CcUC02G018350 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC02G018350
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr02: 1269898 .. 1276624 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC02G018350
SyntenyCcUC02G018350
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTGCTTTGCCAGCTTGGCCAATTATATAGAAGAATACACAGCTACATACTTTTATGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCAAAGTCCACATTGGATTCAGACATTACCCCCACTGATGCCAAAGTTCATATATTTTTTGTATTTTCAATCTCGTTTTACTCCTGCAATTTTATTCAATTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTGGTTTCTATATTTTTTTATTTTACTATTGCTAAAGGTCAAATTTCTTATTTTTAGTCCAATTTTAAAAACAAAAATGGACAATCATATGGGAGAGCACTTTTGTACGGAATTGCAAATATAGCAAAATCTATCCGCAATAAATTCTATCATTGATAGAATCCTATCAATGATATATCACTAATAGACCATACTAGCGATATGATTTATTACTAATAGACTTCGAGAATAGAATCTAAATTTTGCTATATTTATAAAATTGTATTGTGTTATATCTGCAAATACTTTGGGTTTAATTACTTATTTGCTACCGTCCCAAACAAAAACAAGTTTTTGAAATGTTAATAAATTTAATCTTAAAAAACCAAATGGTTATCAAATTAGACTTTACGAATTAGAATCAAAATTAAAACATATCATTCCTCGTAAAAAAGAGGAAATTATTTTTTATGATAAAACATATCATCGTATCATATATTTCTATCGTGGTCTATCATATCCTTTCTCTATTTGACAGACAGACACAGATAGTAATCTATTGCAGATAAACATCAAAATTTTGTTATATTTATAAATATTTTGATTCATCTTTCCTATATTTGAAAACAACCTTAGAGAAAATTAAAAACATGTCATTTTTTTTTTTATCATTTTAATCGAAATCATGATTTAAAATATTCAATACCTCTTAGACATATACTTTTACAAATTTGAACTAGATTTATTTGAGCTTTAACTAGCCTATCTAATAATATTAATTGTCTCATATATTTGGAATTAGAATTTGAGCATTGATTTTTTTTTTTTTATTATTTTTTATTTCATCGGAAAGAAATTTCTATACGCGGCTTATAGTCTCATTCACGAGCCTTGATATTTTGAGACTAATTGTTTTCTTTTATTAAAAAAATAAATGCAATTTGGCTTTGTCAAATTGTCTTTTTTGACTTCAACAATTTAATTTCAGAGAAAATAACAAATCATATAAAATATTTAATTTCTCTTTCTATTTCAGTCTATTGTTTCGCTTTCGCAATTAATTTGTAAAGGCAATGTTCTTATTTTTTGAAATAGGTAAAGGCAAACTGTAGAAAAGAAAAGAAAGACCATTTTAATAAACAATAAATATCTCAAGGCAAGCATAGTTCAATGCACGTATAAGAATAATATTAATCATGAGGTATGTGGTTCGAATTCTCCTATCCCTATTGTACTAAAAAAATAAATATTATAATAACTATAAAATTGTAACAAAAGATGAAATATTTATTCAGAATGTCAAATAGGGTTATTGGGTGTAATGTCAATTGATTAAGATATTTTTGTTTTATTTTGTTTTTTTTTTAAAAAATTTTTTTTACTTCATCAACATATGAGATGATGATTAAGATATCCAACCTTTTTTAAACAATATATATCTTAATTAGTTAAGTTATCTTCGTTTTGTTGGTTATAAAATTGAAATTCTACGTACCCTACCCTCTCATTTCAACTTGAAAAAGGGGGAAAAACCATCCGTTCAATTTAAAATTTTAAGTAAAAAACCATCTTCATTGGAGGGGAGATTCATTTTTGAAAGGAAATGCCACGTTCAAGAAGGATAGACTTATAGCAAAATGAAGTTCAAGAAAGAAAGAAAAAAAATAAATAAATAAACAAACATTAGGGCAAATATCAATTTATACCACTAAATTTTGAGGGTTGTATCAATTAAAACTATGAAAAAACACAATTAATGTATCAATTTAAATTCTGAACTTTCGTGAGTGTATCAATTTACACCCTCCCTTTCAAATTCCATTTGACTACTATCGTGTGAAACTTATAATTTAAGTTAATTAAACTTCTAAATTTTCATAAATCAATCAAATCTAGACCATTTATTACAATCACCTCTAAAAATCATCTATGCACATTAATTCTCAAATGTGTATTGACTTATTCAAATGTTGGGTTTACAAAGTGGACGATTAGAGTGTATGCATTGATGGTTTTTAATGGAATTTTGTCTAAATTTAAATTGATTTATTCATGAAAGTTTAGGGATTTAATATGCAATTATAAGTTTCACATGAGATTTTTCTAAACAAAACATAATGGATAGTGTAAATTGAATCATTTACAAAAGTCTAGAGTCTAAATTGATACCATTATTAGTTAGGATATAAATTGAATATACGACTCCTTATCAAGTTTAGAAGTATAAATTGATATTTTTTCTAAAAATTATCATATATGTGAATGTTACAACAGAAAAATAGTCAACGTGGCTGGTTCCTAAGAACCTCTTCAATATAGATTCTTCACATGATATTTTTCTCTTCTCTCTTGATCGAGATATTCTCTTCTTCACCGAAGATGATTTTATGATTTTATTTAATCATAAAAAATTTGGAGCATCGTGTGCAATTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGGGATATCTAGATTAATATTTATTGGAAATGCAATCAAAGTCTCAAATTAGGTAACCAAGGGGATGATCATGGACATATAAGTAAGAACAATTATCTCTAATAGTAAGAGACTATGAGGGTTCATGTCTATAATAGACAATACCATATTAGTGTGGAGATATGTAGAGGTCCGTTGTTTCAAAAATATTATCAATTAGAATAATTAATGGTTAATCTTTATTTGAAGTATAGCTATTGAAATTATCAATCATATCATTCCAATGTGTAAGATAATATTTTAATTGTTACAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAATTTTTAAAATATTACTTGGATAGGAATAGAAGAAATAAGTTAGGGTTAATTTAAAAGAAACAAAATAGTTAGGAATAGATAATAAGAAGAGTGAAAAGATAAGGATAGGAGATTAGGAGATGATATTTTTGTAGTTTTTTAGCATAGAGGAAAAAGTCAAGAATAAATGACTGACTCGTGGCAGTAGTCACCGACATGGTTTTGTAATGTTGTTGACTTTAAGCTCCACAAAAGAATACCACTTTGACTTTGTAATAATTTAAAATTTTAATATATTTACGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGACAGAAGCATTTCCGCCGAAAGTGAGAAAGGGGCGGGGCGCGTGGGAGCACTTCCATCACATATCAAAATATTTACTCCTTCAAAACCCTCCATTTTTATTTTCAAATTATTTTAAATTATCTATTCCATTTTAATTAATTTCTTTATTTTATTTAATAACTTTCTAAACTTATTTAACATAAAATTAAAATTTTAAAACATATTAAATACTTTTTAAACTACCAAAGAAAACATAGCTCAATTGATACACCAATGTATTCATGTGAAGTTTGTGATTCGAATTTCATTACTTTCAATTGTACTTAAAAAAAACACTTAATAGTTATTTTTTTATAATCATCATTTATCTAATTTGATAATTATTTAGTTCTATCTTTTTCTTAAAAAAGTTAAGCTTATAAATACTAATTTTATTATTGATTTTTTTTTATTTGTTATCTACTTTTTAAGAATATTTTTAAAAAATTAAGTCAAATTTTAAAAACTAAAAGATGGTTTTATAATATTTTTGGTTTTCTGTTTTTATTTTTCATTTTTAAATCATGAATTATCATAAAGAGAACCACACACGTTTTTTAAGATGCTAACATCTTACCAAATGAAACTTATTTATTCAAAATCATTTTATATGGTTTTTGAACTTTATTTAGCAATTTCGAAACCGTTATTAAAATTTTAAAATAAATAGATGAATTGATTATCAAACAAAGTTTTTTTTTTAAAAGAATATAAAATAAAAACTAGAAAACCAAATGTTATTAAACAAACTCTATTATTTAACTATGTGTTAATTCAAATGTGAGGTATATGGTATGAAGTTTAGCAAAAAACAAACTAAATTTTCAAAGTAAAATTATCGAACCTCTAATCTCTAGGTCGATAGTACAAGTTTTATGTTAATTGAACAAAATTGTTACCAATTGAAGTCTTATTTAACTAATTTACTTCTTTTCCTATAATTTAAAATTTTTAACTATAACAACTGTGAAGATGTATAATTGAACTGCTAACTTTTAAGGACTATTACTCCATACAATATCTCTCTCAAGAAATTCAAACACTCATACATATTTTATATTCACCATCAAAAGTTAGTGGATACATTAGAATATCTCTAACATTAGTTGTGACCAAACAATTTATGTGATATGGTTCAACCCTCACGTCATTATGCTAAGTTCTAAGCATATCTTATCTCACAAGCCTACCAATTTAAACTCAAATTCCAATTTTGAAAACCATTAGAAAAACAAAATTGAAATAATTTCTAAATTTTCAAATTTATTTTTATTGCACCCCAAACCTCAAAAAGCGTTTTATATGTAATTAGGGGACATTTTGGGCATTGAGTTGATTATTGTTGTTCGTAATTATAATAGTAAGCACTATAACAAATAACAAATACTATAACACCGAGAGATTTTAAATAGTAATATTGTAAATAATTGTAGGTTATAAATAGTTGTAAACATCACTATCATATTCAAAGCCCCAAACGTAGAGTGGACTATAATAACAAACTCTATCAACTTTAAGTTGGGGGGCCAAACACCCCCTAAGCTTTCAATTTTGTGTTATTTGAGTTTGAACCGTAAACTTTTTTAGCTTGTATCTATTTGATCAAATTTTTTTTATCCAATAGGTCTCTAACATTTCAATTTCGTGTCTAGTAAAGTCCTTGACATATTCGATGATTTTCACAAACCTACCGTTCAAGAAATTGAAAGTTTGTGATCTTATTAGACAAAATTTAATTTTATACCTAACTATAAATTATTTTTTAAAATGTTTAATTACCAGTGTCCTATTGACACAAAATTGAAAACCTTTTAAAAATTTAGGTTAAAAATCATTTTTGGTTGCTGAATTTTCATGAAAGTAACAATTTAGTCCATGAAATTTAGTTGGTAACAATTTAGTCCATGTAATTGTTGGAAAAAACCTAGCACTACTACTATAGGAATAAGTAAAAAAATAATAAATAATTTAAAGAAAAACAATAAAACTGGAGACACTAAAAAGAATTGACGTGGAAAACTAGCTCCCAACACTGAACCACGACCCACCAAAAAGAAATCCACTTTGCGAAAAATTGTTACAATCACACAATAATAATTCTCTACTCTATCCCAATTACAAAAACACTCTCGTGAAGCTTTTGTATTACTCATACCACTTTTTTACTCTCAAACTAGAGTATACATAAAAGGAATTTAACTAGAGCTATCACAATCAAAATTAAAGTTGCTCTTAACTAGAACGATTTGAAACAAAAAAACAACTTCTTTTATAATGTTTGAAGCTCATCACATTCTTAAACCTTTTTGTTGTGAGAGAATTGCACTTTTAATATTTTTCCAAAACTCAAAGCTCAACAATAATTTCAAATTTATAAGAATTTAGTTCTTATACTTTACCATTTGAAACGAATTAGCCTTTATTATAAAAAAAATATATTAAAATTTAATGAAATTTTTGTACACACGTAAATTAATAAACTAATTAGAAATCATTTTTTTTATTTACAAACTACAAATTTGTCATTTATTTGAAAAGATCTTTCATGATAGAGATTAAATTTTTATAAATTTTAAAGTACAGAGATTAAATTGTTACTATATAGATTTAGAAACTAAAAAAAAAAGTAAATCATTAATTATTAACTAAAAGGATAATAGATTAAATTGTTAATTCTAGGACAATTTAAAAATTAAAAGTGCTTTTTTTTAAAAAAAAAAAATTAATAAGTATCTACTCTTAAAATTTTAAGGTTATAATTTAACCCTAATAAAAATATCTAAGTGTGAGAGAGAGGAAAAATTGAGGAGAAAAAAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCCCCCCCCCCCCAGCTCCGCCGCTCGCTCGCTCCATCAAATGGGTTGCTCATCCGACTCTGTCTTTTCTTCAACCGAATAAAATCATGTTTCAATTCAATTCCACTTCATTCCCTTCCAGCTTCTTGTAAATACACTTCGTTTCGTGTTTTTTCGATTTCTTATTCATATTTTGCGAGCGAGAGGTGTGAGCACAGTTAA

mRNA sequence

ATGTTGCTTTGCCAGCTTGGCCAATTATATAGAAGAATACACAGCTACATACTTTTATGTTCTATTGTTTCGCTTTCGCAATTAATTTGTAAAGGCAATCTCCGCCGCTCGCTCGCTCCATCAAATGGGTTGCTCATCCGACTCTGTCTTTTCTTCAACCGAATAAAATCATGTTTCAATTCAATTCCACTTCATTCCCTTCCAGCTTCTTGTAAATACACTTCGTTTCGTGTTTTTTCGATTTCTTATTCATATTTTGCGAGCGAGAGGTGTGAGCACAGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTGCTTTGCCAGCTTGGCCAATTATATAGAAGAATACACAGCTACATACTTTTATGTTCTATTGTTTCGCTTTCGCAATTAATTTGTAAAGGCAATCTCCGCCGCTCGCTCGCTCCATCAAATGGGTTGCTCATCCGACTCTGTCTTTTCTTCAACCGAATAAAATCATGTTTCAATTCAATTCCACTTCATTCCCTTCCAGCTTCTTGTAAATACACTTCGTTTCGTGTTTTTTCGATTTCTTATTCATATTTTGCGAGCGAGAGGTGTGAGCACAGTTAA

Protein sequence

MLLCQLGQLYRRIHSYILLCSIVSLSQLICKGNLRRSLAPSNGLLIRLCLFFNRIKSCFNSIPLHSLPASCKYTSFRVFSISYSYFASERCEHS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC02G018350.1CcUC02G018350.1mRNA