Carg26512 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAGGAAAAAAAAAAAAATCCTAATGCGGGAAGAAAAGTAGGACACACGCAAGCCTAGTCGAAGGGAGAACTCTCGCCGTCGTTGTTCTGAAGTATTGTGCAAGTTTTTTTTGTCTCTTCCTTCCGAATTTCATCTCAATTTCGGTTTCCTCTTTACATTTGTTCTTCGAGAGTTGATATTTGCTTGCAAGATTTTGGGAATTGATTGAAATAATCCTATTGTGATCGATGAGGCCGATACGGCTGCCGGAGCCACCGAGCCCTACCATGGTTAAGGCAGATATATTTGAAGGCGGGGTTTATGGCGTTATTAGGCGGGCGATTGTCATCGGTAATGGGTCTTCCGGTTCTGAGAATCAGTGTATCGGTTTGGTTCAGGCGCTTGGCCTGGCTGACAAGCATGTGCTCTATGTAAGTTCTGCGAATTCATCTTTTTCGAGGGTTGGAAGTGGTCTAATTGTTTTGGTAATTGAAGTTATTGAAGTTAACTGTTTAATTGAAGCTCTATGTATTGCTTGTGGAATGCGTCGTTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTAAGTGCACTGCGTTACTTTGCATATGGGACTGGTTGTTATGTTAATCTAATAATAAGAAACAACTTCTGTATTTCCAGGTTTCATATCCTTAGTAAATCCTAAAATTAGAACTGCTCATCACCTTTTTTTTCAGTATTTGAAGGCTTGTATAGTGAAATCCCGAGACTAACAATTCTTATCTTATATGTGTTCCCCTCAAATGCAGCGGGTTACGAGGCCTAGAGGAGGAATAAATGAATGGCTCCACTGGCTTCCCGTTTCTCTTCACAAACGATTAGATTATATCATGATCCAGATAGGTGTTTACACTCGGATTTTGTTGCGATCCAAAAGGACAAAACTTGTGCCTCTATCTTCAGAAAATGGTGGAAGCATGGGCTTGTCCTGCATTTTAGAAGCTGACTTGAAGCATATTGTATCGATGGCTAAGGAGACTTATGAAAAGTAAATTCGTTTCCGGAATATTTTTATGGGAAATTTGATTATTGGACTTGATTTATGATGTGTGCTTGTATTATTTCCAGGGATGGACCGTTGTTGGTGGTTGCATCTGGTAGGGATACCATAACTATTGCAAGTTCCATCAGACGCATGGCAAAAGAGAATGTTTTTGTGGTGCAAGTATGATAACTATCTTTCTTTGTTCTATTTCATATGTTACTTGTATTTGGCTAAGGGATATGTTTGATGACCATTATGGAAGTTTAAAAGTTCTTTCACAAGCTACTTCTTTTTGCAATTCTATCGAGTATTTAGTTGGAGAGGAGAAACAGGGTTTCTAGAGGAGTCCTGGAAGGAGGTTTGGAGTTTGACACGTTTCAATTGCTGCCTTTGGATGTTTTTGACTAATACCTTTCATAATTATCCTTCCCCCCCCCATCTTTTTGAGCCTATTTTTGTCAGTATTTTCCAGCTTTCTTAATCTGGGCTGCATTGTGGGAAATCTCATGTTGTTTCTTTTATTTATCTTATCTGAAGTTGGATTCTCCATTAAAAACAATAAATTATGAAGATGGATGATAATGGCCATAAGGGGAATGTCATCCTAGTAGGGGTGAATTGATTGGGATGAAAAGTTTCTTGGCATGAGATGCCGGACAGTTTTCTTGGCAATCCTTCAACTTAACCATTTTAGGCTTTTTAGCAACAGTAGCCTTAAGTGAGAGGGAGAGAAGACTTTTGACTAACCCTCTTAGAGGAGGAGTTTATTCTTTTTGTGTGAAATTATGTACATTGCCCTTGCATTGGAACATTAGAGAAAGAGATTATTAAGTAAACTTGCAAGTACTGTAATTGTGTTAAAAAAGTTTTTTCACATGAAGAAAAACCTATTATTCTCTCTCTGTGTGTGTCTTTAAAGGGGGAATCAAGTTTCTTCTTTATTTGAAAATTTGTCCCATTTTTTTTTTGTCAATCACCCCTTGCTCTTGTTTCATGTTCTCATGCTTTGGAGGTTGGTAGTTAAGATTATTCTATTATCAAGGAGTTTGTGCATGTAATTGAAGGCTGAACTTTTGTCTGACATTATATTTGTTGAGAGTCTTGATAGGATTGTTAGGAGATATTTCCATGATGATTGGTACAAAGTTCTTGCTCTTCAGTTATGTGAGTGTGGATAATTTTCTAGCCGTTAGGGCGATGCTTAGTTGTGTTGACAAGTATGAAGCTAGGTTATTGAGTATTGATTGTGAAGAAGAGTTGGCATTTACTCTTTGTTTCTTGTGGAAGTTCAAGTGGAGGTGTGGTCTAAACGTCAGAAGGCCTTGTTATGTATGTTTATGAAGATGCATTAGGACTAGGAACCTCCAACTTTTGGATTGCTTCACATTTGTTAGAGATAGGCGTGGGTCTTTTGGCAAGTGGCTTTGAAGTAAGCTCCACAACATGGAGCCATGTATCATGGTGAAGTTGAACAATAACTATTTTAAGTTTTTCCCTTTCTAGGTTAAGGCCTTTCTGCTCCTAAATCTTTTGTATGACGTTTGTTATTGTTAGCATGGATCGAGTCAATGACTCTTTTTTCTACATGTTTGTTTCTTTTTTTGGTCTTCGTTTGATGGCTTTAGAAGTTTGAAAGGAGCTTTTTGTCTCCACCTCTGTTGGTGCAAGGAGTCTTAATCATACAAAGCCTTTATTTCAACTTCTTCTTGAAAACATATAACCAAGTGGGACCCACTTCAAAAACTCAGTTAGCTAGTAGAATGCTTTTCCCAAGATGTACATTACAGTCACTAGTGAAATGTGACTTAGTCCTCTAGGTATTTATACTCTTGATTCTTGGTGAATATTGTTGCCTGTAATTTAGTATTGTTCCTTCATTTTCTTACCTTTTGGCGAGGAGCAAAACTTGTATTAAAATTTAGTTTGAGGTGAATAAGGGTCTTCCCTCGAAAATCTTAGGAGCCAGAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAGACGCCAATGGGCATAACTGAAGAGACTTGTGTCTGAAAAAAGGGCGGCTTTGTTAGTATATAAGATGATTGTAGGCGCGATGGTTGAAGATAGAGAAATGGTCAAACAGCTTGTGAATGCTCGGAGCTTTTGGATTTTATTGGAACAAAACTAGATATTTGGTTCTCCAAAGACTGAACAAATGTTTTTCACATGCATACCCATGCAGCATATATTTTTCTGGGGAGGTGGGAGCACTTGTGTTGGAGTGTTTCGTGGAGTTCATTTGTTACTTGTGAACTGGCAAAAAGAAACTAATGAGAAGTTGGACCGAGCCTAAGTTACAAAAGTTTGTGCCAGCCTTTAGGCCCAAACTTTGGAGATATGAAGGGTTTTCTTTATCAAGCTCACACAAAGATTTGAATACGTGACCTCCGGTGGGTAGGTGTTACTCGATCAAGCCTCAGTTATTAATATTCAAGTCTCTAGTGGAACAAGCCTTGAGCAAGGAGGACCCACAAGAAGCAACCATTTGAACTGTTTGTATGGAATGTTTATTTAGGATGATTGCCAGTGCTTGTGAAAAAGGAAGAAGCTAGATGGAAGATCAATTGTGGGCTGGAATTGAATGGAGACAATTGGAAGGAAACTGAATATAATAACAAGGAAATGTTGGAAGGCATAGTAAAATGTAAGATGTCATTAATGAGGCTCTCAATTTTCAAGTTGGTAATGGTTTTAACATCAGATTTTGGGATCAGGCATTTATACAGAAAAATCAGCTTTCTTTAACCTATTTAACTGACCGTATTCTGCTGATAAAGTTGATTTGGAACGGCAGAAGCCCAAAGAATGTAAAATGTTTCTCTGGTCTATGGCTTACAGAAGCTTCAATACTGATGATAAGCTGTAATGGAAGTTTTCTCTTGGGCTCTTTTCATGTCTACCTGTAGATCGTGTTTAAGAGACAAAGAATCACTAGGTCATCTGTTTTTACACTGCCCATTTACGCCTAAAACTTTGGCACTTTATTTGTGGAAAAATGGGGGTATCGCGTACCTGTCTTGGAAAATGGATGACTGGCTTATAAAAGGCTTAAATGCATGGATTTTTAGGGGCAAAGCAAAGGTTTTGTGGAACCCTGCAACCAGAGCACTTTTGTGGCACATTCTGGAAGGACAAGAAAGATAATTTTTTTTTTTCGATAATAATATTCAAAAGATTATATTCCAAAAGAACATAAACAACCTAAGGGTGGGGTAGAGGGAACCCCCCAAACAAAGCTATAGAGTGAGTCTTCCAATCGCTAATAATCGTCAAGAGGTCATTTACAAAAGAATTTCTTGTGTACAGATATCTACCAAGACACCATATTTTGTACAAGATTACAAAGTCATAAAACTATAAGAGTTAGAAGACTTATCGTCAAAGTATCTACCGTTCCTATTCTTCCAAATGTGCCACAAAATAGCTCTAAAGATGCAACTACCCATCGCCTTAGCTTTCCTTTTCAAATTCCACACAAGAAAACCTTTCATTGAACAGTCATCAATTTTCTTAGGTATACAAAACGATAATCCTGAACTTTCAGCTGAGAAGTTCTATGACCTATAAGCAAAATTGCAATGGAGGAAGAGGTGATCAATGTCTTCTGCCTCTTTCAAGCACATTCTACAACTTGCAGGTGACAAAGACCACCTTCTAATTTCCTTTGGATTCTGTCATCGGTATTTAAACTCCTACGGGCCAAAGATCAAAAGTGGGGTTTGTATGCTTTTAAACTGTCCCAGTCAGGGATAAATTGACCTTAGAGGTTTCAGACGCAAGACTCTAAAACGCAGACTTACAAGAGTATACTGGAGCCTTCAAGTGACCACAAAATACGATTTTATGCCTCTCCCATCTGCACTGAGCTCAACTTTTCCACTAGGGCCACCTTACTATGTAATTCTCCAAAGAGCCCTCTTCTCAAGCCCCAATACTAGGTTTGGTTTCTATCATCTCATCTC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MRPIRLPEPPSPTMVKADIFEGGVYGVIRRAIVIGNGSSGSENQCIGLVQALGLADKHVLYRVTRPRGGINEWLHWLPVSLHKRLDYIMIQIGVYTRILLRSKRTKLVPLSSENGGSMGLSCILEADLKHIVSMAKETYEKDGPLLVVASGRDTITIASSIRRMAKENVFVVQIQHPRLHLNRFDMVITPHHDYYPLTPQAQEQVPRFIRKWITPREPPDQHVVLTVGALHRIDFATLRSAASAWHDAFAPLPKPLLVVNIGGPTSSCRYGVDLAKQLVTGLLSVLASCGSVRISFSDRTPEKVYNVVVRELGDNPKVYIWDGQEPNPHLGHLAWADAFVVTADSVSMISEVCSTGKPVYVIGTERCKWKYSAFHKSLKERGVIRPFTGTEDISESWSYPPLNDTAEAATRVRDELAKRGWRIRP Homology
BLAST of Carg26512 vs. NCBI nr
Match: XP_022927352.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Cucurbita moschata] >KAG6583715.1 Mitochondrial fission protein ELM1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7019362.1 Mitochondrial fission protein ELM1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 874.4 bits (2258), Expect = 4.0e-250 Identity = 425/425 (100.00%), Postives = 425/425 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. NCBI nr
Match: XP_023520710.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 873.2 bits (2255), Expect = 8.9e-250 Identity = 424/425 (99.76%), Postives = 425/425 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. NCBI nr
Match: XP_022973136.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 867.1 bits (2239), Expect = 6.4e-248 Identity = 421/425 (99.06%), Postives = 424/425 (99.76%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. NCBI nr
Match: XP_038894297.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 811.6 bits (2095), Expect = 3.2e-231 Identity = 390/425 (91.76%), Postives = 404/425 (95.06%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. NCBI nr
Match: XP_004139495.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Cucumis sativus] >KAE8652813.1 hypothetical protein Csa_022781 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 810.1 bits (2091), Expect = 9.3e-231 Identity = 390/425 (91.76%), Postives = 404/425 (95.06%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YN4 (Mitochondrial fission protein ELM1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ELM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 657.1 bits (1694), Expect = 1.3e-187 Identity = 308/426 (72.30%), Postives = 366/426 (85.92%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZE28 (Uncharacterized protein RP120 OS=Rickettsia prowazekii (strain Madrid E) OX=272947 GN=RP120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 1.3e-20 Identity = 85/294 (28.91%), Postives = 143/294 (48.64%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EGX7 (mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434204 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 874.4 bits (2258), Expect = 1.9e-250 Identity = 425/425 (100.00%), Postives = 425/425 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7V0 (mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471654 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 867.1 bits (2239), Expect = 3.1e-248 Identity = 421/425 (99.06%), Postives = 424/425 (99.76%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E536 (Mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold455G002590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 808.9 bits (2088), Expect = 1.0e-230 Identity = 388/425 (91.29%), Postives = 405/425 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CFB0 (mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499828 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 808.9 bits (2088), Expect = 1.0e-230 Identity = 388/425 (91.29%), Postives = 405/425 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T1R4 (Mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold285G001760 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 804.3 bits (2076), Expect = 2.5e-229 Identity = 388/426 (91.08%), Postives = 405/426 (95.07%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. TAIR 10
Match: AT5G22350.1 (Protein of unknown function (DUF1022) ) HSP 1 Score: 657.1 bits (1694), Expect = 9.4e-189 Identity = 308/426 (72.30%), Postives = 366/426 (85.92%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. TAIR 10
Match: AT5G06180.1 (Protein of unknown function (DUF1022) ) HSP 1 Score: 496.1 bits (1276), Expect = 2.8e-140 Identity = 237/404 (58.66%), Postives = 299/404 (74.01%), Query Frame = 0
BLAST of Carg26512 vs. TAIR 10
Match: AT5G06180.2 (Protein of unknown function (DUF1022) ) HSP 1 Score: 496.1 bits (1276), Expect = 2.8e-140 Identity = 237/404 (58.66%), Postives = 299/404 (74.01%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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