Carg24106 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGGATATGGAATCCAAGAAGTGGTGAAAATATTCATGTTGTGAGAGGTATGCTAGAAACGTGAGTGTACGACTCGTTTTTAATTTATCCTTATTAATCATAAACTACATGAACATTCCTCAGAGGATTTGGAAGTTGTAAAGGTGAAGTAACATAGAGGAGTAAAAAGCAAAATGTGGTGTGCCAGCGAGGACGCTGTGCCACGAGGGGATGGATTGGGGGGTCCCACGTCGATTGGAGAGGGGAACGATTGCCAACAAGGACGCTGGACCCCGAAGGGGGTGGATTGTGAGATCCCACGTTAGTTGGAGAGGGGAGCGAAGCATTCTTTACAAGTATGTGGAAACCTCTCCCTAACACACGCGTTTCATTGCTTGCTCTTACCGGTTCAAAAGATGGTTCTGTTCATATTGTGAACATATCGACTGGAAAGGTTATTTCTACTATTTCTTTCGATGATATTCTCGTTTTTTAGCGGAGTAAAGGGGGTTGTTCGGGGCGTTCTTCCCAGTGAATAACCCATCCTTTTCTTTCATGTCTCGAGTTGATTGGAATAGTTTATGCCACATTTTGAATCTCTGTTGGTTTGAATGACTTTGATTGAGCAACTAGACTGTACATTACATAACTATTGAGAAGAATTAAGGTTAAGTGTGAGATCCCGATTGTTTGGAGATGAGAACGAATAATTCTTTATAAGGTTAGTGGTGGGCTTGGGCTGTTACAAATGATATCAGAGCCAGACACCGGCTAGTGTGCTAGCGAGGACGCTGGGCCTCGAAGGGAGGTGGATTGTGAGATCCCACATCGATTGGAGAGGAGAACGAGTGTGAGTGAGGATGCTGAGCCCCAAAAGGGGTAGATTGTGAGATCCCACATCAATTGGAGAAGGGAACGAATCGTTCTTTATAAGGGGTGGAAACCTCTCCCTAGCTGACGCGTTTTAAAAATCTTGAGGGAAAGCCCGAAAGGGAAAATCCAAAGAAAGCAATATCTGCTAGCAGTGGGCTTGAGTCGTTACATTAAGTTAGTACAGTGGTAAATAGTTAACGGTTAGGTTGGAAGTTGTAAAAAGGAGGGTTTTATGTGTTAGTTTTTATAGGAGCAGAAGAGACCTAGCATCTTGTGTCCTTTACTGAACTTCATTTGGTTATTTGACCTGAATTGTATGATAAATGCACAGTTGCAGCCCTGTTGGGTTGGCCTATCGCATTTGCTTGTAATGCTAAATGTTGAAGGCAGTTGTTCTCTAGGACCATTCTAGGACTCTCTGGACATGTAACAGCCAAGCCTAAGTTCATTGCTAGCAAATATTGTTCCTCTTTAGGCTTTCCCTCAAGGTTTTTAAAACGTGTCTGTCAAAGTTTTTAAAACGCTTCTGTCAAGGTTTTTAAAACGCGTATGTTAAGGATGTGAGTTCACTAAAATTTAGTAGTTATTGATTTGAAAGTTTATGAGGAAGTTTAGGAGATCGGTTGTGGAATCTTCACTATAAATACTCATGAGATGTATGTTATTTCAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAGAATTAATAAAGCATAAGTGCTTAAGGTTCCTCTATTCAAGAGCTCTTTCCCCTCAGGTTGTTCTTCCGCTTCAGTTATTTGTTCCGACATATTTCGATCGTGGGCAATTTCCAACAAGAGAGAGGTTTTCACACCCTTATAAAAAATGTTTTGTTCTCCCATCCAACCGATGCGAGATCTCACAATCCACACCCTTTTAGGACCTAGCAATCGGGCTTAGCGTCCTCGCTGGCACACATTTTGGTGTCTAGCTCTGATACCATTTGTAACCGCTCAAGTCCACCGCTAGCCGATATTGTCCTCTTTGAGCTTTCCCTTCCAGGCTTCCCCTCAAGGTTTTAAAACGAGTCTGCTAGGGAGAGGTTTCCACACTCTTATAAATAATGTTTCATTCTCCAACCCAACCGATGTGGGATCTTACAATTCACCCCTCTTCAGGTCCCAGCATCCTCGGCGGCACACTGCCTTGTGTCCACCTTCCTTCGGGGCTCAGTCTCCTCGCTGGCATATCCCCCGGTGTCTAGCTCTGATATTATTTGTAACAGCCTAAGCCCACTGCTAGCAGGTATTGTTCTCTTTGGGTTTTCCCTTTCGGATTCCCGCTCAAAGTTTTAAAACGCGTATGCTAGGGAGAGGTTTCCACATTCTTATAAAGAAGGTTTTGTTCTCCTCCCAACCAATGTGGGATCTGTTGGAAATTGCCTACAATCAAAATATGTCGAAACAAATTACTGAAACGGAAGAACAACTTGAGGGGAGAGAGCTTTTGAATAAAAGAACCTTAAGCACTTATGCTTATCAATTCTCTTTTGTTGTTGTGAAAATAACATACATCTCATGAGTTTTTATAGTGGAGAAAGTACAATCGATCTTCTAAACTTCTCTCAAGTTCCTAAACTTTCTTTTTAAGTTAAGCAACTACTAACAAATATTCGTAATTAAAGATAACAATTTCCCTAAACTTATTCAAATCAATAACACTACTAAATAATTATCTTAAAATTGCTCTAGGTTAATAATTTCTTTTTGATAAGTCAAGCATATTAACTCACGAGACATTCATAATTATTAGAAAAAAGAAAACTTCAACACTATTTTCTTCGGTGCATGTGAATTTCTGATGTTTCGATGTACGGTGCAATGGATAGATTGAAATGAAGATGTGATGTCCTACATCGTTTGGGGAGGAGAACAAAACACCCTTTATAACGGGGTGGAAACCTCTCCCTAGCAGACGCGTTTTAAAGCCTTGAGAGGAAGCCCAAAAGGAAAAAAACCCAAAGAGGATAATATCTGCTAGCGGTGGGCCTGGACCGTTACAAATGGTATCAAAACCAGACACCGGGCGATGTGCCAGCGAGGAGGCTATTCCCCGAATGGGGTAGAACGAGGCGGTGTGTCAGTAAGGACGCTGGGCCCCAAAGGAGAGTGGATTTGGTAGGGGTCTCACATCGATTGGAGAAATGAACGAGTGCCAGCGAGGACGCTGGGCCCTGAAGGAGGGTGGATTGTGATGTCCCACATCGGTTGGGGAGAAGAATGAAACACCCCTTATAAGGGTGTGGAAACCTCTCCCTAGCAGACGCGTTTTAAAGCCTTGACCGAAGCCCGAAAGGGAAAGCCCAAAGAGTACAATATCTGTTACCAGTGAGCCTAGCTCTTATAGAAGACCCTTATTGTTAGGGATTGAAACTGTTTTTTATTCAAGTTAGTTGCTTGTGTCTGGTGTAAGCTGTAATTTCTATGGCCCTGGACTTCTATTTTGTAGTCTACTTTCTCATAAAAGAAAAAATGAAGACGCTCCTTTTGACAGGTCGTTAATTCTCTGGTTTCTCATTCAGATTCAATCGAGTGCATCGGTCTAGCGCCAAGGTACTGTGATTAATTATGATTCATGAAACTTTGTTAAAAATGTTCTTAGGAATCACGGACCTCCACAATGGTATGATATTGTCCACTGAGTATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGAGCTTCCCACCAATAGAGATGTATTCCTTACTTATAAACTCATGATCATTTTCTAAATTAGCCAATGTGGGACTCCCTCCCATTAATCCTCAACAATCCTTCCCTCGAACAAAGTACACTATAGAGCCTCTCATGAGGCTTATGGAGCCCTCGAACAGTCTCCCCATAATCAAGGCTCAACTCCTTCTCTGGTGTCCTCGAACAAAGTACAGCCTTTGTTCGACACTTGAGTCACTTTTGACTACACCTTCGAGGTTCACAACTTCTTTGTTCGACATTTGGGGATTCTATTGACATAACTAAGTTAAGGACAGGACTCTGATATCATGTTAGGAATCTCGACTCTCCACAATGGTATGATATTATCCACTTTGAGCATAAGCTCTCGTGACTTTGCTTTGGGCTTCCAAAAAGGCCTCCTACCAATGGAGATGTATTCCTTATAAACCCGTGGTCATTCCCTAAATTAGCGAACGTGGGACTCCCTCCCAATAATCCTCAACAAAGGTCTAATTTAGTGCAAAATTTTATACGCTAATAGCCTAATGAATGTTCTGATTCTTTTCAATCTTGAATGGCAGCTCCCCTTGGGCTGCAACCGGAGGAATGGATCGTAAGCTCATCATTTGGGATCTTCGACAGTCGACGCCAGCACGAGGTCTATTCACTACTAAATTATGTTTTTAAGTTCGTAAAATAGTGTATTTAGTTTACCATTTATCTTCATAACCCTTCATTAGTGTTGATTGTAAGTAGATTTGAATAGTTGGGTTTGACTTGTTTAAGGATAAACATACCTTCCTTTTATTTTGGACAGGATGGAGTATCATGTCTTACTTGGATTGGCACGTCGAGATATCTTGCAACCGGGTGTGTCGATGGTCGTGTTCGAATATGGGATACCCTCTCTGGAGAGTGTGTAAGAACCTTCACCGGGCACTCCGACACCATCCAATCTCTATCGGTCTGCCAATCATGAGTACCTTGTTTCTGTTGCTCTCGATACTACCGCTCGGATTTTTGAGATTGTTGAGTATCATTGAGGGAATAGGATCTTTGTACTTGAATGTGACAAGTTTCGATCCCCATTGTCGATTCTTGTATAATTATACAATTTTATACCGTTGTATGTGTTTGTCTTGCAAGTAATTGTATGTTTATTGTTGTCAGTGTCGTGTAATTTTTATTTTCATTTAAGGGTTAGTCGAACCTAAGATTTTTCATGTAATGGATAATGTAATAACATAAATTACAACAATTTTTTAGTTGCTTGTTCGAGCGAATAAGGGCACTCCACGACCAACGTTGGAAGCGTAGGAGAATTGTGCTGTATGAAGGAGTCGTCATTGTTTATTTAAGAATAATGAAAACATAAATGTCGATTTTTTTTTTTTTCAATATTTGAGATGTTTTAGGATACACTTCCTTAAATGAAATTAGCGTTATCATTGCATACAAT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ATGAGGATATGGAATCCAAGAAGTGGTGAAAATATTCATGTTGTGAGAGGATGGAGTATCATGTCTTACTTGGATTGGCACGTCGAGATATCTTGCAACCGGGTGTGTCGATGGTCGTGTTCGAATATGGGATACCCTCTCTGGAGAGTGTGTAAGAACCTTCACCGGGCACTCCGACACCATCCAATCTCTATCGGTCTGCCAATCATGAGTACCTTGTTTCTGTTGCTCTCGATACTACCGCTCGGATTTTTGAGATTGTTGAGTATCATTGAGGGAATAGGATCTTTGTACTTGAATGACTTCTCTCAAAACCAACTGGCGGAGGAAGGTGCTGCACCATCAGCAGCCGGTGGTGCCGGTGGTGGAGGTGCTACTGCAGCCTCCCACTCATTTGCTGCCAATGGAACTGCAACAAAGAAAAAACAAGGGAAAGAAAGTGAGAAGAAATGCATGTCGAGTGAGGAAAGGAAAATTAATGGATTCCATCAAACAATTAACGACAAAAGCTCGAGATTCAACCTGGCTCTGGGGCCCACTCGACACTCGAAGCGGCTGGAGCAGCAGGAGCAGGAACCACATCTGCAGCACCCCATTGAGCATCAGAAATTTGTGCGGCCCATTGATCTGAGGCAACAAGTGGTGCAGCACCATAGTCGGCAATGCCAAAGTCTGGGGGTGGAAGAGCCTCTTCCTCTTCTTTCTCCTTAG ATGAGGATATGGAATCCAAGAAGTGGTGAAAATATTCATGTTGTGAGAGGATGGAGTATCATGTCTTACTTGGATTGGCACGTCGAGATATCTTGCAACCGGGTGTGTCGATGGTCGTGTTCGAATATGGGATACCCTCTCTGGAGAGTGTGTAAGAACCTTCACCGGGCACTCCGACACCATCCAATCTCTATCGGTCTGCCAATCATGAGTACCTTGTTTCTGTTGCTCTCGATACTACCGCTCGGATTTTTGAGATTGTTGAGTATCATTGAGGGAATAGGATCTTTGTACTTGAATGACTTCTCTCAAAACCAACTGGCGGAGGAAGGTGCTGCACCATCAGCAGCCGGTGGTGCCGGTGGTGGAGGTGCTACTGCAGCCTCCCACTCATTTGCTGCCAATGGAACTGCAACAAAGAAAAAACAAGGGAAAGAAAGTGAGAAGAAATGCATGTCGAGTGAGGAAAGGAAAATTAATGGATTCCATCAAACAATTAACGACAAAAGCTCGAGATTCAACCTGGCTCTGGGGCCCACTCGACACTCGAAGCGGCTGGAGCAGCAGGAGCAGGAACCACATCTGCAGCACCCCATTGAGCATCAGAAATTTGTGCGGCCCATTGATCTGAGGCAACAAGTGGTGCAGCACCATAGTCGGCAATGCCAAAGTCTGGGGGTGGAAGAGCCTCTTCCTCTTCTTTCTCCTTAG MRIWNPRSGENIHVVRGWSIMSYLDWHVEISCNRVCRWSCSNMGYPLWRVCKNLHRALRHHPISIGLPIMSTLFLLLSILPLGFLRLLSIIEGIGSLYLNDFSQNQLAEEGAAPSAAGGAGGGGATAASHSFAANGTATKKKQGKESEKKCMSSEERKINGFHQTINDKSSRFNLALGPTRHSKRLEQQEQEPHLQHPIEHQKFVRPIDLRQQVVQHHSRQCQSLGVEEPLPLLSP Homology
BLAST of Carg24106 vs. NCBI nr
Match: KAG7025147.1 (hypothetical protein SDJN02_13970, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 469.2 bits (1206), Expect = 2.2e-128 Identity = 236/236 (100.00%), Postives = 236/236 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg24106 vs. NCBI nr
Match: GAY39620.1 (hypothetical protein CUMW_045800 [Citrus unshiu]) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 3.0e-05 Identity = 20/43 (46.51%), Postives = 31/43 (72.09%), Query Frame = 0
BLAST of Carg24106 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2H5NHG4 (WD_REPEATS_REGION domain-containing protein OS=Citrus unshiu OX=55188 GN=CUMW_045800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.5e-05 Identity = 20/43 (46.51%), Postives = 31/43 (72.09%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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