CcUC01G011800 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTGAAGCGTGCTGCTGTGAAGGGTGAGCGTAGGACACAGGTAATAGACAAGGCGTGCATAACATGTGGGCATCAGCAGATGGGTGATCAACACCTTGTTGGGCATCAACCAAAGGACACATACGCTCTCTGCCTCTTTTGAGGTTATTTCGATAGCGTGTGTACAGGAATTGCCGCCCATGAGTGCTTGTGCATGCGGGGCAGTATGCCTGAGCGTGGTCTGCCACACATAGGGGCTAGGCAGACTGTGTATGTGTTGGGTTGTTGGGCATGCCTAGGGGCAATTTGCTATATTTGGTATTTTTATCCAGTGTTTGGAAGATGGTGAGTCATTTTGGGTTGAAATTCCATATTTACGGTCTTAATGAATTAAGTTATAATTAAGAGGATTTTAAGAAAACTTAACAAAGGAAGTTAATATATTTCCAAGCTAAGAGGAGTTAAGGAGATTTACAACCTATTAGAAGCCGGGACAAGTTGTGAGTGACAGTTTTATTTAAAATAAGTTTTATTTACTCATTATTTTTCAGTATGCAAAAGAAAGTTATTAAAGCATGAACAAGACTTAATTTCTCATAAGAAATTTTGGATAAGCAAATATTTTCCCACATGAGTTTATAGTATGGTTTACCGTTGAAATTTAGCTTGAAAACATGTTTTGTGTCTCTTAAAGGTTAAGGAAGTATGCTTTATTGGATGTTGAAAGAAATTTGCAAGTATGTTGGAACTTATTTTCCATGAATATTTTGAATGAACATCAGTTTTCTAGCTTAGGATTATTATATGATTTACAATGGATAATCTTCTAAAAACATGCTAGTTGTTATTAAAGTTTCATGAAGAGCTTGTAGCTTTATGATTTTGCTTTAGAGAAGCATGATACTTGATAGTTGATTTGTGAAGTTGAGATATCATAAACCCGTGTACTAATGTAATATTTTCAAAAGCATGTTATTTTCTTAAATGTGTTTTGGAATCGTCTCCAATGCCGAAGGACATTGAGAAGGCATATGGGCAGCTTGAATATTATGATAGAATTCAACACTGAAGGACATTGAAAAGGTGCCTGAGTATCCACCAGGTCCCTAGTACTAAAGGATGAGAAAGTACATGGGTAGCGCTAGATTGTATATACTCCTATATGCATATAGTGATAGATTTGACGTTGTTGTGTTGAGATTATTCCACATCAGCTAAGGTTATTTGACGTTGAGCAGTGTTGAGATTGCACCACCCTAACTAAGGTTGTTTTTTATGTTGAGCAGTGTTCAACTCCAGTCCACCTCAACTAAGGTTATCTTAAAAGTCAAAGAGGATGTTTATGAGATACTATGATGAGTTTTTCAAATGTTTTACTTCTCGTTTTATGCAAGCATGACTTATGTTTTATGCACAGTTGGAGTTTTTCTTAGCATCGAATTTGACATTATGTTAAAGATTATGTTTTAGTAACTGTCACTCATTGAGCAACTTAACTCACGTTTTCCTTAAATTTCTATTTTCCAAGTAGCAAGCGAGTTTGCGGTGCTTAGCCTACACAAGCATGTCTGATCCAGCTGTATATAAGTTGTAGATCTTATATTAATTTGTATTAAGACTTGAACGTTGTATAAGAGTGAGGCTTTGAGAGGGGGAACTAGTAGTCATGTGAATGTATAAGTTTGTATTACAATTTGTAATATTTGAGTTATGCATGGTTGTTCTTAAATCTGAGAATGATGTCTGTTAAGAATTATAAACTGTTTATCAGGTACTTGGTTAGTTATAAGTTTAGAAGAAGTACAAATTGATGGTAGATGTTGTAAAAGAGTTGATGTCGTAAAAGGGTCGATGTCTGCTATTCTCACATCCTTTCCTAGGTTAAGAGGGTAACTTGGGAGGGGGTGTGACATAGATAACTCTTTTCAAAAAAATATTTAATTCTAAGCCAAATTTTTAAAAGAAAAAACAAAATAACAATTTCTTTCATCGTGTTATGTCCCTCACTCACATACCTCCTAGGAAAATTTATAGAAGATCACTAGAATTATTTCAAGTTAAGCGCACTTAACTTTTGTTTTAGTGTTCCTATAATTGAACCACCAAAAAGGAAGGTGCACCTTTTTGGTAGTAACTATCAATTCTTTGAACCTTTCTTACCCATACTTTTATATTCTTAGGATCCATCTTATTTGGATGTGATCTCGTTTCCTTAATGTATCCCTTCTAAACTCGAACGTTGCGTAGGAATTATTTTTTTTAAGATTTGGCTTCATGTTGTGTGGATAGATATATAACCATTTTTTTGCCACATTTCTTTTAAGGAAATATTGTATTAAACTCATCCTACCATATAATTCTATATGTTTGATGGAGGCGAGAGATGTCTAGTCAATTTCATAATTGCATAATTCATAGCAAACAAATTCAAGCTAAATGAAAATAATTCGAAAAACATATCAAAAGAATTTGAAACTTTAAGAAATTTGATGTAGAACGACCTTAGTATACTTACAGTGATAAAGATACCTTATGAATGTCGAATCTAAGAATCATGTTGAACAACAAGTCCCATAAAACTCAACCCCAAAAGACTCCAAAAGTCCAATTTGATCTCAACCCCTAAGATAGGCTAGATAACAGATTACTTAGACGATCTAATAAACCAAGGATAGAACAAAGCTTTGAAACTCCCAAAAACCATTGATGCTCCAAATATTCATGTATTCTATCACAAGAACACACAAGAAACAAAGCTTAAAAGCTTTCAAGGTTTAAAACCCAAATTGTATATTTTTCCAATTCTTCTTTTTTAATTGTGAAAATTACAACACAATTTAAACTAAATGAAAGATCACAACCTTTCATCTATTTGTCTAGGCTCAAACAAAATTCTTCAATTCCATGCATGAATCATCATAAATATAAATAATTAAAATAAATTGATACATTTAGTATTAATTATGTGAATGAATCTAAATTTTTAAATTCATTATGACTTTTGAGTGTCCAAATGAGTCTTGGAACTTCAACAGTTGTAACTCTTCACCATTGGCTGGAAACTTTATCTTGAAAGCAAGCATTTAATCCACAAGATAAGATGGGTTTGTTTGAGCTTGTTGAGCTTCATTTTCATCTTGTAAAACTTCATTATTTCCTTGGTTGGTCACCTCCATATCGCTGCCACTTATTTGCTTATCAGTAAGGCCAAAGATGCTCCATTAATAATATAATTAAACCACAGTGAGTAGTTTTGAATACATGATTTATCTTTCATAGTAAACCAAGAATGATTGAAATTGTTCAACCAAAATGATATCAAAATTCTAGCAAATTGGAATTAGGTGCCCTCTTGGATGAGAACCTCTAATTCCCAATCACTAAAACCCTCAAATCAATCCCCAAATTAATTTGATTTCAACCCTAAGGATTGGGTTAGATACAGATTGCCTTAAGATCAAAGCTCTTGAGACAAAGAACAAGTTTTTTGGTCCAAGATTCGAATACTTCACAAGATAAGATGATCATTCCCACTTGAATCATGCAACTCAATACATGAATTGAAAAATTCAAAAAGCTTTCCTAGCTAAACTTGAAAGAAAAGGCTCAAAGGCCAAAACTCAATCCATCATAATTTGCCAAAAACCTAATGGCAAGACTTTAAATAGCTTCCCTAAAGGGATTGAATCCCTAGGTGTAAGCCACACACCTAGCTTTGGAAGTTAGCAAGTTATAAAGATTAGTTTTGGAAGATGACAAGTTAAAGAAAGTAAGTAAAGAGTGGCCGAGAGCTTTAAGGCATGAGTTATCATGTGTTGAAGGTGTGCTGTGCGTTTGCAAAGGCTGCTATGCTTTGAAAGGTGTCCTATGCATTAGAGAAGTGTGTGCTAAAAAGGAAGTGGCTAGGTGAAGCTTTAGGGTAGCCGAGACCAAGTATAAAGGGGATGTGGTTGCTAGAGAAGCATGCGTTTCAGAGGTTGAGCGTGAGTAAATGTTCGGGGCTATGCGTTGATGAGGTTGTTGGACCAGCAGCCATGCTTTGGTTGAGATCGATAAGGAGGTTGTGTTGGTCGTTGGCGAAGTATGCGTCCAAGTGTGTCCATGGTTCGACGCATGGTGCAATGTTCCAGGCAGTAATCAAGTTCGCGTTGGCGAAGTTAGCGTTCAAGGGTGTTTACTGTTCAGGCGCATGGTGCGATGCGTCCAAGCTAGCAACCATCTTTGTAAGCGTCCAAATTTGGTATGCGTTCAAGTTTGCTAGGCGTCCAAGCCAGTACCATAGTATGTTAAAAAGAGGTTGCGTTACTTTGTTTAGTAGAAATTTAATCAAATAAAATAGAGAAGAAAGTGGAGGTTAAGTCGGCATCTTGTCTAAGTGTGTAAAGCTAAATTTTCAATCATTTTCTTCGTCTCAAAAGCTCCAATCGATTTCATATTTCAGCTTAGTGATGAAGAGAGGTAGAGGAAGAAGTCTAGGGCAAATTCTTGTAGAATTCTGATCGATTTTATGGTGTAATTGAAGCTAGAATAGAAGGGTTGATTACTGTCGTGCAATCTGAACAATGTTTGGTATTTGAAGGATAGTGTTATGTGGAGATCGAGTTTAGAGCTGAGAATTTAAGGTCGATAAGTTAACTTAATTCTTAACAGCTTTTATGAAGAATGTTTGAGTTGAATTTGAAGAGAAATATGTAAAATTTATGGTGGAAGTGACTGATACAGATTTGCTAAGCGATTTGGAGCAGCTCGAAGTTATTTGGGAATATCTATCAAACGAGGAGGAGTTATGTTCTGAAATATTGAGGTAAGCTAGGAAATAAATTTCTTTACAAGTTTGTAGAAGAGAAAAAGTTCTAAATTTGGCTGGAAATGCAATTTGTAACAGATAGAAGTGAGAATAAGAGGGAAGGCAGAAGCTGCGGAAGACAAGTATCACTGGACTGCAAGTAGCGCTAAGAATTTAAGCGTGAGTAGCGAGACGGGTAACGCGGGTGTCGCTAAAAGCCTTGCGT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ATGGGTATGCCGTCGCTGCCCTTTTGTTCTCCTTTGTTTCACCTTCATATTCTTAATAGCATTACTTTAATCCCCACTTCATGTTTTTCTGAATTTTGCGCAATTTTTATGTCTGTTGGTGCTTTTCTTTTGGGTTCGATTTGCAGTTTTCCTTTGCTTACTGCTCATGATTATATCAATTGCTCCATTTTTCTTACCGTTTCTGTACTCTGTTTGTGCACAGGACTGAAGTGTATAGTGTCTTTGCGAAGTCGAAGATTCGAAAATGAGAGTGATGCATTGAGAGAAGCTATCTCATCTATCTTCACTGATAGCAATGAGAAAAAGAGGAAGTTTACTGAGACCATTGAGCTTCAGATCGGGCTGAAGAACTATGATCCTCAAAAGGACAAGCGATTCAGTGGTTCTGTGAAGTTGCCACACATTCCCCGTCCCAAGATGAAGATATGCATGCTAGGGGATGCCTCGCACGTTGAAGAGGCCGAAAAAATTGGTTTAGACTATATGGATGTGGAAGGCTTGAAGAAGCTAAATAAGAACAAGAAATTGGTGAAGAAACTTGCCAAAAAATACCATGCCTTTTTGGCATCTGAAGCTATAATCAAGCAGATCCCTCGTCTTCTAGGCCCTGGTCTCAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACATTGGTGACACACCAAGAAACGCTTGAATCCAAAGTTAATGAGACCAAGGCAATGGTCAAGTTTCAACTGAAGAAGGTCCTTTGTATGGGAGTTGCCGTTGGAAATGTTGCCATGGATGAGAAGCAAGTCTTCCAGAATGTTCAAATGAGTGTCAATTTCCTGGTTTCTTTGTTGAAAAAGAACTGGCAGAATGTGCCTGTACCTGAAGAGCACGATGGGCAAGTCATACCGGGAGCAGAAATGTCAACCATGTCAAATGCAAAGCTTCCTGCCCGCTGCATGTACAACGGGCCGTGTAGAAATCAACTCAGAAGTGCCATAATCAAGTGTCCATGGTCAATTGGATCTACGAGCAACATTTCAAAATCCTTTGGCTTGAGATCATGTCCCTCATTCAGAGCCTGTGCAATGGCAGTTTACAAGATTAAACTGGTTGAACCATGTGGGAAAGAGCATGAGTTTGAGGCATCTGATGATACTTACATTCTTGATGCAGCTGAAGAAGCAGGAGTAGATTTACCTTATTCTTGCAGGGCAGGCGCGTGTTCTACGTGTGCCGGGAAAATGGTTTCGGGTTCAGTTGATCAGTCGGACGGGTCGTTCCTTGATGATAGTCAAATGGCAGAGGGTTATTTGTTAACCTGCGTTTCATTACCAACGGCGGACTGTGTGATTCACACACATAAGGAAGGAGAACTGATCTGA MGMPSLPFCSPLFHLHILNSITLIPTSCFSEFCAIFMSVGAFLLGSICSFPLLTAHDYINCSIFLTVSVLCLCTGLKCIVSLRSRRFENESDALREAISSIFTDSNEKKRKFTETIELQIGLKNYDPQKDKRFSGSVKLPHIPRPKMKICMLGDASHVEEAEKIGLDYMDVEGLKKLNKNKKLVKKLAKKYHAFLASEAIIKQIPRLLGPGLNKAGKFPTLVTHQETLESKVNETKAMVKFQLKKVLCMGVAVGNVAMDEKQVFQNVQMSVNFLVSLLKKNWQNVPVPEEHDGQVIPGAEMSTMSNAKLPARCMYNGPCRNQLRSAIIKCPWSIGSTSNISKSFGLRSCPSFRACAMAVYKIKLVEPCGKEHEFEASDDTYILDAAEEAGVDLPYSCRAGACSTCAGKMVSGSVDQSDGSFLDDSQMAEGYLLTCVSLPTADCVIHTHKEGELI Homology
BLAST of CcUC01G011800 vs. NCBI nr
Match: KAF3972606.1 (hypothetical protein CMV_003899 [Castanea mollissima]) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 1.1e-157 Identity = 290/401 (72.32%), Postives = 326/401 (81.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. NCBI nr
Match: KAG5602770.1 (hypothetical protein H5410_034140 [Solanum commersonii]) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 1.7e-145 Identity = 281/398 (70.60%), Postives = 315/398 (79.15%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. NCBI nr
Match: KAF3644195.1 (60S ribosomal protein L10a [Capsicum annuum]) HSP 1 Score: 520.0 bits (1338), Expect = 2.0e-143 Identity = 269/374 (71.93%), Postives = 303/374 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. NCBI nr
Match: PHT30114.1 (60S ribosomal protein L10a-3 [Capsicum baccatum]) HSP 1 Score: 519.2 bits (1336), Expect = 3.5e-143 Identity = 269/364 (73.90%), Postives = 299/364 (82.14%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. NCBI nr
Match: PHU16026.1 (60S ribosomal protein L10a-3 [Capsicum chinense]) HSP 1 Score: 519.2 bits (1336), Expect = 3.5e-143 Identity = 269/368 (73.10%), Postives = 301/368 (81.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8B9K6 (60S ribosomal protein L10a OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=RPL10A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 5.3e-94 Identity = 172/196 (87.76%), Postives = 186/196 (94.90%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7F845 (60S ribosomal protein L10a OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=RPL10A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 5.3e-94 Identity = 172/196 (87.76%), Postives = 186/196 (94.90%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P59231 (60S ribosomal protein L10a-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPL10AC PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 8.5e-92 Identity = 172/197 (87.31%), Postives = 186/197 (94.42%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZB9 (60S ribosomal protein L10a-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPL10AA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 338.6 bits (867), Expect = 1.1e-91 Identity = 170/196 (86.73%), Postives = 185/196 (94.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P59230 (60S ribosomal protein L10a-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPL10AB PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 335.5 bits (859), Expect = 9.4e-91 Identity = 168/196 (85.71%), Postives = 184/196 (93.88%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4D8ZCA0 (Ferredoxin OS=Salvia splendens OX=180675 GN=RP-L10Ae PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 525.8 bits (1353), Expect = 1.8e-145 Identity = 278/395 (70.38%), Postives = 311/395 (78.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2G2VAV7 (60S ribosomal protein L10a-3 OS=Capsicum baccatum OX=33114 GN=CQW23_30315 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 519.2 bits (1336), Expect = 1.7e-143 Identity = 269/364 (73.90%), Postives = 299/364 (82.14%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2G3CBC9 (60S ribosomal protein L10a-3 OS=Capsicum chinense OX=80379 GN=BC332_17231 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 519.2 bits (1336), Expect = 1.7e-143 Identity = 269/368 (73.10%), Postives = 301/368 (81.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A4D9BB87 (Large subunit ribosomal protein L10Ae OS=Salvia splendens OX=180675 GN=RP-L10Ae PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 517.7 bits (1332), Expect = 4.9e-143 Identity = 300/519 (57.80%), Postives = 352/519 (67.82%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A3Q7GZT8 (Transmembrane 9 superfamily member OS=Solanum lycopersicum OX=4081 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 516.9 bits (1330), Expect = 8.4e-143 Identity = 270/364 (74.18%), Postives = 296/364 (81.32%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. TAIR 10
Match: AT5G22440.1 (Ribosomal protein L1p/L10e family ) HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 6.0e-93 Identity = 172/197 (87.31%), Postives = 186/197 (94.42%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. TAIR 10
Match: AT5G22440.2 (Ribosomal protein L1p/L10e family ) HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 6.0e-93 Identity = 172/197 (87.31%), Postives = 186/197 (94.42%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. TAIR 10
Match: AT1G08360.1 (Ribosomal protein L1p/L10e family ) HSP 1 Score: 338.6 bits (867), Expect = 7.9e-93 Identity = 170/196 (86.73%), Postives = 185/196 (94.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. TAIR 10
Match: AT2G27530.1 (Ribosomal protein L1p/L10e family ) HSP 1 Score: 335.5 bits (859), Expect = 6.7e-92 Identity = 168/196 (85.71%), Postives = 184/196 (93.88%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G011800 vs. TAIR 10
Match: AT2G27530.2 (Ribosomal protein L1p/L10e family ) HSP 1 Score: 335.5 bits (859), Expect = 6.7e-92 Identity = 168/196 (85.71%), Postives = 184/196 (93.88%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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