Carg09771 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2

Overview
NameCarg09771
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationCarg_Chr14: 3003720 .. 3009042 (-)
RNA-Seq ExpressionCarg09771
SyntenyCarg09771
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GATAGCTACTCTCTCCAATATTCTGGTGTGTTGAGAGAATGGTAAAGAGTATTGCGATCGCCATCTGGGTATATATAAACCTTATCTCTGGATTAAGGTTGAGAGCGCTATGCCTGCATGTGAGGAACTACCTGTTTTTGAAAGAAACTGATCTTCTAAGATGTGGCTTGTAAATCCAGCTCAATCTGTGATTAATGGCGTCGATTAATGGGATCAAGGAGGCACCATTCAACTTAATTAGTGTCAAATTCGATGGTGAGTGTAATACTAAGGTTTTTCTGCGCTTGCTCGGGATTGTATGTTTTCAATTATAATGCAAATTGCGGCTCAAAATAGAACTGTTCTCATAGATTTTGTACTCACTAGTTTGGATTTGGGGAGAACTCAAGCTCTAATCGGAAGTATCATATCGCGTTGTTGTTTAGTCATCCGAAGTTTGTCAATCCTCTCGACGTTTACCCTAATTTGTTTCATAAAGTTTCATAGAATTAGGAATTTATGATTGGATAGGAGATAGTTAGATCTGATGTTTGAAAAACACGTACGAAGAATTAGGAATTTATAGTATGGCTAACCATTTGAAAACTTTCTTCTTTGAATTTTCATGCAATTTCCGATTGTTTTTGACAGAATCTTTATCGCCCAGCTGATATTTGCACAATTACAGAGTGAAACGCGAGAATGCAGATAGTTCTGGGTGATAGATTACTAGCGAAGAAGGTCTGTTCACTATGCTTCCAATTTAACATATTGCAATTTCCCTTCTATTTTGTTTATTGCATATGACCATCCTTCGTTGATATCTTTAGCACACACATTTACATGTTCTCCTAAAATCATCAGCAGTATACCATTTTGGAAAAAAAATGGCAAAAAAAAATTCAACTCAAAAACTTCATCTCTGCAAGGGTTCTTTCCTGGTGTTTAGCGTCAATGTCCTAAATATCGGTACCATGTATCTTGTGGTGGCATGGTTGCATTGATGCGTTACAATGACATCAAGTAGTAATAGACCAGTGCTACCGGCAGTGCAATGAGCAAGCCCAAGAGTACCCTGTAAACAAAACAAAACCTCATTTCAGTATGTAGTTTAGCTATATAACTTGTTTTTCCTGTCTTTGATTTTTTGGATGAAATGTTAGAAATTAATATGAAGCGAAGTTCTATCATCTGAGCCCATTTAGATACAAGAAATGATGAATGTTTGATTTGAAAATTACAATATTTACCCTGTGCTTAAAACATCTGGATGTATATTATACTCCTTGGCAAAGACAAATGGAACAATTCCTTGAGGAAGTGCTGCCTGTACCAATAAAGAAGAAAAAAGACGTCAAACAGAATTGTCAATCCTGCATGTGGACTTAGTAATACAAATTACAATGAACCTGCACAATTGCCACTTTGAGCAATCTGCCCCTAAGTCCTAGAGGAAATGAGCATGCTGCCATAAGTGCAGGCCCGATCAAGAATTTCATTCCCATGGCCACCAGTGTCATCTTTGTACCACATGCTATAATGCTACTCCGCGAACCCATGAACAGTCCTAATGAGCAAGACAACTTGAAGTCAAGTTTTTCTTCATTTACTTGATAGAACTTCTTGTAAAGTTTTCATTTCATACCTAAGCTGAACATAGCCATACCAAGTCCTCCAGTTGATAGAATTGTTATTGATCTGTCAATAACTTCTGGCAGTTTTACTCCCCACCTGAGAGCATGTTAGTTTCATCCCAATGCATCTTTAAGTTTTTTTTTTTGAAGTGAAAGTTATTGTTTTTAATTCACCTGAATCGTATGCTTGCCCAAATGAGTCCCAATATAGTTGCATGAGTATTGGGGTTGCTGATGAGCTTTCTAGCAACTGTTAAGAGAATGGTCCTAGTTTTGAGACTCCTCCTGCTTCTGTCTCTTGCCTCCTCAATTTCTTCTTTGGCTCGCTCTTCTTGAGTTATATCAATTTCTGCTTTTCAAAAAGGCAAACAGCATAACTAGAATGATTGAATCTGACAAAGTTAGCTTACACATTTTTGTTTCGTAAATTTATGTGAGAGTGTGAGATCCCACATTGGTTGGGGAGGAGAACTAAACATCCTTTAGAAGCGTGTGGAAACCTCTCCCTAGCAGACGCGTTTTAAAAACCTTGAGAGATAACTCGGAAAGCCCAAAGAGGACAATATCTGCTAGCGGTGGGCTTAGGCTGTTACAGAGAGTATTTTAAGTATTCTTTGTGCCAAATACACTGGATTAAGTATAGCACTCATGACTAATGGAAGTAGGAAGAGAATAAAAATTTAGGAAATGAGAGCAGTCAAGAAAAAGTTAAGCAAGTTCCCATTCTTGGTCTTACATATATGAAGTAATGTTATTTTGGTTGATAGCATGAATACAGCAGCCATTTCTGTTGAGGGAAGTCCTAATATTGTACATGAGACTCAAGCTGGGATGGTTATTGAAGTTCATGGGCATGAATATGACCATTTTTGTTTAAGGAATTCCTAAGCTTTACACAGCATGACCTATAAAGTAGGGGTGAATTGATTCTGTTTGTTACTATTTTAAAAAGCAATTCCAATGCCTACCTGTGGCTTCTGATGCTGGAGCTAAAGAAGCTGCTTTGGTGGTAGTAAACTCAAAGAGAAACAGTAATATGTTGTACCAAAGAATGCTCTGTAACACAACAATCTGGGCAAGAAGCACATCTGCTTCAGTGCCGTACATGGCCTTCAATACTGGGAGTCCAAGAATTAGAGTATTTGGCATGGTTGACAGAGAGAGACCAGTGATAATCCAATGCAAGCCTCCCCTAGAGGTGATTTTAGTGATAGCTCCCAGCAAAACAATAGCCAATATTTTCTGAAGGAAATCGGCCAATATCAGTTGCAGGTTCATTTTGTAGAGGTTGTTGTCTGAAATGACTTGAAATGATAACAGTGGGATTGAGAATTTTGCCACAAACTTGTTTATTCCAGAACATTGCTCCGCTGTGAAGAACTTCCACCATTTTACAGAGATGTAAGCTAACATCATGGCTACGTACAGAGGGACTGTGGCTGCCACAACATGATAGACATCAGACAACGAAATCATGGTGACCAGCAGAAGAAGGTTTGAAATTTTTTTTTGTGTTGTCTATAGAAATTCCTGGTTAATAAAGCACTTTTCTCTGCTTTTCTTGATTGCTTTATTAATCAATAAAAGCTCGGGTTTTGAGCCACTGTTCCTTGGAAGCCTCTTCAAAAGTTCCAATAATGCCCAGAATGACCTTCAGCTTGCTTATTTGTAGATCACAACAAGTCTATGTAGAATTTTTATAATATGAATTAAACAGCATATGCTACATGAGATTTTTTTTTAATAAGATTAAGAGATCCATTATGTTATACATTTATGAATCACCTTTTTCTAATCCCTCGTGTGATGGTTAGATAATGAGTATAATTATTGTAATAATCATGTGTAATAGCAGGGACTAATTAACTTATGAAAGTGGGGGTATTCTTGTCACTGTAAGCTAAAAGTAGATTCCAGAATTCTTGTACTCATGTGCTTTACATTTATCAGTTCTTTAAATAAAGAAGATCTAACTAGGCTGACATGATAACTCTATAACTTCATGCTTTAGTCTTTTACTTCATTTTGAAAGAACATTAAAAGGGATTTCCATTATTTTTTCAATTTTGTTTTCCATCTGGTCGACATGATAAAACATTCATTTTATTCAAAGTTTTTCACCCCTCCCCTCCTGTTCATCAACCGTATGCTTACACTTGGTCTTTCCTCGTGGTAGAATAATGCTTCAAGTAGTTTCCTTGTATGATTGGAAAGTGCCAGCGTGGACGCTGGGCCTTAAAGATGGGTGGATTGTGTGATCCCACATTGGTTGAGGAGGATAACGAAACATTCTTTATAAGGACGTGGAAACCTCCCCTATTAGACACGTTTTAAAACCTTAAGGAGAAGCCCAAAGAGGACAATATTTGCTAAGTAGACGTGTTTTAAAACCTTGAGGGGAAATCCAAAGACGACAATATCTGCTAGCGGTTAGCTTGGGCTGTTAGACCTTGTATGATTGGAAAGCTTGTATCGGGTCTTATATTCTAAATTTAACCTGCAAATTTGTAGGCTTTTGATAATTTCTTTTTTTGTTTATGTTGTAACAGTGGGAAGAAGGAATAAAGAACTGAATTGCAAGTGAAGTAATGGGAATAACAGTAGCAGAGTTCAATGAAGTTGTAAGATAAGAATTTTTCCTAAATATGGTCAAAAGTGTGAGAATAACTGTGAAGGGAAGGAATTGAACCTACTGTCTCTGTAGTTTTCTTTACAGTAAAGAGCTGAGAAACTGGAAGAAGCCATTGAATATTGATGACATCAGCGTGCTGCTTTTTAGAAGAATGATGCCAAAACCTTGTAAGTGTCTGAAAAGTAGCTCAAGAATTGGAACATGATGCCTTTTCCTATTCATTAGAATTAGATACTCCTTTCGTAACAGAAAAAAAAAAAGAAATTATTTGCAATAAATCAGAGAGGATTCATTTTTGATAATAGAAATTGCCAACTCGTTAGAAAGTCAAGACCATCTCATTCATTAGGGAACATAGAGTATGGAGTTAAAAAGTAGGATGATCAAAAGGCAGACAAACAACTTCATTTGAATGGCTGTGATTTGATGGCAATGTAGAATAGTGTGACATAGAATTTATTTTTCCTAGTGGCTAAATAGTTGTTCAAATTTGATTCTCCACATTACTTCAAATTCTTTGTGCTATAAAAATGGTGTGACATAGAATATCTTTTGACACTGACTTTGCCCACTGGTTTATGAAACACTGTTTGGTATCTGTCTTGGAAGGAGTTATGTTGTCTGCAACTTCGAGATTTCTAATTCTTTTGTACCTCAGCTGAAGATATTATGTTTCAAGCTTCTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTCACTTTTGTTTTGTTACTGTGCAGGACGTGACTTGGTTGATTTACACAACTTGAATTGGAAGGGAAGAATGAGTTCTTACTTTCCCTTTAAGATCATTTCCATAGGTTTGTAGCTAAGTTTGGTTAAATTATATTTTTACTCATGCGTTTGCTTTAACCTCTTGATAAAGATATTTTATTTTGAGGTAAATTTGGAATAGATGAACAAAATTTTGTTAGGACGAAATGGAAAATATTTCTTCCTGTTAGATAAATAGAGACGGGGCCAGATTATATTTTCCGTCCTCGTCTTCATTCCTATCATGGTTAATATAAATATATTTTCAACACATATTGAAATTGTCCGATGCTATATTAAACTAAAAAT

mRNA sequence

GATAGCTACTCTCTCCAATATTCTGGTGTGTTGAGAGAATGGTAAAGAGTATTGCGATCGCCATCTGGGTATATATAAACCTTATCTCTGGATTAAGGTTGAGAGCGCTATGCCTGCATGTGAGGAACTACCTGTTTTTGAAAGAAACTGATCTTCTAAGATGTGGCTTGTAAATCCAGCTCAATCTGTGATTAATGGCGTCGATTAATGGGATCAAGGAGGCACCATTCAACTTAATTAGTGTCAAATTCGATGGCCCGATCAAGAATTTCATTCCCATGGCCACCAGTGTCATCTTTGTACCACATGCTATAATGCTACTCCGCGAACCCATGAACAGTCCTAATGAGCAAGACAACTTGAAGTCAAGACGTGACTTGGTTGATTTACACAACTTGAATTGGAAGGGAAGAATGAGTTCTTACTTTCCCTTTAAGATCATTTCCATAGGTTTGTAGCTAAGTTTGGTTAAATTATATTTTTACTCATGCGTTTGCTTTAACCTCTTGATAAAGATATTTTATTTTGAGGTAAATTTGGAATAGATGAACAAAATTTTGTTAGGACGAAATGGAAAATATTTCTTCCTGTTAGATAAATAGAGACGGGGCCAGATTATATTTTCCGTCCTCGTCTTCATTCCTATCATGGTTAATATAAATATATTTTCAACACATATTGAAATTGTCCGATGCTATATTAAACTAAAAAT

Coding sequence (CDS)

ATGGCGTCGATTAATGGGATCAAGGAGGCACCATTCAACTTAATTAGTGTCAAATTCGATGGCCCGATCAAGAATTTCATTCCCATGGCCACCAGTGTCATCTTTGTACCACATGCTATAATGCTACTCCGCGAACCCATGAACAGTCCTAATGAGCAAGACAACTTGAAGTCAAGACGTGACTTGGTTGATTTACACAACTTGAATTGGAAGGGAAGAATGAGTTCTTACTTTCCCTTTAAGATCATTTCCATAGGTTTGTAG

Protein sequence

MASINGIKEAPFNLISVKFDGPIKNFIPMATSVIFVPHAIMLLREPMNSPNEQDNLKSRRDLVDLHNLNWKGRMSSYFPFKIISIGL
Homology
[Close]
BLAST of Carg09771 vs. NCBI nr
Match: KAG7017719.1 (hypothetical protein SDJN02_19585 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 178.7 bits (452), Expect = 2.1e-41
Identity = 87/87 (100.00%), Postives = 87/87 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MASINGIKEAPFNLISVKFDGPIKNFIPMATSVIFVPHAIMLLREPMNSPNEQDNLKSRR 60
          MASINGIKEAPFNLISVKFDGPIKNFIPMATSVIFVPHAIMLLREPMNSPNEQDNLKSRR
Sbjct: 1  MASINGIKEAPFNLISVKFDGPIKNFIPMATSVIFVPHAIMLLREPMNSPNEQDNLKSRR 60

Query: 61 DLVDLHNLNWKGRMSSYFPFKIISIGL 88
          DLVDLHNLNWKGRMSSYFPFKIISIGL
Sbjct: 61 DLVDLHNLNWKGRMSSYFPFKIISIGL 87

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Carg09771 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7017719.12.1e-41100.00hypothetical protein SDJN02_19585 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
BLAST of Carg09771 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Carg09771 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Carg09771 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Carg09771-RACarg09771-RAmRNA