CaUC11G209810 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAAAAAAAACGACAGTACGAGGACCTTCTAAAATCATTTCCCTCTTCCACTTTCTTCTTCATTCTTCAACCCGTCTCCTTCTCAGAGCTTCCATTAGGCAGCATCGAATCACACAGCCTCCTTCAGCTCAGCTGAACAGAAGCTTACTTCACTTCTGGGAGCAATGGTTGGAGCAGGAGGCTTTCTCCCTCTTCATTGTTTCTGGTCCCGGAAGTCCGAACCCGAACCCGAACCTGATCGCGACCCGGTCCTGCTCGTCACCGGCATTGGGGGCTCCATTCTTCACGCCAAGAACAAGAAACTGTTCGGCTTAGAGACCCGTGTGTGGGTGCGGATCTTCTTGTCCGACCTAATGTTTCGTGAGAAGCTCATTTCCCTCTACAATCCCGACACAGGTCCTTACTCATTCCCCTTCCAATCCCAATCCTAATTCTCTGTGTCTTTGTTTCATTTCATAGCTTTTAGTTTTGAGCGTTTGGTTGCTGCTATGGAAGTGATGGAATCTAGATGGTGTTAGATTATTCCATTTGCACGTGTTTTGGGGCTTTTTTTTAGGGTGGGTGAAGTTTGGGAGCACTTTTTTCTTCTTTTTTTTAAAAGGGAAGTGTTTTAATGTGTTTACTTACGTTATGCTTTCATAAATTTTTATTTTGTTGCACTTAATCCAGTCCAAAAGTGATTCTATTCATCATTATTTTTTTTCTCTTATTTTCTTAAAAGGGAATTTAATCAAATTTTCCTGTTACACTATAGTAAAAAATAAGTGATTCTATTAATCACAAATTTGTTTTTTTCCCCTCAAGATTCTTGGTAAACACTTTTTTCCCCCTTCTTCTTTTAAATGTTTTAAAATCAATATGATTCTTTTTTTTAAAAAAATAAACTAATGCATAAAAAATGGAAAAAAAACATTTAGTTGTCTAAATAATTTCTTATTGAGCACCATTCTGTTTACCAAGTCAAACTGCTGGTAGGATAATGAAAGAAACCAGATAATAGAACTTGGAAATTATATTGAAATATCAATAGGAAAATAAAGTAAGATACTTCCCAGTGTTTCAACTTTCAAGATACCCTCTTCTAAACACTCAAGACTAAAGCTAAACCACTACAGAATCCCCTTCTATTTTTAGCAAACTCTTAATACCTTATCTTGCCCATTACTTTATTTCCCTGGATGGCTATTCTGAACAGAGAAGTCTTAAAATATTATTCATTAGGTTACCCGAAATGATGCTTTTTTTCAAAATTTTTAATTTTTTAAAATTTATTTTATATATATATATCAAGGCTGTTTTCAAATATAGGAAATGAACCAAAATATTTACAAATATAGCAAAATTTTACTGTCTATTTGCGATAGATTGTGATAGACTACTATCTATGTCTATCTGTGTCATGATAGATACAACATATCTAAAATTTGTAGTCTATCCGGATCTATTGGAAACTGTGATATTTTGCTATTATTTGTAGTTTTGTCATTTAAAATAATTTTTCATATATATATTTACACTACTATTAGTCATGAGTGATGCCAATGTGTTGTTCCTTCCCTGGTTCAAATAGGAAGTGGTTGCATTAATTTGCAGTGAAATTCTTGTAATATTCAGATCTGGGGTTTTAACTACAAGATCAGCCTTCATCAAACTCACTGAAACTTCCCAAAAGCTTAAAACCCCTCTGATTGATATAATATGGAAGTTTAATGTTCCCAAGAAGATTAAAGTTTTTCTTTGGAGTTTGGCTTATAAAATATTGAACAAAAACGAAAGAGTTTGCTAACTGGAGCCTTTCACCTTCGGCAAGTAGCTTGTGCTTCAGAGAAGAAGAAAATATTGATCATTTATTTATCCAGTGCCCTTCTGCTTCAGGTGGTTGGAATCTTCTTTTAAATACTTGTGGTTTGCCTTTGTGTTTGCCAAATTCTGTGATGAAGTGGATTTTTGAAGCATTAAATGGTCGGAACCTTAATGGAAAAATTGAGGCTTTGTGGAAAATTGCGGTTCAAGCTTTCCTTTGGGAAGTTTGGAGGGAAGGGAATCGGAGGGTCTTGAAGATATGTCTGATACGTCTTACACTTTATTTATTTATTTATTTTTTAAGAAATGAATTCAACTATGAAATTATCCAAAGAGATAAAAAATTGGTCCCATTCAAAGGGAATACAAAAGATGTCTCCAATTTGCATCAAGGAAATTTAAACTATTACTTTTGAGGGGTTGTAAACTTTTACACCAAAAGAGAGCATTGGAAATATATAACTCTAAAACATCCCTTTAAGATCTTTCTTTACCTTGGAAAATTCTTGCATATCTTTCCTCCCAAATCTTCCATAAAACAACTCAAACCATGATGGACCATATGGGGGTGTTAGGTCTCCCAATTTCAAGTTGGTGGAGTTGGTTTTTATAGCCCACTTCATGTTTGGGCCACCGACTATATTAGTTGTGTTTACAACTATTTATTACATACATTAAATACTATTTCAAAACCCTCTTAGCTATAGTATTTACTATTTTCCACTCATCCTCTCTTTTTCTCTTTGCTATAGATTACAGTGTTTACTATTTCCTATCCAGACTAAAATAGTTTGCACCCCAAACACAGACTATAACTTGGACTAAAATAGTATGTACCCCAAACACAAACTAGCCACAGACTATGATAACCACAAACTATAATAACCAACTCAATGTCCCAAAACACCCCATATACTCTTTTGTAGACTTAAAGGATGATCAATAATTAACATCCTAAACCATGCAATAGAATCAGATGGAGGAGGTATGGACTAGCCGAAAGCAGAAAATAACTCAGCCCAAATCTTAGCAACAAATAGGCACTTGAAGAATATATGGTTCTGGTTTTCCTTATCTCTCTGGCAGAGCAACATCAAGATGGAGAGGTGGATCCGAGGTGGATCCGAGGTGGATCCAGGTGCATCTCTTTTGAAGCCTATCCATAGTACTAAGGCAAGAATGGACAATTCCCAAAGAAGAAATTTAATTCTTTTTGGGCAAGGAAACTTTGATATGTTTTTGTAAAGGTTCTGTGATGCTGACGAATTGGTAACAATGAGATGGGAAGTCAGTGAATTAACGGTGAAAGTACCGCTGTTGTTAAGCTTCCATTTCCAACTGTTGGGCCGGTGTGTGAGTTGAATGACAGGGACAAGCTGATTAAGGGAGACTCATTCGACAGTTCCATTATCTTTGAGATTTCTTTTAAAATTTAGAACCCACGAGCTGTTTCCGAGGTTCCAAAAGTTAGCAATGGAGGCTTTTTTAGATTCAGCAATGGGAAAAAGCCTTGGGCAACATTTTCTAAGGGCTTCATTCCCAATTCAAGGGTCAAATCAAAATGAAGCGGTTTTGCCATCCCCAGCAATGCACTGTATGTGGTTAAAAATAAGATCCTTCTACTGTATGTGGTTAAAAATAAGATCCTTCTTTTACTAATGTGATTCCATGGATTTTTTTTGAAGGAGATATGATGATTCAAGGAAGGTTTTTTTTTTTTATCACAATGATGAGAACCATACTTTGCCTTGATGGTTTTTCTCTAAGGAGCCCTTTTTCCTGTCTAAAGTGCCTAGTCCATTTAGTTAGAAGTTGAAAGTTTTGAAGAAGAGTATGCACTTTACTTGGCTAGCAGTGTATGGGAGGGTTAACACCATTGTTTATTTTGAGATTGGGCACAGCTGGTGCATTTTTGTGCAAGCATTCGTGGGAGGGATCTTGATCACTTGTTGGGGCTTTGTGCTTTTTAGTCTTAATGTACGTGACTTTTTGGAATGCTTTCAAAGTAAATTTGGCTCCTTGTTAGTGGATCAGGGATGCTTTTGTTGAGCTATTTCCTTATTCTCCATTCTTGAGGAGGGGGAGTGTTATGGAATTGATGAACAAAGAAAATAGGAAACTTAAAATAATAGAAAACCGACATATAGATTTACATGATTCACTTACAGTATGTTAGTTACATCCACGGGAAGAGGGAGAACAGTTTATTACTAGGAAGAATAATGCAGATTATAGAGTAAATGGTGCTTCTAGCGTTAGAGAGTTTATATAGTGCACTTCTCTAAACCATCATAATCATAAATAAATCGAAAATAATATAAATATGAGAAATATGAATTCAACTTAGGTTTTTTAATTTTTAGGATAAAGTTGCTACATGGGAGCAGGTTTGGATTGCCTCCACGCTATAATGCTTCTTTGTGGGCATCTATATCTTTTGTATGTAGTCTTCCCTTTTTTATTTTTGCCATTTGGAAGAGTTACCTCCACTTCTGGCCTTTCTTGTAGTTGCACTTTATTGAAAAAAGGAAAACCTTCCAATTTCAATCAGGATGGGTTTTCCAAGCGCATGGGGCAAAGAAGACTTTAAAGTGATTTTTTGCCATGTCGATTAGGTTAGTACCACACTTTCGAGACCTTTTAATTGAATATATACCAACAATAATGTCCATATAAACTATTCGAAGAAGGAAACTTCTCCACCTTTTGTTCTTGAGTTTGCAAAGTCTTATCTGAATTTCCTAACTGAACATCACAGGTTTTTTGTTTTTTCAGGCTGTACTGAATGCGTGGATGATAACATAGAAATTTTGGTCCCTGATGGTGATGATGGCCTGTATGCGATTGATATTTTAGATCCATCTTCGGTAAGATATCATGAAAATTTCTACTTAGGCCTTTATAACTTATTCATCATTTTATAGTGATAAATCGGTGAGCGAATGTCTCCCATTTTTTAACTTCACCAAATTCTCCCAAGTTGTGTGGTAACGTTTCTGTTATTAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTGAAAAATAGAAGTGTTTTACTTACTAATGTTTCTTGTTTCTCATTTTTCAGAAACGTTTCGATGATTGTGTAGTAATTTTAGAAACAATAAAATCAAGTTTATTATTTCTTGTTTTTTGTTTTTGTTTCTAGTTCTTTCAAAACATAAAGAAAA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ATGAGATGGGAAGTCAGTGAATTAACGGTGAAAGTACCGCTGTTGTTAAGCTTCCATTTCCAACTGTTGGGCCGAACCCACGAGCTGTTTCCGAGGTTCCAAAAGTTAGCAATGGAGGCTTTTTTAGATTCAGCAATGGGAAAAAGCCTTGGGCAACATTTTCTAAGGGCTTCATTCCCAATTCAAGGGTCAAATCAAAATGAAGCGGTTTTGCCATCCCCAGCAATGCACTGCTGTACTGAATGCGTGGATGATAACATAGAAATTTTGGTCCCTGATGGTGATGATGGCCTGTATGCGATTGATATTTTAGATCCATCTTCGGTGGTAAAATGCCTCCATGTGGATGACGTGTATCATTTTCATGATATGATTGATATGCTTGTTGGATGCGGGTACAAGAAGGGAACCACATTGTTTGGTTTTGGTTATGACTTCCGGCAGAGGGCATTGATTGTTCTTGGTGACAGAATTGGCAAAGCTATGGATGGTCTTAAAGCTAAGTTGGAAACTGCCAGTAAAGCTTCTGGTGGTAGAAAAGTGAATTTAATATCTCATTCTATGGGCGGGCTGCTAATTTCGTGTTTCATGTCACTCCATAATGATACTTTTTCCAGATATGTAAATAAGTGGATCTCTATAGCTTGCCCTTTCCAAGGTGCACCGGGATGCATCAATGATTGTCTGTTGACTGGATTGCAATTTGTTGAAGGCTTTGAAAGCCAATTTTTTGTATCTCGATGGACGTTTCACCAGCTGTTGGTTGAATGTCCTTCAATTTATGAGATGCTGGCAAATCTGGGATTCAATTGGCATGCACAACCACAGATCCAAGTTTGGCGAAAGAGTTCTGTCGATGGGAAAACTTCTGTTGATTTGAAGTCGTATGGCCCAACTGACAGTATTGCTTTATTTGAAGAAGCATTAAGAAATAACGAGATAAAATTTCATGGAAAGACCATTCCTCTGCCCTTCAACTTTGATATTCTCAAATGGGCTACTGGTACTCGCCAAGTAATTGATAGCGCAAGAATACCAGATGGAGTCGCCTTCTATAATATTTATGGAACATCATTCGATACACCTTTTGATGTGTGCTATGGCTCAGAGTCATTGCCGATTGAGGACTTGTCTGAAATCTGCCAAACTTTGCCTCAGTATTCCTATGTGGATGGAGATGGTACAGTTCCTAGTGAATCAGCCAAGGCTGATGGTTTTGAAGCAATTGAGAGAGTAGGAATCGCAGCAAGTCATCGAGGACTTTTGAAAGACGAAACAGTGTTTCAGTATATCCAGAAGTGGTTGGGAGTTGAAGAGAAGAAGACTAGTAAGCACCTAACAACTTCCAAAGTGGTCGATGCTTCTCTGAAGTAG MRWEVSELTVKVPLLLSFHFQLLGRTHELFPRFQKLAMEAFLDSAMGKSLGQHFLRASFPIQGSNQNEAVLPSPAMHCCTECVDDNIEILVPDGDDGLYAIDILDPSSVVKCLHVDDVYHFHDMIDMLVGCGYKKGTTLFGFGYDFRQRALIVLGDRIGKAMDGLKAKLETASKASGGRKVNLISHSMGGLLISCFMSLHNDTFSRYVNKWISIACPFQGAPGCINDCLLTGLQFVEGFESQFFVSRWTFHQLLVECPSIYEMLANLGFNWHAQPQIQVWRKSSVDGKTSVDLKSYGPTDSIALFEEALRNNEIKFHGKTIPLPFNFDILKWATGTRQVIDSARIPDGVAFYNIYGTSFDTPFDVCYGSESLPIEDLSEICQTLPQYSYVDGDGTVPSESAKADGFEAIERVGIAASHRGLLKDETVFQYIQKWLGVEEKKTSKHLTTSKVVDASLK Homology
BLAST of CaUC11G209810 vs. NCBI nr
Match: XP_004138893.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 731.9 bits (1888), Expect = 3.5e-207 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. NCBI nr
Match: XP_008441766.1 (PREDICTED: phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 730.3 bits (1884), Expect = 1.0e-206 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. NCBI nr
Match: KAA0051373.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK23849.1 phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 730.3 bits (1884), Expect = 1.0e-206 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. NCBI nr
Match: XP_038889823.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Benincasa hispida] >XP_038889824.1 phospholipase A(1) LCAT3 [Benincasa hispida] >XP_038889825.1 phospholipase A(1) LCAT3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 720.7 bits (1859), Expect = 8.0e-204 Identity = 345/375 (92.00%), Postives = 358/375 (95.47%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. NCBI nr
Match: XP_022933151.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 713.4 bits (1840), Expect = 1.3e-201 Identity = 337/378 (89.15%), Postives = 360/378 (95.24%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93V61 (Phospholipase A(1) LCAT3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LCAT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 535.4 bits (1378), Expect = 6.2e-151 Identity = 255/377 (67.64%), Postives = 305/377 (80.90%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q71N54 (Lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LCAT4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 381.7 bits (979), Expect = 1.1e-104 Identity = 182/363 (50.14%), Postives = 248/363 (68.32%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FZI8 (Lecithin-cholesterol acyltransferase-like 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LCAT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 9.7e-11 Identity = 77/316 (24.37%), Postives = 121/316 (38.29%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VEB4 (Phospholipase A2 group XV OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pla2g15 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 7.7e-08 Identity = 84/367 (22.89%), Postives = 139/367 (37.87%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8NCC3 (Phospholipase A2 group XV OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLA2G15 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 9.4e-06 Identity = 37/137 (27.01%), Postives = 66/137 (48.18%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LHR5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G093800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 731.9 bits (1888), Expect = 1.7e-207 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U650 (Phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold419G00130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 730.3 bits (1884), Expect = 4.9e-207 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3Q4 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485824 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 730.3 bits (1884), Expect = 4.9e-207 Identity = 350/378 (92.59%), Postives = 364/378 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EYB8 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439951 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 713.4 bits (1840), Expect = 6.2e-202 Identity = 337/378 (89.15%), Postives = 360/378 (95.24%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IEK6 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472543 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 708.8 bits (1828), Expect = 1.5e-200 Identity = 334/378 (88.36%), Postives = 360/378 (95.24%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. TAIR 10
Match: AT3G03310.1 (lecithin:cholesterol acyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 535.4 bits (1378), Expect = 4.4e-152 Identity = 255/377 (67.64%), Postives = 305/377 (80.90%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. TAIR 10
Match: AT4G19860.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 381.7 bits (979), Expect = 8.2e-106 Identity = 182/363 (50.14%), Postives = 248/363 (68.32%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. TAIR 10
Match: AT1G27480.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 6.9e-12 Identity = 77/316 (24.37%), Postives = 121/316 (38.29%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. TAIR 10
Match: AT3G03370.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DegP protease 7 (TAIR:AT3G03380.1); Has 55 Blast hits to 55 proteins in 11 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 3.9e-07 Identity = 28/51 (54.90%), Postives = 35/51 (68.63%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC11G209810 vs. TAIR 10
Match: AT3G03370.2 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DegP protease 7 (TAIR:AT3G03380.1). ) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 3.9e-07 Identity = 28/51 (54.90%), Postives = 35/51 (68.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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