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CcUC02G018160 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAGTTTGATTGTAGCTACTTAACTGCAACTGTAAGGATCTCTTTGATTTTTCTCTTCTTTTTTAATACTTTTTACTCTTTTCCAGCTCAGTTAATCAACTGCCGTCTTGATCATGGACAACAAAGAAATGAAGAGAAATTCGCCACTAGTATGTCTTCCTATAATGGGTGTTGTTATTTTTATTCTTTTTTTTGCAGTTTCTCAAATATGTCTTCCTTGATTGCATATGTAAGAATCTGTTTCATTTTCACCTCTCTTTCTTTTTCCAGCAAGATTCATCAACTGCCCTCTTGGATCTGGGAAATAAAGAAATAAAGAGAAATTCATCACTAGTATGTGTTCCCATAATGGCTGATTCGGCTGATTTGATGGTTGCTGATGCATGTAAGGCAAAAACTAGTGGTGCTGATCTTGTGGAGATTCGATTGGATAGTTTGAAGATTTTCAACCTGCAAACAGATCTCAAGACTCTTATAAAAGAGTGCCCATTGCCTACTCTATTTACTTACAGGTTTGCACAGGAATCTCTCTTTGATCAAACTATATTCATTAATCTCAAGTCACCATACGTTAAATGAGATATTTCTTTTTTCCTTGGAGTTCAGCTATTGAAGATCTAGTTAATGAAAGACAACTGGAAAACACGAATTAACATTTCAAAATTGAATTTTAATTTAAATTGGTGTATCTTGAATCAGCATTGGTTGGAGTTACTTTTCAGTTGTATGCTATTTTTCAATGCTGGTGATATTCTTTAGCATCTGATACGGGAAAGCCTTCTCCTTGTATATATGAGTAAGGTACAAAAAGATAAATGCAACTTAACTGACTAACTTGAAGCAAAGTCATACGCTAATACTGAGGAGTAGCCAGCACTTTTAAGTTGACATGTGAGAGATAATAGTTAACAAGGTGATTATAGTGTCGTAAGCCATTGAATGGGGTACCCATTTTGTCAATTGGAGGATTTCTTCTATTCCCTTAGAAATGCGTGAAGTTGAGATTGGATATATGTGAAACATGAATGTGGTCCTTCTAGCAAATGGGTTTGAAGGTTCATTGAACAAGGTCATTCCTTTCGGCATAAATTTATTGTGAAAAGAATACTGGAATGACTATTCTGATTTCTGGCTGGTTTAACGGCCCTTATAGTATAGTAGCTCACGCAGCCCTTAGCTTTTAACTGCTGAACTTAGAATTTTGATTCTCGATTTTTCTAAACTTTCACTTGGTGGTGCCTTTCAAGTCAAAATTTAGGAGGTATCTTGGAAAGATGAAGTTCCTATGATGATAAATCTTTCTCTTAAGGACTTCCCACAAATCAAAATTGGAACTTTGTAGGTAATGATTGGGTTTGTAGCCTGTAAGAGATTTTGATGATTGGGAAATGGGAGATAGAGCTCAACTGTTCGAGAAAATCCATGGGTAAAGATCAACTGGTTCGAGGATTGATATCTTTGGGGACTTCGGAAAATTCAGGTCTTATTTTCTGTAGAATTTGTTCTCTCGATATTGAGTGGGGACTGTTGAGCAGTATTTTGTTCTTGTCAAGTTATTTGACATAGTATTCATTTATCAATGAATTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTAAAAAAAAGTTATTTGAAATAGTTAATACTCTAAAAGTGCAAGGTCTTCTAGTGGCTCCAACTTTGGGTGATATTAATTCTATAGATAAGGGAAATCGAATTCAACTGCATATATCTCTCCCCTAATTGATGCATGTGATGAAATAAAAAAAAGATAGAGAATAAAGAGGCTGATCAGCTACTCCATTATTGTTCTTTCTTGGATATTTGGTAGATCAATAATTTTCTTGTATCTTTCATTTCAGTGAAACTATTTTGAGATCCATTCGGTAGGCCTTTATGGTTCATATGCAACTGCTCCTCTAAAAGAAATACTTTGATTCTTCAGCGTAACTCCCAAATGAGCTCTCCTTTATGTTGCTTCACTTGTGCAATTCACAAAAGTTTTTTTTTTTTTAGTTAAGGAAACATTTTATAAATAAAGGGAAAAAACCACAAGAATTACAAGAACTACATGAGCGATAGCCAATTGTTAACTAAAAAAGATAAGTTGATATGAGCAATTCACAAAAGTTTTTTAAGGCGTGGAAATTTGGAATTCTATATTGCTTCGTTCTTGTACTTGGATTAGTCCTTTCTTCTTCATTTCTGCACCTTCTTTTTCCTGTAACCCAGCCTTCTCTGTGATTGTAACCATTTGGAAAGACTTCTTGTTATGCAAGGCTAGAGCTTTTGGAATTCTTGTCACTTTTTCTTTGAAAATTTCATCTTTCCAACTAAATACGAGTGCTTCTTATTCAAAAGGTTTCCATTCAAGCCATTTTGACCATATAGGGATTTTCTACACGAGATTCTTCATGTCAAAGGGTTTTGGCTACGTTGGAAAAAGTGGTTTCGTGGTTGTATTTCGTCCACCAACTACTCTACTATCTCATCTACTCTCTCATCATGGATGGGAGGCATAGGGGAATTATTATTGCCTCTAAGGGCCTTTGTTGAGGTGACCCATTATCACCTTTCCTTTTCATTCTAATTGTTGATTGTTTAAGTTAGATTCTGTTCTATTTGGAAGCTAGAGGATTGATCAAGGGGTTCACTGTAGGAGTCAATTCCTTATCTACAATCCACCTACAGCATGACCTTATCAACCTTTTCAACACCATTTTTTTTTTAATAAGAAACCAAGCTAAGGAACAATATATACAAGGGCACACAAAAAAACAAACCCAAGATTGAAAAAACCCCACGTCCAATTACAGAAAGGGGCTCAATCCATAATAATAAAGCTATGCTGATAATTACAAATAGTTGCATTAATAAGCGCCCACTAAGAGGAATTAAGGCTAATCATTTTCAAAAGCTCTCCCTAGACTGCTGTGCCCCATGAAAAATTCTACTATTCCTCCCCAGCCAAATGCCCCACAAAATAACAAAAAAGAAAAGAGAAATATTGCCACAGGATCCTTGCTTTATCATGAAAGGAAGGGTTCAACAGTCCCTCCTAGAATATTGAGCATCACCCTCTCTTATGAGCCAACATAATTTCAATAGTCTAAAAAAATTGGTTCCATAGAAAACTAACAAACTGACTATCCTAAAGGAAATGGTTAAGATCCTCTTCCTAATTCCTACCAAGAATACACCATTGGAGCTGCAACATAAAGGAAGAAAGCCTTTGGAGATGGTCTACAGCGTTCACTCTCCCATGCAAAACTTGCTAGGCAAAACACTTCACTTGCTTTAGAATTTTAACCTTCCAGTGTGAGGAAAATGTAGGGGTTTTCTGAGGAGGAGTGGTGGAGCAAAGAATCAGAGTGTACTTGAAGAAGCCTTTAGAACGCTTTGGAAACCAAGACCTAGAATCCCTTTTCCTATGTTGAGTGACTTGGTTAGAAATAATAGAAAGAATATTGACAGCTTCACAATAGGGAAACGAAAAGCCAGGGAAAGAGAGGAAGAAGAACCAAAGGGTGGCAAAATAGAGGATATCAAATGCATCCTCTTAATCGGAAAATGATAAAGATGGGTATACAAGGCACACAGAGGCCTCTCCCCCTCCTACGAATACTCCCAAAAATAGGTGTTTAACCCATCCCTAATAGAGCAGTTAATGAATTAAGAGAACAGAGGAAAGTGCAAAGCAATAGTAGACCAAGGGTTCTGACAAGAACCCTTAATCCTACTGCCTGAGACCCATTCAAAAGGGGGAGGTTCATACTTGCTTGCAATAGTCCTCCCTCTGCCAGAGTATTGGGCTCCATGTGGAAATACCCTAACCATTTCACTAAAAGAGTCTCACTACATAATTGTAGATCCCCATGGCGCCCCATTTTGCAATTTTAATAGATGTTTCTTATAAAGTTGTCTTCCTCCAAAATAATAGATGTTTCGTATTAAAAAAAAGTAATTCTAGTTATCAGATTTTAATAGTTTTTTACCACAATGTATGTAGTTTAATTAATTTATGTTTTCTAGACCTAAGTGGGAAGGTGGCCAATATGATGGTGATGAAAATGAACGGCTCGAGGTACTTCGATTAGCCATGGAGTTGGGAGCTGATTATGTTGATGTGGAACTTCAGGTTTACTTCCTCCTACTAAAATATATATATTTTTTTAATGCAACTGCAATGTGGTTCAAACCTCTTTGGCTAAATTATGCTTGTGTTCTAATTGATATTCTTTGTTGAACTTTTTTCTTGACTTTTTTTAAAGAACTCTGACAATTTTGTTCTTCTAGATTTCTAATCTCACTGAAAAATTTGACTAATTATCTGCTTTAGTGAAAGAACATGGATATTATAAACCTTCACCTTGATCAGATAGTGCAATTTCCAGCTTTGAATGTGGAGTTTGAGGGGAAGTTCAATGGAAGTAGTCTTAGAGCTGTCTAGTGCTAAGTAGGTGCTTGAAGACCTTTGACACATAGGATGGAGTGATGTTTGGAGGCAGAGACATGCTATCATATGTCGATCTTGAGAAAAACCTGATCCCAAGTTGACAAATGCGTCTTGGGTGAATGGTTGTTCAAGGAATCTTCTCAACAATGACTATTGATTAAGCAATTAGGTTGAAAATAGCTCATGCAATATCTTGATCTTAAAAACGTCAAATGCTTCTGGGGTTTAAAAGAAAAACATTGAATCCAATTCCTTGCTGGAAGAAGCTTTTTTAAATCTTTGATATCTATCCAGTTGCATGTAGTGATGGTACTTTAGGGGGCGTTTGGCGGCTTGTTTGGAATCCTAAGCCTAGGAATGTTCAACATGGAAAGTGAAGTTGGGGTTTAAGTAGAAAATTATGTTTAGGGTGTAGGTTTAGGAAGTTCGGGTTTAAGAAGTCTGTATATGGGAGTGTAGGTTTAAGCCTGAAAATGGTGTGCAAATTTAGAAATCTTGGGTTAGTGAAATATTTCATTGTATTTGATAAGTGGTTAGATCTTAGATT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MQFDCSYLTATFLKYVFLDCICKNLFHFHLSFFFQQDSSTALLDLGNKEIKRNSSLVCVPIMADSADLMVADACKAKTSGADLVEIRLDSLKIFNLQTDLKTLIKECPLPTLFTYRPKWEGGQYDGDENERLEVLRLAMELGADYVDVELQVAREFIDSIRGKKPEKFKVIVSSHNYQETPSLDELGKLVARIQESGADIVKIATTALDITDVSRIFHIIVHSQVPVIGLVMGERGLISRILCAKFGGYLTFATLEAGIVSAPGQPTIQDLLTLYNFRQIGPDTKVFGIIGKPVGHSKSPMLFNEAFKAIGFNGVYVHFLVDDIVNFLQTYSSSDFAGFSCTIPHKEAAAKFCDEVHPVAKSIGAVNCIIRSHDGKFCGYNTDYIGAISAIEEKLKGHHTVSTQSGSPLSGRLFVVIGAGGAGKALAYGAKEKGAKVVIANRTYVYQFMITSVLFVPFLLLQILTFSHLVLKERAKELAETVGADAVTLADLDNFHPEENMILANTTSIGMQPKVEETPISKHALRYYSLVFDAVYTPVMTRLLKDAEASGAKIVTGLEMFVGQAYEQYERFTGMPAARNLGVPQIKSDTHNQKVINDDLKVHDEEHFSSTDDLGAMDYTPASKKPPIHN Homology
BLAST of CcUC02G018160 vs. NCBI nr
Match: XP_038901058.1 (bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic [Benincasa hispida] >XP_038901059.1 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic [Benincasa hispida] >XP_038901060.1 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic [Benincasa hispida] >XP_038901061.1 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 938.7 bits (2425), Expect = 2.6e-269 Identity = 479/554 (86.46%), Postives = 501/554 (90.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. NCBI nr
Match: XP_011649384.1 (bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031736761.1 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031736762.1 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031736763.1 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN62101.1 hypothetical protein Csa_006373 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 929.5 bits (2401), Expect = 1.6e-266 Identity = 475/544 (87.32%), Postives = 496/544 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. NCBI nr
Match: KAA0045904.1 (bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 924.5 bits (2388), Expect = 5.0e-265 Identity = 472/544 (86.76%), Postives = 496/544 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. NCBI nr
Match: XP_008457914.1 (PREDICTED: bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic-like [Cucumis melo] >XP_008457915.1 PREDICTED: bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic-like [Cucumis melo] >XP_008457916.1 PREDICTED: bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic-like [Cucumis melo] >XP_008457917.1 PREDICTED: bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 924.5 bits (2388), Expect = 5.0e-265 Identity = 472/544 (86.76%), Postives = 496/544 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. NCBI nr
Match: TYK13685.1 (bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 920.6 bits (2378), Expect = 7.2e-264 Identity = 470/539 (87.20%), Postives = 493/539 (91.47%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SQT8 (Bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EMB3004 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 720.3 bits (1858), Expect = 1.9e-206 Identity = 371/547 (67.82%), Postives = 437/547 (79.89%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C4R4R8 (Pentafunctional AROM polypeptide OS=Komagataella phaffii (strain GS115 / ATCC 20864) OX=644223 GN=ARO1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 173.3 bits (438), Expect = 8.6e-42 Identity = 150/515 (29.13%), Postives = 247/515 (47.96%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6C1X5 (Pentafunctional AROM polypeptide OS=Yarrowia lipolytica (strain CLIB 122 / E 150) OX=284591 GN=ARO1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 8.9e-39 Identity = 142/524 (27.10%), Postives = 239/524 (45.61%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7HPN3 (Shikimate dehydrogenase (NADP(+)) OS=Bacillus cereus (strain AH187) OX=405534 GN=aroE PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 1.7e-37 Identity = 100/296 (33.78%), Postives = 159/296 (53.72%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9IYA1 (Shikimate dehydrogenase (NADP(+)) OS=Bacillus cereus (strain Q1) OX=361100 GN=aroE PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 1.7e-37 Identity = 100/296 (33.78%), Postives = 159/296 (53.72%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LQ48 (Shikimate dehydrogenase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G297240 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 929.5 bits (2401), Expect = 7.5e-267 Identity = 475/544 (87.32%), Postives = 496/544 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C6S2 (Shikimate dehydrogenase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497484 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 924.5 bits (2388), Expect = 2.4e-265 Identity = 472/544 (86.76%), Postives = 496/544 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TS71 (Shikimate dehydrogenase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold243G004420 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 924.5 bits (2388), Expect = 2.4e-265 Identity = 472/544 (86.76%), Postives = 496/544 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CQ69 (Shikimate dehydrogenase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold299G002050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 920.6 bits (2378), Expect = 3.5e-264 Identity = 470/539 (87.20%), Postives = 493/539 (91.47%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L0I7 (Shikimate dehydrogenase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499937 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 892.5 bits (2305), Expect = 1.0e-255 Identity = 456/545 (83.67%), Postives = 483/545 (88.62%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC02G018160 vs. TAIR 10
Match: AT3G06350.1 (dehydroquinate dehydratase, putative / shikimate dehydrogenase, putative ) HSP 1 Score: 720.3 bits (1858), Expect = 1.3e-207 Identity = 371/547 (67.82%), Postives = 437/547 (79.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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