
Carg21644 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAGATAATCATCGTTTCTATTTAATTTCGTGGACTCTGCCTGCTCCGTGGGAAAGTTCGCAATTGTGGCTCAGGGCACTTGAATACAACACCCATAGCCCATTCCGTTATCGTTTTTCCTACCAATTTCACATCTTCTACGAAAAAGACTATCCAAATCGATCATATTACGTAATCAATTGAAGTTCTTCGGAAAGAAGATGGATTGAAACAACGATTGAAACAATTCACAGGAGGAACGCGAATCGAGAGGAAGAAAATTGACTGTCCCGAGGCCGAAAGACAGAGGACATGGTGATGCGCGAGCTGGTTACTGGAGGCGCTGCTTGTGCCGTTCCTGGTTCTTCTTCTTCTTCTAACCCTCTCGGTGCCCTTGCCAACGCTCTAGTTGGTTCCTCTTCCAAGACCCAGGTTCTTTCCACCCCTACTTTCTGAATTTGTTCGATGCTTCAATTTAGTCATTCTTACTATCTGTTATCTGGGGTTCCATTAGAATTGTGTTTTCTTATACTTTGATATGTTAATTCATGAAATTTGCTGTTGCCTAGTATTGTGAAATTTAGATTGAGCTTTGGTTAACTTGGTCTTAGTTGCTGATTTTGTTCTTTATCTTATTCACGTTACCAAATTGGTATTTCTTCATATGGGTTTGATCCTGTGAATGAAGTTATTCGGTAATTCGTCTTATGTTTGAATAATATTTTGAGCAGGAAAGATTGCGGGAAATTCCTACATCGCAGCTCACAGGTCCTGAGAGACCTTTTTACCCTGAGAGCCATGGGCAGCTCCCTGGCTCTGAATTGGATCATCCACCGTTTCAACCCAATGAGCAGGTTTGGTTTTGCAAATTTTCCTTTTAGAATCCTCATTTAGTTTTTAACATATCGATTGTTTCGATTTTGCTTGATGTCAGGCGTCAAAATTTTTTAGTGGCTTCCACTCGGCTGCTGATCAGAGTGGTCTGGCCTCTGCATGGAATGAGGTACAGGGCGGTCCCCCTCCTCCCCATTTGAGAGAAATGCAACCAAGTCTTGCTGAATTTGATCGTATTTATGAACAAATGCCTGCATCTCAGCATCAACCAGTATTTGAAGGTACTTCTTGAGTTTCTTCTTTATTCTTTTAAATTTATGGATCGTTGGTATTGTTGGCTTGTCTTTTGTGTTGCTTCCAAACTGTTTTAGTTCAATTATAAGGACTCTGCTAATGACAACAATAATTTAATTCAATGATATGGAGTTCCAGGCTTTTGACCTACAACACCTATCATCCATCAATTGACTTTAGAAGATACTTGTGTACACTAGTGATGTAATATGTCCTTAGTGTAGTATAGTTAATTGAAAAACTTCCTGATAATAGTCTTGATTTGAAACTCCAATCCCTGCAAATTATTGCTAGTCAAACAACAGTTTCCTCAACTGTGGCCTCTGCAGGTTTGGGATTCAGTTTCGAGTTATATAATTTTAATTAGGTTTAAAACCTAATTAAAATTTGTGTCACTGGATTGGGTCTTCCTTTGTAAACCTAAAACATGCTAACCTTGACTGACTTGGTAGAGTGGAAGATTCATTTTAGTTCGTCACGAAGTTTTTAAATGTTTGCAACTTTATCTGACTATGTAACATCTGCTAGTATTAGAGCTTGGATTTGAAATTCTTTTCAGTCCTACTAATTATTTTCCCACTAATTATTTTATGGGAAAAATACCCTTTTGGTCCCTAAGTTTGGAGTATAGTTTCCATTTTAGTCCTTAGGTTTCAAAATGTTATATTTTTACTCATGACGTTTGAGTTTAGTTTCAATGTGGTGTTCTTTTAGCCATGATGCCAGGATTTGGATAGCCATTGTTGGTGTGAGTATCGCCGACATCGGGTGACCTCTTTTGCCTTTGTTTCATTCTGGTTTTCATGGAAAAGAGTGCCAAGGTCGGTATCCGCAAGGATAATCTCTGGCTACAGAAAAAGAGGTTGGGCATACCCGCGGCAGGGGATGGTGAGGTTGTGGAGGGGGGTAGAGGGCTAAATGCATATTCATCATTAGATTCTTTGTGAGAGCCAACAACGGAGAATTTTGTTTTTGGGATGAGGAAGGTTTTTTGGTTATTTATGATGACGACATGTTTTTTTGGTGATGATGTCACAACTTGTGGGTTGGAATAAGAAGTGGTATAGTAGATGAGGTTTTGGAGATTGGTGAAATGTAGGGTGAGGGGCTCCGTGGCCTTTGGTTTATGGGGGGAAGCTATGGGTTTATGGGGCATGGCCAATGGGGAGGGTGTGGAAGTGGGTTCGACTGGGGGTTTGACCTCTTTTTGTAGGAGTTGGCTTGGAAAATAGGGGTGATTCATAGCAGATAGGAGTGATCTTTATGTTTTAGGGCTTTGTGGTAACATTTTAGGGACCAGATGTAATATTTTAAAACCGAGGGACCAAGTGGAAATTAAACCTCAAAAGTAAAAGGGTAACATTTTGAAATTTAGGGACCAAATGCAAACTATACTCAAAATTAAAAAAAAAAGAAGAAGTATTTTTTCCTTATTTTATTTTTGACTTCACATTTGCTGTATACCAGGGCCACCGCAAAAGAGCTGCTTTCAAAACTTTTTTTGCATCATTTGTTAGAGACTCAGCCGTGGTGGAATTCTCCTTTTCGCATCTTCTCCTACCTCTGCCTTTATTGGGGACGTATCTGAAGGTGTGAAAGGCAGTGTATTACCGGAGATCGTAGTAGCAATAATGGCTTTTCACATTTCTTTTTGGCAGATACAAGTGAGAATTGTCATAAATGCGGGCAGCGTTATTGGTGAGTGGTGGTTCTAGTTTAGTGTAGCGCCGAATTTCTTAAGAAAGTCATGAGTTTATCTCTTGTCGCTCGCATTGTTATAAACGCCGATAATTGGATTAAGCTAAGCACATGTGTCGAAAGCTATCTATTTAGGGGTGGAAGGTACATAGTCTCCGTCATGCTATGTTTGCTCTCATTTTATCGTCCCTTTCTTTATTTGCCTTTTCTTAATTAGAGGAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGGTTGGAAAACAGTAATTTCCATATATTTAACACAATGGTAGAAAAAAAATATAAATCTTGAAAAATTTTCGTATCTTAAAATGTTTATGGTTTTTCGGATAAGAGACAATTCATTAATGCCAAGATAAGTACATGAAAAGGGGATTTATTGGCCGTAGACACGAAATGTATTAAAAAAGTGGTCCTGTAAATATTGTTCTTAAAAAATAACTATAGCCACAAGAAAAGAGATCACAAACGTTTTAATGATTCCGAATGAGTTTGCAAAGAGAAGTGTTGCAACCTTCTGTAAATTCAATTGGTAAATTGTAAATGTAAACTTATGCGAGTTTCACTGTTTTCAATCCCTTCAGGTGAATGCACTTCTATCTTCCTTAGATATTGACAGCAGTAAACAGGTTAAGGGGTTTCAACCTGGTAGGTTTCATGAGTTGGAGGATTATTGGAACGAATCTCAAGCTCTACAGAGACCTGGTGGTCATATTGCAGATGGATGGGCTTCTGAATATAGCCTAAACAGGGAAAAATATGCTAATCATGAGGGTTGGGCTCAATCCTTTGAACAACAATACGGTGCCAATGGTTGGGCCTCCGAGTTTGAGCAGGTAAGGTGCTGCAGCTTGTCCTACAAGTTGCACCTATAATGATGGTTTTTTATCTGATGAACCCATAGTACATGATCTGTGGCTGGTGCCTTGGTTAACTTTTTTGTGATAATTTTTTATTCATGCTTTGAGTTCGAGTGATTAGCCGACAATCATTTTTTGAATGATAACCATGAAACTGGCATTCGGTTGGCATCAAATCATGAACTTGAAATCCTTGATAGTTATTAAATTAATTAGTAACTTTCTGTTGGATATTGAGTTGTGTAGTTTAGTCGGCTTCTGCAATAGACTTGGTCATACAGAGTTATTTTAGCATGTTAGGCAAGCTGGTTATACTGAGTTATTTATCTTGCCTCTTTCATTTTAAGGTTTAGACTATGATGAAGCTGCTTAATATAGTTTTGAGCAGTTTATTTCTTGGTTGACCACTACCGACTACTCTGTGGCCTGTGTTACGGGACCTTGTTTTCAACACCTTCGGAAAATATGTGTATTTATATGCCCCTCACTCTTGGTTTGTATAATAATTGATTTTGTATGCACAATGCCTTATTTGACTCAGTCAATTATAATAACTATATTGGACTCCATGGGTTGTGAATTGTAATTCTCTTGATATATTACTGCAGGAGAAGTTTCAGTTAGCATCGGCCCAACAAATGGCAGGTGGTAATATGATGAACTTATCTGCAATGGAACAGACTCGCAAGCTTGCAAATACATTAGCTGAAAATAACGACCCGAAGTTTCAGGTTGATATTTTTTCTTTTATCATGATTTTAGTATTTCATTCATCTAAAACATAACTAAAGTTTTTCATTTTCCTTCCGCATTTGATGAGAGTGCAACACAAAAGCAAACATCGACAAACAATTGGAATGATAAATTAGGTTTGGCAACGTTGATTTTTTTAAAAAAACAGGTTGTATGACGGTATACACTATAGTAATTGTCTTCCAAACAAGACCCAAGGTCAAACTAATGGCTTTTTTCTGGAGTACCTTCATTCTTGTATTATGCAACAATATGACTAGCACCCTGAATATCTTTGTTTGTTAGGTGGTTCTAGATATTTAGTATATGCTTGCTGACGGATAAATGACTAGTTTTCATTATCCTGCCTCTCCTTTGTTCTTTAACATGGTTCTTCAATTTTAAATAGTTCCTATTAGTCTTTGGTTTCGACCTTTTATTAACATTTATTTTTTCTGGTTTTATTTTAACATGGGCATCTCATGTAATTGCCTTAACTTCTAGGTTAATTATGTTTTTATTCCTTAATGCCGTG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ATGGTGATGCGCGAGCTGGTTACTGGAGGCGCTGCTTGTGCCGTTCCTGGTTCTTCTTCTTCTTCTAACCCTCTCGGTGCCCTTGCCAACGCTCTAGTTGGTTCCTCTTCCAAGACCCAGGAAAGATTGCGGGAAATTCCTACATCGCAGCTCACAGGTCCTGAGAGACCTTTTTACCCTGAGAGCCATGGGCAGCTCCCTGGCTCTGAATTGGATCATCCACCGTTTCAACCCAATGAGCAGGCGTCAAAATTTTTTAGTGGCTTCCACTCGGCTGCTGATCAGAGTGGTCTGGCCTCTGCATGGAATGAGGTACAGGGCGGTCCCCCTCCTCCCCATTTGAGAGAAATGCAACCAAGTCTTGCTGAATTTGATCGTATTTATGAACAAATGCCTGCATCTCAGCATCAACCAAGACTCAGCCGTGGTGGAATTCTCCTTTTCGCATCTTCTCCTACCTCTGCCTTTATTGGGGACGTATCTGAAGGTGTGAAAGGCAGTGTATTACCGGAGATCGTAGTAGCAATAATGGCTTTTCACATTTCTTTTTGGCAGATACAAGTGAATGCACTTCTATCTTCCTTAGATATTGACAGCAGTAAACAGGTTAAGGGGTTTCAACCTGGTAGGTTTCATGAGTTGGAGGATTATTGGAACGAATCTCAAGCTCTACAGAGACCTGGTGGTCATATTGCAGATGGATGGGCTTCTGAATATAGCCTAAACAGGGAAAAATATGCTAATCATGAGGGTTGGGCTCAATCCTTTGAACAACAATACGGTGCCAATGGTTGGGCCTCCGAGTTTGAGCAGGAGAAGTTTCAGTTAGCATCGGCCCAACAAATGGCAGGTGGTAATATGATGAACTTATCTGCAATGGAACAGACTCGCAAGCTTGCAAATACATTAGCTGAAAATAACGACCCGAAGTTTCAGAACTCAAAGTTTCTTCAGTTTGTTTCAAAGATGAGTAGGGGTGAACTCATTATTGATGATAATCAAGTCAAGCCAAACTCTTTATCTCCATCAGATAACTGGGCTTCCGAGTACCAGCAACAATATAGTGGAGGTCTTCCCTGGGCTGATGAATTTGTTTCCAATAAAACTAATCAGTGGGCTGATGAGTTTGCTGAAGGGAAGCAGCATGCGTCAGATGATCAATGGGTTGATGAGTTTTCCAAGTTGCACATGCAAGACTGGGTGGAAGAATTTGGTCAGCAGGTCGGAGAAGGTGCTTCTGGAGAAGCTGATAATTGGGCGAATGCTTATGATGAGTTTCTAAATGAACAAGTAGCTGCCAAGGGAAAGACAGATGCTTCAAACGGAATATATGTCTTTTCTGACATGAACCCGTATGTTGGTCATCCAAATCCTTTAAAGGAAGGCCAGGATCTGTTCCGTAAAGGCCTTCTGAGTGAGGCAGTGCTTGCTTTAGAGGCTGAGGTTATGAAAAACCCTGAAAATTCTGAAGGTTGGAGGCTTCTTGGAATTGCACATGCTGAAAATGATGATGATCAACAGGCCATTGCGGCCATGAAGCGAGCACTTGATGTTGACCCTACAAATTTAGAGGTGCTTCTTGCGCTTGGTGTGAGTCACACAAATGAATTAGAACAAGCAGCTGCATTAAGATACTTATATGGATATCTACAGCATCACCCAAAGTACGGAGCACTTGCAAGGCCGGAGCTTTCGGATTCATTGTACTATGCTGATGTAGCTGGCTTATTTAATGAAGCTGCAAAAATGTTTCCTGATGATGCTGATGTGCACATAGTACTTGGTGTCCTTTATAATTTGTCCAGAGAATTTGATAAAGCAATTGCTTCCTTCCAGACAGCCTTGAAACTAAAGCCGCAAGATTACTCTCTTTGGAACAAGCTAGGTGCTACACAAGCCAACAGCATTCAAAGTGCTGATGCTATATTAGCTTATCAACAGGCACTTGATTTAAAGCCTAATTACGTCCGTGCATGGGCCAATATGGGAATCAGTTATGCTAATCAGGGGCTGTATGAGGAATCAATCAAGTACTATGTGAGGTCACTTAGTATGAATCCAAAGGCAGATAATGCATGGCAATATTTAAGAATATCACTAAGCTGTGCATCAAGGAATGACATGCTGGATGCCTGTGATTCCCGCAATCTTGATGCTCTGCAGAAGGAGTTCCCATTATGA MVMRELVTGGAACAVPGSSSSSNPLGALANALVGSSSKTQERLREIPTSQLTGPERPFYPESHGQLPGSELDHPPFQPNEQASKFFSGFHSAADQSGLASAWNEVQGGPPPPHLREMQPSLAEFDRIYEQMPASQHQPRLSRGGILLFASSPTSAFIGDVSEGVKGSVLPEIVVAIMAFHISFWQIQVNALLSSLDIDSSKQVKGFQPGRFHELEDYWNESQALQRPGGHIADGWASEYSLNREKYANHEGWAQSFEQQYGANGWASEFEQEKFQLASAQQMAGGNMMNLSAMEQTRKLANTLAENNDPKFQNSKFLQFVSKMSRGELIIDDNQVKPNSLSPSDNWASEYQQQYSGGLPWADEFVSNKTNQWADEFAEGKQHASDDQWVDEFSKLHMQDWVEEFGQQVGEGASGEADNWANAYDEFLNEQVAAKGKTDASNGIYVFSDMNPYVGHPNPLKEGQDLFRKGLLSEAVLALEAEVMKNPENSEGWRLLGIAHAENDDDQQAIAAMKRALDVDPTNLEVLLALGVSHTNELEQAAALRYLYGYLQHHPKYGALARPELSDSLYYADVAGLFNEAAKMFPDDADVHIVLGVLYNLSREFDKAIASFQTALKLKPQDYSLWNKLGATQANSIQSADAILAYQQALDLKPNYVRAWANMGISYANQGLYEESIKYYVRSLSMNPKADNAWQYLRISLSCASRNDMLDACDSRNLDALQKEFPL Homology
BLAST of Carg21644 vs. NCBI nr
Match: KAG7028329.1 (Peroxisome biogenesis protein 5 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1450.3 bits (3753), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/726 (100.00%), Postives = 726/726 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. NCBI nr
Match: KAG6596803.1 (Peroxisome biogenesis protein 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1353.2 bits (3501), Expect = 0.0e+00 Identity = 694/750 (92.53%), Postives = 698/750 (93.07%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. NCBI nr
Match: XP_022940955.1 (peroxisome biogenesis protein 5 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1351.7 bits (3497), Expect = 0.0e+00 Identity = 693/750 (92.40%), Postives = 697/750 (92.93%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. NCBI nr
Match: XP_023005312.1 (peroxisome biogenesis protein 5 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1347.4 bits (3486), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/750 (92.00%), Postives = 695/750 (92.67%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. NCBI nr
Match: XP_023539736.1 (peroxisome biogenesis protein 5-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1342.0 bits (3472), Expect = 0.0e+00 Identity = 686/750 (91.47%), Postives = 694/750 (92.53%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMA3 (Peroxisome biogenesis protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PEX5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 896.0 bits (2314), Expect = 2.9e-259 Identity = 479/743 (64.47%), Postives = 570/743 (76.72%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZMQ9 (Peroxisomal targeting signal 1 receptor OS=Gallus gallus OX=9031 GN=PEX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 250.8 bits (639), Expect = 4.9e-65 Identity = 176/526 (33.46%), Postives = 263/526 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P50542 (Peroxisomal targeting signal 1 receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEX5 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 246.1 bits (627), Expect = 1.2e-63 Identity = 182/561 (32.44%), Postives = 279/561 (49.73%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O09012 (Peroxisomal targeting signal 1 receptor OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pex5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 244.2 bits (622), Expect = 4.5e-63 Identity = 182/561 (32.44%), Postives = 280/561 (49.91%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2M2R8 (Peroxisomal targeting signal 1 receptor OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Pex5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 243.0 bits (619), Expect = 1.0e-62 Identity = 183/563 (32.50%), Postives = 280/563 (49.73%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FS68 (Peroxin-5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446384 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1351.7 bits (3497), Expect = 0.0e+00 Identity = 693/750 (92.40%), Postives = 697/750 (92.93%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KSS7 (Peroxin-5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498348 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1347.4 bits (3486), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/750 (92.00%), Postives = 695/750 (92.67%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L1F9 (Peroxin-5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500246 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1259.2 bits (3257), Expect = 0.0e+00 Identity = 646/751 (86.02%), Postives = 676/751 (90.01%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E6I9 (Peroxin-5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431159 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1256.9 bits (3251), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/751 (85.75%), Postives = 676/751 (90.01%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BKZ0 (Peroxin-5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490975 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1250.3 bits (3234), Expect = 0.0e+00 Identity = 641/750 (85.47%), Postives = 673/750 (89.73%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. TAIR 10
Match: AT5G56290.1 (peroxin 5 ) HSP 1 Score: 896.0 bits (2314), Expect = 2.0e-260 Identity = 479/743 (64.47%), Postives = 570/743 (76.72%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. TAIR 10
Match: AT3G11540.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 2.1e-10 Identity = 64/233 (27.47%), Postives = 98/233 (42.06%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. TAIR 10
Match: AT3G04240.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 2.3e-09 Identity = 63/249 (25.30%), Postives = 112/249 (44.98%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. TAIR 10
Match: AT1G05150.1 (Calcium-binding tetratricopeptide family protein ) HSP 1 Score: 50.8 bits (120), Expect = 5.2e-06 Identity = 60/239 (25.10%), Postives = 105/239 (43.93%), Query Frame = 0
BLAST of Carg21644 vs. TAIR 10
Match: AT2G32450.1 (Calcium-binding tetratricopeptide family protein ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 2.6e-05 Identity = 59/242 (24.38%), Postives = 104/242 (42.98%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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