CaUC08G154050 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC08G154050
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr08: 25734557 .. 25743177 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC08G154050
SyntenyCaUC08G154050
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCTACATGTCTTCATGTTTTGGGGATATTTGCCTTCTTATATTTAGGTCTTCTGCTGAGGGATTGGAGGACATTGTGGACAAGGACAACCATTGTACTTTTCGAGAAGTTTGTAGAAGAGTTTGGGTATTGTCAGCATACCTTGGAAGGCACACTACACCCTTTCCTTTTTATATTGGATTGGACTCTAAGCTAATATTGAGTCCGATAAACTTTGGGTATGTCTAGCTATATGGATGTTAAAAGCGAGTTTAGTTCCGCAGTAATTGACTTGACTTTTCATCTTAAAAGTGAAAATTTCATCCTCAATCTCTACAATTATTGTACTAAAACATGGTCTAGTTATATGGATTAAGATTTCACTCTTAACAAACTATTTTGAGAGGGAATTTTAAATGTTTGCAACTTGCAACTTTTAAACTTTGTTTGATAATCGTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTAGTTTTTTTAAAATTAAGCTTATATAAACTTTACTTTCGTAGACTACTTTCTACCAATATTTTCAAAAACCAAACCAAGTTTTGAAAACTACAAAAAGATAGTTTTTGAAAACTTGTTTTCGTTTTTAGATTTTGACTTAGAATTCAAATGTTTCTTTAAGAAAAGTAAAACCATGATAAGGAATTTGAGAGATAACATTTCAAAACCAGAAAACTAGAAAACAAAATGATTATTAAACCAGAAAACGATATAAGGAATTCTCACGGGACAACCCACCTGACTTTACAACATTCGAGTGTCAAGAAAACTTGTAGATATTAAATCCTAGGTAGGTAACTACCATGCAAGGTCATGTATCTTATTTACCACTAAGTCAACTTATAACGGCTAAAAGTACATGATATCTTAACCGGTTAAGTTATGGTTTTATGGGCTATTATTTAGACTAAATAGCACTTTCAACCTAATGAATTGTAGGGTATCATGACATATCTTTTCTTATTTCTACTAGGTTTCGGTTTCAAATAGATAAGGTTTAAAAAGCTTCACGTCAGCTTTGAAATTCTTGTGTACAACTAAGATCCCAAGTATTCAACTTTATATTTTGAATATGAAAATGTAGTTGAGATTGGTATTTCATGGGGCCATATATGAGACAGATCCAAACAAAGATTGGTGTTGACTTGTAAGTATTAATATATAAATATAAACGAATATATGAAGAAGAAAATCTCATAGCATTTTTCAGATTTGGATATCTAACCAAAATAATACTATATATATAAATATGTTGGATTCTTGGTTTTAATTTATAAAATCAATGTTCCTACAATTTTCTTGTGAATATGTTGGGCAATCTAGAGAAATATTATTTGTTACATTAAGATTTGTTGGATACAATATGTTTGGCCAATCTCACTAAATTTTGAATAATCTTAATAAGTGTATTTGAACTTTTAGATGATGTGTATTTGAGAAAAATCATGTCATTAATCTAATAACTTATTTTGTTAAATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAACAAATTGTGGTATGGAAAATCGAATTTCTAATTTTTAGAGAGGAAGGTAATATTAATTACTGCTGGCTTTCATTATTCACTATTTTGTTAGACAGTTAAACACTTAAAATTAGAAGTTTTTTCCTATTTTTATCCGTTCTTTCTTTTACAATAGCTTGAACTTTGTATAAAACAAACAAACTTAAACTTAATTAGTGGAGCTAAAAGAGATAAGGATACCTTTATAAAGAACTAATATGGTAAAAATATAATAATGCCACCATTAGTGATGTTAAACCACTACTCATAATTTAGTTTAATTATATCAATACTTTAACATTCTATCATTTGTGAATTTGAAAATAAATATTAAAAAAATGATATTCTAAAAATTTAGATGTCATATTAAATCACTAATAAATTCAAACACTTCAACAAAATAAATTACTCAATAAGAGGAATTCAAAAGAATATATCTAATTAAGTTTTTGAAAATGAGGTTAACATAAAATTTTGGTCCTTATGGTTTGCATATGTTAAATTTTAGTTCATATATATTTTTAATTGTCGAATTTATAATTTCAATAAATTTTAAACTCAAGCTTTCAAAATTATTTTTTACTGAAAATGGTTAAATAGCAATAATAATTTTTATGCAAAGAGATATAATATATGAATATATTTTTAAAATTTATGGTAAAAAGACTAATAGACAACATTAGTAACGATGACTAAATTCAAGATTTATTGAAAGTACAAGGACTAATAGATTTGAGAAATTGAAAGTATATAAACTAAAATCTAACAAAATTTTAAAGTATAGGGTCGAAAATAGTATTTTACTCCATTTATTAACTTATTGAATCAAAATTTATTAGATAAAATACGGAAAATTTTGATGATAATATGATTGAATAGTATAATGATAAGGAGAGATCTGAAATAATGTGTCAAGTGGCAAAAAGAATCGAACAATTAGAACATTAATAGATTTATTAAACTTAAGTTTTTTTTTTTTTTTCGAGGATCTTAGAGATTTAAATTAAGAAATACAATTAATTACATATTAATAGTTTGGATTACGTAACTTGTTTGGATTTATTATTTAAAAAAAATCAACTTCAATGTTCCCCAGTGCCAACCCATACCTCCAAAAATGCAAACATGTTCTACGTGGTCACTGTTAAAACCATTCATTCAAATATTTAAATATCATATATTATATACTTTTGATATTAATTATTTTGATTTGACAACTAAACTTTTTGACATTTTAAAGCCTCTTAATTAAATCTGTCTTCTAAAGTCACTTTGTTACTTTGTTATGTGTGTGTTTGCTTCTAGTCCACAACATCAAACTAAATAATCAGTAGTGAATAGATAATTAAATAGACATATTTAGATTACAATGAAACTAATTAAGATAGTTTGAGATGTTTATTGTAATGATTGTACCTAAGCTAATATAAAGTTTGAAAATGATATAAATGTCCTTTCCAATTTTTCGTAGCAACTATGTATATATAAATGAACAATTTCAATGTTCCAAGTACCCAAAATAAAATTTTTTAAAGTATAGGCTATAATTAGAATTTGTGTATATTTTTTAATACTACAATTAAGAAAATCACTAGTTTTTACCAATAATTGAACTATATATTAACATTTTACTCATTGTTAGACAAAAGAAAATGAAATAAATGATTCTAGTAACTCAACTCAACATAACCCTAATATTTAATGGTTGTAAGAGTTTTGAAACCAAATAATGCATTAATCTAAGGCAATATAATTTACAATAAAATAGGCTAAAATCGCGCAAGAATCTATTTGCCCACTAATTTCTTGGAGTCTTTGCCCTTAAAAATTATGTTTTGAAAAAGATTTTTATTTTAATGCAGATTTAGGAAATAAAAAATTAATTAGGTATGTGTTCACAAAAATATGTTTTAGACTTTTAGTTGACTGTGGAATGTGACAATGTAATATATTTGATTTGCATGATTCGCACCGTTAGATATTCAATTAGGTGAGAAAATGGGGTTTTGGCCGTTGATATGGACGACTTTTAGATAAAATCAGACATACAAATATATTACATGATATTATTTCTTTTATATTTCAATGGACTAGTAATATACAATAATTTCAAGAAATTTTATTCCTTTTCAATTACTAGAAATAATTGAATTTTGTACATCAAAATATTCACACGCATTAAACTATATGATATCTAAAATTAATTATTCTTGGTTTGGTTGGTGCTTTACAAAGAGAAAAATATTTAAGGTACTAGAATGTTATTAAAGAATACCATGTTGTCTCTATTTTTATTTAACCCCTCCACATTGGGAGTTTAAAATTTTATTAGATACAGATTCTAAGTATAATTTGACTCGTTAATCAAGATCGGTGTATCTTTGAAAGTTGGAATTTGTTTTCCTTCAAATATTTATGAGCTAAAAAATGGAATTTATTAGATAATTTTTAAATTTTGGAGATTTATTATATTCAACTCTTAATGTACAAAAAGAAGAAGAAGAAAAAAAAAATGCTAAACTTGTAATTTAACCTAAATACTATGATTAAGGACAAATGATAAGTTTACGAGATGTTTTGGTCCTCAACTTTAAGTGGGTGTGGAGTGGTTTATTATAGCTCACTCCATATTTGTGGCTCAATTTATAATAGTTGGCGTTTCTAACTATTATAACCTATAATTAATTACAGTATTACTATAATAATATGCACCTTAAACATAAACACTCCATTAGCTTCCTAGCTTTCAAGTGTTTAATAAGTCACATAGGTCCATTATAGATTTAAGAAGTCCTTCGCTAGATAGCTCTACACCACACAATTTCTTCCTAAACATTGTCTTAAAAGTGTTAAATATGTTACGAACAAGTCTATAATATATCTGAACACTTGAAAAGAAAGAAAAAAATTATTAGACATTTTACTTAAAATTTAAGTATATAAATGAGATAGAAAATTAAAAGTTTATGATCATCTACTAAACAAGTTTAGGGTCGGTGGATCTATTAGAATTTAAACACACCCTATAAAGTTTATAGACTAAACTGTGGATTAAATTTAATATATGATTTACATATAAGTAGGATTAATATAAAAATTATATACACTTATATTGTTTGCCAAGAAGCTATTACGTGGCCAAAATGGGGATTTTGAAGCGTAAAGAAAGCCATGGAAGAGAGGCCACATGGGCACTGCATGGTGCGTACGGCGTCGTTTTCTGCCTCAATTCTTCTTGAAAACTCTTTGAAAAGGATGGCCTTTGACCTATTTATGAAGGTGCCTTTCTTGGAACCTTCCCTTCAAATTTTTTTCCTTTTTTTATTTTTATTTTTTTTTTATAGATCCACTTATTATTATTTTTTTACCTTTTATTTTTAATGACTAGACTTACCAATATTTTATAATAAACCCTCTTTTTTTATTTAATTAAAAAAATAATGTTATAAAGTTGTTTCAGAAGAAGTTCCTTCATA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mRNA sequence

ATGGCTACATGTCTTCATGTTTTGGGGATATTTGCCTTCTTATATTTAGGTCTTCTGCTGAGGGATTGGAGGACATTGTGGACAAGGACAACCATTGTACTTTTCGAGAAGTTTGTAGAAGAGTTTGGGTATTCATATGATCGATCTCGATCATTAAATTTTCCATTCTGGTCTAAAATTACTCTGACCAAATTTGTGATTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTACATGTCTTCATGTTTTGGGGATATTTGCCTTCTTATATTTAGGTCTTCTGCTGAGGGATTGGAGGACATTGTGGACAAGGACAACCATTGTACTTTTCGAGAAGTTTGTAGAAGAGTTTGGGTATTCATATGATCGATCTCGATCATTAAATTTTCCATTCTGGTCTAAAATTACTCTGACCAAATTTGTGATTTAA

Protein sequence

MATCLHVLGIFAFLYLGLLLRDWRTLWTRTTIVLFEKFVEEFGYSYDRSRSLNFPFWSKITLTKFVI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC08G154050.1CaUC08G154050.1mRNA