CaUC04G068100 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview


Name	CaUC04G068100
Type	gene
Organism	Citrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
Description	Ulp1-like peptidase
Location	Ciama_Chr04: 4708676 .. 4738463 (-)
RNA-Seq Expression	CaUC04G068100
Synteny	CaUC04G068100

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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mRNA sequence

ATGGAGAAGTTGGACAAAAGTTTGGATAAAACAAATGATCCTAAGTGTGACCTGAACTCCACTATGTGGGTGTGCTGGACAAGTGGAAAGAAGATGCAAGCATCACATAAAGAAAGCGATGGCCGTAAAATTAATGACAACAAGCTCCTCTCCAAGAAGAAAAAAGTGTTTGGCTATTGGAGAAAATACAAGATGAAAACTTTGGATGAAAAGTACTTTGTGATTGAGGATTACATACCTCGATTACATGAAATCAACTTTCAATCACAAGTTGAAATGGAGGAGAGTAAGCTACCACCTCAGACTAAACAACACAAAAGAGATATCTTAGAAGTGAAAGTTATAGGAAAGAAGAGGTCTTTACGAAGGAAGATTTGTAGTGATGAAATGTTGCATAACCACCAACTAGAAGAGGTAAGGGTTCAAATAGAAAAATCAAATGTGTCTTCTAATGATCACGATAGTTTGCCTATTCTAGATGACAACAATGTGGAAAGATCTCACATTAGTGCTCACCATGAACATTTCACACCCAATCATAATGAGAAGACAGTTGAAGGATTCCTCAGAGCAGTTTGTTCCCTCGCACATCTTAGTAGTGTAATACATGAGGCCTTACTAAGGGAGGTTATCCACACCCGAGAAGATGGCACTACGTGCAACATTAGAGGATTGCTTCTGACTTTCGACAAGCCAGAATTCCTATTGATGACAGGGTTGTGGCCTTCTGTTGATGTCTCGATTTGCGTGCATAAAAAAAAGGTGAGCCCTTCTTCTTCTTCATTTCGCGCCCCACACATCCCTGCCATCTTACTTCGACTTCGCCATCTGCCACCATTTCGATCATCGTCATCACCTCGAGTTGTGTCGTTGTCGTGGATTTCGTCCATTGTTGCCTCAGGTAGCGCCAGCAGCCGCCGCGTGGGTTGGAGTGTTGTCATTCGCCTAGTTGCCAGCCATCTCCGCCAGTCTAGCACTCGTTCGTCTTGGGTTTGGTTCAAATCCGTTGCAGGGCCAATAATTCAAGAAAATATCAATTTGGGTCCAAAAATGTCTAAATTTACTCAAAATGGCCGTAGGCAACCTTGGTGGGCGGCAACTGGGCGAGGGGGTGTCGACAGGTGCAGGGCGTGGGTGCTGGGCGTGGGCGTGGGGCAGCTCTGGCAGCCTCTTCGGCCAATAGTGTACTGTTTCCAACCTGATTTTTCAAAGCTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGAAGTTGGACAAAAGTTTGGATAAAACAAATGATCCTAAGTGTGACCTGAACTCCACTATGTGGGTGTGCTGGACAAGTGGAAAGAAGATGCAAGCATCACATAAAGAAAGCGATGGCCGTAAAATTAATGACAACAAGCTCCTCTCCAAGAAGAAAAAAGTGTTTGGCTATTGGAGAAAATACAAGATGAAAACTTTGGATGAAAAGTACTTTGTGATTGAGGATTACATACCTCGATTACATGAAATCAACTTTCAATCACAAGTTGAAATGGAGGAGAGTAAGCTACCACCTCAGACTAAACAACACAAAAGAGATATCTTAGAAGTGAAAGTTATAGGAAAGAAGAGGTCTTTACGAAGGAAGATTTGTAGTGATGAAATGTTGCATAACCACCAACTAGAAGAGGTAAGGGTTCAAATAGAAAAATCAAATGTGTCTTCTAATGATCACGATAGTTTGCCTATTCTAGATGACAACAATGTGGAAAGATCTCACATTAGTGCTCACCATGAACATTTCACACCCAATCATAATGAGAAGACAGTTGAAGGATTCCTCAGAGCAGTTTGTTCCCTCGCACATCTTAGTAGTGTAATACATGAGGCCTTACTAAGGGAGGTTATCCACACCCGAGAAGATGGCACTACGTGCAACATTAGAGGATTGCTTCTGACTTTCGACAAGCCAGAATTCCTATTGATGACAGGGTTGTGGCCTTCTGTTGATGTCTCGATTTGCGTGCATAAAAAAAAGGTGAGCCCTTCTTCTTCTTCATTTCGCGCCCCACACATCCCTGCCATCTTACTTCGACTTCGCCATCTGCCACCATTTCGATCATCGTCATCACCTCGAGTTGTGTCGTTGTCGTGGATTTCGTCCATTGTTGCCTCAGGTAGCGCCAGCAGCCGCCGCGTGGGTTGGAGTGTTGTCATTCGCCTAGTTGCCAGCCATCTCCGCCAGTCTAGCACTCGTTCGTCTTGGGTTTGGTTCAAATCCGTTGCAGGGCCAATAATTCAAGAAAATATCAATTTGGGTCCAAAAATGTCTAAATTTACTCAAAATGGCCGTAGGCAACCTTGGTGGGCGGCAACTGGGCGAGGGGGTGTCGACAGGTGCAGGGCGTGGGTGCTGGGCGTGGGCGTGGGGCAGCTCTGGCAGCCTCTTCGGCCAATAGTGTACTGTTTCCAACCTGATTTTTCAAAGCTTTAA

Protein sequence

MEKLDKSLDKTNDPKCDLNSTMWVCWTSGKKMQASHKESDGRKINDNKLLSKKKKVFGYWRKYKMKTLDEKYFVIEDYIPRLHEINFQSQVEMEESKLPPQTKQHKRDILEVKVIGKKRSLRRKICSDEMLHNHQLEEVRVQIEKSNVSSNDHDSLPILDDNNVERSHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAVCSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTCNIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPSVDVSICVHKKKVSPSSSSFRAPHIPAILLRLRHLPPFRSSSSPRVVSLSWISSIVASGSASSRRVGWSVVIRLVASHLRQSSTRSSWVWFKSVAGPIIQENINLGPKMSKFTQNGRRQPWWAATGRGGVDRCRAWVLGVGVGQLWQPLRPIVYCFQPDFSKL

Homology

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BLAST of CaUC04G068100 vs. NCBI nr
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Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
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           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS   S+
Sbjct: 165 NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPSPTKSV 192

[Close]

BLAST of CaUC04G068100 vs. NCBI nr
Match: XP_008437501.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103482899 isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 5.7e-04
Identity = 33/88 (37.50%), Postives = 45/88 (51.14%), Query Frame = 0


Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
Sbjct: 103 SHIGTANKIVKEKLTPKQLDLFKRTVFGRFVDMDLVFSSPLVHHILLREVKDERPDAMSF 162

Query: 227 NIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPSVDVSI 249
           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS   S+
Sbjct: 163 NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPSPTKSV 190

[Close]

BLAST of CaUC04G068100 vs. NCBI nr
Match: KAA0042614.1 (Ulp1-like peptidase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK06016.1 Ulp1-like peptidase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 5.7e-04
Identity = 33/88 (37.50%), Postives = 45/88 (51.14%), Query Frame = 0


Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
Sbjct: 28  SHIGTANKIVKEKLTPKQLDLFKRTVFGRFVDMDLVFSSPLVHHILLREVKDERPDAMSF 87

Query: 227 NIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPSVDVSI 249
           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS   S+
Sbjct: 88  NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPSPTKSV 115

[Close]

BLAST of CaUC04G068100 vs. NCBI nr
Match: KGN49944.1 (hypothetical protein Csa_000148 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 9.8e-04
Identity = 32/83 (38.55%), Postives = 43/83 (51.81%), Query Frame = 0


Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
Sbjct: 22  SHIGTANKIVKEKLTPKQLDLFKRTVFGRFVDMDLVFSSPLVHHILLREVKDERPDAMSF 81

Query: 227 NIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPS 244
           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS
Sbjct: 82  NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPS 104

[Close]

BLAST of CaUC04G068100 vs. NCBI nr
Match: XP_031741885.1 (uncharacterized protein LOC105435430 isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 9.8e-04
Identity = 32/83 (38.55%), Postives = 43/83 (51.81%), Query Frame = 0


Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
Sbjct: 105 SHIGTANKIVKEKLTPKQLDLFKRTVFGRFVDMDLVFSSPLVHHILLREVKDERPDAMSF 164

Query: 227 NIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPS 244
           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS
Sbjct: 165 NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPS 187

[Close]

BLAST of CaUC04G068100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TGU0 (Ulp1-like peptidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold376G001140 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 2.8e-04
Identity = 33/88 (37.50%), Postives = 45/88 (51.14%), Query Frame = 0


Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
Sbjct: 28  SHIGTANKIVKEKLTPKQLDLFKRTVFGRFVDMDLVFSSPLVHHILLREVKDERPDAMSF 87

Query: 227 NIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPSVDVSI 249
           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS   S+
Sbjct: 88  NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPSPTKSV 115

[Close]

BLAST of CaUC04G068100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3ATU8 (uncharacterized protein LOC103482899 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482899 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 2.8e-04
Identity = 33/88 (37.50%), Postives = 45/88 (51.14%), Query Frame = 0


Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
Sbjct: 105 SHIGTANKIVKEKLTPKQLDLFKRTVFGRFVDMDLVFSSPLVHHILLREVKDERPDAMSF 164

Query: 227 NIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPSVDVSI 249
           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS   S+
Sbjct: 165 NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPSPTKSV 192

[Close]

BLAST of CaUC04G068100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AUB0 (uncharacterized protein LOC103482899 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482899 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 2.8e-04
Identity = 33/88 (37.50%), Postives = 45/88 (51.14%), Query Frame = 0


Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
Sbjct: 103 SHIGTANKIVKEKLTPKQLDLFKRTVFGRFVDMDLVFSSPLVHHILLREVKDERPDAMSF 162

Query: 227 NIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPSVDVSI 249
           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS   S+
Sbjct: 163 NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPSPTKSV 190

[Close]

BLAST of CaUC04G068100 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KM59 (DUF1985 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G141180 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 4.7e-04
Identity = 32/83 (38.55%), Postives = 43/83 (51.81%), Query Frame = 0


Query: 167 SHISAHHEHFTPNHNEKTVEGFLRAV------CSLAHLSSVIHEALLREVIHTREDGTTC 226
           SHI   ++        K ++ F R V        L   S ++H  LLREV   R D  + 
Sbjct: 22  SHIGTANKIVKEKLTPKQLDLFKRTVFGRFVDMDLVFSSPLVHHILLREVKDERPDAMSF 81

Query: 227 NIRGLLLTFDKPEFLLMTGLWPS 244
           N+ G++ TF K EFLL+TGLWPS
Sbjct: 82  NLNGIIATFSKEEFLLVTGLWPS 104

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of CaUC04G068100 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_008437500.1	5.7e-04	37.50	PREDICTED: uncharacterized protein LOC103482899 isoform X1 [Cucumis melo]	[more]
XP_008437501.1	5.7e-04	37.50	PREDICTED: uncharacterized protein LOC103482899 isoform X2 [Cucumis melo]	[more]
KAA0042614.1	5.7e-04	37.50	Ulp1-like peptidase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK06016.1 Ulp1-like peptidase [...	[more]
KGN49944.1	9.8e-04	38.55	hypothetical protein Csa_000148 [Cucumis sativus]	[more]
XP_031741885.1	9.8e-04	38.55	uncharacterized protein LOC105435430 isoform X2 [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of CaUC04G068100 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of CaUC04G068100 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5A7TGU0	2.8e-04	37.50	Ulp1-like peptidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold376G...	[more]
A0A1S3ATU8	2.8e-04	37.50	uncharacterized protein LOC103482899 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10...	[more]
A0A1S3AUB0	2.8e-04	37.50	uncharacterized protein LOC103482899 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10...	[more]
A0A0A0KM59	4.7e-04	38.55	DUF1985 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G141180 PE=...	[more]

BLAST of CaUC04G068100 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
CaUC04G068100.1	CaUC04G068100.1	mRNA