CaUC06G110640 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCAAAACTCACCCACTTTGTAAAATAAAATAAAAATAAATAAAAGAAAGAGGAAACCCCAGCTCTCTCATCTTCTCCTTCTTCAATCTTCACGCCGTCTCCTCCGACCTTTCAAGCTCAGTGTCGTCGTCGCCGCCGCCTCTCTCCGGTTCAGTGCTGCCACCGCTGTGTATTTCTTCCACTCGTGTCGCCGTAGCATCCAAGCGGGCTTGCGCTGATTTTATACTCTCTTCTTGTTACTGGTATTCTCCCAATCTCCACAGATGTCTTCTTCTCACTTGAGAAACATAAATTAGGACTTATCTAATGAAAGAATGGAGGATTTTTTCTTTTCTTTTTAAATAACAGTAGTCGAATTAGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGGGGGGGGTAGGGGAGCAGCCTTGTGGCAAATTGACACTTTTCGACCTGCCTTTTGATTTGTTGCATATGTCTGTCAATTGAGGCTTTAATCCTCTGTATATTTCTTTCGCTCTGCTGAAATTGCCTTACGACCAATAACTTTTCAGCATCTCCGTTCTTTAATTATCAGAGAATCAGTCAGAAGTAATCTATCGCATCATCCCATTCACCGAACAATCTCAAACCATATTTCTATTCGTAGATTATAGTTGGAAAGAAGACAGTGAATTTTTCTTTTTCTAAATTAAAATTCTCTCCCTCAGATTAACCAATACAATCATCAATGATAATTTGGATTTATTGCAAACAAGAGTCATCTATATGCGTTATACTTCATGTTAAGCCATTATGGAACTCAAAAGAAATTAATTGAATAAACATGGAATCTTTTGGTCGATTGGGAGGCTTGGTGATCATGTGGGATGAGATGCAAAGTGAACGTTTTAGAAGTATAAAAGGTGGCTATTTCCTCACAGTGTAAGTATCTTTTCAGCAAAATGAAGTTTGTTGGATTTCAAATTTATATGGTCCAAATGATTTCAGAGAATTAAAGTATTTTCCAAGTGAGCTGAGATCTTTTCATTCTTATTGTGAAGATTTGTGGTGTGTAGGGGTGAGAGTTTAATAAAATTATTGATGAGATTGGTTTGATGGAAATTCCTCTAAAATTCATATGGATTAGGGAAGATGATGGGCATCAATCTTTGTTAGATCACATTTTGTAAGAATTAAAGAGCAGCTCCCAATTGGAAGACAGACAAAGAATGGGATGGCATGTTTGGGAATTAAAGAGCGTCAAAACTGGACCTATGGCTTAGGGGAACTTCTTTGAAGCTTTATTTTCCCAAGCTTTTAGTTTTTGCCATCTCTACATCTCAATATGGCTCAGTTTCAAATCTATGGGATTCTCATTTTCTTTCTATTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTCCTAAAGGAAACATATTTTTCATTGATATGAAAAGAGGCTAATGGTCAAGATACAATGTCACATGAAACAAGAAACAATTAGTACAAGATAATTAAACACCTAGTTTGAGAAAGTAAAGGCGCTCCAATTTAGACAAATATCTTGAATAGAAAAATTAGCAAATAGTTCAGAAAGAGAACACTAGGACAAGACATTGGTTCTTGCAACTTCAAACCGATCAAACTACTAAAGAGATTTGTCATGGAAGACCCTCTGATTTTTCTCAAACAAAATTTCAGCAAGTAGAGCTTTAATTGCATTAGATCATAATAATTGAGATTGGGGTTTCAAAGGACCAACGAGGATCTGTTATCTATACTATATTGTTCTTAAATGTATCACCAAAGGTCCATTGAAGATGAAAGATAGCCAATAATTTCAAGCAACAAGCCATTGCAATTAAAGAGTGGAAGAACAATTTAGCAACCCAAAAATCATAGCCGAAATAAGGATGTTAACTCTCTTAGGGCTGTTTGTTTTCCACAATTTCTGAAAAGCTGCTTAATCAATTGCAATGGAGGCTGCCAAATGCTTAGATAAAGATTTGACCGAGTAAAATCCCGAAGAATCATCTTAGAAGGGCTCTATCTTCCCAATAAAACTCGTAGCAGCTGCTCAAACTCCATAATTTTGACATTCGCCTTTTAAAATAAATAGCCCAAGATAAAGTCTCCATCCCAATGGTCAAATACAAAACCATTGGGAGATACTGCAATCTTGAAAAGTTGAGGAAACCAAGAACTAGGGTGCGATTTTCAACCCAAGGGTGGTTCCAAAATGAAATTCTTCTACCATTACCCAATGTAAAAGTTGCCAAGGATTGTTTGGGTGAAATCTTTATCAAGGAAGCGCTTCTACATCTCCTATGCAAAAGGATCTGTCTCGAGCCAGTGGTAGCCTTAGTACATTGTAAGTTTTTTAAATTGGTCCTTCTTGCCCACAAAGCCTAAGTTACTTTGGTTAAACAGGGTCAATGCTCTTTTATTAGAAATTTAGAACTGTGGATGGAGAACAATTTGAGATTTTTTGAAGGTGAGCATCTCCCTTTGTTTGATTGGTTTGAATATGCACGATTAAATTCTTCATCACAGTGTTCTCTTTCCAAGCCTTTTGTTGATTTTTCTTTATATGACATTTGTTTAAATTGGAATTGCTTTTCTCTGCTCATTGCCGTTTGGCCAATTTTACACAGGCGAGTTAACACTTTGGGTCGGCTTTTAAGGAAGATGCCCTTGTTAGTTGACTCATTTTGATGTGTTCTTGGTCGGAAGGCGGAGGAAGACTTAAATCACATTTTTTGGAGATGTGAGTATGCGTTATTCCTTTGGAATTCTTGTTTTCAGAAGTTTGACTTCTTGCTAGCTCGAGACAAGGACACTAGTGATATGATTAGGGAGTTCCTTCTCCGCCCACCCTTTTCGTGAGAATGGTTGATTCTTATGGTTAACTGGGGTATGCTTTATATTGTGGGATCTTTGGGGTAAGAGGAATAATAGAGTGTTTAAAGGGTTAGAGAGGGATCCTAGTGGGAATAATAGAGTGTTTAAAGGGTTAGAGAGGGATCCTAGTGACATTTGGTCCCTCGTTAGATTTCATGTTCCCCTATGGGCCTCAATTTGAAGTTCTTTTGTAATTATTTCTTAGGAACTATTTTACATACTTGGAGCCTCTTTCTCTAGTAGGCTCCCTTTTGTGGGCTTGGTTATTTGTATGCCCTCATATTATTTCATTTTTCTTGGATGGAAGTTTATACCGAAAAAAGTTCGGTTTGTTATTCAAAATAAATAAATAAAAAAAACCCTTATCTTCCTAGCCATGTGGATGTATGGATGCTTGAGGTTTTTTTGTGGGTGGTAGTTGTAAAGCAAGGTTAAGATCTAATGGAAGTTTGCTTCTCGAGCAACCTTATGGGTATTTGGCTAGACCAACTATTAGATTGGGATTATGGATCATTTGGATGAGAAGTGTTCAACTTGGTTAAGCTGATCCTTTAATATATTTGTATATATTTTTCTGAAAAACAAAGGTTTAATTGAGATCAAATGAAAGATTACAAGGAGAATACAAAACAATAACCCCTTAGCCGCAACAAGACAAACTAACATAAAAAGGAACTCCAATTGAACAAAATAAGACCTAAAGGGTTATTAAAAAAACTTTGCACACGGAGGGCTAAAGAGAGGTGAAAAATCTAAAAAGGGGACATGACTCAATCACTCCAAGTCTCTCAAGCCCTCTAAAAATTTTATTGTTCCTTTTTTTCCCAAGGACCCCATAAAATAGCACAAAAGCTAGCAACCCCAAGAAGCAACCTTTTCCACAAAAAAGGAGATGGAGAAGCTCCTCCACCATGGAACTATTCCCTATAGGTCAGGCGAAGCTAAAGTTGAACGTCTCAAAAAAAAAAAGCTTCACACCAACCTAGACAAAAAATATCTTTGAAATAAACATTTAGAAACACTTTTATAGTATTTTTTGAAATCACCAGCATTACATTTTAAAAATATCTCTCATAGTTTATGCTACCAAAAGTTGTAGATTCATGGACGTTCCCAAGAAAATTGTTTGATGAAAAATACGAAAAACTTTCAAGTTATAAACTCTAATTAGGAGTGAAAAGGAAACAGAAAAAATCCAACAAACTAAGGCGTGGATATAAGGGCCCCTTAATTTGCACAAATATCATTAAAGGAGTAGCTTGCAAATAAAGAAAAGAGAAAACTCCAATAAGAAACTTTAATGTTGATTCCAAAATGTTCTCGCCAAACTAAATGTTTATCTTAAAAAATTCTCTAATTTTTTTTCAAACCAAACATCATAGGTGATAGCCTCAACAAAGTTAACTCATATTAGTTGAGCTTTTGTAAGCAATAAGAGGGGAAGAAGAGAGTTGAGAGGAAAAGGATTTACATATCAGTTGGAATTGGATAGAATCAGACGATTTTAAACTTCTAGAAAAAGAGAGAAATGCAATCTTTTTCTGAAATTTTTTGTTAGGCCCCCAATATTATCGAAGTATTCTCGAAGGGGCAAGAAAGGAAATTAAAAATGTATAGAAGGAAAGTAAAACGTAGTAAACATCTCTTTCTATTCTGCCGAGTGATGAGTACACTTTGGAATAGAAGGACGTTGGTATTTATACCAAGCTCAACGAATCTTGTAGTGCAAAATACTAAGCCTATATGAATCTTTGTCTTTTTAAAGAACAGTGGAGCCCTGCGCTAACTATTTCTAAGGTGCTATGTTCAAGTATGCTATAGGATAGTGGACTACAGTCTTCGAAGTATGCTATAGGATAGTGGACTACAGCCTTCGAAGATAGGAGTGCCCTTGAATCTTGTTATCCATGAAGTGAAATGAAATGAAAGCCTCTGTATTCATAAGACTTGAATTTTTTTGCAAGGAACCTGACTTTCATTGTGAATATTGATTTGAAGAAATTATATAATGGAAGTTCTGTAACTTATATTACTCTATATTGTCAAATGAATCTTTGTGTTTTTCTTGAGCTACTATTGCTGCGTTGAATAATTTGTGATTGAATAATTT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MSLTPKEPEHVMKFRGGSVLGKKTILKSDHFPGCQNKRLSPQIDGAPNYRQADSLQVHGVAIPTILGIQNVLKYVGAQKDGQQAQVLWINLREEPVVYINGRPFVLRDVERPFSNLEYTGIDRARVEQMEARLKEDILIEASRYGNKILVTDEMPDGQMVDQWELVSHDSIKSPLEVYEELQVEGVHVDYERVPVTDEKSPKESDFDILVRKISQVDINTEIIFNCQMGRGRTTTGMVIATLVYLNRVGASGIARTNSIGKVSDCSANVDDNLPNSDEAIRRGEYAVIRSLTRVLEGGAEGKRQVDEVIDKCASMQNLREAIATYRNSILRQADEMKREAALSFFMEYLERYYFLICFAVYIHSERSALRSTSSGHCSFAEWMKERPELYSIIRRLLRRDPMGALGYASLKPTMKIAESADGRPSEMGVVAALRNGEVLGSLTVLKSDHCPGCQNQSLPERVEGAPNFREVPGFPVYGVANPTIDGIRSVIRRIGSSEGGRPIFWHNMREEPVIYINGKPFVLREVERPYKNMLEYTGIDRERVERMEARLKEDILREAEHYRGAIMVIHETDNGQIYDTWEHVSSESVQTPFEVFKRLECDGFPIKYARVPITDGKAPKSSDFDALALNIVSASKDTAFVFNCQMGIGRTTTGTVIACLLKLRMDYGRPIKILLNKKTHEEVDGGTSSDEDTETNAALSPSTYAEVKQKNQSRVFGINDILLLWKITRLFDNGMECREALDAIIDRCSALQNIRQAVLQYRKVFNQHVEPRVRRVALNRGAEYLERYFRLIAFAAYLGSEAFDGICGQGECRGMTFKNWLQQRPEVQAMKWSIRLRPGRFFTVPEALRAQHESQHGDAVMEAVVKARCGSVLGKGSILKMYFFPGQRTSSYIQIHGAPHVFKVDGYPIYSMGTPTITGAREMLVYLRTKLEVNASSTLNVTIIDLREEAVVYVNDTPFVLRELNKPFDTLKHAGITGPVVEHMEARLKEDILSEIKQSGGRMLLHREEYNPSLNQSNVIGYWENIFADDVKTPAEVYAHLKDEGHDVTYKRVPLTREREALASDVDAIQFCKDNSAGCYLFVSHTGFGGAAYAMAILCIRLGSEADDFASNIPQSMTNADLSYACEDSLHPQASEEAAFRIGDYRDILSLTRVLMYGPKSKADVDIVIDRCAGAGHLRDDILYYCKELKKFPGYDDEHRAYLMDMGIKALRRYFFLITFRSYLYCTKSEEEMNFASWMKERPELGHLCNNLRIDK Homology
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BLAST of CaUC06G110640 vs. NCBI nr
Match: XP_008458276.1 (PREDICTED: paladin [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2418.3 bits (6266), Expect = 0.0e+00 Identity = 1209/1257 (96.18%), Postives = 1230/1257 (97.85%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. NCBI nr
Match: XP_023006485.1 (paladin isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2407.9 bits (6239), Expect = 0.0e+00 Identity = 1200/1257 (95.47%), Postives = 1229/1257 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. NCBI nr
Match: XP_022959171.1 (paladin isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2404.4 bits (6230), Expect = 0.0e+00 Identity = 1200/1257 (95.47%), Postives = 1228/1257 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. NCBI nr
Match: KAG7013719.1 (Paladin [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2400.2 bits (6219), Expect = 0.0e+00 Identity = 1199/1257 (95.39%), Postives = 1227/1257 (97.61%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ULE6 (Paladin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PALD1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 175.3 bits (443), Expect = 4.5e-42 Identity = 200/815 (24.54%), Postives = 335/815 (41.10%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8JHZ8 (Paladin OS=Gallus gallus OX=9031 GN=PALD1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 2.1e-39 Identity = 193/793 (24.34%), Postives = 333/793 (41.99%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DIR8 (Paladin OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 159.8 bits (403), Expect = 2.0e-37 Identity = 186/801 (23.22%), Postives = 343/801 (42.82%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q803E0 (Paladin OS=Danio rerio OX=7955 GN=pald1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 158.7 bits (400), Expect = 4.3e-37 Identity = 191/813 (23.49%), Postives = 344/813 (42.31%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P70261 (Paladin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pald1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 138.7 bits (348), Expect = 4.7e-31 Identity = 181/789 (22.94%), Postives = 312/789 (39.54%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C832 (paladin OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497744 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2418.3 bits (6266), Expect = 0.0e+00 Identity = 1209/1257 (96.18%), Postives = 1230/1257 (97.85%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L094 (paladin isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499203 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2407.9 bits (6239), Expect = 0.0e+00 Identity = 1200/1257 (95.47%), Postives = 1229/1257 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H438 (paladin isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460243 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2404.4 bits (6230), Expect = 0.0e+00 Identity = 1200/1257 (95.47%), Postives = 1228/1257 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KB71 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G001780 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2390.9 bits (6195), Expect = 0.0e+00 Identity = 1194/1256 (95.06%), Postives = 1218/1256 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWJ7 (paladin isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025168 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2389.8 bits (6192), Expect = 0.0e+00 Identity = 1194/1258 (94.91%), Postives = 1220/1258 (96.98%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. TAIR 10
Match: AT3G62010.1 (unknown protein; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; Has 553 Blast hits to 216 proteins in 93 species: Archae - 0; Bacteria - 124; Metazoa - 193; Fungi - 58; Plants - 108; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 70 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1903.3 bits (4929), Expect = 0.0e+00 Identity = 953/1259 (75.69%), Postives = 1078/1259 (85.62%), Query Frame = 0
BLAST of CaUC06G110640 vs. TAIR 10
Match: AT3G62010.2 (unknown protein; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages. ) HSP 1 Score: 1892.9 bits (4902), Expect = 0.0e+00 Identity = 950/1259 (75.46%), Postives = 1075/1259 (85.39%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL246-FR2) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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