CcUC02G018610 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC02G018610
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr02: 1442754 .. 1446212 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC02G018610
SyntenyCcUC02G018610
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGCCCACATCTAACTCATTAAAGCATGCCCAACATAATTGGAAGAACAACCTGCAAAAAGTTTTGGTATTTGTTAGGGATGCAAATAAAAATTAAAAAGATAAAGTACAACGAGCAAATTTAAACCGGGTTGAATTGAATGGTTTGGTTTGATTTTTTTCTAAGGTTTAAAATTTGAGAAAATTGAACCAAATCGAAGGGTATATATCATTTAAAAAGATTCTAGAACCAATTAATTCCCTGATCGCCTTAATAGCATTGTCAACCATCGTCTCCTTATACCAGTCATGCCTAGCACCAACGAAAGTCTTCTTCCTCTCTTCTCTTTTTGATTTGATTCTTCTCAAATTCAAATGGTTCCTCAACCTCTTTGCCTTATTATCTCAGTCCCATCAACCATCAACGCATATGTCTTATTGGATATTGGTAATTCAGTTCTTCTGTAAAACACTAACTGGATTGGGCCTAAAACCCAAATATCTTAAATGAGTATCGTCTTGAGTTCTTGTCTAATCATAAGAAACCTCTTAATTAGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATGGTCATAAATTTAGAAACAATTGGAAGTCGTTAAAATAAGGAACATAAATTTCAAGAACTATATACTAAAACTACAGGCACGTATGACGTGCGTATACTATTTTAACTCCGTTTCCAATGTCCAAAAATAATATTGTATAAACCGGCAACTCCAAAAGGTAGAGTTGAGTTTTCGATTTTTGTATCTTCTATTTATATTATTATTACTCAATATTTATAACTTAAAAAATAAGTTTTTTACTTACGTAAATATCCATCAATATGGATATTTTATCGATATACTTGTGAAATTGAAATCTCAATATCAATACGGACACTGATATTTTAATTAATCATACTAAATTAAGATTAATTGAAAGTAGAAAATCAAAACTAGACATTTCAAAGTAGCATTTTAATCCTGTCCTAAATTAATTAATTAATTAAAAGTTAACATCAAAATGGAGTGAACGTGTAAAATATTAAAGCTAGGGATTTCCAAAAGATCTAAAAAATCCAATCAACTCAACTTAACCCGTGCGATTTGAGTTGAGTTGAGTTTAATGGATTTTTTATGAGTTGAATTACTTCATTGGTTCACTTATTATTTGTTTTAAAAAGTATGTTTCTTTAAGTATGAAACAATTATATATACACATATTTATTTTAATTTTGTTTAGCTTCATAATTTTTTAATAGTTTATTCTTCAATCACTTCTAAACATAACTTTTTTACCACTTTTGGAAAAAAAATTATACTATAAATTGAAATTGAGTTGTTAATCTTAATTCAATATATATATTATATTATTAAATAAAATTTTATACACTAACATTTTACTTATTTTTAGAATAAAAATTTTTAATAAATGACATGATTAACAAAACCCAACATGAATTGAGTTCGGATTGAAAAAACATACAACTCGAACAATTGGTTTAAGTCTAAAAGGTGTTTCAACCCAGTTCAATTTAACTCAACCCAGAAACCCTCTCGTTAAAACCGTTAACAAACCATCGGCCATAGACACAAGGAGTTCCATATTTACACAAATATAGGGAAATAATATGAGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACAAAAGTATTTAGAGAGATAAGGACAAAAAGAAAACGTGGAATTGAGCTCTATTTTAAAATTCCACGGTTTTTCCCATAATCCGGGGGGGGAAGAAATAGAAAGGCTGTATAGTGTATATCCAACTTAATCGGATATATCCCAATAATTTTAGTTCGTCAAAACCCAATTCTACCCCTCCAATTCTTATCCCGAAACGCAGTTTCAAGGGGCAAGTCCACTTACTACAAAGACCAGTCTAACAAAACCAAAACACCACTTCGCCAGAAACCATGCGGGGTTTATTTCTCAGGCTAAGAAGTTTTCCTCCGCCGTGCCGTCCGCCAACCACGTACAAGAGTCGGAGGAATCTCTGAGGAGGGTCATGTACCTAAGTTGTTGGGGTCCTAATAGCTGAACTGAACCCACCGTCGAGACCGGTTGGACCGGCCGCGGTTCAGCTTAAGGGTCGTGATTGTAATTAATGGGAGATGGGCGGCGGTCTGATTTTTTTTCGAAGGGTTTGTAAAAGCAATTCCCATTTTTATTATTTAATAAATTGAAATTGATGGCTTTTTCAGTGCTTTAATTTCTGTTGCACATTGATGATTTTGTTGAGTAGTGCTTTAATTTCTGTTGCACATTGATGATTTTGTTGAGTAGGAGGGGGTGAAATTTTCAATTTTTTACTTTAGGAGGTATCAATTTGATCTAAACTTCCACTTTCATTAAATTAGACTCCCAACTTTAAGAGGTTGTTAGGGACGCTGAAATGTAATTAGGATTACTGGAAATTAAAGAAGTGTTGAAATGCATGAGGTGTCGAGCAGAACGGGAATGAGATCGTAAAACGAAAAAACAGTGGGAATGAAGGTTTGGTTAAAAACTATAGGAACGAAATGAGTTAAATATTATAAATCAAAACATGAGTTTTTGATTACATTACAATCTAAACATCATTATATTTACGGCCACCGAACAACTTCTAAGGATTGCAATTTTAATCCTGTTCAATTTCTCTTAATTTGTTCACTAGTTTTAATTTTTTTTTTTAAAAAAAAGAAATAAAAGAAAAAGGAAGAAAAAAAATACAAAGCTTCATAAACTTATTTAATTGAAACTTATTAATTTCAATTAAATAAAGCTGTGCTAAAAATAGGTTGGATCAATTTACAAATTAACCCTTGGAAAAATCCATATATATCCATTTAAAGAAACCGTTCTAATCTCGTTATCTAACAAAAACACTTATTTAAATTAAAAGTTAAATCGGATATAATTAGCAATTAATTTTTTTAATTATTTTTAAATATAACAAAATGAACTATTATTTATAAATATAAAAAATTTTCACAATTTACATAAACAGAAAGATTCCGTTACCTCTAAGTTCACTGTAATCGATTGTTCACACTCTCTCCATACGAACAAATCTTCCAAATAAGGACAATCAAATAATAAACAACAGATACAACAGCTGCTAATACGATCACATATTTGAACAGTAAGCCACGTCATAAAAGGAAAAATTTTAAAATCCTATGTCTTAGTTAACTTGCGCTGTTTTGTGGGAGAAATACCAATATTGTATAAGACACGTGGAAATGGAAATGGTAAACCGTGTGCCAACAAATTTCAGAATTGTACTCCAAAACCCAATCCTACCCCCTTCACTTCCATCTCCAAAAGGCAGTTTCAAGGGACAATTAAGTCTATTCACAAGAAAAAGTATGAGTCCCATCCAAAACCAAACACAAAAACCACGGGCTCCTCTCCTTCCGGCAGCCTCTGTATAAAAACCTCACTCCACCTTCAAATTTCACCATCAAAATTTTGA

mRNA sequence

ATGCCCACATCTAACTCATTAAAGCATGCCCAACATAATTGGAAGAACAACCTGCAAAAAGTTTTGAATTGTACTCCAAAACCCAATCCTACCCCCTTCACTTCCATCTCCAAAAGGCAGTTTCAAGGGACAATTAAGTCTATTCACAAGAAAAAGTATGAGTCCCATCCAAAACCAAACACAAAAACCACGGGCTCCTCTCCTTCCGGCAGCCTCTGTATAAAAACCTCACTCCACCTTCAAATTTCACCATCAAAATTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCCCACATCTAACTCATTAAAGCATGCCCAACATAATTGGAAGAACAACCTGCAAAAAGTTTTGAATTGTACTCCAAAACCCAATCCTACCCCCTTCACTTCCATCTCCAAAAGGCAGTTTCAAGGGACAATTAAGTCTATTCACAAGAAAAAGTATGAGTCCCATCCAAAACCAAACACAAAAACCACGGGCTCCTCTCCTTCCGGCAGCCTCTGTATAAAAACCTCACTCCACCTTCAAATTTCACCATCAAAATTTTGA

Protein sequence

MPTSNSLKHAQHNWKNNLQKVLNCTPKPNPTPFTSISKRQFQGTIKSIHKKKYESHPKPNTKTTGSSPSGSLCIKTSLHLQISPSKF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 49..72

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC02G018610.1CcUC02G018610.1mRNA