CaUC07G132030 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGGTTTTGGCGATATTGCCCCGACGGATTGCTAAGGTTCGCTTTTTAACTTAAAAGTAGCGAAAAACTCATTGGTATTGATTGTGAGGTTTTATTCTTCATCAAATTGATTTATATTTCTTATTCTTTGGGTTTCATTCTGATTTAATAGATTAGCATTCATATTATCTTAGATTGTCTGACAAACTCTTCTTGATTGTATGATTGGATGCTTTTGATTAGTAGATAATACGTGACATATAATTATATGTTAATATTTAAGAAACAATATGTTAGATTCTTTTGAGATTGTGAATCGATGACAATAATTAGAATTGTGTAATCAACCTAGAGAAACTACATGAGATTTCTAATTAGGTGTTTCTTATTGGAAATTTACCCTAGCGTAATCCCTAGAGCTTAATGTGGTTAGTTCAGTTTGTTAGTATGCATTTAATCTAATTTAATTGGCCAATTAGATAATTAGGACCGTCGGTTAGCAATTCTAATAAATTCTAATCAATTTTCTAAGGACTTTTTTGGTTGGGCTTAAGAGTGAAAAGTTACACTTAGACATATTTTGAGGTTGTTTTGGGAATTGAAGTGTCACTTAGACACATTTTAGGTACGTTTTAGGTTGGCTTTGAGATTGAAAGTCACACTTACTTGGAATCGATAAGTTGTCTTTCAATTAGTTGTTAATGGTTTCTATTGAATTTGTTTTAGTTTATGAGTTTTGCTACCTTGTTTAATTTATTTCTTTTGATAAGTTGAGTTGTTTGTGATTAGTCGTTTATTGAGTTCTTTTTGTTTATGTTTATCCATTTTGCAATCAAAACACTAGATATGGAAATGAGAAAGAAGGAGCAAATTCCTATTGTATATTTGAATTCTCTGTTATAATTTTTTAAGTCTTTTTTAGAGTTAAAGTGTCACTTAGACATTTTTTAGGTTGGTTTTGAGATTGAAAAGTTGCATTTAGATATTTTTTAGTTGTTTTGAGAGTGAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTTAGGTTGGTTTTGAGATTGAAAGTCACGCTCAAGCATTTTTAAGTGTTTTTGAGAGTTAAAGTGTCAGTTAAACATTTTTTAGGTACTTTTAATCCCTAAAAGATATCTTTAAGTTTATTTAAAAGAAAAAAAAACATTTATCTGATTTCTTGCCTTAATTCCTACAAGGTTTAATTTTTTTTCCATTCTACAGGAAAAATAAGCAAAGATGGAGTCTTGTCTTTTGTAAACTTTTGAGGTAGTTTTTAGGTTTGGTTCGAAAGTGAAAGGTGCACTTAAGCATTTTTAGGTTGTTTTGAAAATCAAGGTGACTCATATAAACTATTTTGATTGTTTTGGGAATCACATTGTCTTTTGAAGACCTTTTAGGTACTTTTTATGTTGGTTTGAGAGTGAAAGTGTCACTTAGACACCGTAATTTGTAATTGGTTTTAAAATAACATTGACATTTACAAACTATTTATAGATTGTTTTGGGAGTTAACAAGTCTCTTGGATACTTTCTAGAAACTTTTTAAGTTGTTTTGAGAATGAAAGTGTCACTTAGACACTCTTAAAATACTTTTTAGGTTGAGTTTGAGAGTGAAAGTTAGCACTTAGACATTTTAAAATTGTTTTGAAAATTGAAGTGTCACCTACATATTACTTTTGAAAACTTCATAGGTTGGTTTTGAGTTTGAAAGGTTTTTAAGTTGTTTTGAGAGTTAAAGTACCATTCAGACACTTTTTAGGTACTTTTTAGTTGCTTTTGAAAATCAAAATGACACCTAAGAACTATTTAGGTTGTTTTGGGAGTTAACAAGTCTCTTGGACGCCTTTTAGGAACTTTTTAAGTTGTTTTGAGGGTGAAAGTGTCACATAGACACTTTTTAGGTTGATTTTGAGTATGAAAGTCACACTTAGGTATTATTAAGTTGTTTTGGGGGTTAAAAGGTCATTTAGTAACTGTTTAGGTAGTTTTGAATATAAAAAAGACACTTAAAAACTATTTAGGTTGTTTTGGGAGTTAACAAGTCTCTTGGACACTTTTTAGAAACTTTTAGTTTGGTTTTGAGTTTGAAAGTCACATTTAGTCATTCTAAAGCTGTTTTGAGAGTTCAAGTGTCACTTAGACACTTTTTGGTACTTTTATTTGGCTTTGAATATCAAAAAGACACTTTAAGAACTATTTAGGTTGTTTTGAGAGTTAACAAGTTTCTTGAACACTTTTTAGTGCATTTAGTGCTTTTATTATTTGCTTGAGTTGTAATGTGCTGTGGCTATCCTGTAGTTATGGTAGCCAATTCATGCATTTAGTGTCTTTATTATATGCTTGAGTTGTAATGTGTTGTGGTTATCATGTAGTTATAGTAGCCAATTCATGCATTTAGTGCCTTTATTATATGCTTGAGTTTAATGTGTTTATTATATACTTGAGTTTAATGTGTTGTGGCTATCCTACAGTTATGGTAACCAATTCATGCATCTTAGATTTGGTTGGACTTTTATATTTGTTTGATTGTTTTGGGAGTTAACAAATCTCTTGGACACTTTTTAGGAACTTTTTAGTTGTTTTGAGGGTGAAAGTGTCACTTAGACACTTTTTAGGTGTGTTTTGAGTTTGAAAGTCATACTTAACCATTTTGAAGTTGTTTTGAGAGTTAAAGTGTCATTTAGATACTTTTTAGGTACTTTTTGGTTGGTCTTGGATATTGTGAAAATACTTGAGAACTATTTAGGTTGTTTCGGGAGTTAAAGTGTCATTTAGACACTTTTTAGGCACTTTTTAAGTTCTTTTGAGGGTGAAAGTGTCACTTCGACACTTTTTAGATGTGTTTTGAGTGTGAAAGTGCTTAGGCATTTTGAAGTTGTTTTGAGAGTTAAGTGTCATTTAGACACTTTTTAGGTACTTTTTGGTTGGTCTTGGATTTGTGAAGACACTTGAGAACTATTTAGGTTGGTTTAGGAGTTAAAGTGTCATTTAGACACTTTTTAGGTACTTTTAAATTGGTTTTGAGTTTGAAAGTTATACCTAGACATTTTGAAGTTGTTTGGGGAGTTAAAGTGTCAAAATGACACTTTTTAGATACTTTTTGGTTGGTCTTGGATATTGTGAAGACACTTGAGAACTATTTAGGTTGTTTTGGGAGTTAAGGTGTCATTTAGATACTTTTTAGGAAATTTTTAAGTTGTTTTGAGAGTAAAAGTATCACTTAGACACTTGTTAGGTGGGTTTTGAGTTTGAAAGTCATACTTAGGCATTTTGAAGTTGGTTTTAGGTACTTTTTAGTTGGTCTTGAATATCATTTTGAAAGTCATGCAAATGAATTTGATTTTGATCATGTTGTGCTTATTGAATTTTAATATTATGCTTTCCAGGTCTTTATATTTTGAAGAAGGCCATAAATATCATTTTTTGTGAAGACCAATTGACCAAGCAAAACATTTTTTGTGAAGACCAACCAACTGATAGAACCATTTTTTGTGTATTTAATATAATTTTGTTCAATTTTTATAGCCAAAATGAAAGCTAATAGCTCAGGAAACAAACACTAAGAATAGTTTTTCAGATTTTATATGGTCGAGGAATTAGATGTTGAATAAACTTATTATTATGATGTTAAACATATTTTGTTACATGAAATTGAAATTATTTTTATTTTAAATATTGATCCCCAAGCATATAATATAATAACAATAATAAATGCATTGGCAGTTATAGAGCTATGGCGACGTTTCGTGCGTGGGCAAAAACGAATCTTTTCGCCACGTTTACCTATGTGTAGGCATAAAACAATATCTACCGACTTATCATGCGTGGGCAGAAATCAATATGTCGACGGAAGTCATAGCGTGGGCAAAAATGTGATTTCTAGCCACACATAAAACGTGGGAAGAAATGTGATTTTTGCCCACAAATGTTGATGCGTGGGTAGAAATCGAGTTATGCCGATGGACGTCATAGCGTGGGCAAAAATGTGGTTTCTGGTCAAGCATAAAACGTGGGAAGAAATGCAATTTTTGCCCACGAATGTTGATGCGTGGCCATAAATCAATTTTTGCTTACACATAAAACGTGGGCAAAAATGCGATTTCTGCCCACTAATGTTAATGTGTGGCCAGAAATCAATTTTTGTCGACATTTGTAACATGGGCAAAAAGGTTATTTCTATCGACGCAAAAAGGAGATCTACTAGCAGCGTTGGGATGCTCTAAAAATTTTATGCGGCAGATTTCGCGTCAGTGGCGCGATGCTGTGATAGATTCTTTAGAAAGAAATCTTCGGCATCTAGGTTAAAAATAGCCGGACCAGCCGACTTTTGGCTCCATTCTCTCCTCTTTTCTTCTTTTCATCCTTAGGAACTTGAACCTAATAATCGATATGCCGATTATTGGCTAAGGTAATGTCTTTCTAGCTTGGGTATGGGGAAATTGCACGAAATGACCCAAAAACTAAAAACTTATCTATGGATGACCCGCTCCCAAAAACTTGACCATCAGTGATCTTTTGGCCATGTGAAATACTGATTTTACCCCTCAAAATTAAAACAACCCAAACGCGCCTTTTCATTTTTTCTTTAAAAGTCGCCATTGGTGGAAAACTTTTACGATATTTGAATGATCGCTTTCTCTCTCAACCTTTCCGCTTTCTCTTTGAACCTTTTGCTTTCTCTTCTTCCTAGTTGTCGTCTTCTACTTCATCTAAAAGGTACGCCCATTACGATTGCCCATACTAGGTTTAACGATCACCCCGTCGTAGGTTTAATGTTCGCTCATAACAGCCTTAACGATCGCTTAGCATAGCTCAAGCGATTGCTGAACTTTGGTGAAACGATCGCTAAACCTAGAATAACTGATCGCCCAATCTAGGTTATACAACTAAGCGATAGTTTAAATGACTATGTGATCGTTTAGATTACTACGTGATCGCATAGATTACTAAGCGATCGCTTATTTCAATAAGCGACCGTAGAGTATGGACTAAGCGATCGCTTAGTATTT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BLAST of CaUC07G132030 vs. NCBI nr
Match: XP_023543023.1 (uncharacterized protein LOC111802764 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 5.4e-09 Identity = 33/40 (82.50%), Postives = 35/40 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. NCBI nr
Match: KAG7033009.1 (hypothetical protein SDJN02_07061, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 5.4e-09 Identity = 33/40 (82.50%), Postives = 35/40 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. NCBI nr
Match: XP_022990398.1 (uncharacterized protein LOC111487268 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 5.4e-09 Identity = 33/40 (82.50%), Postives = 35/40 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. NCBI nr
Match: KAG6602326.1 (General transcription factor IIF subunit 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 5.4e-09 Identity = 33/40 (82.50%), Postives = 35/40 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JT60 (uncharacterized protein LOC111487268 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487268 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.6e-09 Identity = 33/40 (82.50%), Postives = 35/40 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HM37 (uncharacterized protein LOC111464821 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464821 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.6e-09 Identity = 33/40 (82.50%), Postives = 35/40 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPS7 (uncharacterized protein LOC103503307 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503307 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 7.6e-09 Identity = 39/69 (56.52%), Postives = 42/69 (60.87%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TBC4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold98G001170 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 7.6e-09 Identity = 39/69 (56.52%), Postives = 42/69 (60.87%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSW1 (uncharacterized protein LOC111489465 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489465 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 69.3 bits (168), Expect = 1.7e-08 Identity = 32/40 (80.00%), Postives = 35/40 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. TAIR 10
Match: AT4G25030.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G45410.3); Has 125 Blast hits to 125 proteins in 36 species: Archae - 2; Bacteria - 31; Metazoa - 0; Fungi - 4; Plants - 88; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 1.9e-04 Identity = 24/44 (54.55%), Postives = 27/44 (61.36%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. TAIR 10
Match: AT4G25030.2 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G45410.3); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 1.9e-04 Identity = 24/44 (54.55%), Postives = 27/44 (61.36%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. TAIR 10
Match: AT5G45410.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G25030.2); Has 124 Blast hits to 124 proteins in 34 species: Archae - 2; Bacteria - 31; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 91; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 41.6 bits (96), Expect = 7.3e-04 Identity = 22/45 (48.89%), Postives = 27/45 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. TAIR 10
Match: AT5G45410.2 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G25030.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 41.6 bits (96), Expect = 7.3e-04 Identity = 22/45 (48.89%), Postives = 27/45 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC07G132030 vs. TAIR 10
Match: AT5G45410.3 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G25030.2); Has 124 Blast hits to 124 proteins in 34 species: Archae - 2; Bacteria - 31; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 91; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 41.6 bits (96), Expect = 7.3e-04 Identity = 22/45 (48.89%), Postives = 27/45 (60.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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