CcUC01G008780 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTTTCTCTTTTTTCTCACTCTTAAAACACTTAACTTACCATTTTTCTCTCTCACAGACACTCCCTTGACCGTGCTTTCTCTCTCCTCTGTCTCTGTCTTTTCTTTCTCTCTCATCTTTCAGTTGTTTGAAGAGAAGCCCCTTTTGAAATCACTTCTTCTCTTTTACTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTCTCTGTATGTATCTGTACTGACTGACATTCTCAGTCAGTCCGATTGTGGTACCAGCTTACTCTAAAATTGTTTGTCAGTGGGGGTTTTTTTGGGGGTTCAATTTATCTCATCTTTTCTCAGTTTGCCCACTTGATTGTTGTTCGCTTCCGTTGGTTATTTTTTTCTTTTTTTTTGTTTCTCTCTAGAGGGATCTAGTCCGGATTGCCTTTTGATGTGTAGATTGAGGTTTGAATTTGTTTGGTTTGATTTTGAGGGGTTGGAGGGGAGGGAGGGGGTTTGATTTTGGGGGATTTTGTGCTTAAACCCTAAAAACACTCTGTATTTGAGAAGATGGATATTGGGTTGGTTTGATTTGAGGCAGGGGAGATGGGAGAGCGCGGTGGGGTTGTGAGTGATTGCGTTGGGTTTAGGCAGCGGAGGAATCTTCTTAATGTTAACGGTTGAGAGTTATGAGTTTCAGGCAGGGTTCTTGTCCTGTCGATTAGGGTTTTACTATTCTTTTTATTTTGAAATTTTGTGTGTCTGTGTGTGTGTTTTGAGTCTTCTTTTAAGCATTGGGGAAAGCTTGATATGAAGCTTTCAACATCAGGGTTTGGTCAGCAGGATCACGAAGGTATGATTCCCTTTCTTTGCTTTTTTATGTTGGTTTTGTTTTGGTTTACTGTTTCAATTTGGGACGATGGAACTCCTGTTTTGAATTGTTATTGTTATTATTATTATGTGCCTTTTTTCATTTTGTTGTTTGTTTTTCCTCCCTATATTAAATGCTATGGTTCCCTCGTCTCCCGCCATAAATTTTGATCTTCTGTGCTGCACTTTAATTATGGCGTTGTAATGATGGTGATGATTATAGGAGGGGAAAAGAAATGCTTGAATTCAGAGCTATGGCATGCATGCGCGGGGCCCCTTGTGTCCCTCCCAACTGCTGGGACTCGGGTTGTCTACTTCCCTCAGGGTCACAGCGAACAGGTTCCATGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTATAATTTTTTTTTTTAGTTTGAAAATATATCTTTCCATTTTTTCGGCTATCTTTTTCTTTGTATAGGGCAAAGTTGAGAAGTACCTTAATTAAATTAGTTGCCATTGCATAAGCCTGTGAAATTGAAAGGACTTCTCTGTCAATTTGTTTGTCTGTAGGTTGCTGCCACGACCAATAAAGAAGTTGATGGGCACATACCCAATTACCCGAACCTACCTCCCCAGTTGATATGTCAACTTCACAACGTTACAATGCATGTGAGTTCTCTTCTTCTCATGTAATTTGAGTGTGTTTAGCCTTCATTGCGTGATTAATGTTTCTAATGCGTAAATCTTTCGTTAATCTCTTATTAACAATTAATGAGGAAATTAGATTATTAAAGTAAGGAGAACTCTTAAGCAGGATTTGTATATGTGACATTTCAGGCAGATGTGGAAACGGATGAAGTATATGCCCAGATGACATTACAGCCTCTGACTGCAGTAAACTATCTTTACAACTCTGTTTCTCTTTCAGTTCTTCTTGCCACATTTATTAATACCTTAGCTCAATTTATTTTATACATACAGCAAGAGCAAAAGGATACATTTCTACCCATGGAATTGGGGATTCCTAGTAGACAGCCAACAAATTACTTTTGCAAAACGTTGACAGCAAGTGATACAAGCACCCATGGAGGATTTTCTGTACCTCGTCGTGCTGCTGAGAAAGTTTTTCCTCCACTGGTACATACATATATTCTGTTATATGATTTTGTTGGATCTGATGGATGAATTTTGGCATCTTTCTCTGGTATGGTGCTGCAGGATTTTTCACAACAGCCACCAGCACAAGAGCTGATTGCAAGGGACCTTCATGATGTCGAATGGAAGTTTAGGCATATTTTTCGAGGTAAGTCCCTTGATATTCTGTCCATTTGTGGAAATAAGTGTGATGGTTTTCTTTGTTAATGGTTTCTAGTTTACCTCCAACCTTTTCATTGATTGCTAATTCAACCAATTTTTTTGTAGTGTTGGTTAAGCACTCAGATTTAGTTGGCATTTGAAATGAAACTGTTAAGAATCATTTTTTGCTTTCGCTACAAAGTGATAGTGATATCAAGTTTATCAAATGTAAGGCACTTTGTTTTGTAAGAAAAAAGTAACTCACTTCCAAGAGAGTTTGGTTCATACTATGATACGAACATTGAATTACATTTTGTCTCTGAATCAGAGCAAAGGTTAACGATTAATTGGTTCCTGAGTAATGAAATTAAACTTAGGTAGTAGGAAAATGCAGATGACGGAGAATTGAATTACCTCATTAATTAATGGGAAGTAAAGAACCAAACCGTTGATGAAAAGGAAATTCAGAGCACTTCAGTTTCAAGAATATTTATTGGAATTTAAGAGGTTCTGTTACAGGACACTTGGTCAGTCCAATTTGATAGATCTCTTGTCAGTGAGTTATGAACCTCTAGATTCATTGGGTGGTCTTCTTAGAAGTTGACGGTCTTGCTGGGGGTATCTAAGTGATATGGCTAGAGAGATTGATGAAAGTTGCCGATTTTGTTCAATGTTCATGGTTCCATTTGCTTCTTTGAAAGGCATTTCAAGATAGGATCTCAGGTGTTAATGGGCCTACCTCTCACCATTCCAGAATTGATTTTTGGCTTGAACTTAAAGACCTTTTCTCTAGTCTTTATCAGTTTTTTATTTTCTGAGATAGGATCAGAGTTATGAAAAACCACCAATGGTGGATTACCAAGAATGAATTCCTATTGTTTAGTAAAGAAGAAAGACTATAATCTTTGAAATAGTGTGAACTTTACACCAATATAAAAGCCTTAAAAAGAACTAAATCAGGGAAACCCTCAAAAGAAGCATAAGTGTTGTTCAAGATCTTCTAGTTCCTTCTGCACCAAAAGACCAAAAAAAGGATCGATTAAAAGCCAACCAAAGTGTATTTGCATCTCCTTTGGAAGGGTGACCCACAAAAATCATCGGTAGAAGATAAAATCGTTTCCAAGCAAAACCTGACGCGGACCAAAAGCTTATGGAACAAAGTTCTAATATTGTCTTGAAAAGGAACAGAATCCACGGAGTTGGCATCACACATAATACACCTATAGGGGGTGAGGATGAAATAAGCATCCTACAAAAAGAAGCCACATCAAGAGACTTTCTGCTCAGAGAACAAATGAATCTTTAATGAAGTTGGTTTTCAAAGTAATTCCTTTGCACCATCCTTCACTTTAGGAATCTTGTACGATTGATTCTAGCTAGATTAGATCATGAGAGCTGTTTCTTGGGGAGGGGCTGAGAAGGGTGATGGATATCATTTAGTGAATTGGATTGTTGTATCATAATCTGGACTAGGGATAGGAAATTTTTAGTGCAAAAGTGTACCCCTCCTCTTGAAGTTGCTGTGGCAGTTTCCTTTAGAACCTTCAGGCTTTGTGGCATAAGTTCATTGCGAGTAAGTATGAGTTACATTCCAATGGATAGGGTTCTAGTACAGATTCCAAAAGCACCTTTAGGAACTGTTGGGAAGCAGTCTTTCTCTTTATGGTTCTCGCTTATTTCTTATCTAGCTACTTCTATATATTTTATGGTATCTACTATCTTTTGTTCGCAGGTTGGAACATTGTTCTATCATTTCTAATTTTATAAACCTCTCCTTGATCATGAGATTAAGGAGTTAGCTTCTTTTTATTGTTTTTGAAACATAATCACTCAAATATTCATCCATTATATTGAATGATGAACACTAGCCACGGAGAGCCCAACAAAATGCCGAAAGGGAACTAAGGAATAAGATTATGAAATTTCTAAGGCACAAATTTCATTACGTTATATTGAACCAATTTACTAAGATAAAACAATGTGAATTATTTTCTCAATAAAAAAAAAGAAGATAAAACAATGTGAATTATTTATAGAATATATATGGCAAATTTCAATTGAATACAAAGAGATCTATAGCGAGATTTCCATTCTAGGGGATGATTGTTGAGACAATTGTACCAATCAACAAACAGAGATTAATCTCATTGATTATTTTCCCCTTCCGAGTTCCTAATTGCTTTAGCTGTAAATCTAACTACCTTCTTGAATGCAGAATGAACACAATTTTAAAGTGAAATTCAACAAACCACCTTGTAAATGAAATAATAAAGGAGATTAGAAGAGGATGATGATTCATCCAAATCGTTCCTCCCAAATCTATTGAAATTCCTACCACTATTGCCTATGTCATCTCCACCATATGGTTCGTAAAATATCAATGCTTCGTGCACTGCTTTCTATGGCAAAACCTTCGAGAGGCTAATTGGTTTGAACCTGATTTACTGGAAGCAGAGCAATGGTTGCAACGGGGAAAAGTGCGGTTAATAATTGAAGAGGGCAGCAGAAGATGGTGGGATCTGGTCAGCGGTTGAATTAGTGACAAAGATACAGTAATGGGAACGAAATTGAGGAATTTATTGAAGTCGATGCTGATGTTGGCGACCATTGAAAGCGTTTCAATGATTGAAGAGGATTCCAATGGTAGGATTCCAAATTGGAAAAAGAATTGGGATTTCGTAGATGGGAGAGCGAGGGATTTAAGAAATTTGGGAAATTGAAGAAAAATCAGAGAAAAATGAGATGGTAGTTGAGTCACTCTATGACAAATTAGCTTCTTTTTATTGTCTTTGCTTAACCTATTTAGGGGTGGATGTAGGGGCATGTGCCCCTCCAACTTGGAAGTTCCTTTTTTTTTCTTTTGATATCAAAATAACAATTTTCATTGATTAAGAAATGAAAGAATACACAA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ATGAAGCTTTCAACATCAGGGTTTGGTCAGCAGGATCACGAAGGAGGGGAAAAGAAATGCTTGAATTCAGAGCTATGGCATGCATGCGCGGGGCCCCTTGTGTCCCTCCCAACTGCTGGGACTCGGGTTGTCTACTTCCCTCAGGGTCACAGCGAACAGGTTGCTGCCACGACCAATAAAGAAGTTGATGGGCACATACCCAATTACCCGAACCTACCTCCCCAGTTGATATGTCAACTTCACAACGTTACAATGCATGCAGATGTGGAAACGGATGAAGTATATGCCCAGATGACATTACAGCCTCTGACTGCACAAGAGCAAAAGGATACATTTCTACCCATGGAATTGGGGATTCCTAGTAGACAGCCAACAAATTACTTTTGCAAAACGTTGACAGCAAGTGATACAAGCACCCATGGAGGATTTTCTGTACCTCGTCGTGCTGCTGAGAAAGTTTTTCCTCCACTGGATTTTTCACAACAGCCACCAGCACAAGAGCTGATTGCAAGGGACCTTCATGATGTCGAATGGAAGTTTAGGCATATTTTTCGAGGACAGCCAAAACGACACCTTCTTACAACTGGTTGGAGTGTGTTCGTTAGTGCCAAAAGATTGGTTGCTGGGGATTCTGTACTTTTTATATGGAATGAAAAAAATCAGCTTCTTTTGGGTATACGCCGTGCCACAAGACCACAAACTGTGATGCCCTCTTCTGTTTTGTCAAGTGATAGCATGCACATTGGACTCCTTGCTGCTGCAGCTCATGCTGCTGCAACGAATAGCTGTTTCACAGTGTTCTACAACCCCAGGGCTAGCCCATCAGAGTTTGTCATCCCTCTGACAAAATATGTTAAAGCTGTATTTCATACCCGTGTTTCAGTAGGAATGCGTTTTCGGATGCTTTTTGAGACTGAAGAGTCAAGCGTTCGAAGGTACATGGGTACTATAACTGGAATAAGTGATCTTGACCCTGTTCGCTGGCCGAATTCTCATTGGCGTTCTGTCAAGGTGTTGCAGCTTTATTTCCACGACAGTTCCATGAAAACACTTGCTAAATTTACAATGACATTATTTCTCCTAACTTTATCTAATAGCACATGCTTAGATTGTGGCCTCAAATCGGAAATGCCAGCATCTGAAGCACTCGGAAATTTAGAACAAATTATTTATGGCACTGTTTGTCCTAAATTTTGTAGGTACATGTTCCTTTTTTTGGAAGTAGGGTGGGATGAGTCAACAGCTGGGGAGAGGCAGCCAAGGGTATCTTTGTGGGAAATTGAGCCTTTGACTACATTTCCTATGTATCCGTCTCTGTTTCCACTTAGACTGAAACGTCCATGGCATCCTGGAGTCTCTTCTGTTCATGATAACAGAGATGATGCATCTAATGGCTTAATGTGGCTTCGGGGAGGAGTTGGGGAACAGGGTCTACACTCACTGAATTTGCAATCTGTGGGCCCCCTGCCCTGGTTGCAGCAGAGACTTGACTCTTCCATGTTTAGCAATGATCATAACCAACAGTATCAAGCCATGTTGGCAGCTGGAATGCCAAACCTTGGAGGTGTGGATATGCTCAGACAGCAAATTATGCATCTTCAACAACCTTTCCAATATATTCAACAGGCAGGTTTCCATAACTCTCTGTTGCAGATGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAATTGGTTCAACAATCTATGCCTCAGAACATCCTGCAGGCACCAAACCAAGTTTTGGCAGAAAATCTACCTCAACACATTCTCCAGCAAACTCTACAAAATCAACCTGAGGATCTACCAAACCAGCAACAGCATACTTATCATGATTCCATTCAAGTTCAAAGCAATCAATTTCATCAGGGTGGGCATTCAAATGTGCCATCACCCACATTTCCCAGAACAGACCTTATGGATTCCAACACAAATTACTCAGATTCCATTACCTCTAGAAGGAATATACTTGCTTCATCATGTGCTGAAGGGACGGGAAATCTTTCCAATATCTACAGAAGTGGGCAGTCAATCCTAACTGAGCATTTACCTCAACAATCTCCTGTTTCTAAGAATGCTCATTCACAGGTTGATGCTCACTCAAACTCAATGTCATTTCCTCCATTTTCTGGTAGAGACTCAATTCTGGAGCTGGGAAATTGTAATTCAGATTCTCCAAGTCCTACACTTTTTGGTGTAAATATTGATTCATCTGGACTTCTACTTCCCTCTAACGTGCCCACTTACGCTTCTCCATCAATTGGTCCTGATTCATCCTCAATGCCACTGGGAGATTCTGGATTTCAGAATTCTCTGTACAGTTGTGTCCAAGACTCTTCTGAGTTGTTGCACAACTCAGGGCAAGTTGATCCATCGAATCCAACTCGGACATTTGTTAAGGTTTACAAATCTGGATCTGTTGGGCGCTCACTAGACATCTCCCGGTTCAGCAGCTATCAGGAGCTGCGAGAGGAGCTGGCTCAGATGTTTGGAATCGAGGGACAGTTGGAAGACCCTCATAGATCAGGCTGGCAGCTTGTATTTGTCGACAGGGAGAATGATGTACTTCTCCTTGGAGATGACCCTTGGGAGGCATTTGTGAATAATGTCGGGTATATCAAGATACTTTCTCCCCAGGACTTTCAGAAACTAGGGGAACAGGCAATCGAGTCCTTTAACCCTATCGTTGGTCAGCGACTTACCAGTGGTGGCAATGAAGCTGGAAATGTTTCAGGATTACCATCTGTTGGTTCGCTAGAATATTGA 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BLAST of CcUC01G008780 vs. NCBI nr
Match: XP_008463127.1 (PREDICTED: auxin response factor 8 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1635.2 bits (4233), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/922 (89.70%), Postives = 839/922 (91.00%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. NCBI nr
Match: TYK08647.1 (auxin response factor 8 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1633.2 bits (4228), Expect = 0.0e+00 Identity = 826/923 (89.49%), Postives = 838/923 (90.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. NCBI nr
Match: APD15608.1 (auxin response factor 8 protein [Siraitia grosvenorii]) HSP 1 Score: 1630.5 bits (4221), Expect = 0.0e+00 Identity = 825/918 (89.87%), Postives = 834/918 (90.85%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. NCBI nr
Match: XP_011655128.2 (auxin response factor 8 [Cucumis sativus] >KAE8648341.1 hypothetical protein Csa_023113 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1627.1 bits (4212), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/924 (89.50%), Postives = 838/924 (90.69%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. NCBI nr
Match: XP_038877058.1 (auxin response factor 8 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1617.1 bits (4186), Expect = 0.0e+00 Identity = 821/912 (90.02%), Postives = 828/912 (90.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FGV1 (Auxin response factor 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARF8 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1072.0 bits (2771), Expect = 3.7e-312 Identity = 577/894 (64.54%), Postives = 665/894 (74.38%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q258Y5 (Auxin response factor 12 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=ARF12 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 957.6 bits (2474), Expect = 1.0e-277 Identity = 532/877 (60.66%), Postives = 614/877 (70.01%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0J951 (Auxin response factor 12 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ARF12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 954.5 bits (2466), Expect = 8.6e-277 Identity = 532/879 (60.52%), Postives = 613/879 (69.74%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZTX8 (Auxin response factor 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARF6 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 921.4 bits (2380), Expect = 8.1e-267 Identity = 543/997 (54.46%), Postives = 633/997 (63.49%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2X1A1 (Auxin response factor 6 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=ARF6 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 856.7 bits (2212), Expect = 2.4e-247 Identity = 507/987 (51.37%), Postives = 610/987 (61.80%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CIX2 (Auxin response factor OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501352 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1635.2 bits (4233), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/922 (89.70%), Postives = 839/922 (91.00%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C9K7 (Auxin response factor OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold871G00080 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1633.2 bits (4228), Expect = 0.0e+00 Identity = 826/923 (89.49%), Postives = 838/923 (90.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1J0M5G8 (Auxin response factor OS=Siraitia grosvenorii OX=190515 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1630.5 bits (4221), Expect = 0.0e+00 Identity = 825/918 (89.87%), Postives = 834/918 (90.85%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CJP9 (Auxin response factor OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011795 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1611.7 bits (4172), Expect = 0.0e+00 Identity = 820/920 (89.13%), Postives = 835/920 (90.76%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GZ34 (Auxin response factor OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458805 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1582.4 bits (4096), Expect = 0.0e+00 Identity = 803/918 (87.47%), Postives = 820/918 (89.32%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. TAIR 10
Match: AT5G37020.1 (auxin response factor 8 ) HSP 1 Score: 1072.0 bits (2771), Expect = 2.6e-313 Identity = 577/894 (64.54%), Postives = 665/894 (74.38%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. TAIR 10
Match: AT5G37020.2 (auxin response factor 8 ) HSP 1 Score: 1040.8 bits (2690), Expect = 6.5e-304 Identity = 563/872 (64.56%), Postives = 646/872 (74.08%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. TAIR 10
Match: AT1G30330.1 (auxin response factor 6 ) HSP 1 Score: 922.5 bits (2383), Expect = 2.6e-268 Identity = 543/996 (54.52%), Postives = 633/996 (63.55%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. TAIR 10
Match: AT1G30330.2 (auxin response factor 6 ) HSP 1 Score: 921.4 bits (2380), Expect = 5.8e-268 Identity = 543/997 (54.46%), Postives = 633/997 (63.49%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC01G008780 vs. TAIR 10
Match: AT1G19220.1 (auxin response factor 19 ) HSP 1 Score: 567.8 bits (1462), Expect = 1.6e-161 Identity = 419/1123 (37.31%), Postives = 541/1123 (48.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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