CcUC02G041320 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC02G041320
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr02: 36477925 .. 36480970 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC02G041320
SyntenyCcUC02G041320
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCACCAAAGGTAGATCAAGTAGGGAGTAGAGCACGTGTTCCCTCAAACTACTCTTTTATGTACGTAGTTTTGCAAATATAACAATCAGGTTCAAAATATTTGCAGATATAGTATAAGGTAAAAAAATTAAATTTGCTTTCAAAATCTATTAGTGATAGACCATATTAATAGCAAAGTCTTTCAGTGATAGGTCATATTACTGATAGAAGTCTATCGTAGATAGATTTTGTTATATTTGTAATTTTTTAAAAATATTGTTATACACTTAATTATTACTCCGAAAAGTTTTATCCAATGTAATTGTCCATATATGTTCACCACATATTAAACAAAATCCTCGGTGGAAGGAAAAATGTCTACAAGTGGTAAGGTTCGAGTCTCGACTTTTACATTTTGAAATTGTTTTCTTTTTTATTATTATTATTATTTATTATTATTTTAATAAATTTTAATAAAACATTTCATTAAGAAAATCTGAAATATACATATATTTTTAAATAATTAAATAATTAATATTCGATGGACTTCGGCTTAAGATCTGATCCAAATTCAACCCAAACTTTTATCCAAAGAGTCAAGTCCAATGGTTGAGTCCAAGAATGAGATATATTCTCCTTTTTTTTTTTTATGTCCATTACAAATTTTCTAATTATTAACTAAAATATACTATTTATTCAACAATTATTTTTAAATATAGCAAAATGTGTAAAAAAATATTTATAAATATAACAAAATATCAAGTCTATCACTGATAATCATTGATAGACTATTGTCATCTATCACTGTCTATTAGTACTAAATACTGATAGATGTCTATCGGTATCTATCATTGGTAGATAGTAACATTTTGTTATATTTCTAAATATTTTAAGCAATTTTGACATTTAAAATAATTATCCTAATTATTATCATGTTCACGTTTTATTTATAAATATGATATTTAACATTCGTATGATGCATTAGGATCTTAAAGAAGTAAAAGAAAAAAAAGGACAACAGGTCTTAAGTAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAGAAAAGAAGAGAGATTTTGAGAAGTGGGAAACCGAATCTATCAAATCAGATTTTAAAATCCAACGAGGCATCTTGTTTCTTTTGTCAAGTACCGATGGATTTTATTTTGTGAAGAAGCATACAAAATAATTATATATTTTCACTGTTTATCATTAATCAAGTTGGGCTAATGACAATCGGCTTGAGTCTTTTTGTAGGAATGATTCAAGTTTGAATATGCCGTTTGATGTCACCAAAGGTAGATCAAGTAGGGAGTAGAGCACGTGTTCCCTCAAACTACTCTTTTATGTACGTAGTTTTGCAAATATAACAATCAGGTTCAAAATATTTGCAGATATAGTATAAGGTAAAAAAATTAAATTTGCTTTCAAAATCTATTAGTGATAGACCATATTAATAGCAAAGTCTTTCAGTGATAGGTCATATTACTGATAGAAGTCTATCGTAGATAGATTTTGTTATATTTGTAATTTTTTAAAAATATTGTTATACACTTAATTATTACTCCGAAAAGTTTTATCCAATGTAATTGTCCATATATGTTCACCACATATTAAACAAAATCCTCGGTGGAAGGAAAAATGTCTACAAGTGGTAAGGTTCGAGTCTCGACTTTTACATTTTGAAATTGTTTTCTTTTTTATTATTATTATTATTTATTATTATTTTAATAAATTTTAATAAAACATTTCATTAAGAAAATCTGAAATATACATATATTTTTAAATAATTAAATAATTAATATTCGATGGACTTCGGCTTAAGATCTGATCCAAATTCAACCCAAACTTTTATCCAAAGAGTCAAGTCCAATGGTTGAGTCCAAGAATGAGATATATTCTCCTTTTTTTTTTTTATGTCCATTACAAATTTTCTAATTATTAACTAAAATATACTATTTATTCAACAATTATTTTTAAATATAGCAAAATGTGTAAAAAAATATTTATAAATATAACAAAATATCAAGTCTATCACTGATAATCATTGATAGACTATTGTCATCTATCACTGTCTATTAGTACTAAATACTGATAGATGTCTATCGGTATCTATCATTGGTAGATAGTAACATTTTGTTATATTTCTAAATATTTTAAGCAATTTTGACATTTAAAATAATTATCCTAATTATTATCATGTTCACGTTTTATTTATAAATATGATATTTAACATTCGTATGATGCATTAGGATCTTAAAGAAGTAAAAGAAAAAAAAGGACAACAGGTCTTAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAGAATTTATCATTTATCATTTAATTCAAAGTTTCTACTTAACATGTGGATAGTTCATGCACCATTTTTTCTCGCCCTTCCTATTGTAAAAAAAAAAATAAAAATAAAAAAATAATTTCAAACTAACTCGAGGGCAGGTGCTTTAATTGGAGGGACCAATAAATAACAGTGGTCAATATATTACAAGTGTGGGGATTAAGGTATTTGCATACATATCTTATACAATAAAAATCCATTGGAAGATGGACCGCGTACCAAGATTAATTTACGGTGATCACATGTGTACTTGGATCTAGAGAACTTAATGAAAGAACTTGTTTATGAATATCAATCACCAACCAGACTTCAATTTTGATTTTATAATAACTCAACTTATAAATTTTTAAATTTATAAGACTTCAATTTTGGTTTTATATTAAGTCAACTTTTAAATTCATAAAACTATTATTTTCCTTTTAATTTACTTGTATATGGACGTGTGACGCACGTTAAACATAAAAAATAAAATAATAAATTATAAAATTTATAAAAACGTGCGATACACATGAATCGTTGCTAGTTATTCATAAAAGGGACTATTTTTGTCAATTATCAACTATTGGTATTGGATGATTGAGACAATTAATCTTATCCAAACTAATAATATAATAATAGATGGCGAGTGAGACAAAAGGAGAAGAGGCGGACGATTATTTATTTTCTGTTTGTAAAGTTTGAATCATCCTACATGTGA

mRNA sequence

ATGTCACCAAAGGATCTTAAAGAAGTAAAAGAAAAAAAAGGACAACAGGGACCAATAAATAACAGTGGTCAATATATTACAAGTGTGGGGATTAAGGTATTTGCATACATATCTTATACAATAAAAATCCATTGGAAGATGGACCGCGTACCAAGATTAATTTACGGTGATCACATATGGCGAGTGAGACAAAAGGAGAAGAGGCGGACGATTATTTATTTTCTGTTTGTAAAGTTTGAATCATCCTACATGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCACCAAAGGATCTTAAAGAAGTAAAAGAAAAAAAAGGACAACAGGGACCAATAAATAACAGTGGTCAATATATTACAAGTGTGGGGATTAAGGTATTTGCATACATATCTTATACAATAAAAATCCATTGGAAGATGGACCGCGTACCAAGATTAATTTACGGTGATCACATATGGCGAGTGAGACAAAAGGAGAAGAGGCGGACGATTATTTATTTTCTGTTTGTAAAGTTTGAATCATCCTACATGTGA

Protein sequence

MSPKDLKEVKEKKGQQGPINNSGQYITSVGIKVFAYISYTIKIHWKMDRVPRLIYGDHIWRVRQKEKRRTIIYFLFVKFESSYM
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..21

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC02G041320.1CcUC02G041320.1mRNA