CaUC08G157110 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC08G157110
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr08: 28448315 .. 28451022 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC08G157110
SyntenyCaUC08G157110
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATCGATAAAACGCGACGCGGAAACTCAGGAAAACAAGGCCAAGAGCAGAAGTTGGAGATGGTGGTGCGATATGGAGAGGAATAGATCTCTTCGAGAAATAATCCGATGCTACGAAACTACATATACTGAACCTGCAACCCGCATCCCGTCCGTCCGATTTCGAGCAAGATTGCTTACAAAAAACAATTTAAATATTTTCAGGAATGTGTTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAGGTCTGTAGTTCGATCCTGCATGGGGGCAATTATTTTTCCTCACATTTTTCTTTTCTTTTGTAACTCTACGAATAATATTTGTCAATTAAATATTTGCTTTATGGTTCTAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGTCTGTAGTTCGATCCTGCATGGGGGCAATTATTTTTCCTCACATTTTTCTTTTCTTTTGTAACTCTACGAATAATATTTGTCAATTAAATATTTGCTTTATGGTTCTAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGTCTGTAGTTCGATCCTGCATGGGGGCAATTATTTTTCCTCACATTTTTCTTTTCTTTTGTAACTCTACGAATAATATTTGTCAATTAAATATTTGCTTTATGGTTCTAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGTCTGTAGTTCGATCCTGCATGGGGGCAATTATTTTTCCTCACATTTTTCTTTTCTTTTGTAACTCTACGAATAATATTTGTCAATTAAATATTTGCTTTATGGTTCTAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAGGTCTGTAGTTCGATCCTGCATGGGGGCAATTATTTTTCCTCACATTTTTCTTTTCTTTTGTAACTCTACGAATAATATTTGTCAATTAAATATTTGCTTTATGGTTCTAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAGGTCTGTTGTTCGATCCTGCATAGGGGCAGTTTTTTGTACTTTTATAACTCTTCGTTCTTTCTTAATTGTTATTTTTCAAGATAATTTGTTTATACCTTATTTTTGGTTTAGGGTTTAGATTTTAGTTTTTTGTTTCTATTTGGTACATTTTCCAAGTAGAAGAGTTATTCTTAATTAAATTTCAAAAAATCAAAAACAAAATGTTAAAAGACTATATATATATATATATATATTTTTTAATTTTCAAAAATTGGGTTGCATTTTTAAAACAAAGAAGATAACAAAACAATATATTAGAAGTGGGAGGGGTGTTGGAAGCTCAATTTAAAAGAATACTATGGGCTTTAAATTTCATTATTTAAGTTTCTAATTTTTTTTTAAAACGATTATTTTGGTCGTGTTATGCTATTTTTCAATATAATTTTAAGTTGTCAATGCCTGTGTTTAACATATGTGGCATCATCAAATGTTGTTCGTGTCAATGTACTACACATACTTAAATTTTTGTAATTAATTTGTCAACATTTAAATAAAACTAAGGCCAAAATAGTTACTAATTTAAAATTGAAAAACTATAAAATATATAGACTAAACTTAACATTTTAAAAATTTAGGAGTCAAACTAGAATAATTCTAAAAGTTTAAAACCAAAATATATCGTAAAAATGTATAGACTAAAATAAAATGAGTATGAAAATTTAGAAACTAAAATAGAATCTAATAAAAAATATATATATACACGACTCAAGATTTAAAATATGGATGTAAACATAAACGTCAGAGACTCTAAAATGTCATTAATACTGTTAGAAAGATTATTAAAACAAAAATAAAAATCAAATAAAATATTAAAATTAATCGACAAACATTTCATTCCTTAGAAGAAAAAAAATGTTTATTATTTATATTATATTAATATTTTTGAAATTTTATTTGTACTTTTTTTTTTTATTTATTTAATTTTATTGAGTTGTTTACGGCATAATGTCAAGGAATAAGTCATGAAAATGTTGATACGAACACGATATGCATTTTTTCTTTCCTATACAATGATGTATGGCATATACTATTTTCTGAAATCTTCAAATATATATGTGTGTGTGTTTAATAGTCGAATGAATTGGGCTGGATCTGGGATTCTGGTTGAAGCCCAAATCATAAACAAAGCTCATCCAGCGCGAACATGGTCTCTGATTGACTATAAATAAAGCAGCTAAACCCTAAGCCAGTATTGCTTTCGACGGCCGCCTTGGTGAACATTGTTGGAACTTCATTTAGGCAGATTGTTCTGTATGAAATTATCAAAATCCTCTCATCTTCTTTTCTTCTTCATTTTTCGCGTTGTTTTTATTTTTAAACTTGCTTGCATTGTTCCGTAAAATTTATTGGTTTTTGTATCGCCTTCGATAGGCGTTGCGTTCATCGGTGGGTTTAGATCCAGATGGACGCGTCAACGGAGGCGTAAACTAACTGCAACTCTTCAAACCTGATCGTCTCCGTTTCAATCGGAGGCAAGGTATGAGTCGTTTTGTGACTCGTGGCTTTACTGGTTTGACGTTGTGCCATTTGATTTCGTTTCGAAACCTAGGGTTTATCCACTTGTCACTCCTAATTTCTTTACTAAAATTGTTGCTTCTTACTGGTGA

mRNA sequence

ATGATCGATAAAACGCGACGCGGAAACTCAGGAAAACAAGGCCAAGAGCAGAAGTTGGAGATGGTGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAGCTAAACCCTAAGCCAGTATTGCTTTCGACGGCCGCCTTGGTGAACATTGTTGGAACTTCATTTAGGCAGATTGTTCTGTATGAGTCGTTTTGTGACTCGTGGCTTTACTGGTTTGACGTTGTGCCATTTGATTTCGTTTCGAAACCTAGGGTTTATCCACTTGTCACTCCTAATTTCTTTACTAAAATTGTTGCTTCTTACTGGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGATCGATAAAACGCGACGCGGAAACTCAGGAAAACAAGGCCAAGAGCAGAAGTTGGAGATGGTGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTAAAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAGGCATATTGCCCCTATAGCTCAGTGGTAGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAGCTAAACCCTAAGCCAGTATTGCTTTCGACGGCCGCCTTGGTGAACATTGTTGGAACTTCATTTAGGCAGATTGTTCTGTATGAGTCGTTTTGTGACTCGTGGCTTTACTGGTTTGACGTTGTGCCATTTGATTTCGTTTCGAAACCTAGGGTTTATCCACTTGTCACTCCTAATTTCTTTACTAAAATTGTTGCTTCTTACTGGTGA

Protein sequence

MIDKTRRGNSGKQGQEQKLEMVAYCPYSSVVERQSCKLKAYCPYSSVVERQSCKLKAYCPYSSVVERQSCKLKAYCPYSSVVERQSCKLKAYCPYSSVVERQSCKLKLNPKPVLLSTAALVNIVGTSFRQIVLYESFCDSWLYWFDVVPFDFVSKPRVYPLVTPNFFTKIVASYW
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC08G157110.1CaUC08G157110.1mRNA