CaUC09G171320 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC09G171320
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr09: 21565357 .. 21569305 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC09G171320
SyntenyCaUC09G171320
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAATGGGTTGACGATGGGTTGTCTCTCGCTGGGTCGAGGGCCTGATGGTTCTAAGGAAGTGAGCGAGAAGTTGGTAGTTAGTGCTAGTGAGAGTCATAGAGTTGTGTCGCTGGGTTTTGGGTCTAACGGTGCTAAGGAAGTGAGCGAGATGATGGGACTAGCGAGAGCTATGTCGGTCGCTAGTGTAAACTTGGGGAACATGTGGGGCTCTTTTGTAAGCCCCATACTTGACTTTGTGAGAAGGCAAGATAAGAAGAGATCAAGAGATGGGCGTTTGGTAGGATAGTTGACTGAAATGTGTGTGGGGGCAGAAAAATGGCTAAGTATCAGCCATGCGTTGGTGGCACTGTGCCTTGATGGAGGTAGTTTTGGCGTGGACGCAGAAGTGAGGGAAGGCCATGAGGCGTTGAGACCATGAGGCGTTGAGGTCACGAGGCGTTGAGAGCCACTCTGCGTCGAAGGTTATTATGCAATGAACGCATTGAAGGCTACAAGGCGTTGACAGTTGAAGGCCACGAGCCGTCGAGAGCCAATTTGCGATGAAGGTCACTATGCGGTGAATGCTACCATGCGTTGAAAGTGGGTATGCGTTGGTGCATAGAAGGTTGGCCGAAAGAACAATGCGTTCGTTAGCTATCTGGCGAGGGAGTTGGGAAATAGTAACATACAAAACAGAGGCTGTGCGTTGCTGAAGCCAAGCACAGAAGGTATGCGTTGATTAGATTATTATATAGAGACGAAGTGGAGTTTAAGTCGGTGGTATATATATAAGTGGACCGAGAATTCAATTGTTTTGATCACATTTCAGAGCTCGAGTTGATTCCATTTCGAAGCTAAACAACGGAGGGAGGTAGAAGAAGGTGTTCATGTTGATTTGGAGTGGAATTCTCGTCGTTTTCGTGGAGGAAACTTTAGCTGGAGCGGAGGACTCAGCTGGTGTTACTTAATCAGAGTAACGTTCAGTTTTGAGGGAAGAACGAACTGAGGAAACAGTGGCTAAGATCGAAATTCTAAGGTTAGTAAGGTTAACTCGATTTTTAGCAAGTTTTATGAAGGGTACTTGAGCTGAATTTGAGTAAATGTGTGTTAAACTCCGGGCAGAAGAGATCGGAGCTGAATTGCCGGATGATTAGGAGCAATTCGGAGTTGTTGAAGGATATATCTTAAACGGAGAGGACATTCTCTATGAGACTTTGTGGTTAAAGAAAGAAGAAGAAAGGAGGAAGAAAAACTGTTCTGCTACGGCAGTAGTATCGCTGAGAGAGCGGGAGACTGGGCAGCGAAGCAAGTGTCGCTGTAACGCAAGAGGGGCTTTGCGTCTCACAATTCTCGCTGAAGTCTCGCTGGGTGTCGCTCCTCAGGTAATCTCGCTAGTTTCGTTCAACCCGGTATCGCTAGTGCAGTGTTATGTAGTGAAGTTCTGCTGGTAATCTGTCTGTGGAGTAACGTTATTTATGAGTGTTTTGAGGAAAAGAGAGTTTGGAGATGAAACGAGCATAGGGTTTAATTATGTATATTTAATGAGTATAAAGAAAAGGAAGTCTAAGGAAAACTTAACGTGGAAAATGTGTACTTTAAGGCCAGGAAGAGCTCGGGAAGGCATATAATCCACTTAGAACCGAGACAAGTTGTGAGTGACTTTCTACTATATCTTGTGGTTACTTTTAGCATAATTATTTGGCAATGGATGAGTAGGAAGTTATAGTATGGTGTAGTATTGAAGTAATTATGTTGTGTTGGTAAGTCTAAAGGAAACTAGATATACTATTTAAATGTAATCATGGCTGAGGGACCTTGTGGTGAAAGCCTAAGTGAATATGTAACATGATACTCAGTGCTGAGGGACCACGCGTGAAGGCACTTGAGTAGTTAGATGGAATGGATTTCAGAGCTGAGGGACCTTGAGTGAAAGCATATGGAAATCCATCATATGTTAGTTCGTGCTGAGGGACCCTGAGTGAAGGCACTTGAATGGAGATTTGATTGGTTACCAGTGCTGAGGGACCTCGTGTGAAGGCACATGGTAACATTGACATAGTTGAACTCAGTGCTGAGGGATAGAACGTGAAGGCACTCGTTAGTTTGCAAATCCAAGGAACATAATGTTTAGGCATTTTTATGTGATTAGAAATGAGAATTTGTACTGGAATGTGAGTGAGTTGAGTTGTGCTTTGTCACAGCAAGGGTTAGATATTTGCCATGGAATTGTAAGGATGTTGGTATGGTTGTGATCTATAGCATAAGAGGCTTAGAGACTTTTGATATGCGATATGTAGTGGTTACTAAGGTTTATACTAGCTTATGATTGTTGGTAATATCTGAATGAATTTAGTCACTCACTGGGCTTTAGGCTCACTCAATTTGTTTGTTTGATTGTTGTTTCAGGTAGCGAACGTGTCCGGGACACCTAGCCTACAGAAGTTCATCGTCTGGGCCTACATCGAAGCAGACCTCTGGGATAGTTGTAAATACTCAGTTTATGTCCATGTTCTGTAATGTACATGTTCCATGGGAGTGCTGGGAGGATCGTTTTGTATTACATGTATATATAGAATACTTGATGATAGGTTGTTATATTATCGAATGTCTTAATAGTAAAGGTGTTTCTATTTGAGATTAAGCTGGCATTTAGTTTAATATGGAAGATATTTATATGATTTATGCTTTAGATATGGACTAGTGAGAGTGCGGTTTCACACTCACTCCTAGGGTTAAGGAGTATCTGGGATGGGGTGTGACATCTTTCTTGAGGTTCATATTGCATGGTTGAGGTTTCTTCGTTCATATCATTCTCCCTTTCTTCAAGAAGACCCATCCTCATCTAAAGTATTGCTTGGAAGGAACATTGAAGGACAACACACACTTGTAACAATTAATCTATTGGCCCAATTTGAAACATTGGAGTTACATTCTTAACTAATGGCTAGAAAATTTAATGTGCCTATATGTAACTACCATATTTAATGTAAAATAGTCCACTTTTTAAAATCTTCAAAGTCATATAAGAATGAATACCAAAGGAGCATATTTATGACAAAGATGAGATCAAATCAGAATATTATCTAACATGCTTTTGAGAATCAAAGAACAAGTTAAGAATAAATGCTCTTTGGTATAGTAATTTTTCTTTTTCTGTTTGATTTTCATAACACAAAAATTTGACATCGAAGGAAGCCGAATTTGAAGACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGATAAGACTTTGATCTAAAGCGTTGAAGTTTTCAAAAACACGAAAAAAGTGACTGGAGAGAATCCTAAATGGAAGTCCGTAGAAAATCAATCGGTTTTGTCTCTCTCTACCCCTTTGATTAATTGAAGTGCTTCATAAGCTGCATCGCTGTTAGTTCGATTGAGGTTGTTTTAAGAGAGCTGAGTCGACGGTCCAAATTGATTGAAGGAGCTTCCACTAGAGTCAGTGGTCTTTGATTGGAGGAGAGTTTTGCTCACAAACGACACCCACCCCTTAGATACAAATAAAATGGTGCAATTGTTGTGCCGATTTCAGATTGTTGGAATTGGATCTACTCAAAAACGGTTGTCGATTGATTCCGGCTCCTCATACGACCTTGAGTGAAGCTTATATCCTGGTGATGGCAAAGAGGAGATCCCCGATTCGTCAAAAGGGAAAACGTAGTCTGCTAACTCTAGTCCGTATCAAGTTTTGGAAGGGCGAGCGCGTGATTTCCATGCGTGCCACTCTAGGTTTGGCGATTCCTAGTGTTTGGTGCTGTTGTTGTCGGGCGTCGACATCCTTCAGAGGGTGCGACAGTAGCGTTTGTTATCGATGGTCTTCCTTCATATCCATTGTTTGATTTGAGGAATCTGGCCGGAAACCGTGGATTTGGGCTCTGTCTTCTTGAACGTGTTGCCTGCCATTGGGATCTGGCTGCTGGTGATGCTCTGATTGATGATTTAATAGTCTGA

mRNA sequence

ATGAATGGGTTGACGATGGGTTGTCTCTCGCTGGGTCGAGGGCCTGATGGTTCTAAGGAAGTGAGCGAGAAGTTGGTAGTTAGTGCTAGTGAGAGTCATAGAGTTGTGTCGCTGGGTTTTGGGTCTAACGGTGCTAAGGAATGCTTCATAAGCTGCATCGCTGTTAGTTCGATTGAGGTTGTTTTAAGAGAGCTGAGTCGACGATTGTTGGAATTGGATCTACTCAAAAACGGTTGTCGATTGATTCCGGCTCCTCATACGACCTTGAGTGAAGCTTATATCCTGGTTTGGCGATTCCTAGTGTTTGGTGCTGTTGTTGTCGGGCGTCGACATCCTTCAGAGGGTGCGACAGTAGCGTTTGTTATCGATGGTCTTCCTTCATATCCATTGTTTGATTTGAGGAATCTGGCCGGAAACCGTGGATTTGGGCTCTGTCTTCTTGAACGTGTTGCCTGCCATTGGGATCTGGCTGCTGGTGATGCTCTGATTGATGATTTAATAGTCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAATGGGTTGACGATGGGTTGTCTCTCGCTGGGTCGAGGGCCTGATGGTTCTAAGGAAGTGAGCGAGAAGTTGGTAGTTAGTGCTAGTGAGAGTCATAGAGTTGTGTCGCTGGGTTTTGGGTCTAACGGTGCTAAGGAATGCTTCATAAGCTGCATCGCTGTTAGTTCGATTGAGGTTGTTTTAAGAGAGCTGAGTCGACGATTGTTGGAATTGGATCTACTCAAAAACGGTTGTCGATTGATTCCGGCTCCTCATACGACCTTGAGTGAAGCTTATATCCTGGTTTGGCGATTCCTAGTGTTTGGTGCTGTTGTTGTCGGGCGTCGACATCCTTCAGAGGGTGCGACAGTAGCGTTTGTTATCGATGGTCTTCCTTCATATCCATTGTTTGATTTGAGGAATCTGGCCGGAAACCGTGGATTTGGGCTCTGTCTTCTTGAACGTGTTGCCTGCCATTGGGATCTGGCTGCTGGTGATGCTCTGATTGATGATTTAATAGTCTGA

Protein sequence

MNGLTMGCLSLGRGPDGSKEVSEKLVVSASESHRVVSLGFGSNGAKECFISCIAVSSIEVVLRELSRRLLELDLLKNGCRLIPAPHTTLSEAYILVWRFLVFGAVVVGRRHPSEGATVAFVIDGLPSYPLFDLRNLAGNRGFGLCLLERVACHWDLAAGDALIDDLIV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC09G171320 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC09G171320 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC09G171320 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC09G171320 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC09G171320.1CaUC09G171320.1mRNA