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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Gene sequence (with intron) Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. ATGGATCTTCCCAGGTGCTATGTCCACGTGAAGCTAAGTCGTCAGCCTAGGAAAAGTTTGGTGTGACAATTACACATCTGCCCCCACTTAGATTTATTGACTAATTTAGAACCCAATAATTAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTGAGATGGTAAATACAATACAAGTGCCTTTCAATAATTTATTAGCCTTGGGTTGGGGTGGGGTTTTGTGGAACATAAGAAAGGGAACATTATTTCAACCCAACATTTAATAATATATCAATAAATTGTTTCTTTGTCTTCACTTTATTTATTATTATTTCTTTTTTATTCTCAACCATGTTCAAATTGACATAAAATAATTAAATAATAATCTATTTAAATGTAAGATTAATTTTAATATAATTATTTATTTATTTATTTTAAATTTGACTAATAATTCAAAAAATATATGATTTGATATACATGAACCCAATATGGGCTTAAACGTTGGGCTTTTAAACTGGGCTCAAAGCCTCTATTTGGGCTTTTTAAATGGGCTTAAAGCCTTTATCGTGATTAATGGATAGCCCATGGATCCAGACCATCTTGAACCTTTCCTAACACCAGCTTGTGAGCCAAGTACAACCTAACATGAGTATAATACAATATTTAATTTTATTAGTTTTTTTTTAATTTAAAAATCTAAATTGGAAATTTCGGCTCCCATCTCCACAAAAATTAAATGGAAACTAAACAAGAATTCGAGACGTTCAATAAGATTTTACATTTTAAATTTTATATTTAATGTATTTTAATTTTTAATTTAGTATCTAATAAATTTAATAAATTTAAGTCGTATTTAAAATTTAAAAGTTTATAAATTTATTCGACATAAAATTAAAATTTATCATTTAAAGAACTTTTTGGACGGTGGTAACAATTTATCAACATTTTTTATCATCAAAAATTTATTAGAAGTCAATTAAAAATGGTTAAATTATAAATTTAATTTTTTTTTTCAGTTTTATATTTAATAAATTAATGAATTTTAAATGTTTAATAAATTTATAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGAATTCAATTAAAAGGTAAGATGTAAATTTATAATTTTAAGAATTTTTGAAAGTAAGACCGTCGTTGATTCCAAAAACCCTCACTCACAGGTCCCAAAACCCTCACCTCCAGCTATCGTCTCCACCACCGACGGCGATAATGTTGCACCTGTGGGCTTCCTCCTCCGTCCTGCAAGAACCGTCGACTATCCTCTGTAAGTTTCTTGAATTTTCAACAATTCTCTCTCTCACTGTCTTACTTTGAAAATGATCATTTGGTTCTGGAAGATTATGTGTAAATCTTGTTCCTCGTCTTTTGCTGTGGTTTTGAGATTGGAGGTGGGTTAGATCAGATTTCTCTTTGCTCTAATCTGAGTTTCGTTGATTTGAATTGATCCTCTATCCTTGTTGCGGGTTGTGCGAGTTGACATTCTTCCTTTTCTGTCTCCATGTTTCGAGCTCGCCTTGTGTGTATTAAGCCGCCTCACCCTTTGGTAATTAGGGTTTGATTTCATTATTTTTACATGTCCTTGCCGCATTGAAGCATTTCTACTCCTTGTTGCCTTGCTGTCGCCGCTCGCCGCGCGAATGATGTTAGAGCAGAGAGGAAGAGCGATGTTGATATTGCGGAGAAGAAGAAAGCGGGAAAGTTGAGGATTGATGAACTTGACCAATAA mRNA sequence ATGGATCTTCCCAGGTGCTATGTCCACGTGAAGCTAAGTCGTCAGCCTAGGAAAAGTTTGGTCCCAAAACCCTCACCTCCAGCTATCGTCTCCACCACCGACGGCGATAATGTTGCACCTGTGGGCTTCCTCCTCCGTCCTGCAAGAACCGTCGACTATCCTCTCATTTCTACTCCTTGTTGCCTTGCTGTCGCCGCTCGCCGCGCGAATGATGTTAGAGCAGAGAGGAAGAGCGATGTTGATATTGCGGAGAAGAAGAAAGCGGGAAAGTTGAGGATTGATGAACTTGACCAATAA Coding sequence (CDS) ATGGATCTTCCCAGGTGCTATGTCCACGTGAAGCTAAGTCGTCAGCCTAGGAAAAGTTTGGTCCCAAAACCCTCACCTCCAGCTATCGTCTCCACCACCGACGGCGATAATGTTGCACCTGTGGGCTTCCTCCTCCGTCCTGCAAGAACCGTCGACTATCCTCTCATTTCTACTCCTTGTTGCCTTGCTGTCGCCGCTCGCCGCGCGAATGATGTTAGAGCAGAGAGGAAGAGCGATGTTGATATTGCGGAGAAGAAGAAAGCGGGAAAGTTGAGGATTGATGAACTTGACCAATAA Protein sequence MDLPRCYVHVKLSRQPRKSLVPKPSPPAIVSTTDGDNVAPVGFLLRPARTVDYPLISTPCCLAVAARRANDVRAERKSDVDIAEKKKAGKLRIDELDQ
Homology
BLAST of Carg05323 vs. NCBI nr
Match: KAG7027158.1 (hypothetical protein SDJN02_11169, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 195.3 bits (495), Expect = 2.5e-46 Identity = 98/98 (100.00%), Postives = 98/98 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MDLPRCYVHVKLSRQPRKSLVPKPSPPAIVSTTDGDNVAPVGFLLRPARTVDYPLISTPC 60
MDLPRCYVHVKLSRQPRKSLVPKPSPPAIVSTTDGDNVAPVGFLLRPARTVDYPLISTPC
Sbjct: 1 MDLPRCYVHVKLSRQPRKSLVPKPSPPAIVSTTDGDNVAPVGFLLRPARTVDYPLISTPC 60
Query: 61 CLAVAARRANDVRAERKSDVDIAEKKKAGKLRIDELDQ 99
CLAVAARRANDVRAERKSDVDIAEKKKAGKLRIDELDQ
Sbjct: 61 CLAVAARRANDVRAERKSDVDIAEKKKAGKLRIDELDQ 98
BLAST of Carg05323 vs. NCBI nr
Match: KAG6595143.1 (50S ribosomal protein L21, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 117.1 bits (292), Expect = 8.6e-23 Identity = 55/56 (98.21%), Postives = 56/56 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MDLPRCYVHVKLSRQPRKSLVPKPSPPAIVSTTDGDNVAPVGFLLRPARTVDYPLI 57
MDLPRCYVHVKLSRQPRKSLVPKPSPPAIVSTTDGDNVAPVGFLLRPARTVDYPL+
Sbjct: 1 MDLPRCYVHVKLSRQPRKSLVPKPSPPAIVSTTDGDNVAPVGFLLRPARTVDYPLL 56
The following BLAST results are available for this feature:
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| KAG7027158.1 | 2.5e-46 | 100.00 | hypothetical protein SDJN02_11169, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... | [more] |
| KAG6595143.1 | 8.6e-23 | 98.21 | 50S ribosomal protein L21, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp.... | [more] |
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
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| Match Name | E-value | Identity | Description | |
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Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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