CaUC04G076970 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC04G076970
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr04: 26238804 .. 26244447 (-)
RNA-Seq ExpressionCaUC04G076970
SyntenyCaUC04G076970
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTTCGTAATCTTTATTTACCTTTTTTTGATACTTACTTTTTATTTTCCTATTTTACGTACCATTTCAAAAATAACCGTGGCAATTGGATTGAACAATGAAGCGAAGATTGCAGAGAAGAAAGAACAAACCCACCATCACATAAATTTGTTTCTTTATTGCTTCTTGTTCTATTTTTTTGAATGTTCGTAATCTTTATTTACCTTTTTTTGATACTTACTTTTTATTTTCCTATTTTACGTACCATTTCAAAAATAACCGTGGCAATTGGATTGAACAATGAAGCGAAGATTGCAGAGAAGAAAGAACAAACCCACCATCACATAAATTTGTTTCTTTATTGCTTCTTGTTCTATTTTTTTGAATGTTCGTAATCTTTATTTACCTTTTTTTGATACTTACTTTTTATTTTCCTATTTTACGTACCATTTCAAAAATAACCGTGGCAATTGGATTGAACAATGAAGCGAAGATTGCAGAGAAGAAAGAACAAACCCACCATCACATAAATTTGTTTCTTTATTGCTTCTTGTTCTATTTTTTTGAATGTTCGTAATCTTTATTTACCTTTTTTTTTTTGTCAATGTAGGGTGGAAACGAATATCTAACTTACCCCGTCCGATCTCCACGACTTAACATGTAACTCATTTGTACTACCCTTGTTTTTTTTTTTAAGTACATTATCTTACTTGTACTGAATGTTTCTTAATTGTTGTATTTTGTTTCAAATTATTGTGTATAATTTTTGGGTTTCCCTTTTGGTGTGTAAAAATCAAACTTTTGTAATAATAGATGTATTTTACATATTTATGATTAATCAAAGTATTGACATATATATTTTACGTATGTTTTGATTGTGGAAATAGATAATTTGAATTATTGTGCAAATGCTTTTCTTTATCTAGTTTTATTACAAATAGAATATTCAAAAAGAATTCTACTAATTCACGAAACTAACAATTTTTTTTTTTTTAAATTCACATTTTAGGATTAAGATCCAATATTTGTTAGCTTAAAAAAATGGGTACTTAAACATTTATTCCTTTGTTTTACCCTACGTGAGCTAGGAAGGGAATCTAATGGATCTACAGATTAGAAGCTCAAATTATTCGAGATTAAATTAATGTTAATCAACATTATATTCATTAACTGTGGGTCACTCTACTAAAGAGTCACAGTTGCATTTTTTGCACAGTGGATATATTTATGTATCTATGGATATAACCAGTTATCAGTAGGTCGACTCTTAATAAATTGCTCATAATTATAGCTGGGTTGATTTATCGTTTTACCCCTATAATTACTTCTTTCTCCTTAAGTCCTACTGATCCTCTAAATTAGAACAACTTGTTTATGGCCCTACCATAAACAAATCCCTCTCGAGCCAATGAGAGGGAGGGGGCCCTTGTTCAAGACCTGGAGTCAACACTTAAGAGAGTAATTTATCTACTTTCTTGAGGACAGGAAGAAGTGAGCTCCATCTTGTGTAGTTATGCTCTCAACTCCCTACTCGGACAATTCCCCAAAATGATATGCTTATTGAGTCGGCGAACAGGCCACTCTCACCCATAGAAATTAAAGGATTACCCTCAAAAATAGGAGTCCACAACTCACTCAGGATTGAGATCGAGTTATTTATAGTCATCATATGAAAAGTTAATATCTTCAATCAACGGTGTAATAAAGAGAGATTAATCATTTCGTGATCCGATCTTATACAAACTCTTTATACAGAATACTCCCACTCACATGTCTCCATATAAACAATTTGGATCAAATTATTTGTACCACTTAAAATACTTGTAACAATTACAAAGTTGGTCGTATCCGTAGTGGTCACCAGGATAAGGCACCCAACCTTATCCATATTTATAGATACTTTAAGTTATTACTTAAACACGATCAACTTGTATGTCAACCACACATTCAATTCAAGTTACAATAAATAACCTTGAACTTTAGTTTATTGAATTTGAGTTATGCATATAATAAATAAAACACTTTATTAATTAGAAAATAAACAAAACTTTATTTATTCAATAATTTGTCTACAATTTATAGACCACGAGATTTATGACATAAATCCTAAAATACTCAATATTGCCCAATAACATATGGATTTATTACTAATTTTCTATTTTTTGTATACTAGTTTCAAGTAAGTGAACTTAATGAAATTCTTGTCATTGACGGTGAAATTAATGAATATGTTTGAAGTGTGGTTTCTGGTGTATGATCTTGCATGGTTTGCATGGATTTGCATTATTTTGCATAAATTTGCACGGTTTGCATGTATTTAATTGCATGGTTTGCATGGATTTGCATTTGTAGTGAACTTAAGAATACCTTTTGCGGAATGAGATTCGTCAAGTTCACAAATGTTCCAAGCATGAGAATGTGAGACACAACAGAAAAACTTGCAACCAACCACTCAATACTGCTATATAATGTATGGATTTTTTTCTTTTTGTATGATATTGCATACTTTGCATGGATTTGTATCGTTTTGTATGAATTTGCATGGTTTGTTTGGATTTGCATTGTTGTGCATGAATTTGCATGGTTTGGATGGATTTGTATGATTTGCATGGATTTGCATGTATTTTCATAGTTTTCATAGAAGCTCAAACCAACTAAGTACATATTAATCATAAAACTCAGTGCACCCCCAAACATGTATAAAACATAGAAATTCGAGAAAAGGCATGTGAAAACGTGAAATCATGTGCTGGTCTTAAAGACCACCCATAGTTTCATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAGGTAGTCATGACCTATTTAAACAAGTATTTTTTTCATTTTTTTTATTTTTAGATAATTACATTGGATAACACTTTTAGATATAATAATTAAATGTATAGCAACATTTTAAAAAAAATTGTTCTATAAGTTATATGATCTATCATTGATAGATCTTTGCTATTAATATGGTCTATCACAGATAGATTTTGAAGCCAAAATCTAAAGTTTGCTTTATTTGTAATTGTTTTTTTTATTTTGTTATATCTGTAAATAATTTGAACCTGATTGTTATATTTGTAATTGTCCCATTGTCCATTCTTTCATCTTCTTATTCATTTCTCTCTCCCTAGCTTCTCTTTCTTTTTCTTCTTCTCTTCCGTACGTGCGATCTTTCATCTCCCTCTTTTCTTTCTTCTTTCTTCTTTTTCCTTTTTCCTTTTTCACTTTTCTATTTTTTTCTCTCTCGTAGTTTTTTTTCTTCTTCCTTCTTATTTTCTATTTTTAACTTTTTGCTACATTTTTAGCTTTCAATCTTTCCATTTTGTTTTGCTTTAAAGCTCGCTAGATATACGAAATCGAAAACTTGACTGATCAGCCAAACAGTCACTCGCTCGATATTGTTGTCTTTGCCAAAATTGATAAACACCAACCAACGAGAACACCAAAAATATCACTTGGTCAGCAGCGGTCTTTGTCCAAAATCGACGCTGTCCGACTAATTGTCACCCCTAGTTTGCATATGGACTTGCATTGTTTGCCATATAGACTTGCATGAATTTGTATGATTTTGTTCATTTTAGTGGATCACACAAGAACCATTGGTTGCGTAAAAGTTAAAATACTAACTAATACTTAGCCCAAATCTGAATAGCATATTGTTTATGAAAATTGCTCATCCTACCTTGTGTTAGGGTATCCATTTTGGACCCAGTTACATCATACTCAAGATATTTACTTGCAAATATTCTACAATCACCACTTTCATTCTTTCCTTCTTTTTCGTCTTTCTTTCTTCAACTCTCTTCTTTTCTTCACTTTTTTGTTATTTTCTTCTATCAGATTTTAGTTTTCTTCTTTTTATGGTTGCTCTTTTGATCTTCTTCTCAGTTGTCCAATTCATTTCTCATATTCTTCGTCGGAGACTTAATAAACCAACAAAATTGCTCGACTGATTGACCAATGGATGGACTGCGTGCCCTTTGTTCTTCGAAATTGATAAGCACCAATCGATAGCCATCAATATGTAGGTGGTCAGTGCCGGTTTTAACCCAAACTGATGTTACTTGACTGATGATCAACCCTAATTTTTCATGTATTTAATTGCATGAGTTTGCATTTATAGTGAACTTAAGAATACCTTTTGCAAGTGAGGTTCGCGAGGTGCACAAATGTCCCCAGCATGGAAATGTGGGACGCAACAGAAAAATTTGCAACCAACCACTCAATACTGCCAAATAACGTGGATTTATTGCTAATTTCTTTTTTTTCATATACTAGTTTCAAGTAAGTGAACTTAATGAAATTCCTGTCATTAATAGTGAACTTAATGAATAGGTTTGAAGTGTAGTTTCTACTTTTTGTATGATCTTGCATGGTTTGCATGTATTTACATGGATTTTGTTTGAATTTGCAGTAGGGGTGTGCAAAAATCGAAAAAAAATCGTCGAATCAAACCGAACCGACTAGTTTGGTCCAGTTTTTTTTGAAGAATGGAGAACTATCGGTTCACTGAAGAGCATAACTGGACTACTTAGTTCGATCATCGGTTCATTTTCCTAAAGAACCGCAGAAACCCGAACCGAACCAGCTGAGAGAGATAAAAGTGAGAGAGCGAGAGTGAGAGAGAGTGCCTCTTATCTCTCTCGCGTGCACGCTCTCTCTCTCTCTTGCTCTCGCTCTCTTGATCTCGCTCTCGCTCTCGCTTTATTGAAGCATTGGTTAAAAATCAAACCAAACCGGCTGGAACCAAATCAGGTTGGTTCGGTTCAAGAACCGAAACCAATGTGAACCGATTTTCAACCGTTCTTCTTCATTATGAACCGATAACTTTAGTTTGGTTCATGGTTCGGTCAAAAATTGGACCGAACCGAACCGTACACACCCCTAATTTGCATTTTTTAGCATGGATTCGCATTGTTCTACATGATTTTGATGTATTTACATGGTTTGAATGGATTTTTATGATTTGCATGAATTTGCATCGTTTGCATTAGCGGTGAGCAAGGAAGATCGAAAAGCTGAGC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mRNA sequence

ATGTTCGGTGGAAACGAATATCTAACTTACCCCGTCCGATCTCCACGACTTAACATTCATGACCTATTTAAACAAATATACGAAATCGAAAACTTGACTGATCAGCCAAACAGTCACTCGCTCGATATTGTTGTCTTTGCCAAAATTGATAAACACCAACCAACGAGAACACCAAAAATATCACTTGGTCAGCAGCGGTCTTTGTCCAAAATCGACGCTGTCCGACTAATTGTCACCCCTAGCAGGGGATTTAAAGTAGTGGCGGTAGCGGAAACAAAATCAACCAGCCGGCCGACCGGCACGTCCATAGAAGCTCAAACTGACCGAGTCGCGAGAGACATGGAATCGGAAAAATCGACCGACTGGCCGAGCAGTAGGGTTGCTCAACATTATTGTCTTCGTCAAAATCAACAAACACCAACTGACCAGAACACTGAAAATATCGCTTGGCCAGCATCGATCTCCATCCAAAACCGATGCCGTCGGACTGATGATCACCTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTCGGTGGAAACGAATATCTAACTTACCCCGTCCGATCTCCACGACTTAACATTCATGACCTATTTAAACAAATATACGAAATCGAAAACTTGACTGATCAGCCAAACAGTCACTCGCTCGATATTGTTGTCTTTGCCAAAATTGATAAACACCAACCAACGAGAACACCAAAAATATCACTTGGTCAGCAGCGGTCTTTGTCCAAAATCGACGCTGTCCGACTAATTGTCACCCCTAGCAGGGGATTTAAAGTAGTGGCGGTAGCGGAAACAAAATCAACCAGCCGGCCGACCGGCACGTCCATAGAAGCTCAAACTGACCGAGTCGCGAGAGACATGGAATCGGAAAAATCGACCGACTGGCCGAGCAGTAGGGTTGCTCAACATTATTGTCTTCGTCAAAATCAACAAACACCAACTGACCAGAACACTGAAAATATCGCTTGGCCAGCATCGATCTCCATCCAAAACCGATGCCGTCGGACTGATGATCACCTGTAG

Protein sequence

MFGGNEYLTYPVRSPRLNIHDLFKQIYEIENLTDQPNSHSLDIVVFAKIDKHQPTRTPKISLGQQRSLSKIDAVRLIVTPSRGFKVVAVAETKSTSRPTGTSIEAQTDRVARDMESEKSTDWPSSRVAQHYCLRQNQQTPTDQNTENIAWPASISIQNRCRRTDDHL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC04G076970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC04G076970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC04G076970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC04G076970 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC04G076970.1CaUC04G076970.1mRNA