CaUC09G162270 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC09G162270
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr09: 4268949 .. 4273424 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC09G162270
SyntenyCaUC09G162270
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGACCAAAAGCCATGGTCTAAATTCTAAAATAATCTACAAAAGGATTAGTTATTAGTTACTAAAATGTTGCGGCTCTCAAACTCCTTTTTTAAGTCAAACCAAACTTTACACAGTGATCTAGTCAACCAGAGATTTTAGTGGGGGCAAGAAAATGAAGAAAAGAACACCCTATTTTGGATATTATTAACTTAAAAGTTGAGGACCGTAAATTTTGGAAAAGTAACCTTTTAGCCCCTAAATTTTAAAAAAGATGTGCATTTGGTTTCTAAGTTTTATAAATATAGTTTTCAGTTCTCAGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTAGAATAGATACATGTAGTCCTTAAATTTTCAAAATGTAATTTTTTAGTTTCCGAGTTTTTAAGAATTTATTTAAAAAATTTTATAATTACTGTAAATAAATAAATGATATTTTAAAAGTCCTCTTGCCTCTCTCCTAATCCTCGTCTTCGCACCATTTATTTTCCTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAATTATTATGTGTGTGAATAATATATTCAAATTTAATTGTTAAACATATGGTTCAAATATATATTTGAACATTTTGGACTAATATGTGTGGATAGTTAGATAATTTAATAAGTATTATGAATATTATAACAAATTAGATGTCTATTATATAATTGAGCTTAGTGGCTAAAGGTCATGTGTCTACTAATGACACATTCTTAGCAGTCATGAAATGTCACTGCCTATTTGCTAAATTGTCTATAAATAGAGGTTTTTGGTGGATATTGTAACACACATATTGGAAAGAAAAGAAGAGAAAAGATTGGTGAAATTTGAGAAATTTTATTTTCATAAAATCTAACTTTCTTTATTTTTAGTTTATTTTAAGTTTACTTTATTTAATTTGGTTATTTTAATTACTTTGATATTATTTTATTATTTATTATTTTAATATTATAAATTTTCGATTTTCGTGATCTATCCATCATTTCGCTCCTGAATTTTACGACAATAGGTTAATTATTTTGATTTTCTTAGGTAGGAGGTCTTGGAAACTTCTCAGTAAATGAGATTGTTTACATGAGACTTCAACAGGAAAAACTTGATTTGTATCAATTTGCATGTATATATAGCTCTAATATAACTCTAATTTTTTTTCTTTTAAGACGTATGTGCTTCTTTGGTCTTTAAAGGGCTGTTTGGTTGGAGGGTTTTTTGCATGGAAATTGACATAGACATGCAAAATCTATGTTTATTTCACAGTTTTCAACATTTTGCTTGAATTAAGTTATTCTCATGCATCTTCATTTCCCATCGACAAGGTTTTTTCTTACTCCCAAAATTGTGGGTTTTCTCTTTTTCTCTCTCTACCGGTTTATCATTTTGAATATAGTTAATTAATTAATATTAATTTAACAAAAAAATCATTTTTCAATAATAATATTTAATTACTTATTGTTATTTTTATAATCAAACAATTATTTATTGACATTAATTTCATATAATCATTATTGATTATTTATAATCATTTAATTATTTATTGTGATTAGTTTTTATTACTTCATTTATTATTATTCTTTATTAATATTTTTTTTAATTAACATATCGTATTTTTATTTCATTTTTCACTTTTTATATAATATATTATTTATTAAAATATATTTTCTTTTATTATTTAATTAAAATCAAAGTTACTAATGTTGAACTAAATTAATTATAAAAATGATTAAGTATTAGATTATAATTAATATGACGTTTAATGTGAAATTATTTTAAATGACAAAACTGTTAAAAAAATTTACAAACATAACAAAAAATTTATCTGCGATAGACTAATATATGTGTCTATTATGACACAGATAGACATAGATAGTAGTCTATCGCGGTCTATCGTAGTGTATCACAGATAGATAGCGAAATTTTGATATATTTGTAAATATATTGATTCACTTTCTTATATTTGAAAAGAACCCTAAATATGTTATTAGTTAATTTTAATTATAAATTACTCAATTTTTAAATATTTATAATTAAGATTATTATTGACTCTTAATTAATTAATTTTTATTAATGATATTTATTGTTTAATTGATTAATCTATGGCAAGTATATAAGATTATCATGCTTAATTCTATAAATTAAATACACATAAAATTTTTGTTCATAAATTTTTTTATAGCTAAATATAGTCATCTTTAATTACATTTTAGTGTCAGATATTTATAAAACCTTAAACCAAACAATCTCCGAGTTTTAGAGTCTTTGGTTTTTTAAGTGCTTTAGAGTCTTTTAATATTCTAAAAAAAAAAATTTGAATGCTCTTAACATGTTTCCACGTCCTCAAATTGATGAACTTTTGAAAATGGAGCAAGAAGTACTTGTATATTTATAGAGCTTTCTATGGGTAGTGTGGGCTCATTCAGTTGACTTTTGGGTTCATTTCAACTTGTGCCCAAATATCATAGGATCCAATTTGATCAAGCGAGGCTTACTTGTGAGTTTGAAATTGATTTCAAATTTAATAATTTAATTTAGGAAATGATAAATTCACCTCCTACAAATATTAACATGGTGTAAATAAACATTAAAATAAATCGTTTAATTTAATTCTTTTTTTTTAAAGAAAAACAGAAAATAATTTGCTATGGATCTAGTATTGTGCTTGTTAATAAGAGGTTGATAAGAAAAAAAAACCAATTTATAATTTATACCTTTGGGTTGTAATAATTTAAACCCTAAACTAAAATTTGTATCAATTTAAACTTTAAATTTTTGTGATGATATTTATTTACACTCTATTTTAAATTTTGTTCAAAAAATATTATATGAGATTTATGATTGAACTTTTAATTTATTTATAAGCAAATCAATTTAGATTATTTTTGAAAAATGTCGATGTATTAATTAAAACACGTGGATGGACTTCTCCATATGTCAGATTTACAAAATGGATAATTAGAATTAATGCGTGAGCAATTTTCAAAGAAAATTCTAATTGAGAATCCAAATTAATTCACTTATGAAAAATTAGAGGTTGAACGGCTAAAGTATAAATTCATACAACCCAAATGAAACGAAATTGATATACAAATTGATACACTTAGACTTAATTTTTAGAGGTATAAATGGATAATTTCCTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTCATAGCATCTCTGGGAGCTAGATATGGGCCGGCTCACCGGACCATGTTGGGCTAAATGGCCCATGTCACTAACAACCATTTTGAAAATTAATTCAAAATTGCACAAATTGACTGCACTTAGACTTACTTCGCATTCATTAAAAGTAGGGAAATTGACTTTTACATTTACCTGTGCATGTCAAAATTTAACAAACATTTCTTAAATTGCATTTGCTTTGTTTTATTACTCTTTCCCTTTCTAAACTTTAAATGTAACCAAGTCATACAACTCAATAATCATGTTCGTCATTTTAATCGTTTGTAAAAATGCATATATAAGTATATTTTAAAAAATAAAATTTATCATAATTCATTGACTTTTTACTACAACTTTATTTAATAAAGTCGAAAGATAAATATATATGAGTCTAGGAAAAAAAAATAATAATAATAACCAAATACGTATTCAATATTTATCAATTATTATAAAATGTTTGTCTTCGACTCTTCATCATTTTCTTTGGCCTACATTCTTAAAACCTATATAATTATTGATTGTCATCCATAATATTTCATCAACTCCCAATTTAGAATATTCCCTCATTATTTTTTTCAGATTAACAGCAATTTTACATTAATCAAAACTATTAAAATACGCCATGAAGTAATAAGATATTAATTCCATGTGAGCCGACTTGTCGTTTTGCCCATTTCTGGTCAACTACAGCTCTCCCGTCAATAACATTCCGCCACGTCATCTACCAACTTGCACCTTCCAAAATGATCCTCATCCGTCGATCTTTTAGACTCTGATGGTCAAATATTGATCAACGATCAACGGCTACGATTTGAAATTGGGGTGGAGGCTGAAATTTTTGATCTACGAGTCGTTGCCCCCAAAGTCCTCTTGAATTGCAGTTACTGTCTGGAATAAATGGATAAATATGAAACGTAATGGCTCTGTATGAATGCGTATTACAAAGGAAGTAGGAAGCTTTGAGGACTTGTTTCCGTTCTACGAAGTTGATCGGAAGTAGGAGACGACTGGCGAAGTTGAACGAAGTCAAGTCAAAAGTAAGCTCGACGACTCCGTTCTACGACGCAGTCGGCTGCTTTGAGGTTTTCGCTTTTATATTTTATAACAGCCTCCGCTCCCAACGCGAAGGCGACCTGTCGTTACTCTGATTGAAGCATTGAGGACTTGTTTCCGTCGAATTTGATATCTGATCGACGGTATGAATCGATTTCTTGTAATTTTTACTAGCTTCCTGTTGAATTGCTGATGTTTTTTTCTTAGAATGTTAAAGAACATGCATGATGTTGAGTGTATTGCGTTACTAAGTCCGGAAAATTAA

mRNA sequence

ATGAGACCAAAAGCCATGAGCTTTCTATGGGTAGTGTGGGCTCATTCAGTTGACTTTTGGGTTCATTTCAACTTGTGCCCAAATATCATAGGATCCAATTTGATCAAGCGAGGCTTACTTATTAACAGCAATTTTACATTAATCAAAACTATTAAAATACGCCATGAAGAAGTAGGAAGCTTTGAGGACTTGTTTCCGTTCTACGAAGTTGATCGGAAAATGTTAAAGAACATGCATGATGTTGAGTGTATTGCGTTACTAAGTCCGGAAAATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGACCAAAAGCCATGAGCTTTCTATGGGTAGTGTGGGCTCATTCAGTTGACTTTTGGGTTCATTTCAACTTGTGCCCAAATATCATAGGATCCAATTTGATCAAGCGAGGCTTACTTATTAACAGCAATTTTACATTAATCAAAACTATTAAAATACGCCATGAAGAAGTAGGAAGCTTTGAGGACTTGTTTCCGTTCTACGAAGTTGATCGGAAAATGTTAAAGAACATGCATGATGTTGAGTGTATTGCGTTACTAAGTCCGGAAAATTAA

Protein sequence

MRPKAMSFLWVVWAHSVDFWVHFNLCPNIIGSNLIKRGLLINSNFTLIKTIKIRHEEVGSFEDLFPFYEVDRKMLKNMHDVECIALLSPEN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC09G162270.1CaUC09G162270.1mRNA