CaUC07G134300 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGGTACGTGTTTGCTCTTCATTCCCCTCTGTTTTGTCTCCTCCTTCAATGAGTGTCAAAAGTTCATATCAGTGAAAATGAGAGTTTCTAAAGGGAATTCATAGCTGATTCCAATGCTCTAGAGCAAATTGCAGACATTTCCGCTCTTGGTTGCAGGAAAGGTCTACCAAGTTTTCTTAATACGCTTTGGGTTTAGTTGACTCTAGTTGAGAATTGCCACTCAATTTGGTTATAATTGGGGTAACATAAAAGTGTTTTCTGAAAAGGAAAAAAAATCCGAATTTAGTTGGAAATGCTTTATGACAGATAACGGTAAGATGTGAAAAGCACACTAAACAGCAGGAATAGGAAGCATGTCAAAAGCAAACTAAACAGTAGGAATTGGAAGCATGTTAAAAGCACACTATACATTGACTGACTTGTTATTAAGCACTTTTTACTAATGTGTTTATAGTTAAAAGTATATACATCTATATATATTTGCTAAAAGTACTTGGTTTGAAACGACATGCAGATGCACCTTTTAATGTATTGTGTGTGTTTTGTCACAGCTGCTCCTGCGATAAGGAACGCAAGTTTGCTGATGGTAGGAACAGATTCAGACGTATAGAGATATATTGTCCACAGTCAATTGTTAAAAGTAAAGATCAACTGACGTGCATCCTCCGGCATTTTTGTAACTCTCCGTGTTCAATTTTCAAACCCCACCGATGAACTGACAACCAGTGACACAGTCTCTCGCTGGTTAAGCAAAAATGAAAGCATGTGGCAATTGTCAGGTAGATTCAAAACATAACAAAGATCTTTTATGTGTAGATTTGTTCACAGCATATAGAAATGATTCAGATTGTTTTACATATAGCATTGGAATTGAGTTCTCTTGGTCCTGATGTTTGTAACTGTCCAAAAATATTGTACTGTTGTGAATCTCTCAATGGTTTTACCATCTTTCAGAATTCTGATAGAAAGTTCTTACCGTTTGAGTACTGTCTTTACAACGTTCCGTGGAGTTCAAAATTTGTTGGCCTGATTTCCATTTGTGTTTTATTTTCTTTTTGAGCAAGCCTAACTTCCTAGTTTGTTGCATCATTTGACTGAGTTTCAATTTCATATGTATTCATTATTTACAGTGAGGACTTATATATCTGGTTTTGATATGATATTTTGAAGGAAGTTTGAATCGTGATGTTAACAAACCTGAATTTGTGAAGTGTGGGGTTGGAAAGTTCAGGTTTATGTATTTGCATTGTAGAAAGGTAAACATAAGAAAGAGAGCTACAGAGTTTTAAGACATTATGACATTTCATTTTACTTTTGTGGATTAAGAGATTTATAATGAATTATTTATTTTTCTTTTGCGGATGTAATGGTGGAGAGGATATCAATGAATATTTTATTTCTCTTTTTGTAGATATATGTTTTTAAGATGTTGCCATGTGGTATCAATATTTTCTTTTGACATATTAAATTTGTTTCAAACAACCCTTTCATAAACTATTTCATTGAAAATGAGGGAAATTTGACGTGGATATGCTTGTAAAACAGTGGTAGATTTATGTGTGGCTAAAGTTGTAGGTTTCGATTATACCTTAAATTTTAGGGCATGTTTGAATTATACATGTATCATTTTACCTTAGACTCTTGAAATTGTTACTAAACCATCATTTAAATATGAAAATATGATATGACTGATCAGTTGAAAAACTGGAGATTGCATGTGGCAATATTAGCGATGAGTTGTATGAGATAGAGATTTAGTTGAAATGTTGAGGCTACACATTGTGTGACAAGTTATGAACTGGCACAGCATCTCTTGACTATGAAATGCCAAACACTAAAAGAATGGAAGATGGGAGAACTAATAGAAAAAATTGGACATAAACATAACTCAATTGGTCATAGAATGTTTACTTTTGATTAAATTGGTAAAGGGTTGAGTCTCCCACCTTACGTATTGTATGGAAAAGCTTAGCATGAGAAATATATTATAGAAGAGTAGGGTTGATAAAAAGTGTGGATACAATGATAGATGAAAATATGAAAATATTTCAATCCTCAGAAGTAAGAAATTTATCAAGAAATAGTGGTAGCTCGTATTTATTTGTTTGTCTTCTCTTTATTCATTCATGCTCTAACCTTAACTTTTGTCAAGTGGTTGTGAGCCATAGGCTCAAATTTCATTTGTCTTTTTGTTGTCTATCTATGTCTTACTCTTTCAAAAACTTCATTTTACTCAAGTCATTTGATTGTGAGAAATGGAAAAAATATTTTACTATAATCTCTAAATTCACTCATCTCAATCTTTAGGTTATATGACGTTATCTTGAATGTGACTAAGACTCTTTGATTTTATTTTTTACTACCTACACATCATATTTTCATCTTTATTTTAACGATGAAGTTAACCAAACGTTATTTTGAAACAATTTTAAAAGATGAAAATAGATGTTTTAAAATGATAGGACTTTAACATGGATAATATAATTAAAACTCGCCACATTTGCTACATCTACTATACCGTTCACACAAATAACACATTCTCGTGTAACAAAAATTAAAAGTTGATAGGTTGATTATTTTGAAACAAATCTAAAGTTTTTGGATATAATAAGAATATTTCGTGTAGCCACCATAAGGGAAAAAAGGAAAAAAAAGAAAGTAACAATAATAATAAAAGTAAAGCCTATTAAATGAATAATAACAACAATAATAATAAACAAAAGGACTTAATAGAAGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCGCGTTTGGTTTAGAAGAGGAATTCATTTCAACGATTTGTCCTCTTTTATTTCGGTTGGAGGGAGAGGGAAGGAAGGCGCTAGAAGAAAGGAAGGGAGGGAAAAGAAGGAAAAATAATAACGCTATGCGATTTCGCTGGTGGTGGTGCCGGCGGCGACAGTCGGGGAGTAGAGGTACCGGACCGGCGGCCTCAAATGCTCTGCACAAACTTAGTCAGGAAGAAGAAGGTCGTTAATGGCCTTGCAATTGCAAATGAGTTGGCAACCGAGTTTACTGAGTCAGAAGCGGCGGAACGGCCCCCCACTCGGTCTCAAAAACCTAGGCAATACCTGCTATCTCAACAGCGTCCTTCAGTGTCTAACTTACACCCCTCCTCTTGCCAATTTCTGCCTCCGCAACCAGCACTCCTCTCTCTGTAACTATTTTTTCCTTCGTTTTTCTCTCTTCAATTTGATTCCATTTTCTGCCCTAATTAATTTCTCTCTCTCTATGTGTTTGTGCAATTCAGGCGATTCTGCTTCCTCCGACGCCGACCGAAAGCGCGAATGTCCGTTTTGCATTCTGGAGAGGCGGATAGTGAGGTCTTTGAGCTTGGATCTCACCTTGGACTCGCCTTTCAAGATCCAGAACTGTCTCAGGATCTTCGCCGAGCATTTTCGCTTGGGCCGTCAGGAGGACGCCCACGAGTTCCTTCGCTATGTCATCGACGCTTGTCACAACACCTGCCTCCGCTTGAAGAAGCTGCGTCGAAATGGAAGCTACAATGGTGGAGCTACCAGTGGAAGCTCCACGGTCGTGAAGGAAATTTTCGGGGGTGCCTTGCAGAGCCAGGTGAAGTGTTTATCTTGTGGAAACGACTCCAATAAGGTTGACGAGATAATGGATATTAGTCTTGATGTTTTGCATAGTAGTTCTCTTAAAGAGGCATTGCAGAAGTTCTTTCAACTGGAAATTTTAGATGGCAGTAATAAGTACAAGTGTGACAAGTAAGCTTTTATGTATCCATCTTCTTTCTCCCTGCTTTTGGAATCTTCTTTTGCTCGGGTCTGATTCGGGGAGATAATGGTTCTTTTGTAGTTGTAAGAAGTTGGTCGTGGCTAGGAAGCAGATGTCAATACTCCAAGCACCAAATATACTTGTCATCCAATTGAAGGTTTGTTCTGACCTTTGGTTCACTGTTTCTTTTCACCGTTCAATTCATCGTTGTTTGTTCAAGTTCCTAGTGTTGCTGCTTTCATGTAAAGGCATTGTTCTTGGATGGGTTTGGCAGAGATTTGAAGGCATATTTGGTGGTAAGATTGACAAGGCCATTGCGTATGAGGAGAGTTTGCAGCTTTCAAATTTCATGTGCAAAGGAAGTCAGGTGCGTGTCTAACAAAAAAATGATGTTTGCTGAAATGCCTCTTTATTAAGATTGCTTGTATGTTCGAGCTATGCACGTAAACATGTCCATTTAACTATATAAATACTATGAGGTACATAAGCGATGAAAACTTAGTTGGAATACAATTTCACTGTAAAATCGTGTGAGACTTTCTGCCTTAATCCACTCTTAATGATGAATGATGAATGTCCATATATCAAAGATAAGGATTTCTCTGCAAGTTACTTGGAAGACCCTACCCTAGACATTGGTAAAGTTGCAACGATCTTCTTTGACATATGGGAGGGACCAATGACCAATTGTCTACTCTTCTAATTAATTATAGGTTTCAGCCAGAGTTCTAGACTAATTATTGTAGCACAATGAGGTTTCCTAGAATAAATTCTTTATTCCTTCTTCAATCAATATTATATATCAAAAATTACATTATATATATTTGGACTTGCTCTTTCCAGTATGCCTGTAATTTTTATTCTTTTGCTGAGCACTTATATCTGCCATTTTCTTAGCTTGCATGCTAGAATATGCTGGATTTGGAGTGCAACTAAACCAAAGTTAATCAACACATCTTATTTAGAATCTTAAATGGAGACTTGCTGGTTGACTTGTTTTTTATGTGATTGATTGTAAATTTTGCTTGTGCTAGACATAAAATCATCTGTTTAGTTTGGATCCCTAAGTCCCATGCCAGCTTCCCCAAGATGCAATCAGTCACTTCAGGAACCGCATCTGTTAGGGGATGGTTGGTTTAAATGGTGTAGCTCTCTGCAACAAAGTAATTTACTTAGAAACAAAGGTTGCATCATGGCTCTAGCCTCCAGCGTATCATTGCAATGTTATTT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MSCSCDKERKFADGRNRFRRSLNRDVNKPEFVKCGVGKFREGKEGKIITLCDFAGGGAGGDSRGVEVPDRRPQMLCTNLVRKKKVVNGLAIANELATEFTESEAAERPPTRSQKPRQYLLSQQRDSASSDADRKRECPFCILERRIVRSLSLDLTLDSPFKIQNCLRIFAEHFRLGRQEDAHEFLRYVIDACHNTCLRLKKLRRNGSYNGGATSGSSTVVKEIFGGALQSQVKCLSCGNDSNKVDEIMDISLDVLHSSSLKEALQKFFQLEILDGSNKYKCDNCKKLVVARKQMSILQAPNILVIQLKVCSDLWFTVSFHRSIHRCLFKFLVLLLSCKGIVLGWVWQRFEGIFGGKIDKAIAYEESLQLSNFMCKGSQSKPTKWEMGGILDSGNIIWTAIGPLKSLCALVDLRPEYKLFGTIVHSGFSAESGHYYAYIKDASGRWYCCNDSFVTVSTLQEVLSEKVYILFFSRTNQRPVTASTALASNGVKSHECNGSDGSKISKPSVVTKTTTQTRSHVEQSSRKELSNLSKVDKPTFSPRGKSNMNGHSDMNGHSNSIRAPSTINGKIVLEKDQSIKENGKENVNSLPLENGARRKSSVGNGNSRKNFEVDHDVTERGQKPVLMNSNGNGGSMGMKADKHDLCGSNPMNNKFTAGRGSCHDEVDNSVNCSSEVKRAKRKSDFCILFQQDAQSRQRVEELKQKYSQERNFISFTIMRLVRGGLQLHAFKEEIMFTGNGQHPNCTTGGREESSGILFDFESRRQTAETQLMMCVKDIVYGFPKS Homology
BLAST of CaUC07G134300 vs. NCBI nr
Match: XP_038894470.1 (ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 908.3 bits (2346), Expect = 4.6e-260 Identity = 482/584 (82.53%), Postives = 492/584 (84.25%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. NCBI nr
Match: XP_038894460.1 (ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 903.7 bits (2334), Expect = 1.1e-258 Identity = 482/585 (82.39%), Postives = 492/585 (84.10%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. NCBI nr
Match: XP_004147765.1 (ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN53534.1 hypothetical protein Csa_014645 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 882.9 bits (2280), Expect = 2.1e-252 Identity = 468/584 (80.14%), Postives = 489/584 (83.73%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. NCBI nr
Match: XP_011653270.1 (ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 878.2 bits (2268), Expect = 5.1e-251 Identity = 468/585 (80.00%), Postives = 489/585 (83.59%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. NCBI nr
Match: XP_031739553.1 (ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25 isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 878.2 bits (2268), Expect = 5.1e-251 Identity = 476/615 (77.40%), Postives = 503/615 (81.79%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FPS2 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UBP25 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 448.7 bits (1153), Expect = 1.3e-124 Identity = 283/618 (45.79%), Postives = 354/618 (57.28%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B2RQC2 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Usp42 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 177.9 bits (450), Expect = 4.3e-43 Identity = 140/487 (28.75%), Postives = 221/487 (45.38%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D3ZU96 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Usp42 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 174.1 bits (440), Expect = 6.2e-42 Identity = 142/503 (28.23%), Postives = 226/503 (44.93%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E1B9W9 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42 OS=Bos taurus OX=9913 GN=USP42 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 8.2e-42 Identity = 141/501 (28.14%), Postives = 226/501 (45.11%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9P275 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USP36 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 172.6 bits (436), Expect = 1.8e-41 Identity = 106/356 (29.78%), Postives = 167/356 (46.91%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KXI2 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G064660 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 882.9 bits (2280), Expect = 1.0e-252 Identity = 468/584 (80.14%), Postives = 489/584 (83.73%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CZH6 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G001530 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 863.6 bits (2230), Expect = 6.3e-247 Identity = 461/587 (78.53%), Postives = 479/587 (81.60%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DYY7 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492980 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 863.6 bits (2230), Expect = 6.3e-247 Identity = 462/590 (78.31%), Postives = 479/590 (81.19%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V6W9 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold468G00770 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 859.0 bits (2218), Expect = 1.6e-245 Identity = 461/588 (78.40%), Postives = 479/588 (81.46%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DYX1 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492980 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 859.0 bits (2218), Expect = 1.6e-245 Identity = 462/591 (78.17%), Postives = 479/591 (81.05%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. TAIR 10
Match: AT3G14400.1 (ubiquitin-specific protease 25 ) HSP 1 Score: 448.7 bits (1153), Expect = 9.3e-126 Identity = 283/618 (45.79%), Postives = 354/618 (57.28%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. TAIR 10
Match: AT5G57990.1 (ubiquitin-specific protease 23 ) HSP 1 Score: 148.7 bits (374), Expect = 2.0e-35 Identity = 95/344 (27.62%), Postives = 165/344 (47.97%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. TAIR 10
Match: AT1G17110.1 (ubiquitin-specific protease 15 ) HSP 1 Score: 146.0 bits (367), Expect = 1.3e-34 Identity = 112/364 (30.77%), Postives = 164/364 (45.05%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. TAIR 10
Match: AT1G17110.2 (ubiquitin-specific protease 15 ) HSP 1 Score: 146.0 bits (367), Expect = 1.3e-34 Identity = 112/364 (30.77%), Postives = 164/364 (45.05%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G134300 vs. TAIR 10
Match: AT2G24640.1 (ubiquitin-specific protease 19 ) HSP 1 Score: 138.3 bits (347), Expect = 2.7e-32 Identity = 126/434 (29.03%), Postives = 180/434 (41.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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