGTTATTTTATTCAACTTTTAGTCTTGTGTAACTGAAAAGCAGCTAAATTGTGCTTTCTTAGGCTTAGATTTTGTTTAGTGTTATAGCTTAAATGAGATATTTGATGATTTATTTATTTATTTTGTAGAAACGAGCAAGCAGACCAGAATGAGCCAAATATGGTGTAAAATGACCAAAATACACCTACAATAGATCAAACTTGAACCTAGGGTAAAGAATAAGTCAAAAGGGGGCTAAAAAGTGTAGAAGAAGCAAGTACGACGCAGGTGCTAAAAGCTAAAAGAGCAAAACAAGGGAACGTTGCGACGCTCCGACTCTTTCCACATGCGTTTTTTTTAAAAAAGCGTCGCGACGTTGCATCAATTCCATCCCTATATTAAGTCTTATTTTCCGTCATTTAAGGGGGAGTTCAACTTGGGATCACTTAAGGCTTTCCACAGAGGCCGAGAGGCTGCCGTTCATAGATATTTTTAGAGCCTAATGAAGGGGTAGATGGAAGTTAGATCAAGGAGAAGTTGATGCATTATTGGCAACGGCTTGATCGACGACTAATTCTTTTCTCCTTTAATCTCTTTCTTTATATCTTTGTACATCATGTTTAGGGTTTATATTCTGAACATGAGTGGCTAAATTAATATGTAGTTTTAGAGTTTGATTGATTTCAGTATTGTTTATGGATGGTTATTAATTATTTTGATTTGGCTTTTTATCATGTTTGCACTTTCCCAATTGAATGCTTGATCACCATTTGATTGCCTTAGGGTTCTTAATTCTACTTGAGGGAGAGATTTATTAACTAAAACTACCATGATAAACTAGTGTTGGATTATGCATGTGAATGATAGGAAAACATTAGAGGCTAATAACAAAGAGGCTTAATGTTATGTTTACTAGTTTCAATTGCATGAAAATAGAATTGGCTTTTAGACATAAGAAACGGTGGAGCTCATAAGAGAAAACCCAGATCTTAAATCTTCTAGGCCTAAGTTAACTCTTTGTTTTAATTGGAAGAAAATATTTTTCATTCCATAACAATCTTGAAAGAGATCAATACCCTAGGACATCTTAGTCAAGTGAGTCTCTAGTTTGAACATTTATTTTCTTTCTTTTATTTTTATTGTTCGTAAATCACCTTGTTTGAATCCCTAAATAAAGTTCAGAGAATTGTCTAATAGTTAGTTTAATTGAATAAATAATTCCCTAAGGATGATATCCAATTGTGAGGATTATTTTTATTATTTCGAAAGCATGCACTTGCGGTTATCAAGTTTTTGGCATCATTGCCAGGGAATTAGTCTTATTTAATTTGGCTAATATTAAGGTAATAAGATTGATTTTGATTTAAGTGGTATTTTATTTTTATCTTTATGTTTTGTGAATAATTTTTATTTTTATTTTTGTAGTGCATGCGACGGAGTCGCCAGGTTGAACTCATGCCTATCGATCCCGAGATTGAACGTACCTTTAGACGAAACCTAAGGAGGAATTTAAGAGCTGTGTTTGATTTTATGGCTCAACAAGCAAAAACTAAAGCCAGTAGGGATTAGTTTCAACCAACTATTCCTACTAATCGACTTGAGATTGTGTGGGCATCGCTTGAAGTCAACAACTTCAAGCTCAAGGCTGGTCTTATCTAGATGGCTCGAGATTGTGCATTTAGAGCGAGTCCAGCTGAGGATCTCCATATGCACTGACGCTTCTTCTTGGAGATTTGTAGCATAGTAAAGATAAACGATATTCCTCTTGATGCCACACGCTTACATTTATTTCCTTTCTCCATGTAGGATAAGGCTAAGGAGTGGGTAGAGTCTCTTATGCCGGGTAGTGTGACCACCTAGGATAGGCTAGCTTAGGCATTTCTAAATAAAGTTTTCCCACCAGCAAAGATGACGAGGCTCAGAACTGAGATAGGTACCTTCAAGCAGAATGAAGGTGAACGACTATTTGAAGCCTAGGAGAGATATAAGGATCTCCTGTGGAGATGTCCACATCATGGATAACTAGACTGGCTCCAGATCCAATTGTTTACAATGGTCTGTCTAGTTTAACAAAATCCATCTTGGATGTTGTTGTGAGAGGGTCAATTTTTTTTCCAAAACTTTGTAAATGTTACAAAAGTTGTAACTGTTACAAATGATTTGATCCAAATTGTTCAAGTGGAGACATGCGAGTGGGGGTATCCTATATAAAGAGGTTGTATAAGACCGGATCGCGAAATGATTAATATATCCTGTTTATGAGGGCAATCCTTTGACTTATACAGGTGAGAGTGGCCCGTGTCTCCGACTCAATAAGCCTACTCAAAGGTACATAATCCACTTCTTTATGTATTTTGTTGGCTTTTCCTTTTCAAATTTACTTGCAAGTCCTTCCCGATTTGACCATAATTTCATCTCCCTCTTCTCTTTCTTTTTTCTTCACGGTTTTCTCGTGACCGCTTTTTTTAGGCACAATTTGTTTACAATTTTTAGAACATTTTGTTTATATTTTTTAGGCACAGTTTGGTGTTTCATTGATGGTTTTTGGTGTTCATTGATTCAATTTTTAGAACATCAAAAACACTTTTTGTTTGGATCTATCTTTTTTATTATAGCAGTTCTAATTCTCAAATTTACATATTTTTTTTTCGATTTGTTATTATTTCTTCCAATTGATGTCTAAAATAGCCCTATCTTGATTTGTTTCTATTGATGGTTGATAACTTGCAGAAATACAAGTTATTATAATCACTATTTGAATTAATTAGAGTAACTTTAGAGCTAAACGCATGATTTTGGTAGTTGAATTATGTAAAATGTACCACCATGCGTTAGCACTATTTACAAAACAAAATATCTGAAAAATTATGAGCTTTTCTGTTCTTAACGCGGGATTAAGAAGAAAAGAAGCACTAGAGACGAAGCTGCTGCGAGAACAAATGGAAACCCATGCGCCGAAACTATACGTTCGAGACCATGCTTCGAGATCATGCGTTAAAGTAGATACAGATGCCTGGGCAAAAGCTGTCATGTCAATATGCAAAAGGATAACACGTTATCAGGTCATGGCAGAACAAATGGGCCGACGATGTGAAAAGGCTGCGCAGCAGGGTATGGAATTTAATGTAAAGGTGTCAGGTCATCATTAGTTCACTTTTTCGACGCCTATAAATAGCCCAAAGCTTCTCCATTCAAAAGCGAGGAAGGATTAAGAGAGAAACGCGTGACAGGCGTGAAGACTCTACACACCTCCTCCACCATAACCAGCCACCATTTCGAGCTCTTTTGAGAGAAGGATTCTGAGAACTTTCAGAATCGTCTCCCAGTGAGTGAGAACCTTCACCCTATGGACTTTATGTATCAGATAGCAACAATCTCAAGTCTCCATGAAGCAAGACGTCGCTAGTGGCGACTTGATGTCTTCCATTTCTGTTTTATCTCCATTTCCATCCTTCTTACTTATGTTTTGTTAATGACATTCGAGAGAATGATTTATTTTCTTAAATATGAGAATCAAACGATTATCTTCCATCTATTTCCATATTAAATATCTTACACCATGTTGTTTGAATGCTAAATGAGTTAGATGTTGGAGTTAGTTTTTCTTAAATAATATGAAGTATCAGCATCCTGATGAATGCATATCATTAGCTTGCATAGCATTGTCTGACAAACAAATGCGACTGTCTAGCTTGAGAGAGTAGATAGTTAATCCTTAGCATTTATCTAGATTAGATGAGGTGCAGAGATGTAATTCATTTTTTGCCAATGCAAACTTACCATTTGTCTTAGAGATACGATTAATGTGGCATCGGAACATCGAGAGATGGATTCACAAACTAAGTGTGTAGGTATCTTATACTTAAATAGGTTTAAGTTTTTTGTCTAGCTCTTGCGTTAACTCTACTTTTATTGCATGGTTTCATTCATCCTCAACGCATGCTATCTAACACAAAGACATTTGACTAACCATCGTCGCGTCTCCTCATTGTTAGTTGTAGGAAAATTTATTCATTATTTATGTATAGTTTTAGACACATACAACTCATGCACATGTTACTTGTATAGTTCATCGCATAGTCATGCATCTATTCTCAACGCCTAGTTAATACAAATCCCTGCGTTCGACCTAGGAAACCTATAAGAGCTTATACTTGGGTTTTTATAGGAAAACTTGCTTAATCATGATCATACTTGAGTAATTCTCGACGCATTTTTGTACAACAAACTATGAAACTCAATTTAAAATAGAAATCCAATATTAAACCAACAACAATGGTTAAACCAAAAGCTATCTCTCCTTATTTTGGCTAGTACGACTCTTAGATTCACTCTCTTAGAAACTCCCTTCCACTGACGAGAATCCACCTCTTGCAGCCTCTTCTTTTTGGGAATGCGAGGCAACATTAGAGTACCATAATTTTAGAGACATGGTAGGAGGTTGGATTTTAATGATTGGAGTTTGGTGGGTGAGGTTCTTTGATCTACATTGGACACCTTAATTTCTAATCCTTTAAGGCCGATAATGATGAGTAATTTATTGTAGGATTTTCTCTTCAAT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mRNA sequence

ATGAACTTCAACCAATTTGCTTATGTACCAAATAAGCACATGAATCCCAGCACAGTTTGGTGTTTCATTGATGGTTTTTGGTGTTCATTGATTCAATTTTTAGAACATCAAAAACACTTTTTGTTTGGATCTATCTTTTTTATTATAGCAAAACTCCCTTCCACTGACGAGAATCCACCTCTTGCAGCCTCTTCTTTTTGGGAATGCGAGGCAACATTAGAGTACCATAATTTTAGAGACATGGTAGGAGGTTGGATTTTAATGATTGGAGTTTGGTGGGTGAGGCCTAAATCTTGCCTTGCCACTACGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAACTTCAACCAATTTGCTTATGTACCAAATAAGCACATGAATCCCAGCACAGTTTGGTGTTTCATTGATGGTTTTTGGTGTTCATTGATTCAATTTTTAGAACATCAAAAACACTTTTTGTTTGGATCTATCTTTTTTATTATAGCAAAACTCCCTTCCACTGACGAGAATCCACCTCTTGCAGCCTCTTCTTTTTGGGAATGCGAGGCAACATTAGAGTACCATAATTTTAGAGACATGGTAGGAGGTTGGATTTTAATGATTGGAGTTTGGTGGGTGAGGCCTAAATCTTGCCTTGCCACTACGTAA

Protein sequence

MNFNQFAYVPNKHMNPSTVWCFIDGFWCSLIQFLEHQKHFLFGSIFFIIAKLPSTDENPPLAASSFWECEATLEYHNFRDMVGGWILMIGVWWVRPKSCLATT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC03G053540.1CcUC03G053540.1mRNA