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CcUC02G028430 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTTGTAGGCTGTCCATTGTACCTTTCATTCCCATTCTTTGGGTAGTTTGATCTAGATGTGGTCTTTGATTCTGCTCCTCCTTCGTAAACTTCATTTGTTTGCTCCCAATTTTTCTTACCTTGCTTAAAGTCTCCTATTGAATTAAATGTCATGCGTATTGATTATATCCTTTTATGTTTATATTCTCTGTTGTATTTATTGTGAAATATTTGCAAATATATATTTGCTGTATTTAACTTTTCCTCTTCTATTTAAGAAAACCCTTTTCTATCGAAGAGAAATAAGAGAAATAATACAATTTTAAGCATGTTATCAGAGCTATATTTTTTACCCTAAAAAAACCATAATTTTCTCCAAAACCCTAGATCTACTACCACATCCGCAGCTGCTTGACTCTAGATCGCCACCGGATAACACGTCACAGCCACCGAAAACCACCTAGACATCCAATTTTCACCAGTTCGCGAAGCTCGAAGCTGTTGACTCCGCTAGAATCAAGTTTGCGAGTTTTCGTCCGAGTCTTCCTAGCCTGACGCGAGTTTTTAACACATCGATGCCTAGGTTCAAGCCTACTTTGGTAGTCGACCTTGTCCGAGTTACCGTCAGTGTCTTCCAATGAGTAACCGCTGTCAGCCGTTTGTTTTTAGCTGCTGTTGTCGCTGGGTGTTCAGGGTGTGTTTCAGCCTTTATTTGGCTACTATTTCAAATCTACGATTTTTCTCATTTTTTTTAGGTATTCTATCTCTTCAACAACATGTGGACACTAAGGTACCTGTTGCTGGATCATTCCAACACTCCACTATCCAAATAACCAATATTTGGCTTAACGAGGATAATTTTCTTGGTTGGTCCAAAAGTATTCGAATGTATATTCGTGGACAAGGTAATATAGGTTATATTACTGGAGAAAAAACTACTCCCACTCCATATGACCCTTCATTTGCTGTGTGGGACACGGAAAACTCCATGATTATGACTTGGCTCGTCAACTCTATGGTGGAAGACATCAGCAGTAACTATATATGTACTGTACTACAAAGAAACTATGGGATAATGTAACTCAAATGTATTATGATTTGGGCAACCAGTCACAAGTGTTTGAGTTGAATCTTAAACTGGGTGATGTACAAGAAGGAGGTAACTCAGTTACATAGTATTTCCACACTCTGAAGAGGATTTAGCAATATCTTGATCTATTTAATAAAATATGAGTAGAAGTCCATAAATGATCAAAAACATTACTGAAAACTGTAGAAGATGGTCGCATTTACAAATTCCTTGCCAGTCTTAATGTTGAGTTTGATGGGGTTAGAGGCAGGATACTTGGGAAAAGTAGTCTTCCAAATATTAATGATATCTTTTCTGAAGTTCGCAGGGAAGAAAGCCGTAGGAATGCTATGATTGGAAAAAAGGCAATTGATTCGGTTGAAAGTTCAATTTTGGTGATTGAAAATACTGCAATGAAAGCTTCTGATCAATCCAACAAATCTCATGAGAAGTCTTGTATCTGGTGTGATCGCTACAATAAACCCCGACATACACAGGAAACTTGTTAGAAACTTCAAGCAAACCTGCAAATAGGAAGATGTCACACCCCGCCCGAGCCACCCCTCTGTAGTCCAAGATGGGGCATGAAGACAGCAGACACCGACCCTTTTGCGATATCTACCTTCAAGCCTTTACCCTTTTCCGATCTAACAGGTGTAACTTAGATAGGCAGAAAGAAAACTAACTCATGTAAAACATGCATAATTTATTATTGCAACTGTTTAACAAGTTTGTTTATAGAAGACATGTTTCTAGTTCCTCATTTAAACTGCTTCCTACGGCTAAGTGCACATTATATCTCAGCAGACCTCATATTCGAACAACAACAGAAACTCGACTGCTACTTGGAAAGAGAAACATAAGAAAAGAATGAGCTTCATTAAGCCTAGTGAGTGATTAAACTAGGGTTCATAAAACCCTTTAAACATAATATCTATATCTAAATCATGAACAAATATATTTATATGAAACTTAGATTCAAACTTCCCATTCTTGGGTTACCCTCGAAAATTTAGTATCCTACTGGCATTCACAGCACAACAAATCATCTAACTAACCTGCTTAACCTACTGACTCACACGGCTCAACATTCTAAGTGGTTTTCTCCTGCTAGCTCTTTCGGCTCAGCAAATCTTGTAATCTCTGTCCCTATGTGCATATAACCTTATCTTTGAGGATTAGAAGCTAGGTTTGTTGACCTTTTAACCATCCTCTCGAGATACTTTTCGCAGGATCAGGAACTTGGTTCCGACACCCCTTGACCATCCTGTAAGTTCTATTCCCGACATAGGCTCAGACACTAGATCTTTCCGATCCTCTGACCATCCTTTGTGGTGTCGAATTTCGATCCCAGTCACGACCGTAGTCATCAATGCCTTCTCAAGGTTCTTCAGCATTGGGAAACATCTATATATACAACAAAGCTTGATATGCTACAAGCTATTTGGTACCTCACCATAGCACACATATTAATCACAACATCATATAATCATGGTATCAAGTATGTATTCATAAGTGTGCTATTAACAAGTATTCATAAGAGTCTTAATTAAATTCTCTCATGAAAGAAATCAACCACTCATAGAGAAAGTAGTTCCCAAACTTTAGGGTTCTTTCTTCGCCTTGGTTTTCAAACCTTCTCAATTTCTCCCAAGCTTCCGGAACTGAGAATATAGCAACTAGGAAACCTCTGAAACCCTAAAACCTCTCCTTGGACGCTTGAAAGTTCTCTTTGGATGCAAGGCAGATCATCTTAGATGTAGAACAACTCCTTCTTCTCCCAACACAACTCAGTTGGACACAGAATAGCCTCCTTGGACACCTAGGGCACTTTATGGACGCAGACAGCTCTCTGACAACAAGGAGAACAACACCTTAGACGCAGACTTGACCTTCCTTGGATGCAAGGCTCAATACTTCAACCTTCTTCCTCTCTTTTCTCTAGTGAATTCAAGTGCTTTGTAATGGTGTGAGAGCTCCCTTACCCTTTGGTCCTATTTATAGATGTTGGATGGCAAACCTCATCATCCAACCCTTGCCCTAAGCTTGACACTTAGCTCCCATACGTCACCATGCATGATGAACACTCCATGTGTCCAAACAAGTGTCTCCTTGCATGGTGTTCTTATTATGCATCGTGACACCTCCTCCTTATGAAGTGTTATGTCCAAATGAAGCCACTTAGCACCAAAAATACTCAACCATGCGTCCAACCTAGCCCCCGGGATAGGGACCATGTGTCCAACTCCTCCCACCATGCATCTATGATAATGCTTCTAGGGTTTGGCTTCTTTTTGCTCTCTTTTCCTCTTCCAGTCTTCTTATACTTAGCCAAATTTCCTTGCCAAGATCCTCCTATGCGTCCAACCTTCTTCCAAGAGTCCAACACTTAGCCAAAATCTTTTGCTTTAGGAGGTTTGCGTCTAGCAAGTCCCGAGGTTCCCACACTTAGTCAAATTTCTACTTACAAGCTTACTAAGTGTGTGGTTTCCTCCAAATTCCTTAGGTATGTGTCCACCACTTTTTTCTTCTTTCATCCATGCGTCCAAGACTTTCAACATGACCCCATGGACTCCTTGTTAGCTCACCTATACGTCTATGGTGTGCCTTTCAAGTCTATGCTTCCAACTTTCCTCTCCTATGCCTTCGATACTTAGTCATTTTCCAAACAACTTCCCAAGTATGCGTCCAACCCATCTATTTCCTTCCTTAGGGTTGCTGCTCAACTCTCCAAATTATCCAACACTTAGCTAATTCTTCCTAGATAATTGGCTTATGCGTCCAACCTACGTATGGTGAAGTTTCTTCTTCAACTTTGCACCATGTGTTCACCATTCTTTCCCAAGACTTAGGTTTCCTTCCAACACCTCAACACTTAACCAAATTCCTCCCAGAAATTAGGGTCACCATGCATCCAACATGGCGGTTTTTCCCCCAAGGATGTGTGCAACTCACAACTAGCTCCCAACTATTTTTCCTAGGCTATGCATCCAAGCTTAGTCTTCTCATAGCATGGTTGAGTTCTCCAAGCATAGTTGTGACACTTAGAAGATTTTCTTAGCTCATTTGCCACCTTGTGGTCCAAGACTCGAAAATCGCTTAACGGGTTTTCTTCCAAACTCACCTTCGGCTTATTCTCAACCAAAAACTCAAGTTGGCACAAACATTTTTCTTCCTCCTTACCATCTAATGCCTAGTGCCCTCTCCACAAGCCCAGATTTTCTGCTTCACAATTTTTTTCTAACTCTATAGGCTTGTGGTCTAAGTTTTCACCATTTACCCTAGTTTCCTTTCTTTATGACTCTTAAGCAACTAGGTTAAAGATTAGGGTGTCATAGAAGAGCTCTAAGCAATTTGAAAGAAATTCTCAACAACATGCCTCTAATACGAATATTGTTGATTCTAGTCTACTTAAAGAGCAAATTGATCAAATCTTGAAACTGCTAAAGTCCAATTCATCGGGTAATCCTAGTGTTTTCTTGGCACAAACAGTCCACTTTTTTTCACTATAAGGTTATCGTTCATCAAGCTACGTGTTGTGATACTCCTCAGCAAAATGGTGTTGCTGAACGGACAAATAGACATTTGCTTGAAGTTGCTCATGCCCTTATGTTTTCTATGCATGTTCCAAAATATTTATGGGGGGATGTTGTTCTAACCACTGCTTACCTAATCAATCAAATGTCTACTAAGGTGTTGAATTTTAAAACTCCTTTATAGTACCTCAAAGAGTTTTTTCCTACTGCTCGACTGTTCTTGGAGTTACCATTACAAGTATTTAAGTGTACTGCTTATGTTCATAGCTCTCTCGTTTCCCAAACTAAATTGGACCACTGTGTCATTAAATGCCTTTTTGTAGGCTATGTTCCCCATAAGAAGGCATACAAATGTTTTGATCCCTTGACTCACAAGTATTTTGAGCGTATAGAAGTGTGAAAAATTCT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ATGTTTGGACGGGCGGTGGAAGAGGCTTCTTGTAGATTGGTACCGGTGGAGGAAGAGGTGGAGGAAAAGGTTTTTTGTAAATGGGAACTGGTGGTGGAAGTGGCTTCTCATACATTGGTGGAGGAAGCGGCTTCTTATAAATTGGAACTGGTGGTGGGAGTGGCTTTTCATACACCGGTGTTGGTGGAGGAAGAGGCTTTACATAAACCGGAACCAGTGGTGGAAGTGGCTTTTCATAGACCGGTGGAGGATGAGGCTTTACATAAACCGGAACCGGCGGTGGAAGTGGCTTTTCATAGACCGGTGTTGGTGGAGGAAGAGGCTTTACATAAACCGGAACCGGTGGTGGAAGTGGCTTTTCATAGACCGGTGGAGGATGAGGCTTTACATAAACCGGAATCGGCGGTGGAAGTGGCTTTTCATAGACCGGTGTTGGTGGAGGAAGAGGCTTTACATAAACCGGAACCGGTGGTGGAAGTGGCTTTTCATAGACCGGTGTTGGTGGAGGAAGAGGCTTTACATAAACCGGAACCGGAGGTGGAGGAAGAGGCTTTACATAGACCGGAACCGGCGGTGGGAGTGGCTTTTTGTAGACTGGTGTTGGTGGAGGAAGAGGCTTTACATAAACTGGAATCGGCGGTGGAAGTGGCTTTTCATAGATCGGTCACATTCTCCAACACCGATGACCTCGACCGTCTTCACATCGGCATAGCACGAGGTTGCAGCAAAAACAAAGGACACCAAGAAGAAGCACAACAAGGGTGCCCTTCCAAACAGAGGAGGATTCCTCATGGTGAAACCACAATTCTAAACCTGACCCAAAACCAACTCTCTCGAGACCGAGCAGAAGCTACAGAGTTTTGGGGCAATGACGATGAACTTACCTCAAGCCATTCGTCTGATGAAGCATCTGAGGCCTTGGTTCCAACTTCAACCTTAGGAGCCCTCTTGGAAGAATCAGGAAACACAAACTGGAAATCGTGCATTGCCCCGTCAGAAGACAAGGCAGCAACAATCAACGGCACCAAATGA 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BLAST of CcUC02G028430 vs. NCBI nr
Match: WP_148261898.1 (hypothetical protein [Arthrospira platensis] >MBD2710025.1 hypothetical protein [Arthrospira platensis FACHB-835]) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 1.0e-09 Identity = 53/144 (36.81%), Postives = 89/144 (61.81%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. NCBI nr
Match: KDR58217.1 (signal peptide protein [Arthrospira platensis str. Paraca] >BAI90013.1 hypothetical protein NIES39_D05960 [Arthrospira platensis NIES-39]) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 1.0e-09 Identity = 53/144 (36.81%), Postives = 89/144 (61.81%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. NCBI nr
Match: WP_199318077.1 (hypothetical protein [Arthrospira platensis]) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 2.5e-08 Identity = 50/140 (35.71%), Postives = 85/140 (60.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. NCBI nr
Match: MBD2572153.1 (hypothetical protein [Arthrospira platensis FACHB-971]) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 2.5e-08 Identity = 50/140 (35.71%), Postives = 85/140 (60.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. NCBI nr
Match: XP_021347443.1 (titin-like [Mizuhopecten yessoensis]) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 1.8e-06 Identity = 49/169 (28.99%), Postives = 81/169 (47.93%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: D4ZPB8 (Uncharacterized protein OS=Arthrospira platensis (strain NIES-39 / IAM M-135) OX=696747 GN=NIES39_D05960 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 4.9e-10 Identity = 53/144 (36.81%), Postives = 89/144 (61.81%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A674BAU9 (Uncharacterized protein OS=Salmo trutta OX=8032 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 1.7e-07 Identity = 60/175 (34.29%), Postives = 77/175 (44.00%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: Z4XBN1 (Uncharacterized protein OS=Actinomyces sp. ICM54 OX=936549 GN=HMPREF1522_1121 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 1.9e-06 Identity = 66/171 (38.60%), Postives = 85/171 (49.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7C7XV61 (Signal recognition particle receptor FtsY OS=Flavobacteriaceae bacterium OX=1871037 GN=ftsY PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 4.7e-05 Identity = 76/214 (35.51%), Postives = 108/214 (50.47%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G028430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1B3FIY1 (Signal recognition particle receptor FtsY OS=Serratia surfactantfaciens OX=2741499 GN=ftsY PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 4.7e-05 Identity = 66/161 (40.99%), Postives = 83/161 (51.55%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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