CaUC02G030030 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC02G030030
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr02: 4095601 .. 4099338 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC02G030030
SyntenyCaUC02G030030
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCAAGTCAACCTAAAGCGGTTCAAAGAGGTACAAAAACTTGCTGTAGAGTGGGTTCCATCCCCTTTTATGGCCTCCTCGTTATAATAGATAAAAAAGTACAAACCAAAGTTGAAAATACAAGTACTAAAATAGTAGGCAAACCTTCCTCGAATAATGTAACTAGATTTGCGTATAACGCCAAGAATCGAGATTGTGCTACAAGAGCTAAGAAAATATCCTTTGGTTTCACATTTTTTCTCTAATAAATCCTGCTTTATGCTAGATAATGAACGTGCGTCCTAATTTTGGCTTTTCTGATATCTTTACTGATTCTGGTACAGGCTTTTTAATGAATGGATTTGTTAGTGCCTGACAATGAAGCAAGCCTTTTTTTGGAGGATATGGCTTAAAATCCCATTCATATTCATGATCTCTTCAAGCAGGCACTTGCTCTTATTACCTACAAAACTCAAAGGTCCGGTGCAACTTCTTTTGTATGTTCTTGATTAATGAGTTGCATGAATGCCCTTTTGAGTTTATTGTGCTTGATTTTGATTGAATATGTCAATTTTCATTTTGCATAGTGTTGCAGCTTTTTTCTGTATATCAATGTAAATGAATGCTAGCAAACTTCCCACATAGTTTTTGATAGTATTGTCTATAATATTCAACATGAAGAAGCTCTTAAAAGATGGTTTTGTGCTAAATCTTTGAAATGCATTGACAGAAGTTCCATAAAATATTTAGGTTCGGAGCTTATAAAAACTTTTAAATTATAAAATTATTTCCTAAACTGTGTTTCGTGTCTAATTAGTCTTTGTAACTTTATAAAATGTTTAATAAGTTCACGAACTTTCAATTTTATATCTAATAAGTTTTTAATAATTATTTTTTTAAAAAAAAATAATTGATTTGTTAAATGTAAATTTGAATTTTGTCCAACTAAATCTTAAAATTTTAATTGTGTATAGTTGATTAGTAAATTTTTTAAAATATTAAAGTTTAGTTACTAAATTTATAAGTTTTGAGAGTCCAAGAATCAAATAGAAACACATTTCGAATTTTAAATGTTAAATTTATAATTTAGACAAGTGGAAACTTTGGAGTAGGAATTGGAGTTATTCACTGCATGGTTTTTATTTTGTTTATTTATTTATTTTAAAAAGTTAATCATAATTACAAATATAAAGAGATTTACCCTTCAGTTGTTTTTACAGAAATTAATAATTAGTGTGAAAATTGTGGTTACTTAAAGGGGCACTAGTTTAGTTAATCAAGAAAAAGCTTTGATGGTTGAAATATTCCTTTCATCTATATGACATTTGCCAAATTTGTAGCTTCATGCCTTTCATCCATGTATTTTTAGCTTGTTGTAAACAGTTAAATTCTTATTTTGCTCTCTTCTCCTTTTGTTCTATTTTATTTATGTTTGGTAAGGATACTTTTTTTAAAAAAGTTTACAAATAAAGTAATTTGACCTATAAGGTCATGATGTTACATAATTATTCGAAAGAGAGTTTGGACTTTAATTGATTGATGACTTTTATTTAGAAGAATATTTGGATACATATTAAGCTACACTTGTCTTTTTGTAGCTCACTTAAGTGTCTAATCACAAATTGTCAATTTTCTTTCTTTTTGTAATGACAACACCAAGTATTACTCATTTATTTAAATTTTAAAGCTTGGTTGCAAATTTGCAACTTAAAATTTAAGCATATTTGTTTCAACTTAAATTTCACAATGAAAAGTGATATATTCCTTCTTACACATTAACAAGAAAAAAATTCGAGACAATGTCACATTTAATTTCATGAACTTGGAAAACAAGGTTAAATTAAAGAATAAATTTGGAAATTGAATTTTGTAGGATAAAAGTATTTGTGCCAAATTATTAGTTTAGTTTATTAAATATGTTTACAAACTTTTGAGAATATTACATTCTTAAACGATCTGTTTTGTGTATAGTATATCTCAATTTTAATTTTTTTTTTTATTATTATTTTTTTGTGCTAACAAAGAAAAGCCCTAATCTTGTGGGAAACAAAACACAATGTTGTGTGTATTAACTTACGAATTTTTTAAAATGTCTAGTAAGTTATTTAACTAACAAAGTAAAAGCTGAAAATCCTATTAAAAAATTTTACGACTCATTAAAAAAAAAAATTAAAATTTAGCGATTGTTAGATATTTTTCAAATTTAGGAATTGTCAGATGTGCCAAGATCCCAAAATCTGCCGCCTGTCAATGGTTCTTGGGCATGAGGCTGTTGAGGCCCGATTCTTTTCCAACGGAGTTAACAAAATTATTTTGGAATGATTTGTCTTTTTTTGTGGCTGTAGTATTAATTTTTGATCGATGTGTTGATATTTGATTGATATTTCTATGTTGTCATGAATTTGATATCTATATGAGAGTTGAATCGATATCTATATCATAGAAAGATCCACTAAACACAAAAATAATAAAAATAGACATGTTTATTTATTTGAAAATAATAAAAATGTTTATTTCTCATTTAAATTTGTTATTTGTTTTTTTTATAACTTCTTCATAAATATTCATTGAAATTGATATTTTCATCAAAATTTTCGTAAAATTAAGACTTTAATACTCCTATCAACATCAATATTTTAAACTTTGGTGGCAGTGTTGCTGGCTAGTTTCTTTGGCATGTTGCTTGTCGGGAAAAAAAATGATTAAAGGAGAAACTAGGGCTAAAGAGTTGAAACTATAATTAAAAAATTGAGGAATTCATTAGACACAAAATGAAAAGTTTAAAATCTTGATAGAGACAAGATTCAAAGTTATATCTAATAATCAATTAGTTTTTAAAAATTTCAAACTTGCTAATAACAAATTAAATGCCAAAACCAAAAATTTTAGGGCTATTAGGGGCTGTTTGGACCGTAGATATTGTTTTATAAGTATGAATATTAAATGTTTGGAATTCAAATGTGTGTGTTTTGAATGTCTAAGATAATTAATATATGTGTTTAAATATGAAGAATAATTAATATCTAAAAGTTAAATTAATGTGTTTGATTTACCAATTTTATAATTATTTAATGAAAGGTAAGATAACAAGTAATGTAACTAGAATTAAATTTTATTATCAATCACTTGAAATATCAATAAATGAATGTTTTTTTATTAAAAATAATTTAAAATATTTTATTTAATAATAAAAGTACTAATAAGGGGAAAATATTATAAATTAGAAAAAAAAATATCAAACTATTTACAAATATAGCAAAATTTCATTTTTTATCCACAATAAACAGTGATAGACTTCTATCACTGTTTTTTATACATTTGTAATTAGTTTGACTCATTTTGCTATATTTGAAAACTAACCTTTAAATGAATATAAATTAATTAAAATTACTAATAATAATTAATTAATAATAATTTATTAATTAATGGAGCTCTATTCATCTTCTTAATATTTTGGTCAGATAGCTTTAAAGTTCCTCAAATGAAATTATGTGAAACAAGCCAAAATCAAGATATCTAATTTCTGAAATTTTATGACAATATTTGTGAAACAACAAATTAAGAAAAATATTGAGATGAAAATAAGTTTAAAAGGTAATTGTTTTTTCTATTTAAAACAAGTACCCCTTTGATTTATTATTATATTTTTGTAAACACAATAATCAATCCAACAATTAGAAAATATTTGTAAATCGAATCGATAGAAGAAGGTCATGGTTACGACAGTGGTCCGGGTGAATCTCGGCGGCGTTTCTTAG

mRNA sequence

ATGTCAAGTCAACCTAAAGCGGTTCAAAGAGGTACAAAAACTTGCTGTAGAGTGGGTTCCATCCCCTTTTATGGCCTCCTCGTTATAATAGATAAAAAAGTACAAACCAAAGTTGAAAATACAAGTACTAAAATAGTAGGCAAACCTTCCTCGAATAATATAATGAACGTGCGTCCTAATTTTGGCTTTTCTGATATCTTTACTGATTCTGGTACAGGCTTTTTAATGAATGGATTTGCACTTGCTCTTATTACCTACAAAACTCAAAGGTCCGGTGCAACTTCTTTTTGTTGCAGCTTTTTTCTGTATATCAATACAAGTGGAAACTTTGGAGTAGGAATTGGAGTTATTCACTGCATGCTTCATGCCTTTCATCCATGTATTTTTAGCTTGTTCTCACTTAAGTGTCTAATCACAAATTGTCAATTTTCTTTCTTTTTGGCTATTAGGGGCTGTTTGGACCGTAGATATTGTTTTATAAGTAAGATAACAAGTAATAAGAAGGTCATGGTTACGACAGTGGTCCGGGTGAATCTCGGCGGCGTTTCTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTCAAGTCAACCTAAAGCGGTTCAAAGAGGTACAAAAACTTGCTGTAGAGTGGGTTCCATCCCCTTTTATGGCCTCCTCGTTATAATAGATAAAAAAGTACAAACCAAAGTTGAAAATACAAGTACTAAAATAGTAGGCAAACCTTCCTCGAATAATATAATGAACGTGCGTCCTAATTTTGGCTTTTCTGATATCTTTACTGATTCTGGTACAGGCTTTTTAATGAATGGATTTGCACTTGCTCTTATTACCTACAAAACTCAAAGGTCCGGTGCAACTTCTTTTTGTTGCAGCTTTTTTCTGTATATCAATACAAGTGGAAACTTTGGAGTAGGAATTGGAGTTATTCACTGCATGCTTCATGCCTTTCATCCATGTATTTTTAGCTTGTTCTCACTTAAGTGTCTAATCACAAATTGTCAATTTTCTTTCTTTTTGGCTATTAGGGGCTGTTTGGACCGTAGATATTGTTTTATAAGTAAGATAACAAGTAATAAGAAGGTCATGGTTACGACAGTGGTCCGGGTGAATCTCGGCGGCGTTTCTTAG

Protein sequence

MSSQPKAVQRGTKTCCRVGSIPFYGLLVIIDKKVQTKVENTSTKIVGKPSSNNIMNVRPNFGFSDIFTDSGTGFLMNGFALALITYKTQRSGATSFCCSFFLYINTSGNFGVGIGVIHCMLHAFHPCIFSLFSLKCLITNCQFSFFLAIRGCLDRRYCFISKITSNKKVMVTTVVRVNLGGVS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC02G030030 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC02G030030 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC02G030030 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC02G030030 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC02G030030.1CaUC02G030030.1mRNA