CaUC08G142520 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTAAATTGGTGTTTTCTTTCAAAACCTACATAACTAAGAAAAGTTTCTCTAAAAATCTAAAAAATTTTGCCCCATAAACGAAAATAAGGATCGCCAAGAAGCTTTAAAGCAGAAAGCAAGATGTATTTGATATATACAACACTATATATTTGAATTTTTTAAAAATAAACTAGGATATATTTGATAAGTGCATGAGAAAGACAATTTGTATAATATATCGTCTTATATACCGAGCATGAACAATATGCAATATATATTTACAATCTTCAATATATTTGTAAACATACCAAAAAAAATTAACCATAATATATGCAATGTATATTTGTACATTATATTATCAATATAAACGACATATACTCGAGATCTCAATGGAGAGGTAATCAATTTTTAGTTGGGACAAGGACCAATACCGACCCTTATAGAAGTCTATTCTGAGGTTTGTCTTGAGGAAAACAAATCTAGTGCTATGAACATCATAGCTACTCCCATGACTGACTCTGCTGTCTTCAAAGCTAAATCATCTGGTTCTACTAGAGACAATCAAAATGGGAAACCACCTCCAGGGTGTGAGCACTGTAAGAAACCCTAGCATACAAAGGATCACTGTTGGAAGTAACATGGTCGACCACCAAATGGCAAATGACGTCCTCCGAACGACAAGCCTAATTCTAGCCGGGTTCTGGTGAGTGAAACTGCTAGTAGTTCCCAACCATAACCTTAGGTGAACTGCCTAGCTAACCCCAGTGCCTCATCTCTTAGAACTATTGCCCAATCAGGTACATCTCAATCCTTGAGTCTCCTCAGTGTTAGTGTCAAGAAGCCTTAGATTCTTGATTCAGGAGCCACAGATCATCTGACTGGATCCTCTAATAATTTCCTCACATATCATTTGTGTGCTGGTAATGAAAAAACTTGAATTGTTGATGGATCATTTGCTCCGGTTGCGGGCAAAGGCCACATTTCTTCTTTTGATGGTTTGATATTACAGAATGTGTTGCATGTCCCTAAAATACCTTACAATTTATTGTCTATGAGTAAGATAACTAAAGATCTGAATTGTCGTGTGGTGTTCTCACCAGATGATGTTGTTTTCCAAGACTTGAACTCGGGAACGATGATTGGCACTATCCGACACAATAGTGGACTCTATTTCCTTCATGATGATACTTCTTCTAGGTGTAGTTATAGGACTAGTTTGTTGTCATTCTATTTCTCAACTTACAAAAACAATTGTATGTTGTGGCATTTTCGTCTTGGCCAGCCAAATCTCCAATATATGAAATATTTATTTTCTTATTTGTTCAATAAAGTTGACATTTCCTCCTCGTCTTCTGACGTGTGTATTCGGGCGAAAGAACATAGGGTCTCCTTTCCGTCCCAACCATACAAACCCTCTCAACCTTTCACCCTTATTCATAGTGATGTTTGAGGACCCTCAAGAGTTACTACCTCTTCGGGTAAGTGCTGGTTTGTGACCTTCATCGATAACCACACTCGCCTTACTTGGGTCTTTCTCCTCACTAATAAATCTGAGGTCTCATCCATTTTCCAACAATTTTATACTACCATTGAGACTCAGTTCAATGCCAAAATTGTCATCTTTCGGAGTGACAATGGTCGTGAGTTCCTAACTAATACCCTTCGTGAGTTTCTGTCCACTAAAGGTATTGTTCATCAGAGCTCATGTGCCTATACCCCTCAACAAAATGGAGTGACTGAAAAAAAAAATCGTCATCTCCTTGAGGTTGCCCGATCTCTCATGCTATCTACCTCTCTTCTGTCTTACTTGTTGGGGATGCAGTTATGACTGTAGCTCACATTATAAATCGGAGAGGATGGGTCCTAAGTTTGCTGTTAATAGGACATCTGTCGTCACCTTCTACGGTCATCTAAACTAGGAGGCAGATCATGAGGATACTGTTGGTGATGGTCCTCACATGATGACCAAGAGGTGGGGGAGATTGAGGAACCCCAAGGCATACAGGAGGAGAGTTAGTTAGACCATATCCACAATCCTTTAGAACGTCGTTGAGCTTAGATGTTTACGTGGAGATGTCTGGTTTATCATGGATAGGCAAGATCTTTATTTCGCTCATGTAGGTTTTGACCCTCAACTCCGTAGGCCGAGTTCCCCAGGTTCTGATTCTTAGATCCTACTCGCGTTTAGTGCCCTAGTTTAAGTTTCGATCTTTCTTAGTTTCTAGTTTTACTTTTAGTCTTAATTTCTTGTTTTCTTTCCTAGGTTAATTTAGCTAAGCTTCTTTTAAGGTAGGTTCATGCACAATTTCTAAGGCCCTTGCTCGTTTTTTGTTTTCTTTTGCAGGGTTGATCCTCTTCTTTTCTCTTCAAGCATGTCAGTTGCAGCAGCCTACCCTATCTTCTTCAATCTTAGGAAAGGCTTTCTATTTCCTTGTTTTCTTAGTTCTTGCTTTTCACTGTTTTATACATTGGGGACGATGTATGTTTTTAAAGTTGGGGATGGGGTATTTGGCATTTTGGGCATAATTTTGATTTCTTTCCTTTTTGCTTGTTTCCCTGTTATGACTAGTTAATGATACAATTTGTTTGATCATATTGGCATGAGATTAGATCAAGAGAAAGCATGCATGATTTTTTAGCAAATTTGGAAAATTTTTGTCATTACTTGAATGCACATTTGATTCCTTTGTTTAACTATTTTAAGTCTTGCTTGCTTATAATGACATTATGTAGCCTATAGAGTGGTTGTTATCGAAATGACCCCATCAGTTAGGAAGTTATCTAACTTTAGAGGGAGTAATTTTCAACTAGGAGTTATAAAAGTGTCTTAAGTCTGTGCAAACGATTACGGGAAAAAAAAAAAAGAGAAAATAATAATAATAATAGTAAAAATATGAAGCAAAAGAAGAGTGAGGTGTGGGTGCATGGATAGGAGTTAAAAAGAGTTACCTCCTCTTTTACGATTAATTAGGACGCCTACGAGAAAAGAGTGAGTATGAGTTTGTATAGGAGAGTGTGAAAGCTAATACTCCTAGGCAAAAAAAAAAAATGTCCTTTACTTTTTGCCCTTTACTTTTTATGCATGTGTTCCAAGTGGCCTAGTTGGAGCAATTTTGAAAGTTTATGTACCTTATTGATTAGTGCCCGAGCCAAAACTAGGGAAAAACGAGTCGAGGGCTTTATAAGACCATTCCGAGCTAACATAGACTTAATTAGATAAGCTTTGTACTCATTCATGTATGCTTGTATTTGAGAAAACGTTCCAGGACTTGTCTCAAATTGGTTAATTACTTTGGAATGATTTGATTGATTCAAAGCATGATCTTTGTTGACTATTAAAACTGGAGTGGGGAACCTTGCAACTTAGCAAACTTGATTTCGGCATGATTGTGCATTTATTTCTGCCTTACTCAAGATTATCAAAAATCAAGTTGGAGGCAATTTGATAGCACTTCGAATGTGTTATCTTGTCATGTTTAACTCAAGCTCGTTCCTTAGTTTTTCACGTTTATTTAGTGATTTGACAGGTACCTACCTGAGAAGTACATCAAGGCATTAGGGAGCAAATGAAGCTAACACAAATAGATTGAGGCCCTAACAAAGCAAGTGGACCAAACGGAGCAAAAGTTACGAAACTGCACTGAGGGCATAGCACAGCAACACAGCCCAGGCACTGCGCACGGTGCTTTTTCCCGAGAGCATCATTTCTAGTACTCAAAAGAGTGTCACGACTCTGCTCCTTAGCACCAAGACATTATGAAGTTTGACGAGGATCCTGAGACGTGCATGCTTGGCGCGCCACGACGCTGAGGGGCAGCATGGCAGCACCAATTCAAATCAAGTTATATGTAACCTAGCCGTCAACTTGAAGAAAGGATTGAATTTTGTCACTCTCAACAAATAGGGTTTTTCCATCATTGTTCACTCAATTTCTTGTACTTAGACGTTTATTTATATTGTGGATTTGCTTTTGAAGATGATTCTCGACTAATCTGGTAATTTCCAGCTTGGATCTCAGAAATTTCTTCTCATCTATGTAATTTGTGAGATCTATTTTTATTCCAAACAAATTTAAATCTTGTATTTTTGAACTTCTCCACTGAATTTTATTTATATTATCAAATCTAATCTATTGTCTAACAAACTGTTGGTTGGGTATACTGCTTTAAATTCAACTTGATCCATACTTGTCAAATATTGAATTGATTTTGTGGCAATTAGTGGGATTAGCTTATAAGTTTTTGGGCATGCAATTAACAATTATTGATTAACCCACTAAGCGAAAAAACACAATTGACCTTCTAATTAAGCCTAAAAGTCATTCAACTTAGTTTTACCTTGAATGTAATGCAGTTGTCCTAATTGAATTGTATGCATTTCATCTTTTTCAATCTTGGATAATTAGTTAATTGTAGATAATTAATTAGCGTCAAGACTAAGCTTGAAATACGAATCAAATCAAATCGATTGTTGAGTTCAATGATCAATTCTCATAGTTGGAAGGAATTTCGACATGATCCAAGCTAGGAGTGCAACAAAAAAAAAACTGAAAAACCAAATATCCAAATCAATCTAAATTGATCCAATGGTTTGGTTTGGTTTTTTAGTATGAAATTGAACATATTTGTTTGGATTTGGAGAAAACCAAAAAAGTATCGGTTCAGATCGGTTTTTTATTAGAAAAACCAATTAAAATCGAACCAAACCAATGATATATATACCCTTGAAAAAAAAGTCTTCATTAGGTATTTTTTTAGTATTTTAATTATTATGGGGCATGTATACTAATATTTAAACAAAAGACCAATTATTATGGAGTGGTTATGTTTTTTTATTTAGAAAAGGGAGAAAAAAAAAACAAAAATGTCAAATATCAATTTTATAAATAAAATTAAAAAAAATCCAATTTTAATTTAAAATTAGCAAAAAGAACCGATTCAAAACAAAGTGTAAATAAAAATTAAAAAAGTTGGTTGAAAAAAAAATGCCAAACACTGAGAACCAAATCGATAATA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MRGKPMNGKLTLVLCFASFLAGSLFTGRTRIQTKDPQFLNHLENPEAATPDCDHKRKLVESNDQDIMVEVTKTHQALQSLEKTFGNWEMEMALSRTNGRNPRPLPPEKAFVVIGINTAFSSKKRRDSIRETWMPRGESLKKLEKEKGIVVRFVIGKSGRPGGALDRAIDEEEEEHGDFLRLRHVEDYHQLSTKTRLYFTTAAALWAAEFYVKVDDDVHVNLGALVTALERHRSKPRIYMGCMKSGPVLSQKGLKYHEPEHWKFGEEGNEYFRHATGQIYAISKDLAAYISLNFPILHRYANEDVSLGAWLIGLEVEHVDDHCEPKSNGGNVCVATFDWSCSGICESVDRMKEVHKLCGEGNGAIWNVVV Homology
BLAST of CaUC08G142520 vs. NCBI nr
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BLAST of CaUC08G142520 vs. NCBI nr
Match: XP_008459501.1 (PREDICTED: probable beta-1,3-galactosyltransferase 8 [Cucumis melo] >XP_008459502.1 PREDICTED: probable beta-1,3-galactosyltransferase 8 [Cucumis melo] >TYK00539.1 putative beta-1,3-galactosyltransferase 8 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 1.7e-209 Identity = 359/378 (94.97%), Postives = 362/378 (95.77%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. NCBI nr
Match: KAA0039356.1 (putative beta-1,3-galactosyltransferase 8 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 736.1 bits (1899), Expect = 1.5e-208 Identity = 358/378 (94.71%), Postives = 361/378 (95.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. NCBI nr
Match: XP_004141519.1 (probable beta-1,3-galactosyltransferase 8 [Cucumis sativus] >XP_011656045.1 probable beta-1,3-galactosyltransferase 8 [Cucumis sativus] >KGN52602.1 hypothetical protein Csa_008452 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 733.0 bits (1891), Expect = 1.3e-207 Identity = 357/378 (94.44%), Postives = 359/378 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. NCBI nr
Match: KAG6607546.1 (putative beta-1,3-galactosyltransferase 8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 692.6 bits (1786), Expect = 1.9e-195 Identity = 341/378 (90.21%), Postives = 350/378 (92.59%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C809 (Probable beta-1,3-galactosyltransferase 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=B3GALT8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 502.7 bits (1293), Expect = 3.6e-141 Identity = 251/390 (64.36%), Postives = 295/390 (75.64%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZV71 (Probable beta-1,3-galactosyltransferase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=B3GALT3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 1.1e-121 Identity = 219/387 (56.59%), Postives = 275/387 (71.06%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9MAP8 (Beta-1,6-galactosyltransferase GALT31A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GALT31A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 1.9e-121 Identity = 216/389 (55.53%), Postives = 277/389 (71.21%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8MRC7 (Probable beta-1,3-galactosyltransferase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=B3GALT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 431.8 bits (1109), Expect = 7.8e-120 Identity = 214/388 (55.15%), Postives = 275/388 (70.88%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LEJ9 (Probable beta-1,3-galactosyltransferase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=B3GALT4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 3.9e-119 Identity = 213/383 (55.61%), Postives = 271/383 (70.76%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAF0 (Hexosyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 8.5e-210 Identity = 359/378 (94.97%), Postives = 362/378 (95.77%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BR02 (Hexosyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold169G001500 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 8.5e-210 Identity = 359/378 (94.97%), Postives = 362/378 (95.77%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TBE2 (Hexosyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold64G001550 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 736.1 bits (1899), Expect = 7.2e-209 Identity = 358/378 (94.71%), Postives = 361/378 (95.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KVZ3 (Hexosyltransferase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G647250 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 733.0 bits (1891), Expect = 6.1e-208 Identity = 357/378 (94.44%), Postives = 359/378 (94.97%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7J1 (Hexosyltransferase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471986 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 691.0 bits (1782), Expect = 2.6e-195 Identity = 340/378 (89.95%), Postives = 350/378 (92.59%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. TAIR 10
Match: AT1G33430.1 (Galactosyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 502.7 bits (1293), Expect = 2.6e-142 Identity = 251/390 (64.36%), Postives = 295/390 (75.64%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. TAIR 10
Match: AT1G33430.2 (Galactosyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 495.4 bits (1274), Expect = 4.1e-140 Identity = 251/398 (63.07%), Postives = 295/398 (74.12%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. TAIR 10
Match: AT1G77810.2 (Galactosyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 441.8 bits (1135), Expect = 5.4e-124 Identity = 213/373 (57.10%), Postives = 279/373 (74.80%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. TAIR 10
Match: AT2G32430.1 (Galactosyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 7.8e-123 Identity = 219/387 (56.59%), Postives = 275/387 (71.06%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC08G142520 vs. TAIR 10
Match: AT1G32930.1 (Galactosyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 437.2 bits (1123), Expect = 1.3e-122 Identity = 216/389 (55.53%), Postives = 277/389 (71.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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