Carg19195 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2

Overview
NameCarg19195
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCarg_Chr19: 8306238 .. 8313303 (+)
RNA-Seq ExpressionCarg19195
SyntenyCarg19195
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTAATAAAGTAACATTATTCGGCAGCAAGAACTAGGCTTCTATTTACTTGGCCAGCACTCCGCAGCTAGCTGCTGAAATGGGACTCAAATTTCCTGGAGTTGTTGAGGTACGTTTTGTTTTGTTTTGTAATTGTTTTTCTTTCTGTTCACATGCGATGTTCGGATTCTTTTGCGTCCCTCTTTGCACTTGCATTTTCATTTGCTTTGGGTCAATTTAGCAATAGCTTTGATTGCCTTTGGTTGGAAATTGTTGTGCAAAAACTCACTACACAACGCTACACAAACGTACATAATCCTAGGTAGTAAATGATAAAAATTCGATCCCACTTGGACATATTTATGAAAATTTGCTGAAACTAGCAAAACTATGGTGCACAAATAGACTTTCAAATCTAAAATAATTAATACGAAAAAGACTTAAAAGAGGACAAAACATGCATAAAAATTATAAAACGCATTAGATAACACAATGTTACACAAGGGAAATTTCACATGACGCCAATCTGAAAGCTTATGGAATTCACTTTTCTTGTCTTTAACGCTAAGTTTCTGCCCTGTCAAAGTAACGCATTAGATAATACAATGTTGCACAAGGGAAGTTTCACATGATGCCAATCTGAAAGCTTATGGAACTCACTTTTCTAATGCCAAGTTAAACATTTCTTTGAAAACTCAATGCTAAAGAACACTAATAAAACCCAAATTCTCCTAAATCATAAGCTTGGAACGTGTAACGACCCTAGATTTCTATTAATCTAAAGTCGCTACCGTCACCATCATCTATACTCTTATGCGGAATTAAATATTTAAAACTTAAATCTTAAAACACATACTTCATCTTAAAACACTTTCATGGACTTACGTGTTCAAAAACATCTTAAAACAACGTAAAGGAATACTAAATAAAACAAGCAAACCATTAAAAGTGAAAACACCCTATATTAACCCAAGACTAAGAAATAAAAGGCTACAATCCTATGCATGTGCCATGGTCTCTGATTGCGATGTCGTCATCAACCGTACAAGGGTGCCTTGCCTTCACCTCAAATAAAAGTAGCACATGACTTGAGTATTTTAAGAAATACTCAGTAAGTGACTCCACTATTGGGGTCAGGAAAATACAAACACATACCACTCATGATCTAGGGACTTATCGTTAGAACCATCATAGGGGTGGCCTCTAGTCCGAACAAAATTGGATGTGTTGTACTTCCCTACACACAACCCACGTGCGAGTGTGGATCTCCAAGTAGTTCGCACCCTCCTTGGACCCATCATAGTTGAGCTAGCTCTGTCTGTAGCGACGTCTGGAGGTAAGCAGACCCTTGAGTGTCATGCGAGGTGTCACAATCGCACTCTTGCGATAGTGGGACAACAATTGTGCAGCACTCACGACTGACTTGTTCACTATCGCAAGAGTGCGATTGTGGCACCTCACATGACACTCAGGGGTCTACTGACCTTCGGACGTTGCTACGGGCAGCTAGCTCGACTATGATGGGTCCAAGGAGGGTGCGAACCGTTTGCCTGGGGATCGATCCACACTCGCACGTGGTGTAGGGAAGTACTACACATTCAATTTTGTCCGGACTAGAGGCCACCTCTATGATAGTTTTAACGATAGGTTCCTAAATCATGAGTTGTATGTGTTTGCATTTCCTTGACCTCAATAGTGGGGTCACTTACTGAGTATTTCTTAAAATACTCAAGCAGTGCGCTACTTCTATTTAAGATAAAAGCAAGGCACCCCTGTACGGTTGATGAAGACATCACAATCAGAGACCATGGCATGTGCATAGGTTGGTAGCATTTTATTTTCTTAGTCTTACTAGTATAGGGTGTTTTCACTTTTAATGATTTACTTGTTTTATTTAGTATTCCTTTATGTTGTTTTAAGATGTTTTCGAACACGTAAGTTCATGACAATGTTTTAAGATGAAGTATGTGTTTTAAGATAAAGTTTTAAATATATAATTCCACATTAGAATATAGATGATTGTGATGGTAACGACTTTAGATTAATAGAAATCTAAGGTTGTTACACATTCCAAGCTTGTGATTTTGAAGAGTTTGGGTTTGATCAGTGTTCTTGCATTGAGTTTTCAAAGACATGTTTAACTTAGCGTTAAAGGCAAGAAAAGTGAGTTCTTTAAGCTTTTAGATTAGCATCATGTGAAACTTCCCTCGTGTAACATTGTGTTACCTAATGCATTACTTCGACGGGGCAAAACCAGCTACTGGTTTCTAAATTTCACCGTTAAGGCAAGAAAAGTGACTGTGCGGCACTTTTTTTAACCAAGCGAACAAGTCAGTCGTGAGAAATTCAAACGTCGCGGACAACGTTGGCTTATGTTCGGGCCTCGAATCACATTGCGAAAAAGGGTTTAGAAAACGTGAGCGAGGAATTACATTTGAAAACGAATTGAAGAAAGCAACGTTATATGACTATAAGCAAATAAATAAATACCACGACTTAAATAACATATAACTTAGGGTAGGAAGAAGTGACAACTAGTCATATCCCCTTATAGTATTGGAGCATTTTACCCTTGACGAGTGTAGACATGGTTTTGGTGAATGGTCATACACCTCCGTATTGACCCAATGTGAAATAGTCAAGGTCTATCTAGGATGAAAGCATATAAAAGGGGTTTGGAATGGGCATGCAACCATGGACAACACGTTCTGGATAAGCAAAGATCGAGACATTTGCCGTGTGGCTATAGGCAACACGCCTTGGACAAGTATGATCGTGACCCACTCAATTGGTTGATGTCTCTATCAACCCACTCTTTACAACTCGGTGTTGTAGGTTGAGGCTGACTTTACCTTGGACAAGCAATGACTGTGACCCACTCAATTGGTTGACGTCTCTGTCAACCGACTCTTTACAACTCGGTGTTGTAAGTTGAGGCTGACTTAAGGTCTCTTCGACGCGCTTCTAACTGATCTTGGTGTTGTGGAGTCTCTTCCAATCTGTAAGGAACTGTCGAAAACTACTTGGTTTGTTGACTCTTGGCGTCTCCTGAGTCGAAGTTTCTCCTACTTCCTTTGCTTGAGGATTATTCTTCTTTGTGTGAGGTCGTGTCGCCTCTCTATGCTTGACGTCTTCTAGGTCGAGAGAGTAATGTTTTATGTTATTGACGTGAACAATAGGGCTAGCAATTGGATCCTATATGATGCCTTCCTGATCTTGTGGATAACTTCGACTGATCCATAGTATTTTCGCACCCGTCTTTGACTTTTGTTGCTTTGATCTTGGAGTTGATCTGACCTCAACTTAATCAGAACTCTCTCTTCTTCTTGAAACTGTCGTAGTCGACGCTTTCGACCAACCCTTCTCTTCCTCTATCTGGATGGTACTTATACGCGACCCATGTGTTGTTACAGAGGTATGTCTCTATCTCCCCAGTCCTTGGGTGATCACTAACAACGGTATTTGTGGGCCTAATGGAAGGGCTGATCACTAACAATGGTATTTGTGGGCCTAATGAACCCAACTGACAAGTCATTTAGCTACAGCTGGTAGAATTCAGCTAGCTCGAATTAAGCCGTATGACATTCATTCGTGGTAGGCGATTTTGCCCCCGATATGACATCAACCTTGCTATTTATCTGTCTAGGTCGAGATAAATACTTTACCTGACTTCCTTGTCTCGTGTCGCGATGTTTCTAAATTGACCACGAGGCTTCGACATTCCCTGTGAAGAACTAAGAGCGGAGTTCTTGTTTCAAGCTATCCCAAGTGTCCACAATACATCAACCATCTTGAATGTCCATGTACAAAACTCCACCATAATTTTGCATCGTCGGCTAGATGCATTGTCGTCAGCGTGACCTTCGCTTCCTCTGACATGATATTTGCGACTCGAAAGTATTGTTCGAGGTAGAAGATAAATTTCTCTAGAGCCCTAGCATCTCAAATCCCACGTAAGGGCTTGGGCTCTGAGACCTTTAGCTTATTAAATTGTGCTACACTTCGAGTCGGGGTTTGGTCCCCCACCGCTTTCACAGTGAAGTTCTTGTTTGTAAATTATCTCTTTCCTCTTTAATTAACTGAGTTTTGGTGAGGCCATACCCAGTTTTTTTAAAGTTGTCGTGCCTATATAATTCCATATGGATATCATCGTCATCACGCAGGGATTAGATGCTGCATGTCATGGGCGGATTTTAAGTACATTGATTTGGACACCAACTTCATATTTATTTATTTGTTAGTTTGTTTGTTTCACCTAGTTTCTCTATGCATGCATGCCTGTTTATCGTTGATTTGGTGAATTAGAATACAGTAAGTGTCCTTGTGATTGTGAAAGGCTTAATATAGGATGAGTCATTTTATATGTAGCAGTTCAATATTAAAGTTTATTTACAATAAAGAAATGAAACCGGGAAGACTTGTTTGCTCTATGAGATCTTCTTTAGGTATTAATTAAGATTTTTCAACCTGCTCCTTAGAAAAAGTGTCACATGTCCAAAAATAGACTAAAGTTCATAGTGCGAGTTGCAAAAAAGTTCTAACATCACTCACATTGAATGTCGCTTAGTTGCACAATTCTAGTATCAGTCACGTTTTCCTGTCACTCGTGTCTGGTGGCGTCGATCTAGCCACAAAATTGCAGCGATAGTTGACAAGGATCCGTAGCTCTGTAATGAGGATTCATACAAAATCAACTGATCTCCCCGGTGATCATTGTTATTTTTATGGATGAACTATAAAATTTGTTCATAAGTACATATAAAATTTATATGCTGTGCTCTGTTTGTAGAGATTTTCTGTTCCTAATATGCAGTGATAAATTTAAGACCATATTCACGTGAAAACTTTGGATTGTTTTTGATGCAGTACTGGGTAATCCAGAGTGATGTCCAAGGGAAAGGAACAGAACATCCATTAATTGGTGTTGTCTGTGGACACTTATTTGGTCTGAAGTTAGAGCATTATACAATTAATAGGCAGAGCCGGTAAGATCCTGAACGAAGCGTCCACTGACTTTGAGAGTGCCATCATCATCATTAAGCACGGTAAGTCATCATCCCTTCTCCATGCCCATGCCTGTACTTACTCTCCTGCTTTACGCCACCCCCCCCTGTTTTTTAAAAGAGAAAATAAGTATATCTAAGATTATACTCAAATTTTGAATACATTAATTGGATTAAAAAGACTAATTTCACAATCTCAAAAAACACAAAAGCCAAAACGAATATCTTTGAAATGACCTCAAACTTAGCAATGTGATTGGATTTTTGTGAAGCTTGAGATGCCAAAATTTGAACACATCCCTTCCATTATAAACAGATGCACATAATCCAATCTCTATTAAACAATGGAGATCTACACAACATAATTAATGAATAATGTTGTACACTAAAAGAATTAATGAATAATGTAAAATATATAAAAGCAACCTAACACACAGGCAAATAATTCAAATAAAAAAAATCTGAGGTTTATTGATATTTAGTAGTTATTCAGCAAAGGGGAACTGCTCACAGCCTAAAAGCCTGTTTCTACTGCACTCTGTAGCTTTACCAACTTTTCTGTCACATCGTCCTTTTTTCCTTTTCCTTCATAGGTTATCCCTCAGATATTTTCTATCTATTTTTCAGATAAATCTTACTAGATAAATTACAAATTTTATATATGAATTTTTATATTTATGTTTATTTAATCTTTCATTTTTCAAAATGACTTTTTTTTTTAATTTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAAATTTCACGGATTTATTGAACACAAATTTCAAAATTTTGAGTTTTTAAACATAAGATTTAAATTTATAAAAATTTAAAATGGTCATTAATTAAACATTTTTAAAAGCATTTCATAATATATATAATATTTTTTATAAGGCATTATTGACAAAAAGAAAATTTAAGGATTTGAATCATTACTTTCCCATTTTCTTGAACTTAATAAAAAATAAAAACAAATTAAGCCTTTTTTTTTTTTCAACCTATTCAATTTAGTTTAACATCTAAAAAATCATTAAAATTAAGGAGAGGTATTTTAGTAATTATAACATATCTAATTTCAAAGGAATTTCTATTTCTATTGAGTTCCCATAGCTGTATTTATCCGTTACATCTACTATGTAATTAAATCATTAATAATTGAAAATAATATAACACCCTTTAATAAAATAATAAATCACGTGCAGGTGAAAACAATTATCGGTAATATGAAATTATTAAAGTTTCTTGATATCTTACCTCCATTTGCGGCTACGGGATTTTTATAAAGAAAAAGCTATCTAATTTCCTTATTTCTTTTTTATTTATTTTATTTTCCAAAGATAATTTCGTACAATGCAATAAATATATTTTCTAGTCCATGACACGTCAGTAGCCATCAACATGCCAGCCTGTCCAAATAAAGGCAAAATTTTGAATTGGGTCATACGGGATTGGCTTTTGCCGAAGTTACCTAAAAGTTTAGGGCTGTACCTATAATCCAAAGGGCAAGGGAGTTCTCTCTTCCACGTGGTAATCTTCTATTGGTCGGTGACGGAGAGAGAGAATTTTGGGCGGAGCATAGTGTTTCTTCTTTTTGTGGGTCATGGAATAGTCATTTTTTTCTCTCCAGCTTGCATGATTAAAGTTATTTCACATTATGTTTTGGGACAGTAACAGTTGTAAAGTCACTCTCCTAAATGATTCCTTCAAATCTTGTGTACATTAAATAAATGTTCAACATTTTTTTCTATTTTTTTAGACCATATGATAAGATGCAAATCCAATCCATACACTCCCCTCACCCTTAAATATCCATACTTTCATATTTTTCATATTTTATAGTGAGTTTCTTTTTAATATTTAAATTTTTTTTTTTCAGCTCAACAACTCTGGAGATGGAGAAATTTGAACGGTTGTACTCTTGACCAAAGGTACATATCTTAACTAGTTTAGTTATATTTAAATTGAGACTCGTTTTTTTGTATATTAGTTGATATTTTATATATTAACTTGTCTAACCTTTTTGTTGTCTATTTTATTCGTCACCCTTAATTAATGTCTATTTTATATGTTTGTTGA

mRNA sequence

TTAATAAAGTAACATTATTCGGCAGCAAGAACTAGGCTTCTATTTACTTGGCCAGCACTCCGCAGCTAGCTGCTGAAATGGGACTCAAATTTCCTGGAGTTGTTGAGTACTGGGTAATCCAGAGTGATGTCCAAGGGAAAGGAACAGAACATCCATTAATTGGTGTTGTCTGTGGACACTTATTTGGTCTGAAGTTAGAGCATTATACAATTAATAGGCAGAGCCGGTAAGATCCTGAACGAAGCGTCCACTGACTTTGAGAGTGCCATCATCATCATTAAGCACGCTCAACAACTCTGGAGATGGAGAAATTTGAACGGTTGTACTCTTGACCAAAGGTACATATCTTAACTAGTTTAGTTATATTTAAATTGAGACTCGTTTTTTTGTATATTAGTTGATATTTTATATATTAACTTGTCTAACCTTTTTGTTGTCTATTTTATTCGTCACCCTTAATTAATGTCTATTTTATATGTTTGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGACTCAAATTTCCTGGAGTTGTTGAGTACTGGGTAATCCAGAGTGATGTCCAAGGGAAAGGAACAGAACATCCATTAATTGGTGTTGTCTGTGGACACTTATTTGGTCTGAAGTTAGAGCATTATACAATTAATAGGCAGAGCCGGTAA

Protein sequence

MGLKFPGVVEYWVIQSDVQGKGTEHPLIGVVCGHLFGLKLEHYTINRQSR
Homology
[Close]
BLAST of Carg19195 vs. NCBI nr
Match: KAG7011933.1 (hypothetical protein SDJN02_26841 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 8.3e-22
Identity = 50/50 (100.00%), Postives = 50/50 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MGLKFPGVVEYWVIQSDVQGKGTEHPLIGVVCGHLFGLKLEHYTINRQSR 51
          MGLKFPGVVEYWVIQSDVQGKGTEHPLIGVVCGHLFGLKLEHYTINRQSR
Sbjct: 1  MGLKFPGVVEYWVIQSDVQGKGTEHPLIGVVCGHLFGLKLEHYTINRQSR 50

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Carg19195 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7011933.18.3e-22100.00hypothetical protein SDJN02_26841 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
BLAST of Carg19195 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Carg19195 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Carg19195 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Carg19195-RACarg19195-RAmRNA