CcUC03G045040 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC03G045040
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr03: 3032590 .. 3037738 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC03G045040
SyntenyCcUC03G045040
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGATGGTTTTAGGCTAAGGCAAGCGAATCTAGGTTGGTATTAGAGGTTTTCTTTCCAATTTTGTAAACTCTTGAGATTCTTGTTTAAATTCATCTTATGACTCTCTTGTTTAAGGATTTTTTTTTAATCTATTATTTCAATTGCATTTCCCCAAACCAGAGAGTATAGTTGATTGCCATAGATTAAAACTTAATACATAAACGTTAAAAGTCCCTAAATCTATAAGTGGCAAAGGTTAGGTTAGATTTGTGGATTGTTTTGACATCCAATCAATTAGCATTTGTTTTAAAAATCATATTGAACAAGTAATTAGGCATTGTCGGTTGGTCGTTCATCTTGGCATATTCCCTTAATATTAATGCTATTAACTTCTCCTCCGTTTCTCTCACTAACTCTTGATCCCTCCCTCTTTGTCCTATCTCTCTCCAAATTGAAGCACCAACCAACCACCAAGGCTGCCTTCTCATCGGCGTTGTCGACCTCTCATGTGCGTCACTGCCTCGAACCTCCACTTTTCTCGCGGAATCGGTGTTTCAAGTAAGTTATTTGGTTTCTTGTGGGTTCTTTTTTACATCATTCGATTCTATTATCTTGCTTGTTGATATGATCACTGTAGTATGCTTGTATAGAGTGAATAATTGTGTTCAAGACAATGCTTATTAGAAGCGTCCTTCCACTACATGTTGATTTCTTTTTACGAGGTTTGTATAAGTTTGTGGTTGTTTCACTTTATAGTCTTTGCTTACTTTTGAACATTATTATTGTATACGTAATTACTATATCCATTTGAAATGAAATTAGTTTGTTATTGTTATTTAGTTCGTAAACCTTGTTTCCCCCCCCCTCAATTTTTACATCTTTGTGCACCTCTAGTTCTTAAACATTGTTTCCCCCACATCTTCTTCATCTTCTCCATTGTTTCCCCTAATTTCTTTTTGCTCTACATTTACCTGAACTCTGTCTTCATCTCTATATATATCTATGACTAGAATCATAAAATGAAGGTATCTATATCCTCGTGATATTTCTTCTGAGCGTATATGATTTATCAACAACTTAATTAAGATTGCAATTTAAGTTTTGGAAAAATTCTGAATTTCTGAAAAATTGAGACTTTAATATATAATTTTGTTCCTTGTTTAACTAGAATTTCAAAAAGAAATGATTTGTCTTTAAATCTTTAATTTCACACCAATATTTTAAATGCAACTAAAATATAGATGATAACTTTTAGATTTAAAATTATTAAATGGATTTACAAGTATGTTGAAATCTGTACCCAAAGTCTCATAATTAATATTTACTAATTATTTAATTGCTTTTACTTGCAATATTATATTATCAAGTACATGTAAAATTATAAGGCTATCAATATAATCTTGAATAATATGTTGATGGCATATGATAAATTATGTTCAACAAATAACTAAAAACATATGATATTTGAATAAGGTTGGGTGAGTTCGTTATCCTGGTGATACCAAAAGATATGATACACTTTGTCATTGTGATTTGATCCAAAATTTTCATGTGGAAACATATGAGTAGAGTTATCCTAGACCGGTATATATAAGACTAGACCACAATATATATTTAATCTCTTTATAAATCCGCTAAGTGAGAGGATTAACATTTCACAAGATGATTGTTGAGTGAGAAATTTTGGACCACTCACAAATCATCGCATCATTTCTCAAATTAACAAAGAAATTACAAATCATCAAATTTGGGACTAATTAAAAGTTGACATGTGGTCCAAATTGAAATTGAAGACCTAAATTGGCCAGTTCTAGTGATGCCACATGTTTTTGTCGCAATTTGTTGGATCGGATAAAATACTTTGGTCTAATTCAGTATTAATATTTGCCAAGTCAATTAAGCTAAAAAAATAAAAAGACTTAATTTGGCCCTTGGCCAATCAAGCCCAATACCTAATGAATTAGACCCAAAGGGCAGACCCATAAACCAATCACGTCTAAGCTCACAAAACTCACAGGAAAACTCTATAAATAGAGAAGTTCTCCTAGAACGTAGAGAAAAGTCACCCTAAAATTAAAAGAGTTTATGCTAAGGCTAAAGTTATTTGAAATACGAACAATCTTCCAAGACTTTAACTTCAATAACAGCAATATGTTTCGCTTCTTCAAATCAAGCATACACATTCATCATTGAGAACAAGTTGCACAACCTTCAAGACAAATCACGTTTGAGAACAAGCTGCAAGATCCTGGAGACAAATCAACTACAAAACCCTTGAGAAAGGTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAAGCATCAAAGGATTATTTATTTAAGATTGTACTCCCAATATTGAAATTAATACAAATACATAATTGATTCAATCAATTAAATTTCTCTCAAAATCTCTTCCAACAATGATCATATGTCTTGAATGATTATGATTACTTTGAGGTAATTAGTCAAGACATTGGTTACCTCCCCAAAAGTTGAGAGTTTAAATCTCCACCCCGTTAAACGAAGAAAAAGAGAGAACACTTTGCAATATGCAAAGTATGTAATATAGAAGCTCGTTCATCACTATTTGGTAAGGCCCTCTATGCACTTAGCTCAACTTGGCGATGGTAGCAAATTGTAGGAATTGTTCATAGCACAATGCTTTGCCCTACACTACAAAGTCAAAGAGAACCCAACAGCCATGTCTTAATGACCCTTCATGTCAGCTCGGAAGAACACAAATTAGTACCAAGGTCTCCTTGAATGATAATTGATCAACATTATATGTTCTTTTCTATACATTTATGTTATTACTTCGTTAAGAAGACAGTCTTCAGTCATCTTCTAAGCTATTTTACAACATTATCAAAATAAAATAATCATGGTTAAGTATTGACCATAATAATATAAGATCAAGTATAAGAATGGTCAAAAAGAAAAGAACTGCTACCAAGTGATCCAACCACTATACACACTAGAGTTAGGAAAGAGAAAAGTTTCAAGTATATGTATTTGTATTGAATGTATGTAATTCTATAAGTAACAGTATATCTTCCAACGGTATACTGCTACAAAAATTATCTTCACCCCAGCATTACAAATTACACAAAATCTCTCCTCCCTCCCTCCCCTCTCTACAGCTAATGGTATATCTTTTGAATTGAAAAGAGCAGAAATCAAATCTGATAACGAAACATGATACAAGAAAGGGCAATGTGTTAGAAATTTCCAGCAGTAAATAGGAGCTCTTATGTACAAAAAAAATGTGCAATCTGGTGAAGAATGTGAGACCCGAGGCGTTTAACGAGACACTAAGTTGAAGTTTTATTTGGAGATTAGAGGAGCAAGCAACAAGCTGAGTCGGCTGCAAGGAGATCAGATCGCTTTTACAAGCAAAGAAGGCTGAAGAACACAAGTGGTATGAAAGCGTTGTCAAGTTGTGCTGTATAAGCCTCCAACAAACCACTAATTGTGACGGCTAGGAGAAGGGACAACCACTGCTGAAAAAGTAATCAACGATATCAAGAATATATTGACACAAAAGTCATAAAATATCAATATCCATAAGTCAATTATTGATTAGTTTTATTTGGATCTTGATGCTTTTCCTGATTGACTGTGACATGACAGTGAATGTGTTTTTTTCTCCCCTTACCCGTGAGTTTTCAAACCAACTTGCATGCACCTTGACTAATCTCACAAAACAACTTGCCTACCTCTAGTGCCTTTTTGAATTGTTAATGATTCATAATTCAATCTTTTTAATGTTTTCTGTTAAATTTTTAATACTAATTGGCACCCCTGCCTCTATCTCTGTTTTCTCTCTCACCCAACCTCATATCTTTTCTCTTTCTAACATCGGTTGCAGTCCTCTCTTAAACCTTCTGACAACAAGAACAATGCGAATGAGGTTGATTTCGTTGAGAAACAGACCTCCATTGACACAGAGGTAGAAGAAATGAACTCAATTGAAACGGTCGTAGGAAAATTAACAGGCCGGAGGATGTGAAATACTTGTGGTTGTTAAGATGTGAAATACTGTTCATTTGCCGATGTTGAGGCTTCAAAGAAACTTTGTTCAGTTTTACATTCTATGGGAATTGGAAGTGGCTGGAAGTATTTTTTATGACTATTTCCATGATAAAAATAATGGGAAAATTGCTGGATGACAGGCATGGTATAGTCACCAACAAATTGGCCTTTGAGGGAACGCCTGTTCTAGTTCATGTCAGTCCTAGTCCTACAAGCATTGCATAGTCATTTCTCTCTAGTGGTCGATAAGATAATTTTGGAGATAGCAGCACAAGGTGGGTGTGGTGAAGAAAAAGTGAACAAAAATATACTTTTAATCCCTCAAAATCAACTCAATGTTTAATTTTACACTTTTATATGCATTTTTCATATTATTAAAATTGATTTTGAATGATTAAATATAGGAGTGAGCATGATAGACCAAAAACCGACCAAACTGAAGGCGGTCGGTCGGAGAAGAGGAGAGGCTCTATCGGTATCAGTTTGAGAAAATTTCAAACGACATTTTTTATAAAAAAATTCAAAGAACAAAACCGACCTAAACCAATCGACCGAAGGCCGATTTTCACTCCTTGACGGCCGAAATCGAGTTGAACATTTATTAGACCAACCATAGTCAGTTCAGTGGCGGTTTGGTCGAAAAATCGACTTTGACCGACCGCTGCACACCCCTAATTAAAAACATTTTTTGAGTGATTTTTAACCATTTTAGAATCACTACCAAACATGTGATCGATTGATCTGCATTTTGAGGTTTTAAAGGCAAAGTCCACGTCAATTTAGGGTTTAATTAGCGTAGGACGTCTAGTATAGAGTAGCTAAATCAAATGGTTACTGTTTGTTAGAGTAAGTTTGTTGGTGGGGGTGTTCATAAGTAGAATGAGCCGCTGCCTCAAACTTAAATTAAGCAATTTTCTAGTTGTCTGGTCCTGAGCTTGCTCATGAGAAAACACTCGAGTTCCTCAAATCATTTGAGATTCTATTTTGCTGCATTATTTTTCTTATTAACATCATTTTCCTGAATTTTCTTGCCTTGTTAGTGTTTCAGAGGAACAGTGAGATGGACCAACCTCTGTCAAAAAATATCCAGTGGATGCTAGAAGTGGAAGCAGAATGGAACAAGCAGCCAGGACAG

mRNA sequence

ATGGATGGCTGCCTTCTCATCGGCGTTGTCGACCTCTCATGTGCGTCACTGCCTCGAACCTCCACTTTTCTCGCGGAATCGGTGTTTCAATCCTCTCTTAAACCTTCTGACAACAAGAACAATGCGAATGAGGTTGATTTCGTTGAGAAACAGACCTCCATTGACACAGAGAGGAACAGTGAGATGGACCAACCTCTGTCAAAAAATATCCAGTGGATGCTAGAAGTGGAAGCAGAATGGAACAAGCAGCCAGGACAG

Coding sequence (CDS)

ATGGATGGCTGCCTTCTCATCGGCGTTGTCGACCTCTCATGTGCGTCACTGCCTCGAACCTCCACTTTTCTCGCGGAATCGGTGTTTCAATCCTCTCTTAAACCTTCTGACAACAAGAACAATGCGAATGAGGTTGATTTCGTTGAGAAACAGACCTCCATTGACACAGAGAGGAACAGTGAGATGGACCAACCTCTGTCAAAAAATATCCAGTGGATGCTAGAAGTGGAAGCAGAATGGAACAAGCAGCCAGGACAG

Protein sequence

MDGCLLIGVVDLSCASLPRTSTFLAESVFQSSLKPSDNKNNANEVDFVEKQTSIDTERNSEMDQPLSKNIQWMLEVEAEWNKQPGQ
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC03G045040.1CcUC03G045040.1mRNA