
Carg25263 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGCCTATGATACACCATCTGAATTTGGAGGATACATTTCCTGATGTTATAGTCTATTACTAGGTTTCATGCTGCAGTTGCAAGAACAGCTTTTAAGGGCGATGGTCAACAAAGCTTACATCATTTTTGGTATATTGTTCCACTGTGATTATTATTTCTCTTTATCAATTGATCTAACTAGATCATTATTAATATAAAAAGCTTATCTTTCATGGTTCCAATGATTCATGCATCATGGACAGATGGTTCTTATGTTCTTTGATGAGTTTAGTTCTCTCATATATCCTTTTTGTGATATGTGAGAGTGCTAAATAATGGTAAAATAAATATGGATTAATTTCACATTAATTTTGTATTTCTAATGGTCATTATAAATAACCTTAGTATCTGACTGGTGTCTTTGGTATGAAAAAAATTATATTTCGCATTAATATTATATTTATTATTGTCAATGTAAATTATCATGCTTGCTTTTCATATTAATTTTCAGAGAGATTTGAGAGAGGTACATGTGCCTTTTATAATAACTAACTAAATTTCTAGATATTAGGTAAGATTAAATCTGAATAAATCTCTAGATACTAAGTAACTATAAATCTAAATAAATCCCTAAATACTAGGAAACAATACATGAAAATTAGGGAGGTTAGCTATTTTCCTTTATTTAATAGGACACAAATATCTCCTAACTTAAGGCTAGGAATAACACAAATATTCCTAAAATCAAAGTCATTCCTTCAACACTCCTCCTCTCGTTGAGAAATAGATATCATCCATTTTCTGTTTGGATACTAACTCATGAAACATTGAACTATGAAGTCCTTTTATTTGCATATCTACTAGTTGAAGTTATGAGGACATAACACTAATGCATACTATCCCCTTCTCTAATTTCTCCTTGTTAAAATGTCAATTAATTTCAATATGTTTTGTCCTATCACGTTGGATAGGAGTATAGGAGTATGTGCAATATTGATAGCTGATTTGTTGTCGCAATATAACTTTATTGGACCTTCTCCCTTAATCTTTTAAGTCATCAAGGATTATCTTCAATCATAAGAGTTCACATAACTCTTGTCCAATATCTTGAAATTCTGATTCGACAGGATCTAGTCACCACATTTTGCTTTTTCTCCATGTTACCAAATTACCTCCAAGAAAAGTACAATGCCCCATTGTAGATCTTCTGTCCACTATTGAGCCAGCATGGTCAAGATTGGTGTGAACTTCCAATGCAAGAGAATTCTTTCGTTTGAACAAAATTCCTTTTCCTGAAGTTCCTTTTAGGTAACGCAATACTCTATATGTTGCTTGAAGGTGAGGCTCCTGCGGATCATGCATGAATTGACTAATTACACTCCTTGAGGATGCTATGTCTACTCGATTGTGAGCTAGATATATAAAGATCTCTATTAACCTCTGGCATATTTCTCTATATACTGCAAGCTCTTCTTTTGACTCTCACAATTTTTTATCGTTTCTTCTTGTTTCTAAAAATAAATCCATCAGATATTTCTATTGTGATATGAAAATACCCTAAGTTGAGTATGCTACTACAATACCAAGAAAGTACTTTAACCTTCTAAGTTCTTTGATCTCAATTTCTTTCATCAATTTTTAACTGAGTTCAAGTTTTTTTTCTTCATTATCTCCATTGATTATGATGTCATCTACATATACTAGAAGCACACTGTAACTCCCTTTGATTTTGAATGCTTGACAGAGAGATTGTGATCTCCTTGACTTTTCTTATACTCATAGTCTTTCATTACGTTTGTGAATCTTCCAAACCATGCCCTTTGATGATTTTTTTTAGTCCATACTGGGCCTTTCTCAATATGCACAGTTCACATATTGAGCTTTCAAATCTTGGAGGATGCTCATATCGATTTTCTCATTTAGATTGTGATTTCCTCATTTAGATTGCGATGAAGAAATGTATTCTTCACATTATACTATGAAAGCTCCAAATTTAAGTTGGCAGCCAAGTATAACAATATTCTTACGGTGTTCATCTTCGCAATTGGGCCAATCTTTGCAATTGGGCCAATTGTCTCCTAGTAATAATCTATTCAGTAAACTTCAGTGTATCCCTTAGCTTCTAACCTTGTCTTATACCTTTCCAACGTTCCATCAGCCTTGTACTTTACTGTGAAAAACCACCTACACCCAACTATATTTTTTCTTTTTGGCCTATCCACAACTTTCCATTTGTTATTTTTTCAAGGGCCTGCATTCTTCTGTCATAGCATCCTTCCATTCTCCTTTGGATAAAGCTTTAGAAACTGTATTAGGTATAACAATTTAATTTAGACTCACAATGAAACTCTTGTGTGGTGGGGATAGTCTTTCAAGAGATATAGTTTGTTAAGGAGTATAAAGGCCATTTTATGCATTATCTAGCGGGTTTTCAAAGACCTATGGGTCTATCATCTATTGGTAACCGTGTTGCATCCTTATTTTGAATAGAGTCGGATGTTTGGACTTGTATCAGTTCTGAAATGACTGTCCTTCTAGCATATACTTGAGAAAACAATGGATCTGGAAATGGAGGTGGAGTATGGTTCAGTTGGTGATTCTATGGTAGTAGGGGAGGACTCGTAATTTACGATAGTAGGTACTCATAATTAGATTCGGTAACAAGCATGGACTTAATAACTGGTTCTGTGTGCTGGTTATTCAGTGTGTCCACGGGGTTCAATAGTTTCCAAAGGACCTTCAATCTCCGTGTTCTCCATCTAAAGAGAAGCCTTAGAGTACAATGGCTTTTGCTCTGTGATATGTCACATCAATTGAAGTGTAAGACTTCCTAGATGTAGGATGTAACATTTGCACCATTTTGTGGTCGAAGTGCACCCAAATATGCAGGGTGTGAGACCATTTGACGTCTGAAAGTGAGGATGAAATGGTTGAGGACTTCTATTAGGCTTAGGTTATTCCGGACAAAAGATGGGAAATGATTAATCATGGGAGTTGCAGAAAGACTCCCTCCCCCTAGTAAGTTTTTGACATATTTTCGTAAAAAAGCAATGCTCGGGTATTGTTTAAAAGGTGTTCATTTGTCATTTCGACCACTCCATTTTCTGCTGTGTTATAACACACAAAGAATAATGGATAATGCCTTGAAATCAGAAACATGGAGATAAGGTTGGATTGAAATAATTTCTGGCATTGTCAGAGTTTTGATTTTGATACTAAATTGGGTCTGAATCATTGAGTGGAAGAGAAAAATAATATGACTAAATCTAATTTTTGTTTGAGAAGAAACAGCCATGTGACCCGAGTACAATCATCAATTAATTTGAGAGACCAATGAGCACTAAAAATACTTGGAACAGTTGAGTGTCCCCAAATATATGGAACAATTCAATATGAATCAAATGAAAAAGAGTAGAACTTTTATTTTGACGGATGGGAGAAAATATATGAGTATGTTTCACAAATTCGCCCATATCACAATGAAAATTAGAGACTAGAGTTCTTGAAACAAATTTGGAAATATGACTCTTAAAACTCTAAATGAGGAATGACCCATGCGACAGTGATGTAATCAAATTGCATTATTATTGGAGGAACTAAGAAATGACACGGGCACAAGGTTAGTTTCTCTCTCAAGTAATTGCAAGTAGTACAAGTCATTCAATTCCTTAGTAAGTCCAATTGTCCATCTCGAGATCTGGTTTTTAAAAACAAACATGATAAGGAGAAAATAACACTGCAGTGACTGCCATGGATAAACTTTTGTATGGAAAAGAAACTATTCGATATTTTGAGGTGTATGACATTTTTTAGTGTACGAGTTTGAGAAATGAATATATTACCTACTCTCGCGATGGTGGCACTATTTCCTTTTGCCATCGTAATTTTTTGATTACTTGGACATTGTTTATATGTTTTAAAATATTTTTTAAAATATTGTGAGTGAGGAGTCAAGTGATCAGTTGCACCAGTGTCTATAATCCAAGAGTTGACTTGACTTATCTCTGAAGAGTTTATGTAAACAGTGAATTGAGACATACCTAAGATTGTCAAGGCACTGAAACTTGATGGTTTGTTTAGCAAGTCCAAGAACATATTCAATCTCTCAATCTCTTCATTATTGAATCCACTAGTCTTCACATGTAGCAGCTTTTGATTTGGACTCTTTTGCAATGTATTCTCGTGCTTTCATCATTCTCCCTTGTTTTCCAAACTACGAATGGACACAAGTGAGCTTGCAGATTGATGGATGAATGGATTGATAGTAGGCTTTCTGCTACACTTGCGGTGAATGAATCTGAGAATGCTAATGCTGATGCTAATGATGCGGCTTTCCTACTATGAATACTCTTTTATGTGATCACTGATTGCTGTGAAAATGTTATATGAAGGCTATGAATGAAACTTGGTTAAGTTGGAAGATCGATAGCTATGAAGGCTTCGACTAAATTTGGTAAAATGGAAGATCTGTAGTTTTGAAGGTTATGCAAATTAATCATACCTCCCTGACTTTGATACCATGTTGCAAATGTAAATATCTTGCTTGCTTTTCATATTAATTTTTTAGAGAGGTACATGTGCCTTTTATAATATAGAAAGACTAACTAAATCCATAGATGCTCGGTAAAAATAAATCTAAATAAATCCGTAGATACTAGGTAACAGTAAATCAAAATAAATCCATTGATACTCGGTAGCACAGATAAATTAGGAAGGTCAACTGCTTCCCTTATTTATTGAAATTACATAAACATCTCCTAACTTAAAGGCTAGGAATTACACAATAGTTCTTAAATCAAGGTCATTCCTTCAACCTTTATAGTGGTTAATACTTTCTTTTCATTTTGACACACATCATGTTAATATAGGTTGACCAGGTCACATCCAATTTGTTTTACTTGCAAATTGACACATAGACTAATTTCTTATTTGAATTATCTTTAGATTAATTTCTTATTTGAATTATCTTTAGACTAATTTCTTATTTGAATTATCTTTTTTCCAGGGAAATGGTTG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BLAST of Carg25263 vs. NCBI nr
Match: KAG7032601.1 (Sodium/hydrogen exchanger 7 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1096.3 bits (2834), Expect = 0.0e+00 Identity = 553/553 (100.00%), Postives = 553/553 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. NCBI nr
Match: XP_023525790.1 (sodium/hydrogen exchanger 7 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1075.5 bits (2780), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/542 (100.00%), Postives = 542/542 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. NCBI nr
Match: XP_022955963.1 (sodium/hydrogen exchanger 7 isoform X3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1075.5 bits (2780), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/542 (100.00%), Postives = 542/542 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. NCBI nr
Match: XP_022955949.1 (sodium/hydrogen exchanger 8 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1075.5 bits (2780), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/542 (100.00%), Postives = 542/542 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. NCBI nr
Match: XP_022955956.1 (sodium/hydrogen exchanger 7 isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1075.5 bits (2780), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/542 (100.00%), Postives = 542/542 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LKW9 (Sodium/hydrogen exchanger 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NHX7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 745.7 bits (1924), Expect = 3.7e-214 Identity = 385/543 (70.90%), Postives = 450/543 (82.87%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3YL57 (Sodium/hydrogen exchanger 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NHX8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 1.8e-160 Identity = 288/428 (67.29%), Postives = 351/428 (82.01%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GXP6 (sodium/hydrogen exchanger 8 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457781 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1075.5 bits (2780), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/542 (100.00%), Postives = 542/542 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GVG1 (sodium/hydrogen exchanger 7 isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457781 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1075.5 bits (2780), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/542 (100.00%), Postives = 542/542 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GV93 (sodium/hydrogen exchanger 7 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457781 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1075.5 bits (2780), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/542 (100.00%), Postives = 542/542 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JNG7 (sodium/hydrogen exchanger 8 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486905 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1065.1 bits (2753), Expect = 1.0e-307 Identity = 536/542 (98.89%), Postives = 539/542 (99.45%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JL99 (sodium/hydrogen exchanger 7 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486905 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1065.1 bits (2753), Expect = 1.0e-307 Identity = 536/542 (98.89%), Postives = 539/542 (99.45%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. TAIR 10
Match: AT2G01980.1 (sodium proton exchanger, putative (NHX7) (SOS1) ) HSP 1 Score: 745.7 bits (1924), Expect = 2.6e-215 Identity = 385/543 (70.90%), Postives = 450/543 (82.87%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. TAIR 10
Match: AT1G14660.1 (Na+/H+ exchanger 8 ) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 1.3e-161 Identity = 288/428 (67.29%), Postives = 351/428 (82.01%), Query Frame = 0
BLAST of Carg25263 vs. TAIR 10
Match: AT1G14660.2 (Na+/H+ exchanger 8 ) HSP 1 Score: 492.7 bits (1267), Expect = 4.0e-139 Identity = 259/428 (60.51%), Postives = 322/428 (75.23%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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