CaUC06G111980 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC06G111980
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr06: 6492100 .. 6503864 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC06G111980
SyntenyCaUC06G111980
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATCTTGAAGATTGGACCTCGAAACAATTACTGATTGAAGCTCAAAGAGTAAGGTTTTTCTCCTCTTTGCTGCGATTTATTATGAGATCTAGATTGTTTAGCATTATCTTTGGTGAATTTGATGGAAATGCGTGGGGAAAAAAAGACACGCAGAGTTCAAACAAAAAGTGTGAACAAGTTTATAGTTTATTGAAGAGTTCTCAATGCAAGTGAATTTTTTCTTCTCACAAAAGTTTTGTTTGATTATTTCATTACGGAGTGTCCATCACACAGTTGAATCGAGCAGATAATTTAGTAGCACATTTTTTCTGCTTAATGGAAATATAAAAATATCTTTATCAGAAAGCGGAGAAGAGTTGTAATAGTACCTAACGCTGTAGGCTTGAATCCTATTTGCTCATGAGACTCCATAAAAGTACCCCAATAGGACCAAACCTGATCAAATATTTGACGAGAAATTCCTCCCTGGAAAGCAAAACTCAGAATTATCTAACATGTCCAGGTGAAGGACTAGGAAGCCAGAGTTGAAGAAAATGAAGAATTCCTAGCTAGTTCGAAAGATTTTAGATGCTCCGGCAGCAGAAAATGTAGAATAGAAAATCTTGGAAGTAAACAAAATTTAGCTCAATCTAGTTATCTAAGGGATCAAGAACCTAACCAGCGGTCAGTGAAGGATAAGCATACAGCTAGTTCGTGAAGCACACCTGTTCCCGCAGAAACCTAAATCCCGTCCATATTCCAGCTTAGATACAATACAACGCAAAATCAAAAGTTCAACTAGTCAGAGATTAAACAGATGCGCAGACTCACTTCTTCGAGTTTTGAAAAAACGACTTGGAGCAAAAACCAGCTGAGAATTCCTTCTTTGTACAATAAGTGACTCCGATTGATTTGCTTCATCCAGAACACTGATCGTCAGCTATACATCAACGCGCTTAATCATCGATTCCTCGATCGTCGTCTTCCTTCCATTATATATAATCTACAAGAGCACAGTTTAGAATATCAAACCTACAGCCGCAATTGACTGCACAAGTAGCAGACTACAACCGAGAAATTTGCGGATTGACTTGAAATAAAGCGCAAAAAACGTTGCCGAGAAGTTTCCTCCACCTATGGAAGTCCCGGAGATGTGATACTAGCTTAACATTGCCTCTGTTCGCTTTGCCAAGGTTCAGAATGGAGCGGCCGAAGGAAGAAGAGTGAAAAACTTCACAAACCGTGATTCAGATAAACAGAAGCGATAGAAGATGAATGAAAATCTTCATAAATTATGATTCGAGGTTCAACGTGAGAGAATGTTGGCGATTGGCCATGGATCGGAGGAGGGAGAACTGAAGAACGAGTGAGTGAGCGGGAACAGAAAAGCGAGGATTGAAATTATAAATTCAATGGCGGTTTCGTCCCTTATATATGATCCACTGTTTCATGTAAAATAATGGTTCTTTTTACCATATGTGTTCGTTCAATTGGAGAAAGAATAATTAACTAATCTACATTGTATCTCATAATTAAGATTGAAAAAAATGCTACACGAAGAAAAACTAAATATAAACTATCTACCAACCCCCAATTTCAACTAAACAAAAAACTTCAAACAATATTATGAGTTATATCTCCATTGTTTAGGGTTCACCTGACCCTACTTAAGCATGTATATTATGTTAATGAAGACTTGGTGTGAATTCTTGAGTTTACTATAGAAAGAGCAAAAGGCCTAGACTATAGAAAGAGCAAAAGGCCTAGACTAGGGTAAGTTTGGGGAACAGAGTAAGTGAGCAAATGTGTTTACAGTCAAAGTCAAAGATGATTGTTCTAGGCAGGGCGGGCCGTTTTCAAATGAATTAGAATAATTTTTTTAAGTGACAAAACTATTAGAAATATTTTCAAATGTAGCAAAATATTATTTCCTATTATAGATACAATAATAAATATCATTGTCTATCACGGATAGATAGTGATAGACAATAGTAGTTTATTAATGTCTATTTTTATATTTGTAAATAAATTGGCTCATATTTGTTGGGTTTTATGTCCTAAAACCCGTAGTTTGTAAACTTTGAACATATTCTCAATAAAGTTTCTAAGAAGAAGAAAAAAAGAAAAAAACATATTCTCAATGAAGTTGTTATCGAAGTTTATTCAGTAAAAATGTTATTGAATATGTGAATTACATTTATTAAATCCAATAAGCTAAGAACCCCTGACATAAATTGGATCAAGTTTAGGTAATAGCCAAAACGGGCTATAGTATAGGGATAAGGTTAGGTAGATTCAGCCCATTTTGTATTTGATACAAACGACGTGATTCTATATCGTTCATATAGAGACATGAGAGTGGGGCATCATATGCAATGAGTTTTCATAAGACCGGCCCATGAAATAATCACTTTTACTTTATAACGTCGTTTATTGTTAAAGATTGATTATTTCAACATGACGACCTAGGTAACTTGATCTTAATCCTAAGTTAGCTATGAACTCTTGTTTATTTGGGACTATCTTTTAATCTGCATGAGTGAGAGTGGCTAGAGTTCGCTGACTCAATAAGCCTACCATTTTAGGGATTAAACCAGGTAGATAGCTGCGGATATAGTCTTGCGAAATGGAATTCACTCATACCTAATTTTAGGTTAGTAGAGAAGTTGTTCCCTTAAGTGTTGACCCCGAGTCTTAAAAAATGCCCCACACCCTCTCATTGGCCCAAGTGGGACTCGGTTTGATGGTTAGACACAAACTAATTGTCATTAGAGGATTAGTGGACTTAAGGAACAAGATGTAATTACATGGGTAAAATGATAATTTTGACCTAGCTATAATTACGAACAACTTGTGAATGATCAACTTACTAATCATGGCTATATCAAGTGGATATGAATATATCTACAGTGAGATTGCAACTACAACGAATGTTAATTAACTAGGTTAAATAGTTTAACTGGTTAATTTTGGATCGTTGGAGCTCATGATATGTAGGTCCATTAGGCCCCCTTATTAGCTCTTGCACTAATCTTTAGAACAGTGTGATGAAAGAATTTGAAAATGTTCAAATTCATTTAAGAAGCAAGTTTTACGACTTGTTCATTTTAATTATGAATTAAACGGAATTGAAGTGTTGAGAATATTTATAGTTAAATATTAATCGGATGAATAGAGATTCATTGAGTTGGAAATTGACAGGATAAGTGAAAAATATATTAATTTAATATTTAATATTAATTTAATATAAGTCATTATTATTGAAATCAATTTTATATTAAATTAATTATTATAATTAATTTTAAAAGAAATAAAATTGAAAATTCAATTATTTATTTTTTAGAAAATCAAAATTTCAATTTCTTTGGATTTCTCCACTAATGCATGGTTGAAGGAGAAGGTGTTCATACGGAAGGAATCAAATTCCCAGCAGAAGTGAATGATCGCCTTGTGCCATTAAATTTAGTTTTGGAAAACCAAAATTACAGAGAACATGCATATGGATAAACAAAGTAATTAACATACCTTTTTTAGAAGAGTTAAGAGAAATGATGTTTCCTACCTTTGAAAACCGTATTCAATGTGGAATTCTTCTTCTACAAACCACTAACCAAAAATTCTCCAACAAAATCACTATAATAACTTTTATTCTCTTGGGAACACCACCACCACAACGTTATCTTGCTATTCTCGAGGTAGAATCAAAGAAGAGTTTGTGGGCTCTTTTTGTTTCTAGTAAGGGAAATATTTGAAAGGACGAAGAGAATTTGGGAGGGAATAAGAATTTTTACACAACACTTATGCAAAAAACTCACAACCATCACTTTTCTCTTTCCCTCTTTGTTTTTACGTAAAAACAGTGAGAGAGAGCAAAATAACTCCCGTAGTGGAGAGTTATTTTTAATTAATAATATAATATTAATTAAGATTAGTATTAATTTAATTATAATTTATTAAATCATATTTAATAAATATAGTTAAATAAAAGTAATTAATTAACAATTAATTAATTAATTAAATATCTCATATTTAATTTGAATCATATTCAGATGACCTCTCACATAACCTATAGTTTTAATATGAATCTCATTCATATAATTTATTAAATCTCGTTTAAATATATTATTTTAAAAAAAAATTATTTAAATATTAATATCCCTTATAATATAAAGTATAAATTTTGAATCCCATCCAAAATAAACTTTATATTATAACGTATTTATATACATTATGCTAATTGTATCACATACAATTAACTCCCTTATTAATTTGAAATTTTCAAATTAAACCAAAATTTTTAATTATTATACTAATCATTTATGAGCTAGCAATGGGACCTTATGGACCTATAGTTAGAAGTTCAAATGATATGAGATTAATCAATTAAACTATTTAATTAGATTAATCAATATTCATTAACTCTAGGTCACTCCACTAAAGATTTACAATTGCACTCTTCGCATTATAGATATATTTATGTGTCCATGAAATTTATTAATCAACAGTAAGTCGATCTTTCAAGAATTACTCATAACTACAACTTGGTCAAATTACCGTTTTACCCCTGTAGTTATATCTAACTCCTTAAGTACCACTGATCCCTCTAATGAACAAATTGTTTATAGTCCAACTATAAACTAACCCCTCTCAGGCTAGTGAGAGGGTGAGACCTCATTGTTCAAGACCTAGAATCAACCCTCAAAGAAGTGATTTATCTATTTACCATAAATACAGAAAGGAGTGAATTTCATCTTGTGAAGATATATTCCCAGCTCCCTAATCAGACAAATCCTCAAAATGTTAGGCTTATTGAGTCAGCGATTTGGCCACTCTCAGCCATACAGATCAAATGATTGCCCTCATAGACAGAAGTTCATAACTCACTCAAGATTCAGGTCGAGTTACCTATAGTCATCCTATGAAATGTTAATTTCTACAATTAACAAAGCTACAAAGAGAAATTAAACATTTCGCGATCCGATCTTATACAAACTCTTTGCATAGGATATAGGATCAAATCGTTTGTAACACTTTACAACTCCTTATAACAATTACAAAGTGAGTCGTACCAGTAGTGTTACAAAAATAAGGCACCCAACTTTATTCCTATACTACAAACTTTTTTTGTTATTACTTAAACATGATCCATTATTGTATGTCAACCACATACATGTTTAAGTTTACATAAAATAACGATGAAATCTTAGTTTATTGGATTGAGTTAATGTATAAGATAGATAAAACAACTTCTTATTTTATTCAATAAATAAAATGTATTTACAATTTACAAAACTACAAGACCTTAGAGATTTAGGACACATTAGTACCAACACATACCTCGTGGCCTCTTCACCTCCATTAAACACCTCCTAATTGATTTTCTTAATCACCATATTTGGTGGGTTGATGCATGTAAATGAGATTTGCATGGTTTATTTTTTAAATAGAAAAAAGAAATTTAGAAGAAAGGTTAATCTTCTTGGTGGTCCACGAAGTGTTCGTGATAAAAAACTTGGAAAAAATCGCTCCAATTTTGAACTATAACAAGTAAGTATAAAACCTATGTTTTTTGGTTTTAAGAACAAGCATGTTTAATCCTAAAAATTGATGCAGTTAAAGTGCTCTAGATCCCAATTGCTACTGCATTTATGTTTTTAACTCATTCAATATTATTATAATTGAAAATTGCCCAATGAATTATTAGTAAAAACAATTGTATAAATTCGAGTGTTATATAATTTTTTTATTGCAAATATATGTTTTAATCAATTGAGTTATGTACAATTTAAAAAATAAGTCCGATTAATTTAGTTAGTTGAGAAAATATTGTTTTTGAGGTATTATTACTTGTATAATAAAAAAAAATAGAAAAAACTTGAACACAGACTAAAGTACTTGCACCCAATACACATACTATTGTAATATATACTAAAACAATATGCACCTTAAACAGAGACTATTATAACTCATACTATTTTAGTTTGTACCTCAAACACGTACTAGTACAATTCGTAACTTACATACTGTAACAACTAACTTTGCACCCCAAATAGCCCTTCAAAGTTTCATCATACTCTCATGCTTTAAACAAAAAATATAAATAAATAAAACTAAAAATTGCCTTTGCTGATAGTATATAGATAAAATTGTATCATTTATCTACATCTCATCACTATCTATTCTATTTTTCTATCACCTGCTTCAATCTATGGTATAACATTTCCCTAAGATCAATAAAACATGTTTTCCTAATGTGATAAGACAAACATCAAATATCAAATTATCTATCTTTTTAGGGTATTCACGTGACTAAACCCTTAAAGAACCGTATCTTAAAATTGAAATCAGAATATAAATAATACTTCGTTGAATTAAATGGAAACAATTGTTATTATTACAAAATGACGAAAAAATCGAGAACGATAAGAAATCGGGTTGAGCTCGTTTTGTCCTTTCTCAATTGAGCTAATGTGCATAACTTTGGTCTCTCAACTAAGGGAAATTTACGAGAAAAGTCACAAAGAACTCACTTCCTAATAAGTTCAAACTTAGTTGGAAGAAATTAGCTCTCTGTCACTTTTCCCGTAAAATGCTTATCATAATTTTACAGGAAAAATCACAGAGAGTTAATTCCTTCCGAAAAAAGTTTGAACTTACCAGGAATTAGCTCTTTGTGACTTTTTCCCATAAAGTTCTAATCAACATTTTACGCGAAGGGACAAAGGGAATTAATAAGGACAAAAACGTCATTTCGCATTATTGGCCCTCTTAATACTGAGTCCATTTTTTTTTATTTATTTATATACCGTGGTATATACCTTTGTTTATTTGAAAATTATGAAATGTATGATATATATTATGATATAAATGAAACTTATGACACATACTGTGATTTATGTTAAATATTGAGTCAATCTATAATTTATATACTATGGTATAAATAATGAAGAGATGATTAAAAATATTTAATCTTAATTTGTATATTGTATTGTCATATAGTTACGGTTTTATCGACACTTTCGAAAAGTATATTTCAAATATACAAATAAGTCTTGATATATTGGGAAATTATTTTAAATAACAAAATTGTTGAAAGGTCCTCTCATGTTCGAAAGAATCGAAACACAACATATTTATAAATAATAGCAAAATATCACCATTTATATGCGATAAATCGTGATAGATAGTGAAATTTTGTTATATTTGTAAATATTTTGGTTCATTTTCCTATATTTGAAAACAATCTTAATATATTTCGTATATTAGTTATAATATTTTCAAACATTTAACCATAAGAATGAATAAGCAAAAAAAGCTTAATACGTGAAAATAGAAAAAAAAATCACATTAATTACAAAATATGAAAAAAAATCTCAACTAATTAATAATTCATAATAAAAGTATATTCTCTTTCCAACACATTAATTAATATATATTTTTCCAAATTCTCTCTCCATCATATTGGAAAAATATGGATTTTATTTTTGCCTAATAAATAGCAATAAATGCACTCAGACTACCCATAAAAAATGTAAGTTTTGTTGTAAAATTGAGGAGTAAAATGACAGAAAGATGAGAGCACGAAAATCGAAAAATTATAATATTAAAATAATATAAAAGTAATTAAAATAACCAAATTGAATAAAATAAACTAAAATAAAGAAAGTTGGATTTTATTGAAAATTAAATTTCAAATTTAACCAATCATTTATCTTCTTTTTCTCTCTCATGTGTGTTATAATATACATCAAAATACTCTATTTATAGTTAATTTGGCAAGTAGGTATGACATTTCATGGTCACGAAGTATGTGTCATTAGTAGACACGTGACCTTTAAAACTTAAAACTAAGCACATTTATATAATGGACATTTAATTTGTTCTAATATTCCTAATAAGTTTATCATATTTTTCAATTAAATCCTGAAAATGAGAATATCCAAAACTTTAAAGTGTTTTAGGTTAGGGGTAAATTTAGTCATTTAACCAAATGTGTAATTAAACACAATAACTAAGGATGCTTTGGTAATTTCATCTTCGAAATAATCATTTATTTTCATTTAATCAGCGGGCGTAGAAAGAGAAGAATCGCGAACGAAAGCAATCGATACCGTAGAATTTGCATCGAATCTCTCAGGCGAAGAACCCTCACTTTAAACGTTATTACATTAACAATTTTCAAAAATTCACCAGAGAAATTCATTCACTGCAAAATCCCTTTGATTTTCTTCCGATGCCCAAACTTTGCGTTCCCCTCAAACTTTTCTTCTCCTTCAACTCTATGTTTTTGTTGCTCTTCAACTGACAAAAAAGCACAAGTAAGCACATATTTTTATTTATGCTATTTTTCTTCTTCCTCGAAATTTCTATGTATGAATATGTTTGGGGGTTTTGTTTGAATCCCATCACCAAATCGTCGTCTCTAAACTTCTGCAGATTTTGATTTTATGTTCTGTTTCGGCTTTTACTTTTGACTAAAATGGATTCAATGGCGTTTTTGAAGTTTATTTGTTTCTTAAATGTGGGTTTTACCTAATTCGAGTTGAGTTAGGGTTTTACTGCGTTGGTTTTGCATAGAGTTTCATCAGCTCTTTCTTTGTGAAGTCCTGAAATCTGAGAATCGAAGCCTTAGTGGAATTTGGAACTGTTGACAGATTTTGCGATGAAGGCGTAAAAGTGTTTATTGAGTTTGGTCGCCATATCAAGAGCGTAGAGCTGTAAGGAGGTTCCATGCATTCCTTTCTAACTCTAGTGGAGTGATGGTTGGTTTTTGTAAAACGGATTGTGGAAGTGAATGTGTGTATTTACTCATCGTCAAACTCTTGATAACGGACATCGACATTCCAGCAATCTGCATTTAATTATTCAACTTTGTAAAATATGTTTTTTATTTTTTAAATCACATAATGTCTACCAAACTTGCATATTAAATTTCTTGAAAACAACATTAGTTGTTTGTGTTTGCACCTCCACCTTGTGCACATCTCAACTAATTTTATGAGATAGTTGCCTAACCCCACTACATTTGTTTAGTAGGGAACTCGTAAAATTTTAACATTCTAGGAGTTGGGCATGCTATTTTGTAATTTGGTCAAGATGGGACATAGGCAGAGTTGAAACTTGAAAGAGTGAGACAAGAAATAGTTTAGTAGTTCTGGGGAGGATCAACCCACTTTAAAGTTAAAAAACATTTTCCCACCCCTACACATCACTAGTAAGTAGCGATGGCCCAAATAGAAGGAGTTGTATACTTGTATCCATCTATTCGCCTTACCAATCAAGTACGGTTTAGAGGGTCTAAGGTTCAAATCTCCATTTGTGTTTCTCTTCTTCTTTATCTAGTTGGATAGTCTTTTTGTGACTCCTTTCGAGTGAGGGTTTTTCCTTTTCTTTTGTAATTTCACGCCAACAATAAAATTGTTGCTCAAGTAGTTCATGAAAAAGTTCCACCCTTATTGAGCTCAGTTTGTGTCAAAAGTACCAAGTACGTCCCTAGGCACGCCAATGGGAAAGAAAGTTGATAATTGAAGGGAGTATATGGTAGCATGATTGTGTGTAGTGGCAAAGGAAGTCTGGAAAATACTAGGCATGAAGCAAAAGATTGTGTGTTATTGGAAGGGATGGCTTAGTTGTTGCAATGACCAAACTTGGTAGAGGATTAAGATGGTAGTAGAATTGTTTGCCTTGTTAAGAAGGCAAGGGAAGTAAGACACTGGAGGAGTCAACATTGGAAGACAAGGCAAGTGCATTGAGTGAGTCAAATAAGGAAGGAGCTAGGGGTGTACACGGGTTGGGTTGAAAGCATTTTATGGACCAACCTGAAATTGCAGGATGTTTGCTTCTCCAAACGAAGGATTCTAACATCCAACCTAATATATGTTCGAGTTGGGTTAGATTGGGTTGTCAGATTGCTAAGATTTTGATAAATCAAGCATGAAATAGAGATGACTGAATGAACGAAAATGGAGGTGCCAAAAAGGAGATATTGAGGGTTAGAGATGTAGATTTGTCGTGTTGAGGAGACAATGAAGACACCAAATGCCAAATATAGACACCAAATGCAATACACAACGAAGAGAGATTTGGAGAGACAAGTCGAGATACCCACATCAACAATGAAAAATTTGAAGTGAAAATGTTGAGAAGGCATAAATCTAGAGTGTGTATGTTAGAGAGGAACATTGGAGAGTGAAGACTAAAAAATGAAACTTGAGAACAACGAAGAAACGAGCTAGAGATAAGAGAGAGGTTATGTGTGAGAAGCATTGAGAGGAAGATTCACACAGAAAGAGATTGTCAGACACAAGTCTGAATGATAAGTTTGAAGTGAGAGAAGAGAGATCATTGGAGAAGAGTGTGATATATATATATTTTTTAGGAGGAGTGTGTGATGATTAATGAACTCAGCTTTTATTATTCTAATTTTTTCTTTATTTTAAACTATTACACACATACACAAACTTTTGTAGTTTTTAAGGAGTAAAATTGGAAAGACATGCCGAATAAAAGCAATTTATTTTTGTAGTGTTATCACGGATAGGGTGGTTTTGGTGGGTTTGGGCCACCAAAAAAAAGCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAATGAACTCCTTTAAAGAAAGGGCCTCCAATCTTGTAAAATAACACCTGTCGAATGATTGAAATAAAAACTTTGTAATTGAAGCCCAAAGAGAAACATGAAATATAGTGCGGGACCACAAATTACTTTGGTCCCTATCCAAATCTCTTAACACTACATTGTTCCTCTTTTCCCAAATATCCCATAATAGTGCACACACCCCGGCTAACCACAAGAATTGACCCTTCTGCCTAACAGGTGGATGATGTACTCCTCGATTATCTTAACAAATCTCTATGTCGAGCTTTGTTGAAAGGCTATCCACATTGTGATAGGAGAACAGTGTAAAGGGTTATCATTAATCATTTGAAATGGTGGTTTCTCCCCTACCGGATCTCTCATATGAAATGTTGGGAAGAAGCTTCTTGAATGGGTTGAAAACGACTTAAGGATAATGGTGAGGAGAAAGAGAATGTGGAGAGAGTGATGAAATAGTGGGGCTGTCACTTAACTTGATTGTTGAAATTCAGCCTCAGTCCGTGCACAGTAGTCAATACATGACTCCAAGCTATTCCATTTAGTGCTGGCCTCACTGGTCTGATTGGTGGCTAGGGCAATTATGTACATCTTGATTTATTTGAGCGCTCCTATGTAGTTTTGGAAGAGCTTGTGCTTGAAAGGAACGATGAAAATCTTTAACAAGGAGAAATTCTGCAATCGTTTCTTCAGTCCTCTTTCTTTCGTAGCTCGGTCTTGATGTAGTTGAAGTACATTTTTCTTCTTTTGGAAGAGCCTTTCGGCTTCTGTATTCTTAATTGGCTCGAGGCTTTGATTTCCTCCTCTTTTTTAATTTTGATATCATTTTTGAAATTGTTTTTCATCTTTGTTTTGTCAGACTACCATTTTGATCTTATAACTTCAAATTAGACAACTTCTAGAAAAGTGAAGGTCCAAATTTTTTCTTGATGGTTTGGTGAATACTCAGAATAATTTGTGCCTCAAATTGATTTGCATGCTTATAAAGAATTTAACATCTGTCTGCTCACCAGGCATTATTTCTTTAATAGACTTCTCTTCCATCTGCTTAAAATTTATTTTAATTGATTTAACTCGTTTCAAACTGTAGCAACCAACTTGATTTGAGGTCTGTGTGCTTTGGGGCATGGTTTGGAAGTACCGGTGGTTTATTCAGAGTTGCAGTGTAA

mRNA sequence

ATGGATCTTGAAGATTGGACCTCGAAACAATTACTGATTGAAGCTCAAAGAGTAAGGACCAAACCTGATCAAATATTTGACGAGAAATTCCTCCCTGGAAAGCAAAACTCAGAATTATCTAACATGTCCAGCGGGCGTAGAAAGAGAAGAATCGCGAACGAAAGCAATCGATACCGTAGAATTTGCATCGAATCTCTCAGGCGAAGAACCCTCACTTTAAACGTTATTACATTAACAATTTTCAAAAATTCACCAGAGAAATTCATTCACTGCAAAATCCCTTTGATTTTCTTCCGATGCCCAAACTTTGCGTTCCCCTCAAACTTTTCTTCTCCTTCAACTCTATGTTTTTGTTGCTCTTCAACTGACAAAAAAGCACAACTCGGTCTTGATGTAGTTGAAGTACATTTTTCTTCTTTTGGAAGAGCCTTTCGGCTTCTCAACCAACTTGATTTGAGGTCTGTGTGCTTTGGGGCATGGTTTGGAAGTACCGGTGGTTTATTCAGAGTTGCAGTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGATCTTGAAGATTGGACCTCGAAACAATTACTGATTGAAGCTCAAAGAGTAAGGACCAAACCTGATCAAATATTTGACGAGAAATTCCTCCCTGGAAAGCAAAACTCAGAATTATCTAACATGTCCAGCGGGCGTAGAAAGAGAAGAATCGCGAACGAAAGCAATCGATACCGTAGAATTTGCATCGAATCTCTCAGGCGAAGAACCCTCACTTTAAACGTTATTACATTAACAATTTTCAAAAATTCACCAGAGAAATTCATTCACTGCAAAATCCCTTTGATTTTCTTCCGATGCCCAAACTTTGCGTTCCCCTCAAACTTTTCTTCTCCTTCAACTCTATGTTTTTGTTGCTCTTCAACTGACAAAAAAGCACAACTCGGTCTTGATGTAGTTGAAGTACATTTTTCTTCTTTTGGAAGAGCCTTTCGGCTTCTCAACCAACTTGATTTGAGGTCTGTGTGCTTTGGGGCATGGTTTGGAAGTACCGGTGGTTTATTCAGAGTTGCAGTGTAA

Protein sequence

MDLEDWTSKQLLIEAQRVRTKPDQIFDEKFLPGKQNSELSNMSSGRRKRRIANESNRYRRICIESLRRRTLTLNVITLTIFKNSPEKFIHCKIPLIFFRCPNFAFPSNFSSPSTLCFCCSSTDKKAQLGLDVVEVHFSSFGRAFRLLNQLDLRSVCFGAWFGSTGGLFRVAV
Homology
[Close]
BLAST of CaUC06G111980 vs. NCBI nr
Match: KAG7013620.1 (hypothetical protein SDJN02_23787, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 117.1 bits (292), Expect = 1.5e-22
Identity = 61/82 (74.39%), Postives = 65/82 (79.27%), Query Frame = 0 

Query: 46  RRKRRIANESNRYRRICIESLRRRTLTLNVITLTIFKN-SPEKFIHCKIPLIFFRCPNFA 105
           RR+RRIANESNRYRR CIESLRRR LT+NVITL+  KN     FIHCKIPL  FRCPN A
Sbjct: 2   RRRRRIANESNRYRRNCIESLRRRALTVNVITLSTSKNYQRNSFIHCKIPLFIFRCPNSA 61

Query: 106 FPSNFSSPSTLCFCCSSTDKKA 127
             S FS+PS LCFCC STDKKA
Sbjct: 62  LRSKFSAPSALCFCCYSTDKKA 83

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC06G111980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7013620.11.5e-2274.39hypothetical protein SDJN02_23787, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
BLAST of CaUC06G111980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC06G111980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC06G111980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC06G111980.1CaUC06G111980.1mRNA