CaUC01G024900 (gene) Watermelon (USVL246-FR2) v1

Overview
NameCaUC01G024900
Typegene
OrganismCitrullus amarus (Watermelon (USVL246-FR2) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCiama_Chr01: 36871288 .. 36877191 (+)
RNA-Seq ExpressionCaUC01G024900
SyntenyCaUC01G024900
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTTAGTTATTAATTTAAATTTATTTATTAAATTTTTCGTTTTTATAATTTTTTTAAAAATATCCATTGACATCAAAATTTTATTGATATTTTTATCAATATTTCTATAAAATTAAGTCCTCGATGAAAATCTCAAATATTACTTATACCTTTAGTAAAATCCACTATCCTTTGTTTAATAGACACATCACATCATCATCATGTACCCAACACTCATATTTGTAATAAGAACTAAAAGAATTACGATTCAAAGATTTTTTTTTCTTTTTTAAGTTTAACAAATGAAGAACCAAATCAATAAATTTGTTGTTGAGAATATAATGTTTTAATTAAATAAATTAAGACTAATTTTGAGCAGTTTGAAATATTATTATTATTACTACCTAACTCAATTCAAACAAGTTTAAAAGGTTAAAAAGGTTAAAAAGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAAAAGGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACGCATTACGTCTTGTTATAAACTTATAACTTTTTCTTTCTCTTTGAATTAGTTATAAACTTATAATTTTAAAAAGAAAAACATATTGTTTATTACATAATAATTCACAACTGGCCCTTAGGAAAAACGAAATTCACAACTGACCCCACAAAGTAATTTGATTTGGATTTGATTTTACTTTTGGGTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAGCCTTCTCTGCCCTATCCACTAACCAGTTGAAAATGGTGCCATAAACAACCTCCACACTCTCCTTCGGCTCTCCGATCAACTGATGCCACAATCCCGGATACACCTTCAACGTCTTATCCTCACTCTCCGCCGATTCGAACACGAATCTCGCCGACCAACTGTCGCAAACTACGTCGTCTTCTCCATGAACCATCAGCATCGGAACCCTAATTTCATGGCAGTTCCTCTTTATGTACTCGCAAACTCGGAGAAACTCCAATGCTGTCGCCATCGGCGGCTTTCCTGAAAATCTCCGATTAGGGTTTTTCGCCACCAATCTCCTCTTCCATTCCTCTTTGTACGATTTGCTCGCGACGGGCTTCGATACCACCAATCGCAGTGAGGGCGCTAAAGACGCTGCTATTGGAAGAAGCTTCTCCAATGGCCAAATCGGTTTGAATTTCGCCGAGATTCCACACATGGAACCGTTCAACACCATTCCGTTCCAAATTCCCTCTTGCTTCAAGGAAATCAGGATCGAAATTGCACCGCCTAGGGATTCCCCGTACAGAAAAGCAGGGAGGTTGGGATTCTCTTCTCGAACAGAGTCGAAAAACAGAGTACAATCGAGAACAAGGAGTTCGATATCTGGGATTGAACCAGGGGATCCCTCGGAGCGGCCATGGCCTTGAAGGTCGAGCGAGCAAACGAGGAACCCAAGTTTGGCTATGGCGACGGCAGTGAGCTCAAATATCCAGCCACTGTCACAGGTGTAGCCATGGACCATGGCTACAACCCCTTTGAGCTCTGAATCAGAAACAGGACGCCATGATTGAGTGAAGATTTTCATCTTCTGTGCATTGAGCATAAAGCTTTCATGGTGAGTAATTTTGTGTTTCTTGTAGAATTCTTCCTTTGTTAGCCCTCCATAAGGGCTGTTCTCGTTGGCCTGGTTTATTGGGTGCGACATTTTCAGGTACCAAAAGAACAGATTCTGTTACATAAAACAGAGAGAGTGATGAAGAAGACCAAGTGGGAGGTTTGAAGAAGAGGTATATACTTTTGAAAATTGAATTGGGTTTTGGTTTTTGAAGAGGAATGAATGTGTGGGGAAATGTGTTGATTTAAGTTTGTGTAGGGAAATGATAAGTATCCATTGATGGAGTAGGACCAAGAAAATTGAAACCCTATTTATATACAGTGTGAACGGTGTAAATACATAGAAGGACTTGAAATTTTCTCGAAATGAAAGAATGATTGATGACAAAATTGAGATATGTGGAGTGTGCTGTGCCAATAAATTTGGAAATAGTGACATCCTAATTCCTAAACAAAATAAGTGTATCTTTCTTTTCTTATCCTTTTACTTGACAGCTCCCATCTCAGCTTTTGAGTATTAATTTCCATTCAAACTTTCAACTGTCCAAGTGCTGTGTGCTTTTTATGGTTAGATTTGAATGATGTTAGAGGAGTTTGTGTTTGGAATAGAGAGGTATGGTATGAGTTTTGATAATTATGCACGTAGGCTATGATGACTAAACTTTGGAACTTTAGATGCGAGGGTTTAAACTTGGGAGTTGTTTTTATCTATGGTTAGACAACCGTTGAAGAGGATTCGAACCACAAACTTCTTCATTACTAACACATTGATATGTAAGTTGAGTTATGCTTGCTTTGGCAATAGGTCATAAATCTTTAAATACGTATGTTACAAACTAAGGAGGTGTTTGGAACATCGAGTTGAGTTATGAAATTAGAAGTAATATTGGAGTTAGAAAGTTTGTGTTTGGAGTATGGAGTTTGTAAGATAAAGTTCTTGATAAATGTACAAACTTTAATAGTAAATGTATTGAAATTAAGTTATTTAACACCAACTTATGAAGTTGGTGAGCCAAACACCCTAAGTTAAAAAGATGTAATTCTCGTTTTGCATTCAAAGTATAAGTTGTACTGTTAGTTCTTTTTTTTTCTTTTTCCAACACAATAACATAGATGTGAGAATTCAAATAATTAACTTTTTTGAGATTATAATGTTGTTATGTTTAGGTTGACTTTTGTCCAGCAAGTTTAAACATAGTTTGATGGGTCGAATCATTATTAATATTACTTTGAAGGTTCCACTTTTATTTGAAATTTGAAAAGAACGTTGCTAGATTTATAAATTTAATATATATATATATATATTTTTTTTGGCTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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mRNA sequence

ATGTTTATTGAAAATGGTGCCATAAACAACCTCCACACTCTCCTTCGGCTCTCCGATCAACTGATGCCACAATCCCGGATACACCTTCAACGTCTTATCCTCACTCTCCGCCGATTCGAACACGAATCTCGCCGACCAACTGTCGCAAACTACGTCTTCCTCTTTATGTACTCGCAAACTCGGAGAAACTCCAATGCTGTCGCCATCGGCGGCTTTCCTGAAAATCTCCGATTAGGGTTTTTCGCCACCAATCTCCTCTTCCATTCCTCTTTGTACGATTTGCTCGCGACGGGCTTCGATACCACCAATCGCAGTGAGGGCGCTAAAGACGCTGCTATTGGAAGAAGCTTCTCCAATGGCCAAATCGGTTTGAATTTCGCCGAGATTCCACACATGGAACCGTTCAACACCATTCCGTTCCAAATTCCCTCTTGCTTCAAGGAAATCAGGATCGAAATTGCACCGCCTAGGGATTCCCCGTACAGAAAAGCAGGGAGGGGATCCCTCGGAGCGGCCATGGCCTTGAAGGTCGAGCGAGCAAACGAGGAACCCAAGTTTGGCTATGGCGACGGCAGTGAGCTCAAATATCCAGCCACTGTCACAGATTTTGGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTTATTGAAAATGGTGCCATAAACAACCTCCACACTCTCCTTCGGCTCTCCGATCAACTGATGCCACAATCCCGGATACACCTTCAACGTCTTATCCTCACTCTCCGCCGATTCGAACACGAATCTCGCCGACCAACTGTCGCAAACTACGTCTTCCTCTTTATGTACTCGCAAACTCGGAGAAACTCCAATGCTGTCGCCATCGGCGGCTTTCCTGAAAATCTCCGATTAGGGTTTTTCGCCACCAATCTCCTCTTCCATTCCTCTTTGTACGATTTGCTCGCGACGGGCTTCGATACCACCAATCGCAGTGAGGGCGCTAAAGACGCTGCTATTGGAAGAAGCTTCTCCAATGGCCAAATCGGTTTGAATTTCGCCGAGATTCCACACATGGAACCGTTCAACACCATTCCGTTCCAAATTCCCTCTTGCTTCAAGGAAATCAGGATCGAAATTGCACCGCCTAGGGATTCCCCGTACAGAAAAGCAGGGAGGGGATCCCTCGGAGCGGCCATGGCCTTGAAGGTCGAGCGAGCAAACGAGGAACCCAAGTTTGGCTATGGCGACGGCAGTGAGCTCAAATATCCAGCCACTGTCACAGATTTTGGATAA

Protein sequence

MFIENGAINNLHTLLRLSDQLMPQSRIHLQRLILTLRRFEHESRRPTVANYVFLFMYSQTRRNSNAVAIGGFPENLRLGFFATNLLFHSSLYDLLATGFDTTNRSEGAKDAAIGRSFSNGQIGLNFAEIPHMEPFNTIPFQIPSCFKEIRIEIAPPRDSPYRKAGRGSLGAAMALKVERANEEPKFGYGDGSELKYPATVTDFG
Homology
[Close]
BLAST of CaUC01G024900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KIA4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G525505 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 4.6e-48
Identity = 96/105 (91.43%), Postives = 100/105 (95.24%), Query Frame = 0 

Query: 56  MYSQTRRNSNAVAIGGFPENLRLGFFATNLLFHSSLYDLLATGFDTTNRSEGAKDAAIGR 115
           MYS TRRNSNAVAIGGFPEN RLGF ATNLLFHSSLYDLLATGFD TNR++GAKDAAIGR
Sbjct: 1   MYSHTRRNSNAVAIGGFPENRRLGFLATNLLFHSSLYDLLATGFDITNRNDGAKDAAIGR 60

Query: 116 SFSNGQIGLNFAEIPHMEPFNTIPFQIPSCFKEIRIEIAPPRDSP 161
           SFSNGQ+GLNFAEIPHMEPFNTIPFQ PSCFK+IRIEIAPPRDSP
Sbjct: 61  SFSNGQMGLNFAEIPHMEPFNTIPFQTPSCFKDIRIEIAPPRDSP 105

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CaUC01G024900 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC01G024900 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CaUC01G024900 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KIA44.6e-4891.43Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G525505 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CaUC01G024900 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CaUC01G024900.1CaUC01G024900.1mRNA