Carg17612 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCAGGTTAGGGTTGCAAAATCAAATTGATTACGCTACCGGTTGCTATCGAATGATTCGAAATTGAAACCGGTTTTTATTGTACTCGATTAGATTTTCGTTGAATTTATTTTGACTCGTGATTGTTTATGGAATGTTTGTTTTTTCTTATGAAAATTTTACAGGGTTTGTTTCCGGGATTTCTTTGACGAGTGTAGGTCTTTGCATGGGCAATCCATTTTTGAGGTTTGCAAGGACTTGGTGGCGTTGTTAAGATGTACAGGACAGTGGCTACATCTGCGGCCACAACCACAGCAACAACAACAACAGATAGCGTTGATTATGTTGTAAATTTGGATCAAATTCCACGGTGGAGTGATGCAGAACATAGGTCTTCATTGGAGTTCGTCAACGAAGATCCTTCCTTCTCTAATTCGTATTTTCCTGATCCTCTGACGTCTCCATCTGACGCGGAGGGTGGTAATTATGGAGTGGTTTCGAGATTTCCCGTCGATCATGAAATTAATTCCAAAATATATCTGTGGCGGGGGAATCCTTGGAATCTCGAGGTAGATGCTGTCGTGAATTCTACAAACGAGGTGAGTGTTATGTTCTTCATCTCCTTCCTTCTGCAATAGAAAACCTTAATCAAATAAACAAAAGGGAAAGCAATGAGATGCTAAAAGTCCCAAGAACTCAATAATAGTTCCATTAGAACACACAGGGGACAATCTCAGCCCCGAGTTCTGTACATTTCAAAGAAGAAGAAGAAACATAGACATAGTTGCAAGCACAATTCTTCAATGGGTACTAATTATCCCTCGTAATCATATGGTTTTATGTGGTTGAGCTTTAAGGTGGGTATCATTTGAAGTGGCATATATTAGTGGGAAAATTAGTTGAAATTGAAAATCTGTTGATTATTAAGTTTTGGTATGGCTAATCCACTACGAAACGTATGCATATTTCACATGGGATAAACGTATGCAAGATGGAATTAGATGGTGGTCTCCTTAACTTCAGAGGTTCTTGAAAAAAATACCCCAAAACTGAAATGCCTGAGCTTAAGCAACATTTAAATTATGGGTGGATTGAAAGTTTTGTCTGATAAAGTTGAAAGGACATAAGTCTGTCCTGTACAAAAGAGATAGAAGATGAGAGCTTCATATCCTCCATTAGTGTTGACTTTTGACTACTGGAAGACGTACTTAATTCCAAGCACCGACCATCATCATCATAGTAGAAAATCATCTTCTCTAACATTGCACCATACCAACCAAGGCAATTATTTTTACGAATTGTTGTATGAGATAATAGAGGAAGTAGGATAGTACATTGATATTTACCTTTATGAAGAGTGAGGGGAGATCATCACTTGTTCCTCTATTTAATGATGAAGGACCTTTTGGTTCAAGACATGCACCTGGAAGTTGTCGGTTAGAGTAATTGAGTTATTAGTGGGTGAATAAGAATTGATATTGAGGAAGATGGATTAGGGAAGACAACCCTAGGTAAGGGAAAACTAACAATATAGACAAGAAGATCGTTGCCCTCCCATGTGCTCTTCCTTAACTACTAGGAGAGATGATCAAAAGAAGAAAAATAAGCATCTTTAAAGAAAGTAAGATAAGGTAGTACAACATTTAAACTAGGATAATAGTAATTCCCTTTTTGAACTAAAGATAACCGAAGAAAGTACATATCAAAGATTTTGGGTTTAAACTTTGTGAATTCAAAGCAAACAAGTATAGCCTAATATTTTTGGTCATGAGAAATAAAGGTTTTAGAGGCTTTATAGGAACAAATCCTAACATGAAATTTCGCCAATCTGCATTCAAGCTATTGAAGGAGTTTTATGAAATAGTACAGGAATTTCAGATATTCAAGTAACTCCTCCACAGTCACCATGATTTATCAAACCAACAACCTGACTCTTGATTGAATTGGTTATCGTCAAGACCAAACTGGCATCAACTTGGAACCAAGTTCTTCTAGTGTCATTAGTTGATGGATAGGTCATGTCACGTGTGTATGATGGAAACCCATTCCATAAACTTGGTGGATAAAATTAAAAACCAGAAACTCTAACCATCTTCTGAAGTGGTTCCACATGATGATCAAGCTTAGCACATAGACAAAATGAGAATGTGAGATGTTGAGACAAGAACTAGTAATGAAAGTAAACAGAAGTCGGACTTAATCACTATATTATGCTATTTGGTTGCTATCTTTATTGTATTGGGTTTGAATAAGTTAAATTTTATGTACAATTGTCATGCCTCTATAGGATGTAGAGATGCTTAGCTCATTGTTTATGACTTGACGGTATCTCAATCTATTCATATTGAAAGAAAATGAAGAGGTTGTCAGCACAATTGTAGGCATGGTGGTGGTCTATGGCCTATCACTTTAAAACCTCTTAGCATAAAAGCCTGTTTGGTGAGAGTTATGTTGTTGATACTGGTTGATCTGCAACACGGATTTGTATCTGTAATCAGAAAACTCCTTTTCCGGTTAAGTTTATATAAAATGAAATAAGCTGCTAATTTCTATATCTGCCATCTTTAATGATTGTAAAATTAAATTATACAGAACTTGGATGAAGCACACAGTAGCCCTGGTTTGCATGCTGCAGCAGGACCTGGTCTATCAGAAGAATGTGGAACACTTGTACGCCTGTGATTCTATTTACTTCAGTTTAGCCTTTGTTTATTGTTTTTTTCCTGATTAAGAACTGGAAATATTCACAAATTAACATATGCATATATCTTATAAGAAAAAACTGTGGATAGTTTTGGCCTTTTGGAGGTACAATGGAGGACTGCACTATTTTCAGAAAGATTTCTTTATAGAACTTCTTTAGACAATAAGAATGTCAAAACCTGACTCATTATATACATTTCACATCCTGAAGGGTGGTTGTCGCACAGGAATGGCAAAAGTCACTAATGCTTATGACCTTCCTGCTAGGTGAGTATGCAGTTGATGTTCGGATCTAGAGTAAAGACCTATACATCCATTTAATCTTTGGCATTCTCTTTTAGGAAGGTCATGCATACTGTAGGTCCAAAATATGCTGTCAAATACCATACTGCTGCAGAGAATGCTCTGAGTCATTGCTACCGTTCTTGCCTTGAACTTCTCATCGAAAATGGGCTTCAGAGGTTGTGAAAGTAGTTGATGCCACATTATTTTTTTCTCCATATCGTTTGCTTATCTCATGCATCTCTTGCCATTTTTAGCTTACATGTTAATGACGATTTAATGCAGCATTGCTATGGGTTGTATATATACAGAGGGAAAAAACTATCCTCGTGAACCTGCTGCTCACGTAGCAATAAGTGAGATATTTTCCTACATGTTCCTTTAAGATGTCTATGTTTTTCTCTATTCTACTATGATTCAATTTTCTTGTGCTACTTTTGTTCACAAATTATGGCATCCATTAACTGCCAATTTACCTAGTATGTTTAGCTTAGTAGGGATGTTATCAGGGCGGGGTAGGGGCTCGGAAGTATTTTGGACCTAACCTACTAGGGAGTTGGGCTTGAGGACTTGCACTGATCCATGCTAGCAAGCTCTGGTATAAGAAACACAAAATTGTGAAAAGTTTTCTAAATTTTTAATCACTTCTTTATTATTTTTCTTTGATGGTTATAGGTCCATTTGGATCTGATCTTTACGATTTGTGATTGTTACCAACTTGCATTCTGTAAATCAGCATAGCGATTGCATTTAAATCATCGGAGATGATGAAATCTCCAGTAGGTAGCGGAGGGAAAGTAAAGAAAATTTAACATCTTATCCTCATTTTTATTTTGCTTCTTCTTCTGTTTAGGAACTGTGCGTCGTTTTCTTGAGAAGCAGAAAGGTAAAATTAAAGCTGTTGTATTTTGTACAACATCATCAATCGATACTGAAATATACAAAAGGTACTTCACTTTCAAGTAACTGAGGCCTGTCATTCCTAAAGGATATATTTTCCATGCCGTATAAAATGTAACAATCCTTGTTGCATTTATTCGATTTGCTTTTATATGTTTCTGAGCCAGGTTGCTTCCTCTGTACTTTCCCCGTGATAAACACGAGGAAGAAGTTGCATTGTCAAAGCTTCCTGCAGATGTTGGAGATGAGAATGGTGAGACTATTATAGATGAGCGGAAAATCAGGATAAACACTTTGCCCAAAAAGAATGTTCTGAAACCTCCCCAAGTTCCCGATGATCCTCCTGTCAGTCATGTAAGGTTGACACAGAGGTTAGTGTAATGATTTATGCAATGTAACAGTTCTTTTTCAAAAAATATTTCATCTTCTATCTGATGGTAGATTCATGAAAATTGCATACCTGTATGAGTCAGAGTTGCCCTGAATTTGATGACATTGATCTGTGGCATCTACTTTATCTGCGTTTATCATGACTCCCAGGCCAGTTATATTTATTTGAAAGAAACAAAATTATACTGAAAACCTGAAAATCACGAAGGTAGAGCAATCCACCCTACAAGCTATGGGGATCACCAAAGTGGACCCCTATCAGCAAAAGTACGAGGAAGATTGTAGTTACAAAGATCTTGATGAAGAGAAAAAGTGCAAGGTTTCTTGCATTCTACAACTCCAAAGGGAAGGTCGTGATTGCATCAGACCATTTGTTTTTTTTTTTTCTTTTTGATATTCGTCGAGTGGGTGGGCTAGCTTGACTATTCTCATAGAATAACTACTTGACTTTCTACATTTGGTTGTCAAGGTAGTTGTAAGATATTAAATCCTAGATAGGTGACCACCATGGCTTGAACCCATTATCTCTAGGCTCTTTGTAATCTTTAAGGTTGACTCTGAGAAAACTTTATGATCATGTTGATTAGATCTTCTTGGATACAAAAGAAGGGTTTTGGGATGAAAAATATTGGAGAGTTTGGATGTGGAATTGTTTAGGTCAATAAACTTTTCCATCTTTGTTAGAGGGAGGCCCCAAGGGAAGGGTAAAATTTTCGCTGAGGTTATCTGCTATTGCCTT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ATGTCAGGGTTTGTTTCCGGGATTTCTTTGACGAGTGTAGGTCTTTGCATGGGCAATCCATTTTTGAGGACAGTGGCTACATCTGCGGCCACAACCACAGCAACAACAACAACAGATAGCGTTGATTATGTTGTAAATTTGGATCAAATTCCACGGTGGAGTGATGCAGAACATAGGTCTTCATTGGAGTTCGTCAACGAAGATCCTTCCTTCTCTAATTCGTATTTTCCTGATCCTCTGACGTCTCCATCTGACGCGGAGGGTGGTAATTATGGAGTGGTTTCGAGATTTCCCGTCGATCATGAAATTAATTCCAAAATATATCTGTGGCGGGGGAATCCTTGGAATCTCGAGGTAGATGCTGTCGTGAATTCTACAAACGAGAACTTGGATGAAGCACACAGTAGCCCTGGTTTGCATGCTGCAGCAGGACCTGGTCTATCAGAAGAATGTGGAACACTTGGTGGTTGTCGCACAGGAATGGCAAAAGTCACTAATGCTTATGACCTTCCTGCTAGGAAGGTCATGCATACTGTAGGTCCAAAATATGCTGTCAAATACCATACTGCTGCAGAGAATGCTCTGAGTCATTGCTACCGTTCTTGCCTTGAACTTCTCATCGAAAATGGGCTTCAGAGCATTGCTATGGGTTGTATATATACAGAGGGAAAAAACTATCCTCGTGAACCTGCTGCTCACGTAGCAATAAGAACTGTGCGTCGTTTTCTTGAGAAGCAGAAAGGTAAAATTAAAGCTGTTGTATTTTGTACAACATCATCAATCGATACTGAAATATACAAAAGGTTGCTTCCTCTGTACTTTCCCCGTGATAAACACGAGGAAGAAGTTGCATTGTCAAAGCTTCCTGCAGATGTTGGAGATGAGAATGGTGAGACTATTATAGATGAGCGGAAAATCAGGATAAACACTTTGCCCAAAAAGAATGTTCTGAAACCTCCCCAAGTTCCCGATGATCCTCCTGTCAGTCATGTAAGGTTGACACAGAGGAACCCATCATATTTGGATTCATACCTGGATCCTGCTTTCATGGCTTTAATCAAAGATCCGGATCAAAGACGCAAGGAACAATGGGAAAAAACTGCCCAGGCTCAGACTGGATGGAATTATGGTAGAATACTTGGATTTGGTGAACTTGGTGGAGCTCCTTTATCTGCTGCTGAAGAATACTCACTTCATTCAAGATACCTTGCTAAAGCAAATTCTCTTAATCTCTCTGAAATTGGGGAGATGAAAATTGTTTACCGTGGTGGAGTTGATAGCGAGGGTCGCCCTGTTATGGTCGTTGTGGGAGCACATTTTCTACTGCGTTGTCTCGACCTTGAGCGATTTGTGCTCTATGTTGTAAAGCTTTCGTCGTTGACCACCACAACTTGTACCACCAACGCCATTGCCTGTACGGTTGATAAGCCGCACCACCACTATTGGTCAGCCAACTTCAATAAATCCTTGCCAATTACCAAGTTCAAGAGATCAAGAGACCACAAGATGAGGACAGACCGAGATTGA MSGFVSGISLTSVGLCMGNPFLRTVATSAATTTATTTTDSVDYVVNLDQIPRWSDAEHRSSLEFVNEDPSFSNSYFPDPLTSPSDAEGGNYGVVSRFPVDHEINSKIYLWRGNPWNLEVDAVVNSTNENLDEAHSSPGLHAAAGPGLSEECGTLGGCRTGMAKVTNAYDLPARKVMHTVGPKYAVKYHTAAENALSHCYRSCLELLIENGLQSIAMGCIYTEGKNYPREPAAHVAIRTVRRFLEKQKGKIKAVVFCTTSSIDTEIYKRLLPLYFPRDKHEEEVALSKLPADVGDENGETIIDERKIRINTLPKKNVLKPPQVPDDPPVSHVRLTQRNPSYLDSYLDPAFMALIKDPDQRRKEQWEKTAQAQTGWNYGRILGFGELGGAPLSAAEEYSLHSRYLAKANSLNLSEIGEMKIVYRGGVDSEGRPVMVVVGAHFLLRCLDLERFVLYVVKLSSLTTTTCTTNAIACTVDKPHHHYWSANFNKSLPITKFKRSRDHKMRTDRD Homology
BLAST of Carg17612 vs. NCBI nr
Match: KAG7020754.1 (Protein GDAP2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1025.4 bits (2650), Expect = 1.7e-295 Identity = 508/508 (100.00%), Postives = 508/508 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. NCBI nr
Match: KAG6585824.1 (Protein GDAP2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 9.6e-251 Identity = 434/434 (100.00%), Postives = 434/434 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. NCBI nr
Match: XP_022951654.1 (protein GDAP2 homolog [Cucurbita moschata] >XP_022951655.1 protein GDAP2 homolog [Cucurbita moschata] >XP_022951657.1 protein GDAP2 homolog [Cucurbita moschata] >XP_022951658.1 protein GDAP2 homolog [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 873.6 bits (2256), Expect = 8.2e-250 Identity = 433/434 (99.77%), Postives = 433/434 (99.77%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. NCBI nr
Match: XP_023538095.1 (protein GDAP2 homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023538096.1 protein GDAP2 homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023538097.1 protein GDAP2 homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023538098.1 protein GDAP2 homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 873.6 bits (2256), Expect = 8.2e-250 Identity = 432/434 (99.54%), Postives = 433/434 (99.77%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. NCBI nr
Match: XP_023002685.1 (protein GDAP2 homolog [Cucurbita maxima] >XP_023002686.1 protein GDAP2 homolog [Cucurbita maxima] >XP_023002687.1 protein GDAP2 homolog [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 869.4 bits (2245), Expect = 1.5e-248 Identity = 430/434 (99.08%), Postives = 431/434 (99.31%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7T167 (Protein GDAP2 homolog OS=Nematostella vectensis OX=45351 GN=gdap2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 1.8e-66 Identity = 151/401 (37.66%), Postives = 221/401 (55.11%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5CZL1 (Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 233.4 bits (594), Expect = 5.6e-60 Identity = 153/414 (36.96%), Postives = 229/414 (55.31%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q66HX8 (Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2 OS=Danio rerio OX=7955 GN=gdap2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 228.0 bits (580), Expect = 2.4e-58 Identity = 155/418 (37.08%), Postives = 220/418 (52.63%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XGM5 (Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2 OS=Xenopus laevis OX=8355 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 3.1e-58 Identity = 152/437 (34.78%), Postives = 234/437 (53.55%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9NXN4 (Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GDAP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 223.0 bits (567), Expect = 7.6e-57 Identity = 151/459 (32.90%), Postives = 239/459 (52.07%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GJF0 (protein GDAP2 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454405 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 873.6 bits (2256), Expect = 4.0e-250 Identity = 433/434 (99.77%), Postives = 433/434 (99.77%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KPN2 (protein GDAP2 homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496470 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 869.4 bits (2245), Expect = 7.5e-249 Identity = 430/434 (99.08%), Postives = 431/434 (99.31%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KS03 (Macro domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G487740 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 819.3 bits (2115), Expect = 8.9e-234 Identity = 409/434 (94.24%), Postives = 418/434 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5F4 (protein GDAP2 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503322 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 818.9 bits (2114), Expect = 1.2e-233 Identity = 408/434 (94.01%), Postives = 417/434 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G3J6 (protein GDAP2 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450452 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 4.9e-232 Identity = 408/435 (93.79%), Postives = 416/435 (95.63%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. TAIR 10
Match: AT1G69340.1 (appr-1-p processing enzyme family protein ) HSP 1 Score: 684.9 bits (1766), Expect = 5.0e-197 Identity = 338/429 (78.79%), Postives = 375/429 (87.41%), Query Frame = 0
BLAST of Carg17612 vs. TAIR 10
Match: AT2G40600.1 (appr-1-p processing enzyme family protein ) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 5.8e-12 Identity = 44/130 (33.85%), Postives = 70/130 (53.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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