Carg14420 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTGCGAAAGAACGCTTTCATCGCGTTCTCTTCGTTAATAGGAGAGGACTTGGAAGCTCGGCCGACACTGAGAGTCGACGTGTTTTCTGCCAGCTGATGATTCAGTCTCCAGAACGCATAGGAATCACTCGCCACTGCCAATTTCTGAATCTTCGTCATGGTAAACTTACATTCTACGAGCCTGGATTTGTTCTTAAGGTCTTTGTTCTAGTGTAAATTGTAGCGCGGGATTCTTCAGCCCTTTTAGCGGCCTGGATGGCAATGGTTATTGTTCAGAACGCATCACTCTCAATTTTTCTATGAAATTATTGTTTAGTAAGGCACGGAAATGTTTGTTTCAATTGATGATTTTGAGTGGAGGGTTTTATGGTTCGGGAGAATGCATGTTATTAGCTGTTAGGATTATCTCGGACGGGTTTCGAACTTCTTTTATTGTTAACCGGAAATTTTTATTTTGAATGCGAGGGTGGAAGCATGATTTTCCATGTTTATACTGTTTGAAGTTCATAACCAGGCTGTAATCGATAAAATTTCAGTTGAAAAGCTGAAGTTATAGATTCCTTTACTTTCAAATAGGGCAGTGTACTAAGGAAATTGAATAGTCAGGCTGTAATTGATTATATCAGCTGCAAACAATTGATTCTTTTAGCGGAACAATTCGATCCGTGTTTGGTGATTTAGGAACTTAGACGAGTTTATTAGTATTTGGGCATTTTGATCCAGAAACTATTCAAATCAACTCTGGTCTTGTATATATATGTATATATTTTAATACATTGTTCTCCAAGCATCATGCAGCTGTGTTCTTATTTTCCAGGAAGAGTTCCGGAAGGCCATATTACAAACGGGGCCACCAGAAAATTTTGCTCTGCAGACAGTTCAAGATGTTATCAAACCTCAGGTAGCTACACTAAAACGTCGGACTAATTGTATGGCATTAAAATAACACCTCACAAGTTTGTATAGAGTTCATTGAGTATTGAATGTTTTAAAGTCAGATGGAAAGTGCAAGTTTGACCATAAATTTAGAGTTGAAAAGTTTTTTGGTTTTTCTGGGGAGTGAGTGTTCTGTTCTAGTTTTTTTCTTCTCATTGGATCATTATTATCACTATATATAAGAGACTGAAAGGATTTAATGATCGAAAGAGTATATACACACACGAAAAAGAAGAGAAGGCTGTGGATAAGGCATCTCCTCTGGCCTCCCAGCACTCAAGAATTAGGGCTTACAAAAGGGCCCATCCGCAATAAGGATACTCAAGAATGGTGACTTCCTTCCCTCGCCATTTTCCTGCAAGAAATCATTTTTCTTTCTCCCAGAAAAATTCTTGTTAGAGTTGACTGACCCCCTGGGAGCATGAGGACCCTCTCCACTTGAATGGTTAATCTAAGGGCCCAATGACCTTGTTTTGAGCACCATTCTTTTGATCGATAGGTATCCTAAAAGTGAAGACTTAAGAATTTTTAAGCTTGACATCATAATTCCTAAATATCTAGAACAAAGTCTTTGACTTGAGAGAGCATGTTGGATGAAGTTTGGCCTTTGGCTAGGTTCAAGGCCTCTTTTTTGGTGCCTGTTTCTAAGGAGTTACTATCCGTTATCACTTATTCTTATCAACTTGGAGCTGTCGTTCATTACTAGTTTAAAGTTTTTGTGTAGCCTTATTTTGTTTTGGTTTTGTATTTGTAGGTCCCTCTATATATGTTCATTGATTTTAAATGAAGGCTTGGTTTATTGTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTATTTCCCCTTAGATCTTTCTTTTACTTAGATTAATCCTTTATCTTTCATATGACAGAAGCTCACAAAATTGGCTCAAGATGAAAATCAGTTGCTGGAGAATATTCTAAGGCGATTACTTCAAGAATTGGTGGTAAGCTAAACTTTGGAGCTTGTTTAATTGAGTGGTTAAAGGTGATCTTGAAAGCTAGAACTATGCTCCGTTTTCTTGTTAATCTAACTATCTTGGGAGGTCCTACTATATAGAAATTGAAAATATGTAAATTACATACACAACAGTTTGTCTCATAATCAAGACCCTTTTTTTTTTTAATTTGTTATTTATTTTTTATGTTTATGTCTAGTGATTTAGACAAATTTCAAATCCTAAACCATGGGAGAGTCAACATAGAGGAGGTACAGAGAAGGTTTCTTAATACGGCTCTTAGCCTATTGTGTTGTATTGTTTGCAATAAGAATGGAAAAGCCAGGACCATTTATTCATCCTTCGTCAATACAGTAATTTCTGCTGGATAGTCTTGTTTTCCGAATTAAACATGGTCAGGTCAATCATATTATGCCTAAGAAAACTAGTAAGATTGTTTCGTGGCCACAAGTTGAGAAAGCAGGCAAAAGCATTTGGCTGAGCGCAGAAAAGTCTTTGGGAGCTGCTGTGGAATGGAGCAATCAGATTATTTGAGAAATTTAGAGATGGAAGGAAACTCTTTTTGTTTGTTTTGTGTGTGATTATATAGTTCTATAACGGACATTATTTGTTAAAAAAGGAAGGTTGATTAATTATTTTAGGTTTCTTCTAACATCTAGACATTAACACCAAGGAATAAAACCAATTTATTTTACTTGGTACTTCAAGTTCAAACTTTAAAAAGAAACAGTTTTTGTTCATTATGGACACGTCTTTCTTGTCTCCATCCTTATATTAAATGGAATATTTATCAGTTTCTCTTGAAATAAAAGTGTATTAATTCAATGGGATAAAATGGAAATGATGAGAAGAATATTAGCGGAAAGTTATCCATTGGTCAGGATGAGTGTTTTATTCTGTTTCTAGATTTCAAATGTGGATACCATTCTTCTGCCTCACACTTATATTTTCTAGTATTGTTGGAGATAAGTCTATTTTCAATTGGATATTCGTGCAGTCATCTGCAGCTCAATCAGCGGAGCCAATAATGCAGTATGGGATGTCTATTGATGACAACGAAACTTCTCAGGGTCATATTCCGCGCCTTCTAGGTATTACATTATTTTAGACTCAAACTTTTTGTTGTAACCTAAAGATCTAATTTTCATTTATTTTTCTGATAGGAAATAATATTTATAGATATGATTTTGATTTTTTTTATGATATGATTTATTAATTATTGTGTATTTAAAAGAAGTAGCAGATTTTAATTGCTGATTTTTTTCTTTTCTAAAAGATTGATACCTGAGAATCACAAAAACAGATAGACGATGGCAAGGATGTGTTTTTTTTTTCTTCTTAAAAAACCACTTCACGATGAAGAAAAAAAAGTACAAGAAGACCATAAAAATGTAGAAGCGTGAAATGAAGGAGCCTCCAAAAAATAGTTGCAATGACAAGAATATGGCACAATCAAATTGTCATTTTCCTGAACGTAGGAAGACGTGGAAATGTATTGATTAACATGAGCTTTAGTGAGGGCTCGGGACTTGTGGTGTTCTTTCTTTACCAAACAATTTTTTGATCCTCTTCCGTGCAGTCCAAACGAGGTTGAGAGTTATTATTTGCCCTCCATCATAATTCACTTGGTATTTGGCCACTAGATGATTCTTTGTTCTCTCTGGTTAGTGTGTATCCATTATTTATTAAAAGTGAGGGTACCTTGAACATGGATTGTTAAGGCTTATTTCTGTACAAGCAATTCATAACTTTTAAAGATAGTTAAGTCTTCAGATTTTTCCTTAAAAAAAGACACATATTTCAACCATAAATATGATATGATGCAAGTAATGAAACCAAGATTTCAAGATCTCAAGATCTTCAAACTGCAATTTAGAGTCCAAGAAGCCATGCAATGTTCGCCATTCCTTGGTTCATATCATGAATAAATGCTTATTGTGTACTTTAACTTCCATTGGAACATGGGTTTATCAGTGCAAAACATCAGAGCTTAATGACATTTTTGTCCTCTAGGATTTTCCTTGCAGAAATTGTTAATGATGTTGTTCGCTAACAACACATCCTTCACAAACTTCACATCCTTCACAAAGTTCACATGGAGCTTTCATCGGTAGAGGACCAAGCACCACAATTTTCCACCTCTTGAAGTTTAGATGATAATAGGAAAAATCCCAAGCCATTCAACATCCTTCCATTTTGTGTGGAAGCATGAATGAGTGATCTTATGTAGATAAATTGAGAACCTACCATGAGTCGTCGTGTTAGCTTGGCAATTAGCCCAATGTGCATCATGATTTCAACATACTCCACCCTTAACAAATCTTATGTCTCTATCAGGAAAACATGATCTTATATGCTTGAGCACCTGGACTCCATATCTTGGATCCTGTTTCTTTAAATCCTTAATTTTCAAGACTGATAGCTGGATTGAGACGAAATTTTTGAACATTAATGGATGCATCTTTGTTTGGAATTGTCCACAATTATGTAGTTTTGACTAGGTATTTTACTTGTAGTCTGAAGGTTTTACTGCATTGGAACTGCACTAATGATGAAAATGTTTGTATCTAATCCTTCAGCATTCGGGCACATTTTAATTACTTTAATGTTTTCATTCTTTCCTTAGACATTGTTCTGTATCTTTGTGAGAAAGAGCATGTCGAAGGAGGTATGATATTCCAGCTGTTGGAGGATCTGACTGAAATGTCAACATTGAGGAACTGCAAAGATATTTTTGGTTACATTGAGAGTAAACAAGATATATTGGGAAAGGTTTCCTCTTGTACTGAAATACAACTTTTCCATTTTTCTTTTAAGTAAATTTTAAACTCCCAGATATTCTTTGTCCCTTTATTTGCTTTGAAATGGCATGGCTCTTTTGTACACAGCAAGAGCTTTTTGCTCGTGGAAAACTTGTCATGTTGAGAACGTGCAATCAATTGCTTCGCCGTCTATCAAAGGTACTAAATTGTATTGCAATTGCATTATTTTTAATCTTTGAAGTCTCATTTTGAAAATTTTCTAGTGGTTCACATGCACAGAACTTGAGGAAGAAGTTCTTTTATTTTCTCCTTTTCTCTCCTTTC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ATGGAAGAGTTCCGGAAGGCCATATTACAAACGGGGCCACCAGAAAATTTTGCTCTGCAGACAGTTCAAGATGTTATCAAACCTCAGAAGCTCACAAAATTGGCTCAAGATGAAAATCAGTTGCTGGAGAATATTCTAAGGCGATTACTTCAAGAATTGGTGTCATCTGCAGCTCAATCAGCGGAGCCAATAATGCAGTATGGGATGTCTATTGATGACAACGAAACTTCTCAGGGTCATATTCCGCGCCTTCTAGACATTGTTCTGTATCTTTGTGAGAAAGAGCATGTCGAAGGAGGTATGATATTCCAGCTGTTGGAGGATCTGACTGAAATGTCAACATTGAGGAACTGCAAAGATATTTTTGGTTACATTGAGAGTAAACAAGATATATTGGGAAAGCAAGAGCTTTTTGCTCGTGGAAAACTTGTCATGTTGAGAACGTGCAATCAATTGCTTCGCCGTCTATCAAAGGCAAGTGATGTGGTGTTTTGTGGACGCATTCTGATGTTTCTAGCACATTTTTTCCCTTTATCTGAACGTTCTGCTGTGAATATAAAAGGAGTGTTCAACACCTCCAATGAAACAAAATATGAGAAAGAACCCCCAGATGGCTTTTCTATTGATTTCAACTTTTACAAGACCTTTTGGAGTTTACAGGAATACTTCTGTAATCCTGCCTCCCTTACTCTTGCTTCAACAAAGTGGCAAAAGTTCACATCGAGTTTAACGGTTGTGTTGAATACCTTTGATGCACAACCTTTGTCTGATGAAGAGGGAGATGCGAACATGTTGGAGGAGGAGTCAGCAACCTTCAGCATAAAATATCTTACTAGTAGTAAACTGATGGGTTTAGAATTAAAGGATCCAAGTTTTCGACGCCACGTTCTTGTGCAGTGCCTTATATTGTTTGATTATCTAAAGGCCCCAGGAAAGAATGAGAAAGATGTTCCATCTGAAACCCTGAGAGAAGAAATTAAATCTTGTGAGGAGCGTGTGAAGAAGTTGCTTGAGGTGACACCGCCAAGAGGGAAAGAATTTCTTCAGAAGATTGAGCATATATTAGAACGTGAAAATAATTGGGTGTGGTGGAAACGTGATGGCTGCCCTCCTTTTGAAAAGCAACCAATTGAAAAGAAAACCACCCATGATGCAACTAAGAAACGTAGGCCAAGGTGGAGATTAGGGAACAAAGAACTCTCTCAATTGTGGAAGTGGGCTGATCAGAATCCGAATGCTTTGACTGATCCTCAACGTGTCCGCACTCCTGCAATTTCTGAGTATTGGAAACCCTTGGCAGAGGATATGGATGAGTCTGCTGGAATTGAAGCGGAATACCATCATAAAAGTAACCGAGTTTATTGCTGGAAAGGCCTTCGATTTTCAGCTCGGCAGGACTTGGAAGGATTTTCTCGATTCACCGACCATGGCATTGAAGGAGTCGTGCCTTTGGAACTCCTGCCACCCGATGTACGATCCAAATACCAAGCTAAACCAAATGAGAGATCTAAACGTGCTAAGAAGGAAGAAACGAAAGGGGCCGTGCGTCAAGCTGAAGAAAATCAGATGGCAACACCAGCTAGTGAGAATGATGGTGAAGGAACCAGAAGTGACCCTGATGGACCATCAGTGGCGATGGATGCCGATACAACCGTTGCTGCTGGCAGTGTATCTCAAGGCGGTACTCCAACTCCAGAAGAAAATAAACAAAGCTCTGACACCGATATTGGTCAAGAGGCAGGCCAGTTGGAAGCCGATGCCGAGGTAGAGCCGGGTATGATCGATGGCGAGACAGATGCAGAGGTTGATTTGGATACTGCAGTGATTCTTACGCGTAAAGTAGCTGTTTTGTTTGGCTGTTTCGGCTGCTACAAGACTGCTCATGCAGTCGAGTTGAGGATTATTAATGACCAGGAAGAGTTGCAGGTTCTTTTGTTGCTTATTAGTTGA MEEFRKAILQTGPPENFALQTVQDVIKPQKLTKLAQDENQLLENILRRLLQELVSSAAQSAEPIMQYGMSIDDNETSQGHIPRLLDIVLYLCEKEHVEGGMIFQLLEDLTEMSTLRNCKDIFGYIESKQDILGKQELFARGKLVMLRTCNQLLRRLSKASDVVFCGRILMFLAHFFPLSERSAVNIKGVFNTSNETKYEKEPPDGFSIDFNFYKTFWSLQEYFCNPASLTLASTKWQKFTSSLTVVLNTFDAQPLSDEEGDANMLEEESATFSIKYLTSSKLMGLELKDPSFRRHVLVQCLILFDYLKAPGKNEKDVPSETLREEIKSCEERVKKLLEVTPPRGKEFLQKIEHILERENNWVWWKRDGCPPFEKQPIEKKTTHDATKKRRPRWRLGNKELSQLWKWADQNPNALTDPQRVRTPAISEYWKPLAEDMDESAGIEAEYHHKSNRVYCWKGLRFSARQDLEGFSRFTDHGIEGVVPLELLPPDVRSKYQAKPNERSKRAKKEETKGAVRQAEENQMATPASENDGEGTRSDPDGPSVAMDADTTVAAGSVSQGGTPTPEENKQSSDTDIGQEAGQLEADAEVEPGMIDGETDAEVDLDTAVILTRKVAVLFGCFGCYKTAHAVELRIINDQEELQVLLLLIS Homology
BLAST of Carg14420 vs. NCBI nr
Match: KAG6573787.1 (THO complex subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7012863.1 THO complex subunit 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1286.6 bits (3328), Expect = 0.0e+00 Identity = 649/649 (100.00%), Postives = 649/649 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. NCBI nr
Match: XP_022945746.1 (THO complex subunit 1 [Cucurbita moschata] >XP_022945747.1 THO complex subunit 1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1207.2 bits (3122), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/607 (100.00%), Postives = 607/607 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. NCBI nr
Match: XP_023542342.1 (THO complex subunit 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023542343.1 THO complex subunit 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1206.0 bits (3119), Expect = 0.0e+00 Identity = 606/607 (99.84%), Postives = 607/607 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. NCBI nr
Match: XP_022966961.1 (THO complex subunit 1 [Cucurbita maxima] >XP_022966962.1 THO complex subunit 1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1198.7 bits (3100), Expect = 0.0e+00 Identity = 602/607 (99.18%), Postives = 604/607 (99.51%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. NCBI nr
Match: XP_022139144.1 (THO complex subunit 1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1157.9 bits (2994), Expect = 0.0e+00 Identity = 577/607 (95.06%), Postives = 595/607 (98.02%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93VM9 (THO complex subunit 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=THO1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 918.3 bits (2372), Expect = 4.8e-266 Identity = 459/604 (75.99%), Postives = 520/604 (86.09%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8R3N6 (THO complex subunit 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Thoc1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 223.0 bits (567), Expect = 9.7e-57 Identity = 140/411 (34.06%), Postives = 198/411 (48.18%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96FV9 (THO complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THOC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 222.2 bits (565), Expect = 1.7e-56 Identity = 141/411 (34.31%), Postives = 197/411 (47.93%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9URT2 (Uncharacterized protein P25A2.03 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=SPCP25A2.03 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 131.0 bits (328), Expect = 5.0e-29 Identity = 129/506 (25.49%), Postives = 223/506 (44.07%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G1S6 (THO complex subunit 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449893 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1207.2 bits (3122), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/607 (100.00%), Postives = 607/607 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HPE8 (THO complex subunit 1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466514 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1198.7 bits (3100), Expect = 0.0e+00 Identity = 602/607 (99.18%), Postives = 604/607 (99.51%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CC37 (THO complex subunit 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010121 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1157.9 bits (2994), Expect = 0.0e+00 Identity = 577/607 (95.06%), Postives = 595/607 (98.02%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KTL0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G407100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1136.3 bits (2938), Expect = 0.0e+00 Identity = 563/607 (92.75%), Postives = 586/607 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC63 (THO complex subunit 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499294 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1131.3 bits (2925), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/607 (92.42%), Postives = 584/607 (96.21%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. TAIR 10
Match: AT5G09860.1 (nuclear matrix protein-related ) HSP 1 Score: 918.3 bits (2372), Expect = 3.4e-267 Identity = 459/604 (75.99%), Postives = 520/604 (86.09%), Query Frame = 0
BLAST of Carg14420 vs. TAIR 10
Match: AT5G09860.2 (nuclear matrix protein-related ) HSP 1 Score: 912.9 bits (2358), Expect = 1.4e-265 Identity = 459/604 (75.99%), Postives = 519/604 (85.93%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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