Carg08511 (gene) Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGCGCCGTCATCGTCCTCAGCGTTTTCAGTGAGATCGTGGAGGACGGCGTTCGTATTACTACCGAGAGAGAGCGGTTCTTCAACTTCAATTTCCCAACTTCTTCTTTGATCTGACACCTAGGTATTCTTCTGATCCACTCCGACTGAGTTAATCGGGCCGCGGCGCACTAGTCCTTCCTCGCACCCAAGTATGAATTTCTCCGTGTACCTTTTCCTCTGAGGTATTAGTTAATCGAGGTCTTAAAAAATGCCATGGGTGAATCCACGTTTATTTTTTTTTGTGTGTGCATAGGTTTCATCAGATCTGCTGTTTCTCTTAGAAGTGGCGTACGTTCCTGCTTGCGCCGAGCCTGCAGGAGACGTTGCCCACTGCCTCTTCTCGGACTCATACATCTGAGGTGCATACTCCACATTTCGATTTCTATTTTTTATTTTTAACAGTTCTTTCTGGACATATTCTCCGGTCAGGGTATGAGCCTCGAATGGATGAATTGGCTGAAGTTGTGGTCTGTGTAGTAATTGTTCGTGGTTTTGCGGGTGAAGAATGTCCCCAACAATTTGACAATTATCTTTTTATCGACCAGTACTTTTGAGAATGCAAATATTATTTGGTTATGGGATTTGAAATCTTCAGTTAATCGGTGAATGTTTTGAGTAATAGATAGTCTATACTGGACACGATGCAAGTTGAATGCATCCAAATACGCGGAAGATAATATATAATCTATATATATATTTTTTGATAAGAAGGACGAATTTCTTAAGAGAGGACAGTGTCTGCAATTTGCCAAAGGGACATGTTATTCATGTTACGTTATCTACAAAAGAAGACCCGGAGACCAGCAATGTGTATATGAGTGAGAGAAGTAGTGGATCCACATGTGGTGAGAGCAGAATATGGTAAGGTGGGGACACATTTTCTATAAAGAGTGTTGGCTAGCTTCGGTCTTGCATGTTCTGGTGCGGAGTTAGTAGATGGTGTGGATAGTTCGGCGGAGTTTCGTTGATATCGTGGGGAGCGAGAGTGCATTTCGGGTGACGTGGTGCGGTAATGTGATGTGTGGCTATGCGAGTGAGTATATTATAAATAGGTTGACTCCTTAAGAGAGGAGAGGACCAGGCATATGTGGGATAGTTGTACTATCGTAGGTGAGTATGTGTGAGGGTGTTTGCGTGGTGGAAGTCATGATGGTGCTGAAAGGGTGGGTACGTGAGTCGGATTGTAGGAGGGTACGTATGGTGTGATCATATGATGAGGTAAGCCGGATGCCGCAAGGGATTAAGTGAGCATGGCGCATTGCGGTATATGAATAGTTGCGGTGTAGGTTGTGAGTAATCTTGTGTCGTACGGCGCATAGATTTATAAGAGTTTGATATTGTGTGAAGGAAGAGATGGGCTGGCGTGTGGTGAGTGGGGTGATGCATGTGACGGAGGATAAGCAATGGATGAGTATTGTTGTGTTGAGTTAACAGTAATCTTTGCCTGTGCCATAGGACGATCGATGAGGGAGAGGGAGGTACATAGCCAAGTTAGAAGTTTGGAAAGTGAGAGATGTGTATAGCGATTGGTAGACTTAGGGTTGTTGGTTTATAGTTCGTGGTCGTATGCCATTGTGTGGCGGGGTGGCGGTATGAGCGATTATAAGAGGTCGCGCTAATGAGGTCTCAGCTTTGAGTAGCGCTAATTGGAGCTTTAGTGTTAGCCGGAGTCTGATGTCCGTAGGAATGAGGACGTTACATGTTTGTGTAGGCTAGGGTGATTTCTGTCGGTCCATATTGTCTTTGCTAGTGTGAGGTTGTAGGATTGCGGCGTAGGCTGCGGCACACACGCATTGATCCGCGACGCGTCGAGTGGTCCAGATATGTGGGCGGAATAGCATAAAAGTTCGAATCGATTCGTGCGGTTGTGTGTATGAGGGAAAGACTCCGTTACTATGACATGCGGGACTAAAGTGGGGATAGCAGGGACGGGACCATTGTTGTCGGAGTATTTAGTAGAGTGGTGCCGTGTCAGGGCGCCTATCAGGTTGGTAGAGGAGGATGTAGGAATGTTGGTGGGGCTAAGATTGGGTGGCTGAGGTTGAATGGCGATTATGAGGTCAAGTAAGCTTAGGATGTGGCAAGAGAGCTGATCATTGGTTTGGCGTGAGTAGATGATGCAATCGGAAATCTAGAATAGAGGTTCAGTCCTAGATGCAGTAGTGAAGCCACCACTCAGCCCCACTCCTTATTGGTGTAGCAACGAGGACATGCGTGATGAGGATGGTGTGTCGGATGTGTACTGTGATGTGTCGTGTATTCTTAGTTGAGTAGAGTATAGAGCTATTGGATTGGATCTGGAAGAGGGCGTAGGAATTGATAGCGTGACGAGTGTATTATAGTTTGGGATGAGAGATATGCCGTTTGATGTTTTGTGCTGACTTAATGACGATCGCAGTCTAAGATTATTAGGAGTAGGTAGAGAATCGGTACACGTGTGTAGCTGTAGTGGGGCGAGTATGTTGTAGAGATTCGGTGGCACGAAAGTATCGATTGTGTAATGTTAGAGGGAGTGTTCGCGAGGTAGTAAATGAGGTGAAGGTGTGTGATGACAATCAGTTGGAGAGCCAGGTATTAGTGCACATGAGACTGTGAATGTGGCAGTTAGGTCTGCTAGAGGGTAGTGTGCATGTAGTGCAAATGTGTAGTGGTGAGATTACAGTAGGCAGATCGTAGTGGAAGGTGGTGTGACTACGACAAAAGATACATTCCTAAATGATGAGGAATTCGAGTAGTGCATATTTTTTATATAAACATTTTTTAACCTTTGCTGTCTTAACGTTGTTCTTTCCCTGCCTTCTGAAATCTTCGTTTTCTCTAATTATTAATATTCTTGCACCCAATGCAGATCCACGGTATTTCTTATCAAGTTGTTCTTGAATTTAGTTCTTCCTCTTGGAACCTGCTTCTTCAATATTTTGGAGACGCGACCCAATGCATACTTGGAAAGCTTCATATTCCAGGAAATTATGCTCAAATAAGGACCGTCTCGGAATCTTTGGAGATTGTAAGGTTAGCTTCCCTTTTCTCTCCTGTTAGCTTGGGGAAATAGTACTCTGCTGCTTCCACTTCTACACACTAGGCCAGCATTTTGTCATTTGGGCCAAAAGTCATGTTTGCTCATCTGAGTAAATTTATTGAATTTTGTGATCTATATGGTGGGAAAGGGGAACTTTTGTTTGCTTTGTCATTTGTTGAGAGTGAAGCAAACTTTAAACTCTTTGACCTAAACACTGCAGAAAATACCGTCTACTTTGCTAGAGTGCAGATTTTATTTTATTTTTTAATGTCCTGGATGCACTGGACGTTCAATCATTACCGATGGTCTCTCTCTCTGTCTCAAGAATCCCTAGATCTTGCTTGTTAATTTGGATATGTTGTTTGTGTGGCAAAGGTGAGAAGAATGTGGTTTGTTCTAATTGTTTTCTTCATTTGCCAACTCTTCATGTATAAACTCAGGATTTATGGTAGGCTAGGCTGGTTACTTTTCAAAGTGTGGACACGTTTTCATTGCGGAGAGGGAGAGAGAAAGAGTTCATAAAGCTGAATAAAGGGAAAAAATAATTTTCATTGTGATTTTCTAATTATCTTTTTGATGCACGTGGAAAGAGAAACAACGTAATTTTTGAATATATATGGGATGCTATAGCTGCTATTCGGTTGAATTCACTTCATAGCTTCTCTTGGGATTTCTTTGATTAAAGAATCTCAAAGTTGTTGTTTGTTTATGATTTGGTGCTTGTATTTTGTAGTGTTTCCCTTGTATGGACTTTTGATCAATTGTGCACATTGTTTTTATCCTCTTAGTATCGGATATTTTCTTTCTGCTTTTAGTTAATTTTCTTTTTCTGGTTCCTTAAAAAATTGTCTCTTTTTGCAGCTACGTTGTCTGTTCACAACAGCGCAAATTTTTACCAGCAGAAGATATCCAGCTCTCGAAGTTTTTGCTTTCTGTGATTGCTGGCTCTCAATCAGCAATATTTCCCTCGTCAAGTTCAATCATTAGACATGGTTATACCGCTGAAATTGTGAAAAATGTTACCAAATGCAACAGTTTATGGGATGTTCAGGCTGTAGCCTTTGATCTACTTAGTCAGGCCATCACAAGTCTGGGGTCATATTTCCCAGTTGATGTTTGGAAGTCAACAATTCAGGTAGAAACAATTCTCTTACATTTGTAGTTTTTCATATATGTATTTGTAACAAGTGGAACATATTCAATTAGAATGATTTGCAAGCAATATATAGGCAGTCAGCCAGTAAGGAAATAGTGTTTAGTCTCTACACTCTAGGAACAGTTAAGAAGCTAACTATTGAAATATTTATGAACCAACACAGGAATAGGATTACTAAATCAGTTGTTGGTGATGATTCCTTGATGCCATTGTTAGCCTGGATAGTTTGACAACAATGTATGATGTCTACAAGTCTAATAGGATGAGTAAGTGATCAAATGTCCAGAATCTGGCTAGGTTAAGTGTGGGGGTAGGGAATCTATCAAGAAAAGAGAGTTGGGTTATGAGCCTGTTGACAACAAAGCGTCAACAAAATCACAAAAGAAATTACAAAATCACATCTCAAACACCAACTGATATGAACCAAGACATCTCAATCATGCAATATGAACTTTAAGGAAGATGTAAGGAAGATGTGAAAAAAATGTTGTTCAAATTACCACAAGATAAACTCAAGTTGCAATTCATTCCATATAAAAAAGAATCAAGCTTCATTTATTCTTGGATAGTTACAAATTTTGGGTGGATGATAATCTAGAGTTATGGTGATTCGTTAACGTAGTTTAAGACTTTTTATTTACTTTAAGTTTGCATATTTACATAGTGACTAATTATGGTCATAAAGTATGAAAGTTACCACTCTGGAAATGACTTATGGAAGGTCAAGGGTTTTCTTGTGGGGCTATATAAAGCCATGTATGTTGTTTTTATAAAG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Homology
BLAST of Carg08511 vs. NCBI nr
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BLAST of Carg08511 vs. NCBI nr
Match: XP_023534365.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2080.1 bits (5388), Expect = 0.0e+00 Identity = 1093/1166 (93.74%), Postives = 1102/1166 (94.51%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. NCBI nr
Match: XP_022957979.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2072.7 bits (5369), Expect = 0.0e+00 Identity = 1091/1166 (93.57%), Postives = 1096/1166 (94.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. NCBI nr
Match: XP_022996268.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2070.4 bits (5363), Expect = 0.0e+00 Identity = 1089/1166 (93.40%), Postives = 1097/1166 (94.08%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. NCBI nr
Match: KAG6605627.1 (HEAT repeat-containing protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1994.2 bits (5165), Expect = 0.0e+00 Identity = 1060/1166 (90.91%), Postives = 1072/1166 (91.94%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R5R2 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=HEATR6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 1.6e-38 Identity = 199/835 (23.83%), Postives = 353/835 (42.28%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AI08 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEATR6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 162.5 bits (410), Expect = 2.7e-38 Identity = 202/842 (23.99%), Postives = 358/842 (42.52%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1EC95 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Heatr6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 158.3 bits (399), Expect = 5.1e-37 Identity = 190/811 (23.43%), Postives = 349/811 (43.03%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6P1G0 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Heatr6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 156.8 bits (395), Expect = 1.5e-36 Identity = 193/819 (23.57%), Postives = 349/819 (42.61%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZY56 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=heatr6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 3.3e-36 Identity = 187/810 (23.09%), Postives = 347/810 (42.84%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H3P0 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459349 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2072.7 bits (5369), Expect = 0.0e+00 Identity = 1091/1166 (93.57%), Postives = 1096/1166 (94.00%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KAB7 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491546 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2070.4 bits (5363), Expect = 0.0e+00 Identity = 1089/1166 (93.40%), Postives = 1097/1166 (94.08%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H262 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459349 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1934.1 bits (5009), Expect = 0.0e+00 Identity = 1023/1097 (93.25%), Postives = 1027/1097 (93.62%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K894 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491546 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1931.8 bits (5003), Expect = 0.0e+00 Identity = 1021/1097 (93.07%), Postives = 1028/1097 (93.71%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H0R1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459349 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1888.2 bits (4890), Expect = 0.0e+00 Identity = 998/1072 (93.10%), Postives = 1003/1072 (93.56%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. TAIR 10
Match: AT4G38120.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 922.5 bits (2383), Expect = 3.1e-268 Identity = 536/1096 (48.91%), Postives = 725/1096 (66.15%), Query Frame = 0
BLAST of Carg08511 vs. TAIR 10
Match: AT4G38120.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 239.2 bits (609), Expect = 1.6e-62 Identity = 151/368 (41.03%), Postives = 216/368 (58.70%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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