CaUC04G077490 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC04G077490
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr04: 26890492 .. 26897943 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC04G077490
SyntenyCaUC04G077490
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGAGGGAAATTGGTGTGGAGCGAAGGGCTGATGTGAAAGTGCTTTGTGCAGTGTGCTTTGCTTGTGAAGTCTCTGTGAAAGCACTCAGAAAAGCACATGCGACAATATCACGTGACTTTCGAGAATGTCAGCAGAAGATGGACATGGACATGGACATGGACAGTGGCTTTTTGTTGGTACTCTTGTAGCTCTCTCTCTCTCTCTTCACACTTTTTAAAAAATTTCTCCGTAAATAATTATCTGTATTCTTATAAGTTTAGTATTTCAAATTATTGTCTAATTGATCCTCTAACAAAGATGAGAGAAACCATTTGCATTGTAAGTTTAATAAAATTTTGGCATTTCAATTTTGGCAAAATGTTTCAAAATTTAAAGCTTAAGAATGGCAGACTTGGAAGCTAATTGACTTATTAGGCACAAAAATTTGAGATTATTCTTGTTTAATCGTAATGATTCTAAATTTGTGTGTATTAGGTTTTTGAACTCTTAATTTTGTTTTTAAAAGATTCGGTTTATTTAAATTTCAATTGTATATGATATTTGACATAATTGAAAATTTGAAAATCGACTATTGTGTAGATATAAAATCAAACATGATATCTACTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGTTTAAATAGAATAGTGTCTAGGTCACAAGTTCTAGTACTAGACGTATAATTTAGTATTGTAAAGTCTATAGTTTTAAATTTGTATCGACACTATAAAGCATGAAAAATAAGCCGAAAATGTCACTAATTTGAATATATTATAAATAAGTGTAAATTATTGGTCTCCGAGGTTTAGGATTGATGTCAATTTGGTTCAATATTTTAGTCTTCTAGATTTGGAAAATAATTCTAAATAGTCCCTACGGTTAGTTTACTTGACGGTTGACAGGTTGTTGATAGGATTTTTTTCAGTTCTCTTCTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTATTTATTCATTTTTATTTTAAAAAAAATCCGTTTAAGTTCTTGAACAAAGAGAAGAAAACCCAAAAAATGAAAGAAAACGCCAAAAGACTAAAATATCTGGTTTCAAACTTTAGCATGGGTGATACCGAGATCTTGAAAGGACTGGAGTCCTAAACTATTCCATCAAGATTGAAATTTTGAAGCCCCTAAGCTTCAATTGATGCGAAATAAGTCTATTTTGCTCTTTCGTTCTTCATCTCCCTTCGATAAAGAAGAAACCAACCATTTTCAAAACAAAGAACAACTAACAATTATTAATAGAAAAAAGAAGGGAAGGAAGTGGAAGAGAGGAGGATGGCAACATCACAATCTAATCCGCTAAAATTAACCTTCATCTAACTGCCACGTAAACATTTAGTTAAGTAAACTAACAATTAATACTATTTAGAATCATCAAGAATTAAAATGTTTGTTTTCAAACTTTAGAGATTAAATAGACATCAAATGTTAGAACTAAAAGTGTATTTTACCCCTTAAATAATTAATAAATTCTAAACTTGTTTGCACGTGTGTAAAAATAATAATATTTTTCCTTCATTGCGGGTCCCACAGCACACGTGCCAAGCGTCAGGAGAGTTAAAAGGGTGTGTTTGGGTTTGGGAATGGCAGCACGTGGGAAAGGAGGCGGCAGTGGGCAGGGCAGGGAGGGATGGGCACACGTGACCTAACTGCCGTATCACGTGTCTTCAAACTGAACTACACTACCGTGTTCGGTGCTGTCACTTCATCATTTGTCACAGCCCTAATTGCCCTATCACATCTCCACACCTCTCCCCCCACCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAGCTTTTTGGAAATTATATTAATTAATTATCCATTTTACATTTATATTATTTTAATTATTTATACCATACATATACGGACGGCATCCATCCAAGTCGCTTTTTCCCTTTTTTTTTTAATTTTAAAATTTTCATATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGAAAGAAATGAAAGTATGGGGAGAAAAAAAGAAGGAAAAAAACAATGAAAGTGGGTCCCAAAAATAGTGAGTTGGCCACGTGAGGCAGAGGGTGTGAAAAAAATCACGTGCATCTCGCGGATTCTGCGCCGGTGCCCTTTAAAAATTTAATATTTGTTAACTGATCCCTAAACGGATCCGTTCAGAATGTCCGTGTTTTATGCCACCCCTTTCCATTCATTTATTTATTTTTTTAATTACGTTTCTTATATGACAATTCAATACATTAAAGAAACATACATATTTAAAATTCTCAATATTGTATTAATATTCAGTCCTATACTTTTTCTTAAAANTTTTTTCATATTCATTCACTCAATTTTATATATAAAAATGCATAGTACTCCATTTTTGGAAGTCCAATGCCAAAGTTGCTAAATGGGATGTAGCCAAGTGGATGATGTCATGAGATTGTGAATTCATTCTTGTCGAGATTTAGTTGCTTTGTCTCTCAACCATCGACGGTGATTCAATTTATTCTAATTCTATTCTTTTCTTTTCTTTCGAACTCATTGCATGAGCTATGAAAATACTTTGGAAAAGTTATGCGGGAGCATCCCGTATTGCTAGATAGGAGTGCAACAAAAAATGAAGAAATTGAAAAACCAAACTAATCCAAACCAATTCATTAGTTTTGGTTTGGTTTTTTAGTATAAAATTGAGCATATTTGTTTGTATTTAAAGAAAACTAAAAAGTATTGGTTTGGATCGGAATCGAACCGAACGGAGGGTATCTATACCATTAAAAATAAGCTCTAACATTATGTATCTTTTGACCAATTATTATAATCGGGTATAACTTTTATTTAAAAAGTGTCAAAAAAAATGTCTAATTTGAAGAAAAGAAAATGCCAAAAGAGATTCAAACCATTTCAATCTATAAAAATGCCCAATTCCAATTAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGATTGCTTTAATTTTCTATTATTAATTTCATATTTTTAAAATTTAAAGGATGAAACTGAATTTTATGGTGAATTTTCATACAATTTGAGAATTGTATATATATGAAGAAATGAAAATAGCATAAGAAGCCATAAAGCAATAATGTCAAATCCCTGTCTTAAGTGTGGTTGGCTGAAAGAAGAAAGAAATGGAGAAATGATGGAGAGGACAAGGAAGATGGAATTGGATCACTAACTATTGCATATTTGTTATATCAACTTTGCATGAACCCACTTCATCATATTTCCTTTGGATTTTACTTTTTTTTATTATTAAAATCAAATTAAATTACTATAAATAAACTAAAAATATTTCACCCTCTTTTCAATATGTGTGTGTATAAAAGTTAACTAAACCATTTTGTAGGGCCTTAATTTGATAGTGTTTTTAGGTTTTTGTTTTTGTTTCCTTTGGTTTTGGAAAACATTGACCAAACATGTTCTATCACATGCCCAAGTTATGGTGGGAGGGGGATGTTCTAAAGAGACTCTTTTGAGAGAGAGAGAAAAACACATGTTAGAATTAGAAAATCTAACATGATGAACTCAATGTGTAAAACTAAAACGTACCTTATAGGAAGGAAGAAGTTGCTGCCAAAAACAACTGGACAACTACACCAATCTCCGACGAATCAAAAATCTCTGCTATTAATGGCTTATAAACTCTAATTAGACAATCAATTTCCAAAGCAAGTGGACACTACGGACAAAGCAAGTTAAACACCTACAATAACAACCAAAGCTTCAACAAGACCCGTCGACCCCACGTACACCATCATTTGCACACCCAAGAGACTAAATAGTAAAATCTAAAAGATCTACAATTTGTTGTGGTAGGAGATTAAATATTATATAATCATACAAAACAGTTGATAAACATGTGAGAGTTATAAAAATATATATAGTAACTTAGTTTATTTGATAATTCAAAAATCTTATTAGGAAAATTAATTCAAACAAATTAGGAGGTTGTTCTGCTGTTAAATCAAATAGACTAAAACTAATCAACAACCTAAAACCTTTCATGTTATGTCAAATTGTAGCATAATTATATTAATAATTACATTATTTTTTTTAAGAAAACGATTGTTTATTTGGATTTAAAGAAAATTAAGTAAAGTAATTGTACTCTTTTTTTTTTTTTTTTCGTTTTTAGTTTTCAATGTTCATCATCATAAAAAGGGTTCTTTCCAAATATAGCAAAAGTAATTAAAATACTTACAAATATAGCAAAATTTCACTGTCTATCTACAATAAACCGCGATAGATTACTATTTGTGTTATGATAAACACAAATAATAGTGATGATAGCAGTTTCGTCATTTAAGATAATTTTCTTCGTAAAAATGTGTCTAGTTCCCATTTCATCAATTTTAATTGACTCCAATAAACTTCTTGCATTTTTTTTTTTACTTTTGATGATTTTTTTATAAAGAAAAAAATAGATCAAACAAAAAGAAAAATAATAATAAAAGATTTTCTTTTAATCCTTCAATATTATAACTCGATTTTTTTTTCTTTAATTAGACGGTTTATGATGGTTTATGATGGCTTTAGTTTTTTTATAACACAATACAATACTCTTATTTTATATATGAATTACAAATCTAACAATTTCCAACAAGGGGAAGATTGAGAGTAAACATTAATTTTAAAAATATATAAACCAAAGTCCAAATGATGATTATATTATATATTAGTGATCCATGGCAGTATTAGGAAAGGAAACATATATTTTGAAGAGAATTATGTTTATTTTTTAAAGAAAACATTATCTTAAAAAGTTTAGAAGGTATTTTGGTTGATTATTTATTAGATGGGTGTTAGTTAATTGAAGATGTGCACATGGAGGAGAAGCCAGCGTGTGTGTGATTGTGGATAGAAACAAATAATTTTTTTTTTAAAAAAATTATGGATTAAAAAAATAAAGATAAAGAAAATGCCAAAAAAAGTGACCTTATTTTTATTTTATTATTTATTTTAGGGCTTTGTTTAAACTTTAAGCTTTAGACTTTAAAAAACACAAACAAAACACCCTTACAAAAAGGAAATGAAGGGGTTGTCAGTCACGTGATTATCCCACCCCTACCACCAACATCCTCTCCCTCACAAAATAATAAAAGATAAATTATAATTAATTCTATCTTCCTCCTAACTATAGAGATCAACTTTGCAATTTAACCTATTTTATATCAATTTACCTATGTTCAAGTTAGCATATAGTCTGGAAGTGTCTCATCCCAGATTTGAGTAAACTGGGAGTAGATCAATTTGATAATTGAATGTGGACTCATCATTTGTAATCTTTACCTTCGATTGGCTTCACTTTAGCTTGTGTGGGTGCTTGGTCTATCTAGAATGACATAAACACGATTGTTCATAAAGAGTTAGTCCCGTCCATTGCTTTCTAATGTAATTCGGTGAAGGATTATCTTAGGGCTTTTTCAAGCTTGGTAAGGAGGGTGCAACAATGGTTGAAGGTTTGAGGTTCACTATTAAGGCTAAGGTTAAGACTTGCTCCTTTTTCTCTAACTGCAAGGTATTAGTTGATATGATTAATCATTTGTTAGAGCCCACGGCGAAGGTGCAAGATTAGGTTGTAGAGATTTGGCACTTGGCACTATCCTTTTCTTCCATTTCCTTTCATTTTGTCCACAAAGATTGAAATCGTATCGTGTTGCTCACGTGTTGGCCAAAAGAGGTGGGTTTGGCGTCTCATTTTCTTGGCATTTTGATGTTCTAAATTGGTTGATTTCTTATTGTCTTCTTGTTTCTAGTAACTTTATCTTTAGGCCTAGAGATGTTTTCTTAAAATTTTTAAAAAGTATTTTGATAAATGTTCGAACTTTAAATTTTGTGTCTAAAAGATCAATTTTGTAATAGATGAAGTAAAATAATAAAACTTACCTAAAATACAAAATTAGTTTGAAAGTTGTGTCGTGGCTTACAGCTTGGAGGCAATAAAAAATTGGACTCCACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAACAAAACAACAATAATAATATTTAAAATAAGAATTTCGACAGGTTGGGATTGCCGAAAATGTTTGAAAAATGAATTGGGATTGACGCCCAGAGGCATTATATATATATAATGATTTTAAATTAAAGCTCGTGGACAGCGACGCCGTTAATTAAACGGCATAGTCTCACCTAACGGAAAACGACGAAAACCAAAGAAACAAAAACAAAAGGAAAAAATAACTTTTTGTTCCATAATTTTTTTTATTTAATTTTTATTTAATTACAAAGTTTTTAAAGTGATATGTTTCGTTATTAATTACGAGTTTAATTTTTTTAGTAAAACAATTGTGGAGATTAAAGATTGTACTTCTCACTCCAAAGATAGAAAGCTTTGGGGAGTTTAATTCTTATTTACTGATTAAATTCTAAAATATTATATTTTTACTTTTAAATCTTAAATATTTGTTTCTACTTAGTATCTCGATTTCAAATTTTACATTTTAAATTTTAGTCCTTTTTATTACATACTCAATTTCAATTGTTAATATTCATCTCATTTTTCTTTACCATGAAAACTAATCATAAATTTTTTTTCCCTAAAAAAAAAGCTAGTTTTAAAAATTTTATCTCATAATTATTTTAAATTTATTAACTAAAAATTAACGCCAAAAAACCAAGCTAAGCATTAACAAAAATTTAAGATAAAAATTATAAAATATTGAAACTTAAGAATCAAATCAAAACTAAACTTATAACTTAGAAACAATAATAAAAGTTTAATTCTTATAGTTTATAATAAAACGTTTATCACCTATATAGTTTGATAAAACTTTTGTAAATAGTCACTTAAAAGACTATGTTTTAGAATTTTATTTAACTATAAAAGTTGTTTAGAAAATTTTATCAAATCATAAAATTTAGAAATTAAATTATAATTGACTAAATTGGTTAATTTAATATTTTAAAATCTAGAGAGAAAATAAAATAAATCACACCTAGAGACGGAAAAGTGTTTTTTTCTTCTTCCAAAAAAGTAAAAAGAGGGAGAGAGAGTATAAATAAAGATGCTGAATCCACCACTAAGGCCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATTTCTATTTTGTTTTTCAAATTTTCACTTCTGCTTTTCAATTCCCATAATTTCTCTCTTTGCATCCAAATTCTTCTGAATTTTACAAGAAACGATCACTTTCTCATCCGATTCATGCTGGTACTACTCTCTGCTCTCTGCTTATTCATCCGATTCTTCATTTCTTATTGTTTCTGTATGGTTTGTTTCTCGAATTTGTTCTACTATTCAATTCATATTGTTCTTCTACTGCTGTTGTAGCTGGAATTCAACAATTGCTTTCTTCAGAATGAGAAGCATGTGTCTTCTGAACCAACAATCACAATCTTCCATTCCGATTACTGA

mRNA sequence

ATGGAGAGGGAAATTGGTGTGGAGCGAAGGGCTGATGTGAAAGTGCTTTGTGCAGTGTGCTTTGCTTGTGAAGTCTCTGTGAAAGCACTCAGAAAAGCACATGCGACAATATCACGTGACTTTCGAGAATGTCAGCAGAAGATGGACATGGACATGGACATGGACAGTGGCTTTTTGTTGGGCTTTTTCAAGCTTGGTAAGGAGGGTGCAACAATGGTTGAAGGTTTGAGGTTCACTATTAAGGCTAAGGTTAAGACTTGCTCCTTTTTCTCTAACTGCAAGCTGGAATTCAACAATTGCTTTCTTCAGAATGAGAAGCATGTGTCTTCTGAACCAACAATCACAATCTTCCATTCCGATTACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGAGGGAAATTGGTGTGGAGCGAAGGGCTGATGTGAAAGTGCTTTGTGCAGTGTGCTTTGCTTGTGAAGTCTCTGTGAAAGCACTCAGAAAAGCACATGCGACAATATCACGTGACTTTCGAGAATGTCAGCAGAAGATGGACATGGACATGGACATGGACAGTGGCTTTTTGTTGGGCTTTTTCAAGCTTGGTAAGGAGGGTGCAACAATGGTTGAAGGTTTGAGGTTCACTATTAAGGCTAAGGTTAAGACTTGCTCCTTTTTCTCTAACTGCAAGCTGGAATTCAACAATTGCTTTCTTCAGAATGAGAAGCATGTGTCTTCTGAACCAACAATCACAATCTTCCATTCCGATTACTGA

Protein sequence

MEREIGVERRADVKVLCAVCFACEVSVKALRKAHATISRDFRECQQKMDMDMDMDSGFLLGFFKLGKEGATMVEGLRFTIKAKVKTCSFFSNCKLEFNNCFLQNEKHVSSEPTITIFHSDY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC04G077490.1CaUC04G077490.1mRNA