CaUC08G142940 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC08G142940
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr08: 5002423 .. 5015391 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC08G142940
SyntenyCaUC08G142940
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGGGTTGATCATGGGCTGTTTAGTCAATTACCTATGTGACTATCACTGATAGCTACTATCAGTGATATCTGACACTAATTTTGTGCTATATCCCTAATATAGTTTTCCTTGTGCTATATTTTTTATTATTTTGGGCCTGATTGCTATTTGTGCAACCAACCCAATTTTATTCCCATGTTTTTTATTTCCAAAACATCCTTAATTCCTAGGTATCTATAAACTTTAAACCAAATAGCCCCCTAAGTGTCTTTCTATTTTCCTCTCTCTTGGTGTGTTAATCAGCTGCTGCCTCCCCCAAGAAGAAGGTGTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTCTTTGCTTTTCTTAGTCTCATGATGGGTGCCCTAAGTTGGTGAAGATCAACTTAATTTCAAAAAAGCCATTAAGCATTATTTACAAAAAAAGTCATTGCGTTTAATTATTCAATTACCCTCAAATAAAAAACCCACTTAAATAATCTTAGCATTTTTAACAAACCTCCCTCATGACAAGAATATTTAAGGGACCAAACTAATTCTCCAATCACCCTATCATCCAGGTTTTATATTCTAACAAACCCATGAGCTAGAAGAACCTTGGTTAACATATTTGACAAATTCTGTTCTGTATGAACTTTGACCAGTTCAACATCTTTTTGAGCAACAACTTCTCTGATAAATGAAATTTGACATCCATATACTTAGATCATTCATGATAACATGGATTCTTTGCAAGATGAATAGTACTCTAGCTATCACAACGGATGATAGAAATAAACTATTGCGACAACAACTCACCAACAATTCTTTTCAACCACACTACCTCCTTAACAGCTTCACCAACTAAAATATATTGTGACTCTGTTGTTGACAAAGCAACAACTGACTGTAGAGAAATTTTGCAACTGACCACATTACCATACAAATAAAACATCCCTTACAACCAAACATATTGTACTTCTCAAGCAATTTATGCACATAACTCTCTGGCAAAATGGTTAATAAACCTTTCTTCCTTTCTCTTTTAATATTCATGCCTAAGATCTTTGTCGATTCGCCGAAATCTTTCATTTCAAACTCACTACTCAACTATCTATTGAGTTTTCAGATTTCAGCATAATCCTTAGACACTAGTATCATATCATCTACATAAAGTAGCAGATAAATATATGTACCTTTCTGAGATAGTTTCTAGTACACATAGGCATCATATGAGCTCTTGTGAAATCCCTATTTCAAGATAAAGGTATCAAACCTAATACATCATTGTCTTGCCGATTGCATAAGTCCATAGATGGACTTGAGAAGACGACAAACCATGTCTTCCTTTCCCTTCACCTCATAGCCCTTAGGTTGAGCCATGTAGATCAATTCCTCCAATTACCCATAAAGGAATGCTGTGGTGATGTCCATATGTTCAAGAAACATATCAAAATGAACAACAATAGATAAGAATAAACGAATGGACGAATGCCTTACCACTGGAGAGTAAATCTCATGAAAGTCAACTTGCTCCTTCTGTGTGTAGCCCTTGGCCACTAGCCTAGCCTTGTCACTAGGCTTACAATCACCCCTGAAATTGGCTTGATTTTATAAATCCACATTGACTAAATGCGTTTTTTATTAGGTGGCTTTGGAACCAATGACTACGTCTGATTCTTCTGCAACGAGATTAATTCTGCTTCCATAGCATCTTATAACTTGTAGAAATACAAGTCATTATTGTCTCTCGCTTAGAAAAATAGGGTTTAAATGGAGAATCATGTGGTAGTTGGTGTTAAATTCTATTGATAAATCTTCCTATTGTTTTACTCTCATAAATTGATAGAGATAATTGTTTTGAAGCTTTTTGAATCTAAAACGCATGCTTTAATGCAGGAAAGCGAGCAACCTGTGGATGTGTTGGCAACCCTTCAACGCAGGTTGATGTGTTGGCAACCCATGGATGCGTTGGCCTACTTGAACGCAGGAACCCAAGTTATTCATGGACGCATATCAACCAGAAACGCAAGGCAGCTGAGAATCAGATAAGAATCTTGAGAGATTGTTGGGAGATTGATATGCTTGATATGCGGCGAGAGTGGTGGATCTAAATTAAACCGGAAATCACGCAATTAGGCGAGATGGACGCAAGGCAGAAATTTAGCCTCCAATCATGCAGATTTGCCAGCGATTGCAACGCAACATCTATAAAAGGGCAGACCTGAAGGCTAAAAGGTTGTTGAACCTCTCGGAAGAATTCCTAAGTGACAATAGAGTTCTCTCTAGACGATTACCGGAGACAAATAGCTCGAAAGAGAAGAGTCTTCCCTCCGCCTAACCACTTCACAGCAGAACTCACGCTACCATCCCGGCGAGCTCAAGACATTGAGAAGCCATTCCATGCTTTCTATCTTTTTCTTACTTATGTTTTAGTTTATTAGCAAGAAATTGTATTCTCTAAAACATTTATTCCGTTCATCAATCTATACATCTTCCATGGCTATTCATTTCTTATCACTTTCCATTTGCTGTTTATCATCCATGGGTAAATAACTCTCTTAAGGGTCACGGGTTGCGTGATCATCTAAATAAGAACCGTAGAAGACTATTCCATCTTGTCAATTGTATTTTTAATCTAATGCTTATGTCTATCTAGCTGATCGATATAAGTAGTAATAATCAGACTGCTCGGGAGAGTAAGTGATTGTGAAACTCAGTTGACAAGGCTAAGAAGTGTTACCTAGACATAGGAATAACCTTGGTACTTAATACTCTCCTATGCGTTATAGACATATAATGCATAGCAGTTGACAATCAAGAGAAGAGTCGCTGGTATGAAATAGATCTCACTATGTGTTTCCGACTTTAGATGATGACCAACTCTAGCCCTGCATTTACCATTCATATAATTCAATTAGCTGACTTTGCTGTGTTGCATACCTCTTCATCCAGCCACTTTAGCTTAGTTTTTACTACTTTGTAGTTAGTTAAATGCATCACTTCTCACCAACTTCTTTAGACGCATGACTAATAATCCAACTAATTATAGAATCTGCATAATCCCTGTGTTCGACCTTAGACTCACCGAGATAACCTCATTCTTTGCTTATACTTGGGTGAAGAATAGGAAAACTTGACAGATTAGTAACGCATAGTATTAAGCACGTTGAACGCATAACAAGCTTCATTGTAAGCCCCGTACTTGACCTTGAGAGAAGACAAGTTAAGAAGAGATTAAGAGATGGGCGTTTGGTAGGAAAAGTTGGCTGAGTTGTGTGGGGGCAAAAATGGCTAAGTATTGGCCATGTGTTGGTGGCACTATGCGATGAACGCATTGAAGGTCACGAGGCGTTGAAAGCCACGAGGCGTTGAGAGCCACTCTGCACCGAAGGTCACTATGCGATGAACGCATTGAAGGCCACGAGGCGTTGAAGGCCACGAGGCATTGAGAGCCACTCTGCGTCGAAGGTCACTATGCGATGAACGCTACCATGCGTTGAAAGTGAGTATGCTTTGGTGCATAGAAGAATGGTCGAGAGAACAATGCGTTTGTCAGCTATCTGGCGATGGGGCGTTGGGAAATTGTAACATACAAAACTGAGGCTATGCGTTGCTGAAGTCAAGTACATAAGGTATGCGTTGATTAGATCAATATATAGAGACGAAGTGGAGTTTAAGTCGGTGGTATATATATAAGTGGACTGAGTATTCGATTATTTTGATCACATTTCAAAGTTCGAGTTGATTCCATTTCGAAGCTAAACAACGATGGGAGGTAGAAGAAGGTGTTTATGTTGGTTTGCGATGGAATTCTCGTCATTTTCGTGAAGGAAACTTGAGCTGGAACGGAGAATCCAACTGGTGTTACTTCAGTGTTGGGGAGAGAACGAACTGGGGAAGCGGTGTTTAGGATCGAAATTCTGAAGTTAGTAAGTTAACTCGATTTCTAGCAATTCTCATGAAGGATACTTGAGCCGAATTTGAGTAAATATGTGTTAAACTCCTGGTAGAAGAGATCGAAGCTGAACTGTTGAACGATTAGGAGCAATTTGGGGTTGTTTGAGAATATACCTCAAACGAAGAGGGTTACCCTCACGAGACTCTAAGGTAAGATAAAGGACTTGTTTCTTTACAAGTTCGTAGAGGAAAGGAAGTTCTAATTTTGGCCGGAATGCGATGTTTAGCAAGTTAAAGAAAGAGTCAGAAGGGAAAGAAGAAAACAGTGGCTGTTAGGCGTCACCCAGACCGTAGTATCGCTGAAGAGCTGCAGACTTTGTAGCGAAGCGAGTATCGCTAGTAACGCAAAGGGTTCTGTGTCTCACCAGATCTCGCTGAGTCTTGCTGGGTATCGCTCTTCAGGTAATCTCGTTAGTCTCGTGTATTTCGGTATCGCTAGTGCAGTGTCTGGCTGAGTGTTTTTCGCTGGTAGTCTCGCTAGGGACATAGAGTCACGCTAATTATGAAATTCTGGGAATAAGGAGTCTGGTTAAAGAAGCAAGAGTAGAATTTGATTATGTTTATTTATTGATCATGGGAAGGAAGTTTAAAGAGAACTTAACATGGGAAATGTGTATTTACAGACCAAGAAGAGCTCGGGAAGGTGTATAATCCACTCGGAGCTAAGACAAGTTGTGAGTGATTTCTTGTTAATTTCACAAACTTACTTGACCTGTTTTAATAGTTTTGGGTATGTGAAATCTGTCATATGGAGTAGTTAAGGATTGATTTTGTGTTGTGCTGTAAGGATTAAAGATTGTATATGATATTCAGTGCTCAGGGACCATGTGGGAAGGCACTTGAATAGTTGGTTGATGTGGATTCCAATGCTCAGGGACAATATGTGAAGGCATGCGGAAATCCAATGTATGTGATAGCTCAGTGCTGAGGGATCACAGGTGAAGGCACTTGAGCAGTGGATTGATAGGGAACCCAGTGCTGAGGGAATTAAGTGTGAAGGCACCTGGGAACTCCGTTATGATAAAACTCAATGCTGAGGGACAATATGTGAAGGCACTTGA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mRNA sequence

ATGGCGGGTGTGGAAGGAAGCAGATGTCCATGGCAGCCAACTGAGGCTCTTCCACGAAATGGTCTTAGAAAGAGGTTAATCAATAAGGAAAGAGGCTGTTGGTGTCAAGGGGCAGTCGAGAGGCTTCAGAGCCGCAAAGGCCTGCCGCTAGACGCCTGGTGTTGTACGCAAGGTCGACGCATAAGGGCTTCAATGCATCAACCAGTTGGTGTGAATGCCTACAAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCGGGTGTGGAAGGAAGCAGATGTCCATGGCAGCCAACTGAGGCTCTTCCACGAAATGGTCTTAGAAAGAGGTTAATCAATAAGGAAAGAGGCTGTTGGTGTCAAGGGGCAGTCGAGAGGCTTCAGAGCCGCAAAGGCCTGCCGCTAGACGCCTGGTGTTGTACGCAAGGTCGACGCATAAGGGCTTCAATGCATCAACCAGTTGGTGTGAATGCCTACAAG

Protein sequence

MAGVEGSRCPWQPTEALPRNGLRKRLINKERGCWCQGAVERLQSRKGLPLDAWCCTQGRRIRASMHQPVGVNAYK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC08G142940 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC08G142940 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC08G142940 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC08G142940 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC08G142940.1CaUC08G142940.1mRNA