CaUC06G121860 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC06G121860
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr06: 26943587 .. 26947673 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC06G121860
SyntenyCaUC06G121860
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGTTACATTTGGTTTCTCGCTGAAGTGGGTGTGCTCTTTTGGTTGCTGTAGGTTTCTGGGTTTTCCTCAGCTAACTCTCTCATGATTCTTCTCCAAACACCATATGCGTCCCATGTTTCGAAAACCCGAAGGCCCTTTCGTTTCAACTTTTAAGCTCTCATCTAAAGAACCACACTTGAAACTTTGGCCATTTGTGGTGCAATTGTATGTCAAACCATCAGTTCAACCAACTGCACTCACTCTCCATGAAAGTTTTAACATTTATTGGCATGATTTCAGCCAGACTAATTTTTGGTATTTAATATACAACGATTTATATGTCTTCAGTCATTTTCATCCAATGGTTCGTGTTAAATAGGTTAGGGTTCTGGAGTCCTGATTGGGCAAATTAATAAACAGTTTGGATTTTTAAAGGCTGAATTCACTGTCATCTTCTTGTAAGAGTTAGTTAAGTGGGTTTCTTATGGAAATATGTATTTTTAACTTTAATTTCAGTTTAGATCTTGTAGTCACTACTTGCAGCTCTCTATAAAACTTATTTCATTTCCCAACTTGCTGCTATTTTTAATTTCATAGGTACATTTCCATCCTATATAGTTGCAATACATCTTGCAATCTATTAGTGCAGCTCTTGTAGCTTCCCATGTGTGTTTTCAGAGTGAGGTTAAAACCTATGGTTTTGCTTAGCCAAATTGGTTAATGTGATGGAAAAAATTATTCACTTTGGATTACATATCTACCATATTTTCAAAGTTGGACTTAACTTTTAACTTTTTATTCATGAATAAATGTTTGTCTCTTTAAAAGGATTTCATTTTGCAGGTGAAATAGCCTAGAAATTTGTTAGGATAGACCTAACAAGATAAATCAAAAGATAGTAATATATTGTAATATCAAAAGAAGTTACAATATATTAAAAATGTTATACGAATAGAAATTTCTAGGCTATTTCACATGATTTTATCTGTTTATATCTTTTCTTATTGAGAAATCTAATATTGTTCACTAGGTTTTTCGATTTTTGCTATATGTTTATTATTATTTTTAATACATCTAATATGTTGGGTCTTTAGATTTAAAAAATTCAAATTGAGAAGAAAAGGAGCGATAACCACAATTTTAATTTTAAATAGATAAGTCCCACTGTTATTTATCCAGATTATTCGTTAAACCTCATCTTCACGTTGGGATGCCGTTACAATCGGCAAACAGGGGGAAATCAACATTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTATTTGTCTGTTGAAGCATGTAAGAATGTATCTGCTAGGATGACAGTCAGTGGTTGAGCTTCAATGTAGCCAGGGAGCAATGTTGAGAAATAGATGGGTAGAAGGCTTGCTCTGTGGGTGTTTGAATGCTCTCCTCAGTTGGACAATTCAGAACGAAGCGGAAGATATGAACGATTAGGAATGAAAAGATGAAAGTTTGAGAAACTACCTATAGTATCGGAAAATTCTTGTAGAGAAAATTACCTTTTTAGACTTTGAGTCATTAAAATGTATCTTTTTAATCCTATGTTTTTTAAAATAAGTTACTAATGGCTAAAGTGATAACTCAACTAAAAACAATAGTTATCAACATAGCTCAATTAGCATAAGACTTGTGTTATTGACCTCATGGTTAGAGGTCTATACCCCTACCCCATATTTCAGGATTAATGATTAGATATGAAATGAAACACTTGAGGATGCCACTCATTCAAGCAGCTCCTATGATATGATGCTTTAGGATTTGGTGGCTTGCCTTGCTGCGTGTTCTTCAATGGAGCTGAACCTTTCTCAGCTTCTTTTACAATTTCATGAAACTCCATTGGCCCACCACATGGAACTCTAGTGATTCTCAGTGGGTGTAATCCACTTATCATCTTCTTGTCATTAATCTCTGTAGCCATTCTGTCTGGAATTGTGAATGATATCCCAAATTTGATCTGAGGCAGAGTTCTTCTGATACAAAAAACCTTCATTCTTTGCTTTGTGGCTTTTTCAAGCTTCTCTGTGAAGCCAAGCTTTTGCCTTATTGACAGCTTCTTGACTTTAAACCGTTTTGCTATCATTCGAGCTCGGTACCTCTTCGTCTTTGTGTGTTTGTTTCTTGTTTTGGTCATGGTTGGGGTGAAGATTTGGAATGCAAAAATGGAAATTTTCAAGCTGTATGATAAGGGAAATTAGGGCTGCTTTTGTATTCTCAAAGAAAATGAGAATGAGTAGAGTGAATTGAAATCCCATTATAAAACTTATTGGAGAAGCCTAAGAAGCGTATGAAATAAGCATCTCTTGAAGGCTCAGACTTAATTATTATTCCCACGCTTAGTCTAAGCATTTGTTTGCCATTACATTTTTCGATCCCACCACTTTTTAGCTTTTATTCTCGGACGTATTCATATGGTCAAAGAAACTCTCAACTTCTTTCATCTAATCCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCAATGTTCATCCTTCCGTTATATATTGATAGGTCATTCTCCATTTCGTACTCGGATTCTTGTCTCCAAAGGGGTCACTGTTCTTTTTACCTCACATCAATCCAATCTTAAATTGAATCTTGATTATAATCTTTGAAGTTATGAAATCCTTGGCATTGATTAGTTGAAGGGAAATAATATGATTTTATTGATATAGGCCGAAGCTTTTTATAGAGAAACTAATACACAAACACCTAATAATAAATGGCCTAACTGAAACGAATACACGTAATACCAATAATTTAAACTCTCATAAAATACTCCAACCTTATGAGTTGTTTTGGGAAGAAAGTTCATTTACTTCAGATCAACTATATTATTCATAATATCAATAATAAAATTAGATTGTTTTCAAATATAGAAAAATAAATTAATTTATTTATAAATATATAAATGTAGATACTTGGCAGTTTTACCATTTAAAAAAAACATAAAGAAGAAAGAAAAAGAAGTTTTCGAAGTCAATATTGATTTTCATTGGATTTTTGCACTGAAAAACAGAGATTCTTGAAAATGGCTACCCACGTCCGCCGCCACTTCTCCACCGCCGGCGACCGCTTTCTCATTTAGTGCGCTGCCGGCAACTGCTTTCCTTTCTATTCCGCGCCTGCCGCCTTCATCCCCTTCCCAGTTCGTACGCCTCCTCCTTTCAGTGCTCGTTTCCGGCCACTCCTCTTTCCCGCCGTTTACCACCGCCCATTTCGCCGTTGATTTACAAATTTGCCGCCGCCTCCGTAAAGTTTCTATTTTTAAGGTTGAATTTCCTTGTCCCATGGCTGAAAATTGGCAATGGTAATAGATTTTGAATGTGATTAGTTCGATTCTACACACACACACACACAAAAAAATAAATAATAATAATAATAAAATAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAAATTGAAGATTGGGGTGGTGAGAGTAATTTCTATGATGTTTTGAATGAAGTTTTGGACTTTCAATAACTCAAAAATAGACGTGTTATGATGTTCTAAGTGTAGTTGGTTAGAATCACAAAACTTGTTACTTCCTACCTTCAATATCATGAGGAAGATCCTCTATTATTCTCTTAGGTCTCTCACCAACTAAATCAAATATCTCATTTACTTTGCAATTTGAATAGTTATGGTCCAAGTGCAAACATATCCATGAGTTTAGATTCAATTTAAATTCTTAATGGCAATGCAATCAGTGGAACCAAAGGTAACCAATTGTGAATAATAAGTGTTTAGGTTGAATGCGGATTAAAAATAGTAAACAAGGGGGAGTTGAGCATGGATGCAGTTTAGTTTCAACCTTAAGACAATATGCGTTAGGAAATGCAGCTACATCATATATAGACAGTGACTTGTCATTGACAAAAAAACTACTCATTTGATCTTGTATCAAGTTACTTTAAGACCCTAAGTAGCTAATGTTATATTTCTATGGTTGGTTGAATCCTAGATTAATTTCATGCAATTTCTTTATCTTATGGTGTAGTAGGTGTAACATATGTTGCACCTAATCTCATGCTTAGGTGCTCTGGTCTGCACAGAAATGGGTGCAGCCCAAACTCCATTTAA

mRNA sequence

ATGAGGCCGAAGCTTTTTATAGAGAAACTAATACACAAACACCTAATAATAAATGGCCTAACTGAAACGAATACACAGATTCTTGAAAATGGCTACCCACGTCCGCCGCCACTTCTCCACCGCCGGCGACCGCTTTCTCATTTAGTGCGCTGCCGGCAACTGCTTTCCTTTCTATTCCGCGCCTGCCGCCTTCATCCCCTTCCCAGTTCGTACGCCTCCTCCTTTCAGTGCTCGTTTCCGGCCACTCCTCTTTCCCGCCGTTTACCACCGCCCATTTCGCCGTTGATTTACAAATTTGCCGCCGCCTCCGTAAAGTTTCTATTTTTAAGGTTGAATTTCCTTGTCCCATGGCTGAAAATTGGCAATGGTGTAACATATGTTGCACCTAATCTCATGCTTAGGTGCTCTGGTCTGCACAGAAATGGGTGCAGCCCAAACTCCATTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGCCGAAGCTTTTTATAGAGAAACTAATACACAAACACCTAATAATAAATGGCCTAACTGAAACGAATACACAGATTCTTGAAAATGGCTACCCACGTCCGCCGCCACTTCTCCACCGCCGGCGACCGCTTTCTCATTTAGTGCGCTGCCGGCAACTGCTTTCCTTTCTATTCCGCGCCTGCCGCCTTCATCCCCTTCCCAGTTCGTACGCCTCCTCCTTTCAGTGCTCGTTTCCGGCCACTCCTCTTTCCCGCCGTTTACCACCGCCCATTTCGCCGTTGATTTACAAATTTGCCGCCGCCTCCGTAAAGTTTCTATTTTTAAGGTTGAATTTCCTTGTCCCATGGCTGAAAATTGGCAATGGTGTAACATATGTTGCACCTAATCTCATGCTTAGGTGCTCTGGTCTGCACAGAAATGGGTGCAGCCCAAACTCCATTTAA

Protein sequence

MRPKLFIEKLIHKHLIINGLTETNTQILENGYPRPPPLLHRRRPLSHLVRCRQLLSFLFRACRLHPLPSSYASSFQCSFPATPLSRRLPPPISPLIYKFAAASVKFLFLRLNFLVPWLKIGNGVTYVAPNLMLRCSGLHRNGCSPNSI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC06G121860 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC06G121860 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC06G121860 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC06G121860 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC06G121860.1CaUC06G121860.1mRNA