CaUC03G050550 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC03G050550
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionCircumsporozoite protein-like
LocationCiama_Chr03: 643541 .. 656186 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC03G050550
SyntenyCaUC03G050550
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCATCCAAATTACATAACCGAACTTATGAAGATTTCGAACCTCCGGTGGAGCGGTCGGAAGAGGATGGCTGCACCATTCTCACCCTCTACATTCCCGGTTTGTCCCCCTAATTATATTTTCCTTTTTTCTTCTTTCTCATTAATTTCGTTCGCTGCTGATTTAATATTGTGTTAGGAATACCCAAAATTAATATTAATTTATTTAATAATTTATAAATATAGCAAAATTTAGTTCAACAATCTTAATAATTTAGGCTCTTTGGTAACACAACTTTTCGATTTTAAATTTGTTTGTGATAATAAAGCTATTTGATGGAATTTTAGCTTTTTCAAAAATTTGGTATCCTCTCCTAACCATATCAAAGCTATCATTCTATTAATTTATTTTCTTACATTTATTATAAGTTTTAATTGGTTCAATTTTTTATGATAATTATTTAAAAGAATTTTTTTATAAAAAATTTAGATTAAACAATATTAGTTAGATATTTTTAAATAATTATCTTACAGTAAATTATAAATTAAATATGAATATAGAAAATAATTGAAATGATAATTTGGTTTTTCTTTTCATATAAATATATTGCACAAAATTAATATTAATTTACTAAATATGGTAACTATTTTTTTAAAATTTGAAATTAAACTTTACCAACACTATTTTAATTTTTTCGCAACTAATTTTTCTAAAAGTATAACTACAACAATTAGCCAATATGAATATAATTTAATTGACATAAAAATTGTATTATCAACCGATTATCCCATCTCACATCTATTTTATCAATTAAAATTCAACTGTTTTAATTAATCAACTAACATAGAATTCATTTTAAATTTGCTATGATTTTGAAATATGGAATACACTAAAAAGTGGAAGTCTTTTAGCACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAATGAAATGGGGATAGAGTAGGTTGAAAAAGGAGAGAATTAGGGAGAAGGAAACATTGAATGAGTAGAAAAAGAATTTTTTTAACTTTTTGAGAGTTTATGGAAATGGGAAAACGTTTTACACTTAATTTAAACTAAAAATCAAGTGGATGGGTTTGGTTTTAAAGACAAATAGACAATGAATGCATTTGCCAAATGGCCTCAATGCACCCAAAGACAAATTAAAATAAATACAAAAGGAAAAGAAAAAAGAAAGAGAATTTATTTTTCTTTTCTTTTTTCCCAAATTGTGAAGCCAAGCAATTGGGAATTAAGATAAGTTAGAACAATTTTAGACGGCAGAGAAGGAAGGGAAGGAAGATGAAAAAGGGGGAATGAATTTGTCCACATAAAACTCTTATAAACATTCTAATTAAATAAATAAATAAATTCAACTCTCTTTTGGATAAAGACCACAAACCCTTTTTTTTCCCCTCCAAGTCTCTAATTCTCCATTCATAGGCTTACAAAAATGTGTTTCTTTTTAAGATGGTGACAACTTTCCACTTGCCACCATTTTATTTTCTAGTTAATGTCAAAAGTAGTCGTCAAAAATGATGTGAATATAAATCTCACGTGGTTCAATTGCCAATGCGAGCATAGTTCAGTAGAAAAAAAATCAATTTTAACCATAAAACTTGTCGGGTTGTGCAATTAAAACGAATGTCTCAATTCTAACCTTTTAAAGTTTAAAAAGTATTGTAATTTTAATCCTTTAATAAGTTTTCCTCCAAGTATTGTTAAAGAAATTTTATCTTATGCATTTAATGAATTATAGGACATATATACAATATGAAAATTAAATAATAAATTTTTTAAGAGAGAAATAAAAGTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTATGAATTTTGAGAATGTTATTTAATGGTCAGTTTATACGTTGGTCAAAATAATTTTTGTGCAATGCTTTATTTTATTAAAATTAATGAGTTTATGATAATTATTATGTTGCTTTGTTTTTCTTTAATTTTTTTTAATTAGTAGGTGAATTAGTTGAAACTGAATTAAGGGTTAAAATTTTTATATTTGTATAAATAAGGTCAAAATTGATGAAATTAAAAATTTTGAAACTAAATGGGTAACATAAGGTGAAAATTGATCTTCCTGAAGAAGAAAAAAAAGAAAGACAAAAGTCACATGTTGGGTCATGCACATCAAAGTTTTCAAGAATAAAAAAGTTAGAATAACTTGCAAAATGTCATATTGAAATTACGAGTGTGCTATATAGTGTTGTAAGAAAAAACAAATTTGTTAATACTATTTTTTTTTGGAGGATGTTTTAAAAAATTACAAAATTGTTGAAAATAATTATAAATATATTAATATTTTATTTTTCATCGGTGATAGAATGCGATAGACCAAGATAGACATCCATCACTTTAGCGATAGACACTGGTAAATGTTTATCACAAATAGTACTTAAAATTTTGCTATATTTATAAATATTTAAACAGTTTTGGTATTTAAAACAATTTTTTTTTTAATTCGATAATATATAGAAATAGAAATTGTAATTCCGGATATTTTGGTTGAGAATTGAATTGATTTAACATATGTGATATATGGTTGAAATTGATGGTTATTCAAGTAATAAATTCCATAGCGTTTGATTTCATTATCAATACATGAAAATTGGGAAGAAGCCATATTGTGTAAAAAATTGATAGCAAATGGCAATAGAAAGCCTTTTTTTGATCTTTCGTGGGGGAGTTTGGTTTCTTTAGGGTTTGAATGTGACATTATTAATTTCGATCCATAATTATCAACTTTTTAATATGGAGTGGGCGGAAGGTTGAATACACTACGCAAATAAATAATTAATTAATTAATGTAACTTATTTTAAATATAGCAAAATGAGTAAATTTATTTATTAATATAGCAAAAATGTCATATAGTAGACAATGTCGACTACTATCATCTATTATTGTTTATTAATATCTATTATTGATAGTCAGTGATATTCTGCAATTTTCCTTAATTTGATGGATTTCTTCTTAATGGGTTGACTCAGGAAGAATGGATAAAACCTTTTTAGAAGTAATGTGTCAATTTTATGTATTTATCTATTTATTTTGTCCAAAAGTTTAGGAGTAGCTTTTAGTGAGAATTTGAAAATAAAAAATTTAATAAAAACAAAGTTGTATTTCATACTTTTATATATGTGTTTGCAAATTAAGAAATTGGATTTTAATGTAAACAATTATTTAAAATGTGTTTGATATTATATATTTATAAATCATAGTACTATTCGCAATTATATTTAGTTGACAATAAATTATTATTAATTTATTTACGAATATAATTATGCTAAAAATGTTATATAATTATTATTTTATAATATTATAGAATTTAGAATATATATTATTTTTTTTTAAAAAAATGAATTGAGTTTATAACATGAGATAATATATTTCTAAATGCTTTTATCTTTATTTAATATAATTTTGCATTTTAAAATTTAAAATTCAAAATCTAGATATAATGAAAACATAAAATGTCATTTTCAGAATTTTCATTGTTTTGATCATAGAATCCGAAATTTTTTTTCAAAAACAAAATCTTGGATTATCTGTCAGACACATATTTGCTAAACTCAGTGAATTTGAAAACATAAAACAAAATCTGATTTTTGTACCAAATAAAACTTTAGTATGGATCAACTTACCAATATGAGCGATAGTTCAACTAACATAAAACATGCATCGTCGATTAAAAGGTGAGAGATTCAAATTTTTTATCCAGTTGAAAAAAATAATGGATAATGGATTCAATGTATTTTATTAATTATGTTACAAAGTTGGCTAATTAATTAGTTGGGTTTAAAGGTTGAGTAATTAATTAATTAGCATGGCAAACCCACATTTTATTTTTGTTAGAATTTCTTTTTAATGTAATCTCTAAGTTTTATTGTGTAATGATTTTGTTTATGTAATTAATTAGCATGGCAAGAAGTGATAGGTTGATGGAATTTTTGACAATAGAAACTAATAAAGTTTAGGAATGAAATAATTAATTACAAGTTTCAAATTATCTGAAGTTAAGTTCATTACACATATTAAAGTTAATCTTTTAGATAGTTTTTTCCCTTAACGCTTGGATAAGTACTTTGGTAAAAGTAGAGAACCAAATGAGTTTTTCTAAAACATATTTTTAATTAAAAAAACTTTTTTTTCCTCTAAAACTTAAAAAAAAATGTTACAGTTTAGTTTTTAAACTTTTGTTTATCACAATTTAGTTTTATACTTTCAAAATTGTAACAATTCAACTTTTGACTTTAAATGCATTTGTACTTTAGTCTCTATTTTTAAAATGTAATAATTTAAACCCTACCGAAAAAAATCTTTATTATAGTTTAGTGTCAAATTTTATTATGTATACTAGTCTTTTTTAGTTTATAAATAAAATTGGTTCTTAATTAGTTTATCAATCTATATATATATAAGAAATTTCATTAAAATCTTAATATATTTTTTATGATACAAACTAAATTGTCACTAATTTTAGAGTACCTATATCGTTGATGTCAAAATTCAAATAAGAAAGCACGTCTGGCCTTCACATGATAACAATGGTGAATTTGTAATCTAAAAAAGATGTGACTGGTCTGTAAAAGAAGAAAAATCTCTAGGCACCGGTATGGTATTTTCTACAACACCTTTAATGCTTAAATCAATAAGGTTTTTGTTTTAAATATTTTTTTGTAGCAAGAATCCTATGGAGTTGATAATGAACCTACTTCTTTTGAAGTCATAATGATGTACAAATGGATTGATTTACCTAGAGTTTTCCTACTTTTACCCTTAGATTCAAACTCTCAAATATTCAATCTCTTCTCAATCCTCGATATTGGACTATTGCACACCGACCCTTGGGCTTAATGGACCACTAGCAGCCTCATCCCAAGCCAAGACCAGCTGTAATTCCTCATGAACCTCGACTCGTGGCTTACTAACCGTAGGGCCATTTGAGTCTTGGGTCGAGTATTTTGATATTATTGGATTTTGTCTTTTGTCTCATTCAAGTGTGACCTTTAATTTATTGAGTACTCCAAATCAAAACCATTACATATACAAAATTGTTACATATTTGAGTTAGTACATAAATTAAAGTATTAGAAAAAAAACTAAATCATTACAAACTGAAATATATGGATTAAATGGTTACTTTCCCAATAGTCCAAGGACCAAAATTGTTATCTAACCATTCTTTATAAAAATAGGGCACATATCAATTTTTGGCTTGGAGTTTGTTAGGTTGTATCAATTTTAACATTAAACTTTCAATTTCATCAATTTTGATCTGATACTAACTTATATAAGTATTGCAATTTTAACCTTAAACTAAAAGTGTTGTAATTTAACCTTCTAATAACTACTTGCTCTAAGTATCATTAAAAAAGTTGTTCTTTGGGTTCAATGAATTATAAAACATATATATATATACACATACAACATGAAATTGATAAATTGACAATTTTTTTCATAGAGAGAAATAACCTAGGAGCTTTTTTTTTTCCTTCTCTTTGTTAAAATTTATAAATTTTTGAAATATATTCAATAGTTAATTTGTGCATCGGTCAAACTTATTTTTGTACAAGTAAAATTTTATTGAAATGAATGAGTTTATGAAGATTCATACATTATTTTTTGTCTAGAAATTAGTGGACAAATTAATAAAAATTGAACCAAAAAGTTAAAACTGGAATACTTATATAATTTTAAAGTCAAATTTGACGAAATTAAAGATTTAAGATCATGATGTAACCATAGAAATTCAGTGTCAAATTTGATATTTTCTCAAATAATGATAAGGTGTCATTTTTTTAGCCGTAAATAAATACAATAATACAGAATCAAATGGCAAAGTTTTGAAAATAATTACCATCACTATTCACTACACACTTAAATAATAATAATAGTAATAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATCATTACAACGATTTGCAATGTTGAATGATGCTTTTTGTAATTCATAATTATATCACCCAATAATGCTACAACATCAATTCCAACGATTCCTTGTTCATAATTGGCCATGGGTTTTCCAAATTTCCTTCTATTTCTTTTTCAATTTTCATAATTATTTCCACCATTTACCCATGAAACTATATGATTTGATTTGAATCCAACAATCAGATTTTTTTTAATTGATTTAGTCTTGATTGGTCTAACTCACAAATGGGAAGTCAAACTTATGTTTAGTATGTGACTTTGTTTATCTAAAATTATAAAATTGTATAAATTCTATAGGCTTCATCAATTCATGTTCATAAAATTACATTTTTTTCAAATCCAAACTTCTTTTTACCCTTAAATTTCTTATACTCCATAAAACATCAAGCAATTCTTCATCAATATTAAAAATATAAGTAAAAATTTGTAGAATTAAGTAAATGAAAATATGATAAATATATAAGTGAGAATAATATCTCTATTGGTGAAAAGAAAGTTGTGTCAGACTTTACACACAAAGTTAGGCATAGAGATACTCATGGAGTGAGGTGGGACAAGAACAAGGAAGTCTTCTTTGTCCCCTATTTCAATCTACAATTATCATATATCATACTATTGTTATAAATATATTGAGTTTCTAATCATCTTCAAATCTACAATTATTATTTATTTCTTTAAACGATGAAACATAGGACAAAATCGGTTCACATTCCATTATACATCTTTAATTTATAACCACATTGATCTCTATTTGAAGCACTAAAAAAAGATCACCATCATCAAAGTTCATCGATTAATTAAGAGTTAAGATACATATAATTGAAATAAAGTAGTTGACATTTAGAAAAAGGAATATTATAAAGAAAAGAAAAAGAAGAAGAAAAGAAAATAGTGGAATGTCGGATAAGGCGGGTTGATGTCGTCAGATAATAAGACAGAGATTTAAAGGGCAGCCGACAAGAAGAGGTGCATGACTAACACGCCCTCTTCTCTCTCTTATCCAATTCCTAAACAACAATGACTAAACCAAATGGAAATTTGTTTATTTGTTTCATTAATTGCAAAGATGTGTTTGTCTTCAAACAAATCAACAACCTCCCAGGTTCTTGCTTTTCCCTTTTTTCTAATGGATGGCCAACATGTTTGACATATTTTACGTGTGTAAACAATGCGATTCAAACTATCTAAGTTCATTTTAAAGACTATTTGGAAATGTTGGAATAAATGGAGAATTGAGGGTGGAATGAAAATGAAATCGTGAAGTGTAAAAACAACGGGTAAGAGAGTTCGGTTAAAAACTGTGGAAACGAAATAAGTTTTGTATTACAAATCGAGCCCTAATTAACGCTCAATTCAAACATAGATTTTGGGATTACACTACATTGCAAACTCAAATATTATGGGCCCTCAAACAACCTCCAGTGTCTTTGTTCTTTAAACTAAATATATATAGGTTAAATATCATTCATTTCGATCCTGTACTACGTGAAAGTAAATCTGTTTCAATTTTAGTCTTTGACTCTTTGTACTTTTAATAAATATTAAATTTAGTCACACCATTACTAGTTTATTGTTGATTTTTTTCAAAACTTTTTAATAAAATTTAGTAATTTTATTTGAATTTGGAAAATGTATTCACATTATGTAATTTTTTATCAAAAATTATTATTATTATTTAACCAATTTCAACAAAAATTAACATCGAGAGACTAAATGATATTTTCCCGAGAGACTAAATGATATTTTAACGTACGTGTATATAATATAGAGAGGGGATCGATTCTAAGAGCATCTCTTGCTCGTGGGTCTTCCTTGTAGTATTTAAGAGACTTTATGACCTCGAGACTAACCAACGCTTAATAGAGCCAAGATGTTCACTTTATAAAACCCTCCAAAAATGCACCAAATGATACTTTGTGTCGTAAGCATGGGCTTTTACTATATGATAACGTGTCAAAGCTTTAATAGAGCCTCTTCATAAATTTACAATAATCCCAAATTATATTTGGGTCAAAGCTTTCAATTAGGTACATGATATAAAGTTTAATTTAATTTTAAGTTCAAAATCTTCTAATAAAACCCTCCAAAAAATGATCATTATAATTTCATATCAACATTATTATAATTACGTATCATAAAGTCCCTCATGCAAATATATCATAATTAAAATGTTTTAAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGGGAAATTATGATGATCTAAGAGGGCGTGGGAGAGAGGAAGAAGGTGTGGTAGCCAACAATGGCGACCAAAATGCTGATTTTAGGTCAAATCCTTGTCTTAAAAATAGCATCCTAACATATCATACACAAATATTCCATATGCTGGTGGAATTATATTCATATTCATTTAAATTAATATTATTCTTTTCTAAATTGGCTTTTATGATATTTGAATTATGATGGGAATCAATTCAAAAGATAAGCACAAGGGAGCTGAGTGAGCTCTCATTTTGGCCGACAATGCCAACTTATGACATATGACCCATGTTTTTTTGTCCATGTTTTTTGTTTGGTCTTGCATCCAATTTGACCTAATAGCTCTTGTATGGCTTTAATTTCATTAATCCAAAATTGGATAACACAATAAATACTTCATCTCTTACTCAAATTCTACAATTTACAAAAGTTATTTAAAGAAATATAGTCTGTGGCCGCTAAGAATTTTTTTATATATAAGACTAACATACTATATATATATATACTCATTCTATTTAACATTTAACACGTCATTAAATGTTTATTATTTTGTTTCTTGATCTTCACACCGTTCTAAAATGCTTATTTTATAAAAAAAAAAAAAGAAACAATGAAGGAATGTAGTCTGGAAAAAAAATTATACTATCTAGAGGTGTTCACTAAAACCGACCAAACCAAATTTGACTTTTACTAAAAGTACCGGTCTAGTTTTGTTTAAAATTATAAGGAAACCAAACTTTTCTATTTGGTTCGGTTTAGATTCTTCAAATCCAAAACTAAACTGAATCGTATGTGTGTGTATATATATAACTAAAAAGTGAAAACCAAAACAAAACCAAACCAAACCTTATATATATAATTGAAAACCAAAACTGAATACCACTATAGTAATAGAAATTTTTTCTTAGCTGTCCTTTTAAAAATTCATATGCCTCTTAATAACTGTTTGATATAAATTCAAAATATTCTTGTAGTTTCTCTCTCATAGATTTAACAGTAAAAAAATTGTCAGTTATATTATGACAGTTGCATCCAATAATTTCTAGACTCTTGAATTAAAAAATAATAATAATAAAGTTTCATCATCATTGTCCACCATCAACATCTAATAACTCTCGCTCTTATGCTATTATTCCTCTATTTTTCCACTTAATTATTCACCCAAAAGCTACCACATGATGAGTACTGAAACTAAAGTATTTTTCAATCAACTTTATAACGTATTGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCAACACTACTACATTACACTTTTATGAACTATTAAATTTATTATGCTTTTAAACGTCACATCATTACGTATATATTGTTGAACTCAAAATAAAACAGTCCATTCAAGTGCATTATTTAGTTTAGAATTATATTTTTTTTGGATTAAAAAAATGTAAATTAACTTAATGCAATGGCTTTAAAGGTTGTTGAACAGTTTTAATTACTACTTGATAATATGTTGATATAAGGTAAAAGGATTTTGAGTTCAAGTTTCCTGTGGTCAATTTTCTTTTATTAAATAGTGTAATTCATGCATGTGTTGAAACTTGAGAGAGTGATTTTAAAAAATGGTTGTTGAATAATGTCCACATGACAGCCTTTAAATAATTTTTTTAGCTAAATCGTTTTGGATGTGCTGAACAAATGGACATATATGAACATGGATGTTTTAATAATGAATGTTAATATTTAATATAACAAAGACTAAATAGAGAATAATAAAATATACTTGAAGTTTGGTGGATGATTGTTGTTGTTCTAAATGGTTTTTGGAAGCTATTAAGAGCCATTCGTTTTGGTTCGTCAATTTGGTTTATAGTTAAAGAAAGTGTTCACCCCCAAGGGTTTTGGCTACGTATTCTTTTGCTTGTTGGGTTTTACTCTTGATTGCACTCGAAAAGTGTTACGAAATCGACACACACAAATTTACCTAGTTTGCTAACAATGTGTTAGCTACGTCCACGAGACAAAGGGAGAACAATTTTATTAAAGAGAAGGCTACAGGATTACATAATGCCATATAATGAATAATGGTTAGAGAGTTTATATAGTACCATTATCTAAACCCTAGGAGAGAAGGAAAATATTTAAATAATCAAATATATCAAATATCAATTCTAATTAGATTTAGAATTCAAGGCAATTCTCACAAAAAAAAAGTGTTATTATAGAACTTATGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGGTATGTTTTGATGCTTTTCTTTATTGTTTCTTAAGGAACCGATTTAAAGTATAAATGAAGAAAAGAGGGCATGAAGACTCAATTTTGGGTCATAGGGATGCAAATTAAGATGAAGATTGGGAATAAAGAGCTAAAAAGGAAGCGTTGCTCGACACTCTAATACCCTAAGAGCCAACAAGGAGAGCGTCGTGACATTTCAAAAAAAGGAAAAGATGTTAGCGATACTCGATGTTGTGAGCAATAAGGCCAATGTTGGACAACATCTCAACACTATGTGTTTTTTAGCTATTTAATTTGCATTTCGCATTAGGTTTCAAAGGAGGTCAATTTAGGAGTTATCCTCAGGGTGAGGGAGGTCCGAACAATTTTATTCGAGAGGATTTCGACGCTTGGGGAATGATTAGAGAGTGATCAAAATCCTCAATTGATTAAGATAGGTATATCATTAATTTAAAGATATAAATTCTAATATATTCTTCAACATGTTGAATGAAAAAACTAAAACTAAATTTGACAAAAGATTTTTTTTTTTTTTTTGTTAGTTTAATTTAGAGTGAAAGAATGAAAGTATAAAACAGGCAGTAATTAATAGATAAAAATTTGGGAATTGAAGTATTCAAGAACGTGTTGACTCAAAATCAGCAAATTTTCAAAACATAAAATCATTGAAAAATTAAAGAAAAAGAAAATTGTGTTCCCATTTCTCATTCTTGGCAATTTCATTTTGGATTCTCATTCTGTGTCTTAATATTTTTTCACTTCTTTGTTTTTGTTTTATGCGAAAATGATTTAAACATAATTCCACTTGGCTACAAATACATTCATGAAACTACTTAACACTTTCTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTATCCAATTGCTTTTAGAACGAGCCAATTTTAACTTTAGAATCCTCATTTTGTCTAACTGAACCACGAACTTCACTTTAGGGTGGCCATGGAGTTGATTTCCAGATGGTTAAAGATGATTATGAAACCATGTTGACACTTTTTTAGTTAAAAATTGTGATAAAAGTCCATTAAAATCATTTTTTAAAACCCACGTTTATTCAAATCATTTTTTTAAAAATAAATAAATAAGTTCTCTACAAATTTTTGGATTCTCTTTTATCCCTCAAAATTAAAATTTATTTTATATATTTTTTTAACTTTATTACATAACCAAATATTTTCTTCCAATGCAATCATCTTTTTAAAGAAATGTACAATATTGATTCTTTTAAAGAAGTATTAAAACTATTTCCTTTAATCCTTAACAATTAAGCTAGAGTAAACAAAATATAACCTTTTAACAATTACTTAAATAATTTTTAAAAATATATATTTTAATAGTAGTTTTATTTTAGTTATTACGACTTAAACACATTAATTTAACGAGGTTGTTTAGGTCTAAAGCTAAAATAGTTAATTTTTCTAAAAGTATAGTTGTCCGTCATTAATTATTTTAAAAGCTACAACAATTCTAAATTAAATTCATACCATTCTAAATTAAATTCATACTTAAGCATTTTAGACATGATTTATGCATTTTTTTTAAACCTATACCAAGCCCTCTATTTCCCATCTAATTTTGATCTAAATAACACAAAACCATTTGTCCTTGTAATGTTTGCTAAATATTACAGAAATTCAACAGAATTGTCCAAATTTGGAGACTAATTTTTGTGGATATGTTGGATGAAACATTTAGGCTGATTTGATCTTTTCTCTGCTGGACAGAGCTATCTATATCCAAAACTGTTAAATGTGTTGCAATAAAATGCCTAAACAAGCTACACATGCCCGCCCCTACCACACTTCGATGTATCTTACGTAAGTGGCCCTCTTTAAAAGCTTAATTATTGTAGTGATTTTAAAGGAAGTCTCAGAGTCCAAAATGTAATCTTCAATACAACTAATGAAAGAAGAGAAGTGAAATTAGAAATCCGAGTATAGCTCACTAGATAAGACACCAATATTAACGCCCTTATTGTTGCTCCGCAATTGTTGAACTTGAAAAATTGCAATTCTAAGGTAGAAATGGAGGAGGAGGAGATGATATGAACAGAAAATGAATATTATTAAAATTTGGAGTCATAAATACAAAAGAATATGATCAGTCAATTACACTCACAAAACCCTAATTAGATTTGAAGGCTAATCAGAGAGATAAATTTCCCTCTCCCCTCAGCCCTATTTCTCAATTCAATTATGGGGTTAGTCCAGTTGCAGCAGCAGTAGCATCCTCTCTCTAA

mRNA sequence

ATGGCATCCAAATTACATAACCGAACTTATGAAGATTTCGAACCTCCGGTGGAGCGGTCGGAAGAGGATGGCTGCACCATTCTCACCCTCTACATTCCCGTGGGCGGAAGGTTGAATACACTACGCAAATAAATAATTAATTAATTAATGTAACTTATTTTAAATATAGCAAAATGAGTAAATTTATTTATTAATATAGCAAAAATGTCATATAGTAGACAATGTCGACTACTATCATCTATTATTGTTTATTAATATCTATTATTGATAGTCAGTGATATTCTGCAATTTTCCTTAATTTGATGGATTTCTTCTTAATGGGTTGACTCAGGAAGAATGGATAAAACCTTTTTAGAACTATTTAATTTGCATTTCGCATTAGGTTTCAAAGGAGGTCAATTTAGGAGTTATCCTCAGGAGCTATCTATATCCAAAACTGTTAAATGTGTTGCAATAAAATGCCTAAACAAGCTACACATGCCCGCCCCTACCACACTTCGATGTATCTTACATTTGAAGGCTAATCAGAGAGATAAATTTCCCTCTCCCCTCAGCCCTATTTCTCAATTCAATTATGGGGTTAGTCCAGTTGCAGCAGCAGTAGCATCCTCTCTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCATCCAAATTACATAACCGAACTTATGAAGATTTCGAACCTCCGGTGGAGCGGTCGGAAGAGGATGGCTGCACCATTCTCACCCTCTACATTCCCGTGGGCGGAAGGTTGAATACACTACGCAAATAA

Protein sequence

MASKLHNRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIPVGGRLNTLRK
Homology
[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. NCBI nr
Match: XP_038902536.1 (inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 7.7e-08
Identity = 31/33 (93.94%), Postives = 32/33 (96.97%), Query Frame = 0 

Query: 1  MASKLHNRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          MASK H+RTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP
Sbjct: 1  MASK-HHRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 32

[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. NCBI nr
Match: KAA0040100.1 (circumsporozoite protein-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 6.5e-07
Identity = 27/32 (84.38%), Postives = 29/32 (90.62%), Query Frame = 0 

Query: 2  ASKLHNRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          +S  H+RTYEDFEPPVERSEEDGC ILTLYIP
Sbjct: 3  SSNKHHRTYEDFEPPVERSEEDGCIILTLYIP 34

[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. NCBI nr
Match: XP_008449876.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491622 [Cucumis melo] >TYK21725.1 circumsporozoite protein-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 6.5e-07
Identity = 27/32 (84.38%), Postives = 29/32 (90.62%), Query Frame = 0 

Query: 2  ASKLHNRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          +S  H+RTYEDFEPPVERSEEDGC ILTLYIP
Sbjct: 3  SSNKHHRTYEDFEPPVERSEEDGCIILTLYIP 34

[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. NCBI nr
Match: XP_022153773.1 (inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 3.9e-04
Identity = 21/26 (80.77%), Postives = 25/26 (96.15%), Query Frame = 0 

Query: 8  RTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          RTYEDFEPPVE S+EDGC+ILT+Y+P
Sbjct: 47 RTYEDFEPPVESSQEDGCSILTIYLP 72

[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T9W8 (Circumsporozoite protein-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold366G00740 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 3.1e-07
Identity = 27/32 (84.38%), Postives = 29/32 (90.62%), Query Frame = 0 

Query: 2  ASKLHNRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          +S  H+RTYEDFEPPVERSEEDGC ILTLYIP
Sbjct: 3  SSNKHHRTYEDFEPPVERSEEDGCIILTLYIP 34

[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DDX4 (Circumsporozoite protein-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold859G00960 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 3.1e-07
Identity = 27/32 (84.38%), Postives = 29/32 (90.62%), Query Frame = 0 

Query: 2  ASKLHNRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          +S  H+RTYEDFEPPVERSEEDGC ILTLYIP
Sbjct: 3  SSNKHHRTYEDFEPPVERSEEDGCIILTLYIP 34

[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMF5 (uncharacterized protein LOC103491622 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491622 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 3.1e-07
Identity = 27/32 (84.38%), Postives = 29/32 (90.62%), Query Frame = 0 

Query: 2  ASKLHNRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          +S  H+RTYEDFEPPVERSEEDGC ILTLYIP
Sbjct: 3  SSNKHHRTYEDFEPPVERSEEDGCIILTLYIP 34

[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L1N9 (SHSP domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G269140 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 7.0e-07
Identity = 26/32 (81.25%), Postives = 29/32 (90.62%), Query Frame = 0 

Query: 2  ASKLHNRTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          +S  H+RTYEDFEPPVE+SEEDGCTIL LYIP
Sbjct: 3  SSNKHHRTYEDFEPPVEQSEEDGCTILALYIP 34

[Close]
BLAST of CaUC03G050550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DIF9 (inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021212 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 1.9e-04
Identity = 21/26 (80.77%), Postives = 25/26 (96.15%), Query Frame = 0 

Query: 8  RTYEDFEPPVERSEEDGCTILTLYIP 34
          RTYEDFEPPVE S+EDGC+ILT+Y+P
Sbjct: 47 RTYEDFEPPVESSQEDGCSILTIYLP 72

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC03G050550 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038902536.17.7e-0893.94inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like [Benincasa hispida][more]
KAA0040100.16.5e-0784.38circumsporozoite protein-like [Cucumis melo var. makuwa][more]
XP_008449876.16.5e-0784.38PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491622 [Cucumis melo] >TYK21725.1 circu... [more]
XP_022153773.13.9e-0480.77inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like [Momordica charantia][more]
BLAST of CaUC03G050550 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC03G050550 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7T9W83.1e-0784.38Circumsporozoite protein-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_sc... [more]
A0A5D3DDX43.1e-0784.38Circumsporozoite protein-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_sc... [more]
A0A1S3BMF53.1e-0784.38uncharacterized protein LOC103491622 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491622 PE=... [more]
A0A0A0L1N97.0e-0781.25SHSP domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G269140 PE=3 S... [more]
A0A6J1DIF91.9e-0480.77inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like OS=Momordica charantia OX=3673 G... [more]
BLAST of CaUC03G050550 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC03G050550.1CaUC03G050550.1mRNA