CcUC03G045960 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC03G045960
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr03: 3962844 .. 3967686 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC03G045960
SyntenyCcUC03G045960
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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ATGAGGGTCTAAATTGTCATTTAGTACTTTTCAAATCAATAGAATTTTAAGCCGGACAACTCCAGACCTCAGTTCCGTCAAAATGTTGGCGCGAACAATGAACCGTATAAACTGCAACCCAACGAAGCTGCCGGCGAAATAAGAACCGTTTTCGATTCCGACTTCGCCTTCATGGATGCATTGTATCTTCTTTCCGAATTCGCTTTGGGTTGCCTCTGGTTCAAGACAATGGCGTCGATGAATTTCAGCAGAACATTGAGGTTCTACGACAATCCATTTCCGATTTGAACCGTTTCGGGAAGATTTCGAAGCTTATTGCTAGGTTTCTGCCTTCCATTTTTTGAGTCGGTTCACGATGCCCTCAGCCAACGTTATTAGGTCTCTGAAGGTAAGGCGCTTCTTTCATCCATGTATAAACACGTATCCGCTGAGGATTTGAGTTCGATAATGTATTTGTGTGTTTCTAAACTTGTTCTTGAGCTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCATATAGTCACGAAATCATTCGACATTTAATTTAGAATTTCGAATTCTATATGTACTTTTGACTGGTAATGATGAGACAGTGCTTCGTTTTGATCATCATGTTACTATGGATCCTGTTGGGGCTCGGATTGGGATATAGTTGACAAGAGCCTAAAAAGTATCGAAATTCCGTTTAGTATTTTCAATATTTATCTTCTACTATTGTTTATATTTACAAGAAAACTTTAATTGCAATTTGGAATTATCACTTATACCATGAGATTCTCGAATTCATTTTAAAAACATTTCTTCCCTGCTTGTTTCCACTGATCTTTGATATGACTAAGAGCATGCTCTGTCTGATGTGAGACTGCTTACCCCACAACTAGCTTGACATCACACTTTTAACACTCTCCTCTGTTTGTAGACTTGAAAATTTGTAAAAGACATAACAAGTGTAAATCAATATTAATCAGGGAGGAAATGACATACATGAGTTTGAACACATGACCTTCTACTTTGATTCCATGTTAAATCACTCATTGACCCCAAAACTTAAGTTGATGTGTTATGTTAAATATAACTATGTCAACACTTTAATTGTTTGCATCATGCTTATTGATCATGGTTGCATATTGGTGCTTATGACTGATGGGTTGAGGAACTTCTTGGAACTTAGAATTTGGGTTGAGGAACTTCTTGGAACTTAGAATTTCCAGTTGAAGAAGGCAAAAAACCCAGGTTCAATTTAGGACTTGCTGAACTTACGGTCACATATTTTTGATGAAACAAAAATCCCTGGCCGAAGTAATGACATTGTTCTCGAGTAACTGTCTGGAATGTGCTTAAATTTTGTTAGGTTTAATGAGGACTTGAAGTGAAGATTAGCATTTCTGGTGCTTGTACATGAGTTACCACAATATTCATATTCATCTTTGAGCACTTGTCTTCGTCTATGAGGACCTTGAAAAGGCACTTGGACTGGGGCACAGCTAAAGCAGGGCTGAATTTAGGTTCAATGTTAACCGATTTGACTTGAGAATATAGACGCCCAAAGGTTTTACACCAATCGAGTATTTTTCTTCTAGATGCTCTTGATAAGCATACGAGTTATGATTATTTCTTTGTCTACATTGTGCAATTGATTAACTGATAATTCAAAGTTTAAACTGTCTAATTGAGCGTACTGCATGAGTGACATTGTTCTGGTTGACCTTCATTTCGTTATGATGTAACAAGCTGACTGATCAGTGCCACGACTTGCATGAAAATCTTCGGGAGGATTTTTTTTAAAAGAATAATTTTATTATTATTATTATTTTTTCTATTTTCTGTTAGTTGCCTTTGGTTTCTTGGAGAATGCAGGTGTTAATTCATTTCTCTAGTTTATAAATACACCCTGACGTTATACAAGTTTTTGTAATGGACCAACAAAATTGTTGTAATTTTTGTAATTATAATTTTAGTTTTAAATATAAAGCTATCTAAATAACAATGGCTGTAGAAAGTGTTCCCTCTCGATAAAATAGTAATCAAAACAAACATGTGGAAATAGATAACAAAGCTAACGGACCATACCTTAATGAGTCATTGGTTGCCATCCTTTTTATCTTTCTCCAACTTTTGCTTCAATAAATGCTATTTCTCTTGTGGAATCAATTTCTCATGTTCAAAATTTAATGCAGAGGTTGAAAAATTTTTAAAACTATAGCTGTGGAAGATATTGAATAGCCAAGGAAAGCGAATGGCTCCTTTGAATGGCAACTCTTCTGAGGATCTGAAATCTGAAAGGAAGAGAAGGAAGTTAAAAGTTGATCAGGATCTTGGAGGAGCAGGATCTAGTTCATAAAAGCCTGGATGATATAGAAGTTGAGGAGAAAATACTGAGGAAAATGATGGAAAAACGAAGGTGAAGGAGAGGGACTGGAGAGGAGAATGCCACTGATGGCAAGAAAGTTGATCAAGGACTCAAGAACATGGATGAGTAAATGCTGTGAACAGTAGTTAATTGGGGTCAAAGCAAAAGTCAATGGCTATTAGCTGGTACCTGTTCCTGGCCTGCATTTGCTGAAATTTTGGCCATCAGCTTGATGGGTACATTACCTGAAGATGCCTTCTGCGATATGAAGTCTTCACATTGTAATTTGCCACTCAGGTAACTTTTAGGCTAAATATATGTTTTAGTTTCTAATGTTTGGATCATTTGCAATTAAGTATCTATTGTTTAAAAAGGTTTCAATTTAGTCCATTGTGTTATAACATTTTTCATTTTAGTCCTTCATCATTGGTGAACGTTAACATTGGTTGATGAGAAACTGACGTGGCATAATGCTTTGTGAATTGGAAGAAATTTAGAAGGAAAAACTTCGTTGAACAGAGAAGTGTATCAAATTTCTAACACATCGCTAGAAATTTCGAGTTTTCTCCCAGTAGACAACCTTATTTTTTCCTCTAAATTTTCACATGTTATCCAGTATTATGGCATCTAAATTTTTCATGGACCAATTTTAATTTTTAAGATTCACCAAAGAGACTTAATTGAAAAATGATAATACATAAGAGACTAGATTAAAGTACCAAATTCTGTTTTATGTTTTCGAATTCACTGAGTTCGGCAGATAAATCGAATTCTCTTTATGAAAACAGTTTTCGGATTCTGTGATCCAAAAAGTGTAAATTTAGAAAAATAACATTTTTATGTTCTAATTGTATCCAGATTTTGAATTTTAAACTTTAAAATGCAAAGTTATATTAAATAAAGATAAAAATATTTAGAAATCCAATATTTCATGTTATAAATTCAATTCATTTTTTAAAAAATATAATATATATTATGCAAAGTATTATAAATTGTATTATAATACTACAAAATAATAACGTTAATCGTTTTAAATTGTATTCTTTTTAATTTTGATAATTTGTAAATAAGTTAGCACATTTTGCTATTATTTGAAAACAACTCAAGTAATAATATATAAATTTTTTAACCTAAAGCATATTAAAAAAAAATAATAATAATAATCTATTGTCAACTAAATATTGGTGAGTAAGTACAACTAGCTTTATGATTTATAAATATAAAATATTGAACACATTTTAAAGAACGGTTTAAATTAGAATCCAAGTTTTGACTCGACTATCAATTAGAATGACAATTTTATTTTCATTAAATTCTTTGTTTTAAAATTTTTATTTTGAAATTCTCTATTATCTGCCAAACAAGTCCTGAATTTACCCCATCTTCTAATTAGAGAGTACAACATATATTTAACCAAAATATAAAAAGAATTGTCTGCCTAGGAACCTCTACAAGATCTACTTTTCGTCCTTTTCTTTTTTGGTCCTTTCATTATGTAATCTTCTTTGGTAGGTATCTGGAGTTGTGTGCTTTCTATTCTCACCAACCCCATTGGCAGTAGATAGAAAAAGATAAACCACTTAACCCAACGGGCTACCTACCCACCCACTCACCGGACGAGGACGAGTAAAATAGATCAAAACACAAGTTTAGTTTTTGAACTTCGAAGTTTTAGTCAATATAGTTTTTCAATTTTCGAAAGTATTTAATAGTCTCTGAATTTTAATTTCGTGTTTACTAATTTTTTGAATTTTTAATTTTGTGTTTAATAGGTCGATGAATTCAAAACTTTAAAAATTAATTGCTTTCATAGACGTAAATTTGGATATTATATCTAATGACATTTTAGAATTTTCAGTTTTGTATATGATATATTTGCAAATTTTAAAAAATTCGAGAGTTTGAGGACTAAATTTATAGGTTTGACATTTTAGAATTTTCAGTTTTGTATATGATATATTTGCAAATTTTAAAAAATTCGAGAGTTTGAGGACTAAATTTATAGGTTTGAAAGCTTTAGGACCAAATAGATTCAAACAGAATTTCCTAATTGGCTTTAGGGATCAAACTAGAGCCAAAATTGACCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATAATGTTTATTATTGTATGGTTGTGACCAGAAAAATAAATGGGAACCTTTAGACTTCTGTATTATTATTATTTATTAGAGGGTAGATTTTGGCTCATTTTTCCTCTTCCTCTGTTTTTCTTTTCTTTATTTTTTCAGGAGATTCGATGAATGAATGGATGGTTGAAGCAAAATTTTCAACTACTTGTTTCATAGTTTCTTTGGGAAGATGACGACATGTTTGAAATGTATGATAACTTTATTCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGTTAACGTCTTTTTCTTTTTTTAAAAAAGAATAATGTATGGACTTTATTTTTTTAGGATGGTCAAGTAATTTTTAATTAAATTATATTAGTTTCTCT

mRNA sequence

ATGAGGAATTTTAAGCCGGACAACTCCAGACCTCAGTTCCGTCAAAATGTTGGCGCGAACAATGAACCGTATAAACTGCAACCCAACGAAGCTGCCGGCGAAATAAGAACCGTTTTCGATTCCGACTTCGCCTTCATGGATGCATTGTATCTTCTTTCCGAATTCGCTTTGGGTTGCCTCTGGTTCAAGACAATGGCGTCGATGAATTTCAGCAGAACATTGAGGAGATTCGATGAATGAATGGATGGTTGAAGCAAAATTTTCAACTACTTGTTTCATAGTTTCTTTGGGAAGATGACGACATGTTTGAAATGTATGATAACTTTATTCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGTTAACGTCTTTTTCTTTTTTTAAAAAAGAATAATGTATGGACTTTATTTTTTTAGGATGGTCAAGTAATTTTTAATTAAATTATATTAGTTTCTCT

Coding sequence (CDS)

ATGAGGAATTTTAAGCCGGACAACTCCAGACCTCAGTTCCGTCAAAATGTTGGCGCGAACAATGAACCGTATAAACTGCAACCCAACGAAGCTGCCGGCGAAATAAGAACCGTTTTCGATTCCGACTTCGCCTTCATGGATGCATTGTATCTTCTTTCCGAATTCGCTTTGGGTTGCCTCTGGTTCAAGACAATGGCGTCGATGAATTTCAGCAGAACATTGAGGAGATTCGATGAATGA

Protein sequence

MRNFKPDNSRPQFRQNVGANNEPYKLQPNEAAGEIRTVFDSDFAFMDALYLLSEFALGCLWFKTMASMNFSRTLRRFDE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..26
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..23

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC03G045960.1CcUC03G045960.1mRNA